Hepatocellular carcinoma(HCC)is one of the most common types of liver cancer and is the second leading cause of cancer mortality with an estimated 745500 deaths annually(Jemal et al.,2011).Although new therapeutic mod...Hepatocellular carcinoma(HCC)is one of the most common types of liver cancer and is the second leading cause of cancer mortality with an estimated 745500 deaths annually(Jemal et al.,2011).Although new therapeutic modalities including novel chemotherapeutic interventions and targeted therapy have been applied,the prognosis of HCC patients remains unsatisfactory due to the high incidence of intrahepatic and distal metastases(Siegel et al.,2018).展开更多
目的研究肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中microRNA-301b(miR-301b)在478例卵巢癌患者中的表达量与卵巢癌患者生存状况的关系。方法对TCGA数据库中478例卵巢癌患者的miR-301b表达量与生存状况进行分析,预测其靶基因...目的研究肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中microRNA-301b(miR-301b)在478例卵巢癌患者中的表达量与卵巢癌患者生存状况的关系。方法对TCGA数据库中478例卵巢癌患者的miR-301b表达量与生存状况进行分析,预测其靶基因及生物学活性。结果miR-301b高表达患者具有更长的生存时间,是卵巢癌患者预后的保护因素(OS:P<0.001,DFS:P<0.05),综合3个靶基因数据库的预测结果得到12个靶基因,编码的蛋白多数与肿瘤的发生发展有关,其中靶基因TEA结构域家族成员1(TEA domain family member 1,TEAD1)与胞质多糖基化元件结合蛋白4(cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4,CPEB4)的表达量与卵巢癌患者的预后相关(TEAD1:P<0.05,CPEB4:P<0.05)。结论miR-301b表达对卵巢癌患者的预后具有重要的意义,表现出抑癌因子的作用,对卵巢癌的预后评估和治疗具有重要的指导意义。展开更多
目的基于美国癌症肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析铜调节的细胞死亡相关基因与前列腺癌患者预后和免疫细胞浸润的关系。方法从TCGA数据库下载所有前列腺癌患者的基因数据,其中包括前列腺癌组织501例,正常组织52...目的基于美国癌症肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析铜调节的细胞死亡相关基因与前列腺癌患者预后和免疫细胞浸润的关系。方法从TCGA数据库下载所有前列腺癌患者的基因数据,其中包括前列腺癌组织501例,正常组织52例。运用R软件提取前列腺癌患者中铜调节的细胞死亡相关基因表达矩阵,进行差异分析、多因素回归分析筛选出预后基因,对预后基因进行生存分析,同时探讨预后相关基因与免疫细胞之间的相关性。结果甘氨酸裂解系统蛋白H(GCSH)与前列腺癌患者的预后显著相关,同时发现其与前列腺癌患者中的树突细胞、CD8^(+)T细胞、浆细胞也显著相关(P<0.05)。结论GCSH基因在前列腺癌的发生、发展中起重要作用,有望成为前列腺癌预后的标志物。展开更多
目的:探讨线粒体自噬基因E2F1与子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC)预后的相关性。方法:R软件筛选肿瘤基因组图谱数据库UCEC以及正常组织中差异表达的线粒体自噬基因。单因素和多因素Cox回归分析发现E2F1与UCEC预...目的:探讨线粒体自噬基因E2F1与子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC)预后的相关性。方法:R软件筛选肿瘤基因组图谱数据库UCEC以及正常组织中差异表达的线粒体自噬基因。单因素和多因素Cox回归分析发现E2F1与UCEC预后密切相关。Kaplan-Meier分析E2F1高危组和低危组生存时间的差异。GEPIA数据库探讨E2F1 mRNA在UCEC患者癌组织和正常组织表达情况。人类蛋白质图谱(the human protein at⁃las,HPA)在线数据库探讨E2F1蛋白在UCEC患者癌组织和正常组织表达情况。UALCAN数据库探讨E2F1表达与UCEC患者临床资料之间关系。结果:9个线粒体自噬基因在癌组织中低表达,5个线粒体自噬基因在癌组织中高表达。Kaplan-Meier分析E2F1表达低风险组患者的生存率优于高风险组(P<0.001)。GEPIA数据库发现E2F1 mRNA在UCEC癌组织中表达量高于癌旁正常组织(P<0.05)。HPA数据库发现E2F1蛋白在癌组织中高表达。E2F1表达量与UCEC患者组织学分型、肿瘤分期以及TP53突变密切相关(P<0.05)。结论:E2F1在UCEC中高表达,并且其表达水平与UCEC患者的不良预后密切相关。展开更多
基金Project supported by the Education Department of Zhejiang Province(No.G201432123)the Public Welfare Technology Application Research Plan Project of Zhejiang Science and Technology Department(No.LGC19H200005),China
文摘Hepatocellular carcinoma(HCC)is one of the most common types of liver cancer and is the second leading cause of cancer mortality with an estimated 745500 deaths annually(Jemal et al.,2011).Although new therapeutic modalities including novel chemotherapeutic interventions and targeted therapy have been applied,the prognosis of HCC patients remains unsatisfactory due to the high incidence of intrahepatic and distal metastases(Siegel et al.,2018).
文摘目的研究肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中microRNA-301b(miR-301b)在478例卵巢癌患者中的表达量与卵巢癌患者生存状况的关系。方法对TCGA数据库中478例卵巢癌患者的miR-301b表达量与生存状况进行分析,预测其靶基因及生物学活性。结果miR-301b高表达患者具有更长的生存时间,是卵巢癌患者预后的保护因素(OS:P<0.001,DFS:P<0.05),综合3个靶基因数据库的预测结果得到12个靶基因,编码的蛋白多数与肿瘤的发生发展有关,其中靶基因TEA结构域家族成员1(TEA domain family member 1,TEAD1)与胞质多糖基化元件结合蛋白4(cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4,CPEB4)的表达量与卵巢癌患者的预后相关(TEAD1:P<0.05,CPEB4:P<0.05)。结论miR-301b表达对卵巢癌患者的预后具有重要的意义,表现出抑癌因子的作用,对卵巢癌的预后评估和治疗具有重要的指导意义。
文摘目的基于美国癌症肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库分析铜调节的细胞死亡相关基因与前列腺癌患者预后和免疫细胞浸润的关系。方法从TCGA数据库下载所有前列腺癌患者的基因数据,其中包括前列腺癌组织501例,正常组织52例。运用R软件提取前列腺癌患者中铜调节的细胞死亡相关基因表达矩阵,进行差异分析、多因素回归分析筛选出预后基因,对预后基因进行生存分析,同时探讨预后相关基因与免疫细胞之间的相关性。结果甘氨酸裂解系统蛋白H(GCSH)与前列腺癌患者的预后显著相关,同时发现其与前列腺癌患者中的树突细胞、CD8^(+)T细胞、浆细胞也显著相关(P<0.05)。结论GCSH基因在前列腺癌的发生、发展中起重要作用,有望成为前列腺癌预后的标志物。
文摘目的:探讨线粒体自噬基因E2F1与子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC)预后的相关性。方法:R软件筛选肿瘤基因组图谱数据库UCEC以及正常组织中差异表达的线粒体自噬基因。单因素和多因素Cox回归分析发现E2F1与UCEC预后密切相关。Kaplan-Meier分析E2F1高危组和低危组生存时间的差异。GEPIA数据库探讨E2F1 mRNA在UCEC患者癌组织和正常组织表达情况。人类蛋白质图谱(the human protein at⁃las,HPA)在线数据库探讨E2F1蛋白在UCEC患者癌组织和正常组织表达情况。UALCAN数据库探讨E2F1表达与UCEC患者临床资料之间关系。结果:9个线粒体自噬基因在癌组织中低表达,5个线粒体自噬基因在癌组织中高表达。Kaplan-Meier分析E2F1表达低风险组患者的生存率优于高风险组(P<0.001)。GEPIA数据库发现E2F1 mRNA在UCEC癌组织中表达量高于癌旁正常组织(P<0.05)。HPA数据库发现E2F1蛋白在癌组织中高表达。E2F1表达量与UCEC患者组织学分型、肿瘤分期以及TP53突变密切相关(P<0.05)。结论:E2F1在UCEC中高表达,并且其表达水平与UCEC患者的不良预后密切相关。
