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土豆WRKY转录因子家族的生物信息学分析
被引量：
13
1
作者
黄胜雄
刘永胜
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期205-214,共10页
WRKY转录因子家族属于一类广泛参与植物生长发育调控,以及各种生物和非生物胁迫下植物防御应答反应的转录因子.通过HMMER 3.0软件,在土豆基因组中进行WRKY转录因子的比对搜索和鉴定.系统分析鉴定得到81个土豆WRKY转录因子,被划分为3个大...
WRKY转录因子家族属于一类广泛参与植物生长发育调控,以及各种生物和非生物胁迫下植物防御应答反应的转录因子.通过HMMER 3.0软件,在土豆基因组中进行WRKY转录因子的比对搜索和鉴定.系统分析鉴定得到81个土豆WRKY转录因子,被划分为3个大组:Ⅰ组、Ⅱ组和Ⅲ组.Ⅱ组进一步划分为5个亚组:Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e.土豆、拟南芥和水稻的WRKY基因的系统进化树揭示出:土豆和水稻基因组中分别发生了物种特异的WRKY基因扩增事件,其中Ⅱ-e组中发生了土豆基因组中特有基因扩增.同组中的WRKY成员蛋白序列中的氨基酸保守域构成基本一致.各个分组成员的氨基酸保守域组成特异;但共有的保守域区段在各个分组中仍然存在.在受伤、干旱、盐以及病毒侵染胁迫条件下,28个土豆WRKY转录因子基因的表达模式被阐明;其中部分基因的表达水平被显著地诱导增加或者降低,很可能参与了调控土豆逆境胁迫条件下的防御应答反应.
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关键词
转录因子
WRKY
土豆
进化分析
表达模式
胁迫
防御
应答
原文传递
紫花苜蓿幼苗茎叶响应盐胁迫的双向电泳比较分析
被引量：
1
2
作者
熊军波
刘洋
+2 位作者
田宏
张鹤山
陈明新
《江苏农业科学》
2018年第14期148-153,共6页
紫花苜蓿是全球栽培最为广泛的豆科牧草,土壤盐碱化是导致苜蓿减产的主要因素之一。从蛋白质组学角度对紫花苜蓿苗期响应盐胁迫的地上部蛋白质组进行研究,以揭示紫花苜蓿耐盐调节机制,发掘耐盐应答相关蛋白。6日龄紫花苜蓿中苜一号幼苗...
紫花苜蓿是全球栽培最为广泛的豆科牧草,土壤盐碱化是导致苜蓿减产的主要因素之一。从蛋白质组学角度对紫花苜蓿苗期响应盐胁迫的地上部蛋白质组进行研究,以揭示紫花苜蓿耐盐调节机制,发掘耐盐应答相关蛋白。6日龄紫花苜蓿中苜一号幼苗在0、200 mmol/L NaCl处理9 d后,采用双向电泳分别分离了其茎叶部蛋白组,在对照和处理间20个蛋白质点丰度发生2倍以上变化,采用MALDI-TOF-TOF/MS对差异蛋白进行鉴定,最终有14个蛋白鉴定成功。功能分析表明,这些蛋白主要参与光合作用、胁迫防御应答、碳水化合物代谢、转录调控和信号传导、细胞分化和次生代谢。
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关键词
紫花苜蓿
盐
胁迫
蛋白质
耐盐调节机制
双向电泳
光合作用
胁迫
防御
应答
碳水化合物代谢
转录调控
信号传导
细胞分化
次生代谢
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职称材料
题名
土豆WRKY转录因子家族的生物信息学分析
被引量：
13
1
作者
黄胜雄
刘永胜
机构
四川大学生命科学学院/生物资源与生态环境教育部重点实验室
合肥工业大学生物与食品工程学院
出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第2期205-214,共10页
基金
国家杰出青年科学基金项目(30825030)
国家自然科学基金项目(31171179)
博士点优先资助项目(20110181130009)资助~~
文摘
WRKY转录因子家族属于一类广泛参与植物生长发育调控,以及各种生物和非生物胁迫下植物防御应答反应的转录因子.通过HMMER 3.0软件,在土豆基因组中进行WRKY转录因子的比对搜索和鉴定.系统分析鉴定得到81个土豆WRKY转录因子,被划分为3个大组:Ⅰ组、Ⅱ组和Ⅲ组.Ⅱ组进一步划分为5个亚组:Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e.土豆、拟南芥和水稻的WRKY基因的系统进化树揭示出:土豆和水稻基因组中分别发生了物种特异的WRKY基因扩增事件,其中Ⅱ-e组中发生了土豆基因组中特有基因扩增.同组中的WRKY成员蛋白序列中的氨基酸保守域构成基本一致.各个分组成员的氨基酸保守域组成特异;但共有的保守域区段在各个分组中仍然存在.在受伤、干旱、盐以及病毒侵染胁迫条件下,28个土豆WRKY转录因子基因的表达模式被阐明;其中部分基因的表达水平被显著地诱导增加或者降低,很可能参与了调控土豆逆境胁迫条件下的防御应答反应.
关键词
转录因子
WRKY
土豆
进化分析
表达模式
胁迫
防御
应答
Keywords
transcriptional factor
WRKY
potato
phylogenetic analysis
expression pattern
defense response against stress
分类号
S532 [农业科学—作物学]
Q349.501 [生物学—遗传学]
原文传递
题名
紫花苜蓿幼苗茎叶响应盐胁迫的双向电泳比较分析
被引量：
1
2
作者
熊军波
刘洋
田宏
张鹤山
陈明新
机构
湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室
出处
《江苏农业科学》
2018年第14期148-153,共6页
基金
国家自然科学基金(编号:31402130)
湖北省重点实验室开放课题(编号:2012ZD201)
湖北农业科学院青年科学基金(编号:2012NKYJJ12)
文摘
紫花苜蓿是全球栽培最为广泛的豆科牧草,土壤盐碱化是导致苜蓿减产的主要因素之一。从蛋白质组学角度对紫花苜蓿苗期响应盐胁迫的地上部蛋白质组进行研究,以揭示紫花苜蓿耐盐调节机制,发掘耐盐应答相关蛋白。6日龄紫花苜蓿中苜一号幼苗在0、200 mmol/L NaCl处理9 d后,采用双向电泳分别分离了其茎叶部蛋白组,在对照和处理间20个蛋白质点丰度发生2倍以上变化,采用MALDI-TOF-TOF/MS对差异蛋白进行鉴定,最终有14个蛋白鉴定成功。功能分析表明,这些蛋白主要参与光合作用、胁迫防御应答、碳水化合物代谢、转录调控和信号传导、细胞分化和次生代谢。
关键词
紫花苜蓿
盐
胁迫
蛋白质
耐盐调节机制
双向电泳
光合作用
胁迫
防御
应答
碳水化合物代谢
转录调控
信号传导
细胞分化
次生代谢
分类号
S541.101 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
土豆WRKY转录因子家族的生物信息学分析
黄胜雄
刘永胜
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
13
原文传递
2
紫花苜蓿幼苗茎叶响应盐胁迫的双向电泳比较分析
熊军波
刘洋
田宏
张鹤山
陈明新
《江苏农业科学》
2018
1
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职称材料
已选择
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引用分析
参考文献
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