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宏转录组测序揭示褐土脲酶基因的表达丰度和细菌来源 被引量：2
1
作者 胡利伟 轩贝贝 +9 位作者 戴华鑫 郭建华 牟文君 刘阳 翟振 闫鼎 蔡宪杰 奚家勤 薛超群 宋纪真 《烟草科技》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第11期7-14,共8页
为明确褐土中脲酶编码基因的表达丰度,通过土壤RNA提取和宏转录组测序法,筛选RNA水平上表达较高的脲酶基因,共筛选到122个脲酶结构基因(93个ureC、16个ureB和13个ureA)和脲酶辅助基因115个(29个ureD、12个ureE、36个ureF、29个ureG、5个... 为明确褐土中脲酶编码基因的表达丰度,通过土壤RNA提取和宏转录组测序法,筛选RNA水平上表达较高的脲酶基因,共筛选到122个脲酶结构基因(93个ureC、16个ureB和13个ureA)和脲酶辅助基因115个(29个ureD、12个ureE、36个ureF、29个ureG、5个ureH和4个ureJ)。其中ureB、ureA、ureG、ureH和ureJ所有转录本TPM值都小于2,而ureC、ureD、ureE和ureF丰度最高的转录本TPM值分别为3.17、5.37、2.01和2.71。细菌来源的芽孢杆菌属Bacillus、芽孢八叠球菌属Sporosarcina、节杆菌属Arthrobacter、链霉属Streptomyces和类芽孢杆菌属Paenibacillus等在褐土脲酶活性的发挥中贡献度较大。 展开更多
关键词 褐土 宏转录组测序 脲酶结构基因 脲酶辅助基因 细菌
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