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2016-2023年南昌市儿童诺如病毒胃肠炎疫情的流行特征及病原学分析
1
作者 贺凤兰 易柳 +6 位作者 甘厦 涂俊凌 黄四平 李梅 钱科 夏文 倪贤生 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期740-744,共5页
目的分析2016年3月―2023年2月南昌市诺如病毒(norovirus,NoV)引发儿童胃肠炎疫情的流行特征及基因型别分布,为儿童病毒感染性胃肠炎防控提供科学依据。方法对2016年3月―2023年2月南昌市儿童NoV胃肠炎疫情及个案资料进行流行病学特征分... 目的分析2016年3月―2023年2月南昌市诺如病毒(norovirus,NoV)引发儿童胃肠炎疫情的流行特征及基因型别分布,为儿童病毒感染性胃肠炎防控提供科学依据。方法对2016年3月―2023年2月南昌市儿童NoV胃肠炎疫情及个案资料进行流行病学特征分析,采集病例肛拭子、粪便标本或呕吐物,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RT-PCR)进行NoV GⅠ和GⅡ基因群鉴定,核酸检测阳性标本采用特异引物扩增,所得扩增产物测序后进行基因型别及重组分析。结果共调查处理儿童NoV胃肠炎疫情89起,其中幼托机构49起,小学40起,平均每起疫情涉及14.71例病例,总患病率为3.18%。报告病例男女比为1.22∶1.00,平均流行时间约3 d。疫情高发月份为10月―次年2月,城区幼托机构为疫情高发场所。共采集823份病例样本,NoV核酸阳性率为55.65%。GⅠ群NoV 6起,GⅡ群81起,混合感染2起。73起测序成功,经比对分析出14个基因重组亚型。NoV GⅠ群有GⅠ.3[P13]、GⅠ.6[P11]、GⅠ.4[P4]型;GⅡ群以GⅡ.2、GⅡ.6和GⅡ.7亚型为主,有11个重组亚型。GⅡ群疫情中GⅡ.2[P16]型占比最高,优势基因型由GⅡ.2向其他型别转变。结论南昌市近年儿童NoV胃肠炎疫情主要集中于城区幼托机构,冬季高发。引起疫情的主要病原体是GⅡ群NoV,以GⅡ.2[P16]型为主的多种基因重组型同时流行。 展开更多
关键词 诺如病毒 儿童 胃肠炎疫情 基因型 流行病学
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一起老年公寓诺如病毒感染引发胃肠炎疫情的检测与分析 被引量：2
2
作者 蒋烈 常伟冰 周滔 《中国卫生产业》 2014年第33期31-32,共2页
目的对某社会福利院老年公寓发生的一起急性老人群体性肠胃炎疫情中采集的标本采用实时荧光PCR方法(RT-PCR)进行诺如病毒核酸检测。方法采集该老年公寓患病老人、护理人员的肛拭子共8份。结果本次疫情中,在5份患病老人和2份护理人员的... 目的对某社会福利院老年公寓发生的一起急性老人群体性肠胃炎疫情中采集的标本采用实时荧光PCR方法(RT-PCR)进行诺如病毒核酸检测。方法采集该老年公寓患病老人、护理人员的肛拭子共8份。结果本次疫情中,在5份患病老人和2份护理人员的肛拭子标本中检出诺如病毒Ⅱ型(GⅡ)。结论本次疫情爆发蔓延可能是由于带病上班的工作人员在护理和分发餐点过程中将诺如病毒传染给老人并引起交叉感染所致。 展开更多
关键词 诺如病毒 老年公寓 实时荧光 胃肠炎疫情
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丽水市一起学校暴发诺如病毒疫情的实验室基因检测分析 被引量：1
3
作者 雷永良 王晓光 +2 位作者 叶碧峰 钱卫明 陈秀英 《中国卫生检验杂志》 CAS 2016年第16期2355-2356,2360,共3页
目的测定丽水市一起学校病毒性胃肠炎暴发疫情诺如病毒的RNA聚合酶区(RdRp)和衣壳蛋白区(VP1)基因序列,从分子水平对病原进行分型鉴定。方法收集疫情现场现症患者肛拭子、呕吐物、各类饮用水、可疑食物留样标本总计98份,采用荧光定量PC... 目的测定丽水市一起学校病毒性胃肠炎暴发疫情诺如病毒的RNA聚合酶区(RdRp)和衣壳蛋白区(VP1)基因序列,从分子水平对病原进行分型鉴定。方法收集疫情现场现症患者肛拭子、呕吐物、各类饮用水、可疑食物留样标本总计98份,采用荧光定量PCR方法检测诺如病毒,将阳性标本通过测序引物RT-PCR扩增RdRp和VP1基因序列并测定,通过生物信息学软件进行基因分型鉴定和序列分析。结果共检出诺如病毒阳性4份,阳性检出率为4.08%(4/98),均为GⅡ基因型;RdRp和VP1序列BLAST和种系发生分型结果均显示为诺如病毒GⅡ.4亚型。结论诺如病毒优势流行株GⅡ.4亚型是本次学校病毒性胃肠炎暴发疫情的重要病原体。 展开更多
关键词 诺如病毒 胃肠炎疫情 基因鉴定
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2018-2023年北京市朝阳区急性胃肠炎聚集性疫情中肠道腺病毒和星状病毒的病原特征研究
4
作者 孙灵利 韩桃利 +8 位作者 齐啸 黄洋 张越 高艳 赵剑虹 李蓓蓓 张政 徐潇 焦洋 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期603-608,共6页
目的探讨2018—2023年期间北京市朝阳区急性胃肠炎(AGE)聚集性疫情中肠道腺病毒(AdV)和星状病毒(AstV)的病原特征。方法采用荧光定量PCR法对2018年1月至2023年12月期间北京市朝阳区报告的AGE聚集性疫情的粪便/肛拭子样本进行肠道AdV和A... 目的探讨2018—2023年期间北京市朝阳区急性胃肠炎(AGE)聚集性疫情中肠道腺病毒(AdV)和星状病毒(AstV)的病原特征。方法采用荧光定量PCR法对2018年1月至2023年12月期间北京市朝阳区报告的AGE聚集性疫情的粪便/肛拭子样本进行肠道AdV和AstV核酸检测。采用反转录PCR或PCR方法对核酸阳性样本进行目的基因扩增测序、基因分型和进化分析,获得AGE聚集性疫情中肠道AdV和AstV的感染情况及基因型别,采用MEGA 6.0软件进行系统进化分析。结果2018—2023年朝阳区AGE聚集性疫情中,分别在18起(2.44%)和23起(3.12%)疫情样本中检出肠道AdV和AstV核酸,两者均主要发生在幼儿园。在肠道AdV和AstV感染病例中,男女性比例分别为1∶1和1.7∶1,年龄中位数分别为4和5岁。在成功完成序列测定的11起肠道AdV阳性和16起AstV样本中,系统进化分析显示肠道AdV均为AdV41型,而AstV有4种基因型,包括AstV-1(75.00%)、AstV-2(6.25%)、AstV-3(6.25%)和AstV-5(12.50%)。结论本研究对2018—2023年期间,北京市朝阳区急性胃肠炎聚集性疫情中肠道腺病毒和星状病毒的病原特征进行了系统的分析,肠道AdV41型和AstV-1型为主要流行基因型,需要加强对AGE疫情中的病原特征的持续监测。 展开更多
关键词 急性胃肠炎疫情 肠道腺病毒 星状病毒
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2019—2023年北京市某区札如病毒聚集性疫情的流行病学和基因特征分析
5
作者 荆红波 韦伟 +8 位作者 何牧 王彦波 李湛 张赫 赵宇 贾楠 靖灯节 刘盛田 彭涛 《国际病毒学杂志》 北大核心 2024年第2期160-163,共4页
目的了解北京市某区札如病毒引起的聚集性疫情的流行病学及基因特征分析,为疫情防控提供技术支撑。方法收集2019—2023年北京市某区急性胃肠炎聚集性疫情流行病学调查资料和病例粪便样本,使用实时荧光PCR对A组轮状病毒、GⅠ组诺如病毒、... 目的了解北京市某区札如病毒引起的聚集性疫情的流行病学及基因特征分析,为疫情防控提供技术支撑。方法收集2019—2023年北京市某区急性胃肠炎聚集性疫情流行病学调查资料和病例粪便样本,使用实时荧光PCR对A组轮状病毒、GⅠ组诺如病毒、GⅡ组诺如病毒、札如病毒、肠道腺病毒和星状病毒进行检测,对札如病毒阳性样本进行VP1区的基因测序和系统进化分析。结果29起急性胃肠炎聚集性疫情中检出了札如病毒,阳性检出率为12.66%。疫情在5—6月和11月有两个高峰,场所主要集中在幼儿园和小学。共检出5个基因型,分别为GⅠ.6、GⅠ.1、GⅡ.3、GⅠ.2和GⅠ.3。结论GⅠ.6是北京某区聚集性疫情主要流行优势株,应对其进行持续监测,进一步了解札如病毒的分子流行特征。 展开更多
关键词 急性胃肠炎疫情 札如病毒 基因分型
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1起非O1非O139群霍乱弧菌引起的食源性急性胃肠炎暴发疫情调查 被引量：4
6
作者 张国峰 杨艳娜 +3 位作者 崔燕 郑燃燃 李华 杨菁菁 《江苏预防医学》 CAS 2022年第2期200-201,208,共3页
目的对1起学校急性胃肠炎暴发疫情进行调查,为制定有效的预防控制策略和措施提供科学依据。方法采用个案调查表对病例进行流行病学调查,结合三间分布特征和实验室检测结果进行分析。结果该起急性胃肠炎疫情于2021年9月6日报告首发病例,... 目的对1起学校急性胃肠炎暴发疫情进行调查,为制定有效的预防控制策略和措施提供科学依据。方法采用个案调查表对病例进行流行病学调查,结合三间分布特征和实验室检测结果进行分析。结果该起急性胃肠炎疫情于2021年9月6日报告首发病例,历时6 d,累计报告病例82例,9月7日为发病高峰(占52.4%),病例均为学生,总罹患率为1.8%。病例临床表现以腹泻(100.0%)和腹痛(82.9%)为主,无重症及住院病例。该校所辖6个院系均有病例报告,罹患率以京冀院(8.2%)最高、立信学院(1.0%)最低,罹患率3号楼(5.3%)最高、1号楼(0.8%)最低,不同院系、不同宿舍楼罹患率差异均有统计学意义(χ^(2)值分别为16.14、26.15,P值均<0.01)。男、女罹患率差异无统计学意义(χ^(2)=3.04,P>0.05)。共采集样本155份,PCR法检测总体阳性率30.3%,主要为弧菌属和气单胞菌属(阳性率均为8.4%);其中2份病例样本和2份9月6日早餐留样食品样本培养为非O1非O139霍乱弧菌阳性。结论本次疫情可能是由学生食用被非O1非O139群霍乱弧菌污染食物引起的暴发疫情。应加强学校食堂各环节的卫生管理,大力开展健康教育,加强疫情监测和报告,减少此类事件的发生。 展开更多
关键词 非O1非O139群霍乱弧菌 急性胃肠炎暴发疫情 大专院校
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三重实时荧光PCR法检测急性胃肠炎聚集性疫情的探讨
7
作者 杜云鹤 《中国社区医师》 2022年第16期45-47,共3页
目的:探讨三重实时荧光PCR法在急性胃肠炎聚集性疫情中快速检测GⅠ/GⅡ型诺如病毒和A组轮状病毒的应用。方法:采集2020年11月12日一起学校急性胃肠炎聚集性疫情中的疑似病例、临床诊断病例、密切接触者标本及环境标本共373份,用三重实... 目的:探讨三重实时荧光PCR法在急性胃肠炎聚集性疫情中快速检测GⅠ/GⅡ型诺如病毒和A组轮状病毒的应用。方法:采集2020年11月12日一起学校急性胃肠炎聚集性疫情中的疑似病例、临床诊断病例、密切接触者标本及环境标本共373份,用三重实时荧光RT-PCR法同时检测诺如病毒(基因组GⅠ/GⅡ)和A组轮状病毒核酸,根据不同病毒核酸的检出率分析该疫情的主要病原体,分析病原体在感染者中年龄的分布影响。结果:373份标本中检出诺如病毒(基因组GⅠ/GⅡ)144份,检出率38.61%;检出A组轮状病毒2份,检出率0.54%;检出诺如病毒和A组轮状病毒混合感染6份,检出率1.61%。不同性别间诺如病毒感染阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。不同职业间诺如病毒感染阳性率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。>45岁组人群诺如病毒感染阳性率最高,26~35岁组阳性率最低,不同年龄组人群阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:诺如病毒可能是导致本次疫情的主要病原体,同时存在诺如病毒和A组轮状病毒混合感染的情况,三重实时荧光PCR法同时检测多种病毒为疫情快速处置提供了实验室依据。 展开更多
关键词 三重实时荧光PCR 急性胃肠炎聚集性疫情 诺如病毒 轮状病毒
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