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健康老年人肠道中肠集聚性大肠埃希菌毒力基因及超广谱β内酰胺酶的研究 被引量:6
1
作者 许江燕 王原 +2 位作者 骆丰 曹俊敏 吴健 《中国卫生检验杂志》 CAS 2016年第6期768-771,共4页
目的分析健康老年人肠道中肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)的检出率,并探讨其毒力基因及超广谱β内酰胺酶(ESBL)的携带情况。方法取健康老年人的粪便标本分别接种于血平板、SS平板、麦康凯平板进行细菌培养,用全自动微生物鉴定仪和质谱仪鉴定... 目的分析健康老年人肠道中肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)的检出率,并探讨其毒力基因及超广谱β内酰胺酶(ESBL)的携带情况。方法取健康老年人的粪便标本分别接种于血平板、SS平板、麦康凯平板进行细菌培养,用全自动微生物鉴定仪和质谱仪鉴定细菌到种;对分离的大肠埃希菌采用双纸片协同法检测其ESBL的表型,用PCR法扩增其EAEC毒力基因ast A和aggR;ESBL表型阳性的EAEC菌株用PCR法检测其ESBL基因型。结果 175例健康体检者,共检出160株大肠埃希菌,ESBL携带率为36.25%(58/160);EAEC检出16株(10.00%),其中ast A阳性14株(8.75%),aggR阳性2株(1.25%);EAEC菌株的ESBL携带率为56.25%(9/16),其基因型均为CTX-M型,其中以CTX-M-14最多,占66.67%(6/9)。结论本研究获得了健康老年人肠道中EAEC的检出率及其毒力基因和ESBL的携带情况,提示EAEC不仅是腹泻患者的病原菌,健康老年人也可以携带,且具有较高的携带率和耐药性,提醒应加强防范。 展开更多
关键词 老年人 超广谱Β内酰胺酶 集聚大肠埃希
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1起食源性疾病事件的实验室检测、耐药性及溯源分析
2
作者 王彩乔 王盼 +1 位作者 钟笑 贺明丽 《医学动物防制》 2024年第8期831-832,F0003,F0004,共4页
目的通过对榆林市某养老院1起食源性疾病事件的现场流行病学调查和实验室分析,为临床诊断治疗和做好食源性疾病调查工作提供科学依据。方法采用现场流行病学方法、梅里埃FilmArray全自动医用PCR分析系统、传统病原体分离鉴定、荧光定量... 目的通过对榆林市某养老院1起食源性疾病事件的现场流行病学调查和实验室分析,为临床诊断治疗和做好食源性疾病调查工作提供科学依据。方法采用现场流行病学方法、梅里埃FilmArray全自动医用PCR分析系统、传统病原体分离鉴定、荧光定量PCR、药物敏感性实验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)等方法对本次事件及样品进行分析。结果调查以腹痛、腹泻、水样便为主要症状的病例30例,罹患率为38.96%,以老人为主;采集标本68份(粪便标本30份、食品标本30份、环境标本6份、水样2份),5份标本(粪便标本2份、食品标本1份、环境标本1份、水样1份)中检出肠集聚性大肠埃希菌(enteroaggregative Escherichia coli,EAEC),均检出毒力基因aggR、astA、uidA、pic;耐药性分析显示2株菌对四环素、复方新诺明、氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、环丙沙星耐药,另外3株对氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、萘啶酸耐药;PFGE显示5株菌型别一致,同源性>85.00%。结论结合病例临床表现、流行病学信息、实验室检测结果,此次食源性疾病事件可能由EAEC引起,疑似水塔水污染所致。相关部门应加强对养老院生活饮用水及就餐环境的监管,改善老人就餐居住环境,减少类似事件再次发生。 展开更多
关键词 食源疾病 毒力基因 脉冲场凝胶电泳 集聚大肠埃希 耐药
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急性腹泻病患者与健康体检人员肠集聚性大肠埃希菌分子特征及耐药性研究 被引量:5
3
作者 杜悦 王红 +4 位作者 苏爱荣 韦程媛 李秀桂 谭冬梅 黄彦 《疾病监测》 CAS 2017年第12期931-935,共5页
目的比较急性腹泻病患者与健康体检人员肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)在携带毒力基因、耐药性及分子分型之间的差异。方法以PCR方法检测EAEC的7种毒力基因,微量肉汤稀释法检测菌株对13种抗菌药物的耐药性,脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型... 目的比较急性腹泻病患者与健康体检人员肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)在携带毒力基因、耐药性及分子分型之间的差异。方法以PCR方法检测EAEC的7种毒力基因,微量肉汤稀释法检测菌株对13种抗菌药物的耐药性,脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型分析。结果来自急性腹泻病患者的分离株中,毒力基因检出率最高为air,体检分离株为sat。48株EAEC对13种抗菌药物中的12种均表现出不同程度的耐药,对亚胺培南完全敏感,急性腹泻病患者分离株耐药性较体检分离株强。PFGE分型共得到43种带型,均呈现高度多态性。结论不同来源EAEC携带的毒力基因差异不显著,PFGE带型呈高度多态性,来源于腹泻病患者的EAEC耐药性明显高于健康体检人员。 展开更多
关键词 集聚大肠埃希 耐药 毒力基因 脉冲场凝胶电泳
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我国EAEC分离株对HEp-2细胞的粘附特征及集聚性粘附相关基因分析 被引量:5
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作者 刘学通 陈强 +3 位作者 孙晖 赵爱兰 徐建国 熊衍文 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2012年第12期893-896,共4页
目的了解我国EAEC分离株的HEp-2细胞粘附特征、毒力基因和集聚性粘附基因情况,探讨建立PCR检测方法的可能性。方法选择31株分离自腹泻患者粪便的大肠埃希菌,采用HEp-2细胞粘附试验,获得菌株的粘附表型;采用PCR方法检测毒力基因(astA、a... 目的了解我国EAEC分离株的HEp-2细胞粘附特征、毒力基因和集聚性粘附基因情况,探讨建立PCR检测方法的可能性。方法选择31株分离自腹泻患者粪便的大肠埃希菌,采用HEp-2细胞粘附试验,获得菌株的粘附表型;采用PCR方法检测毒力基因(astA、aggR、pic)及集聚性粘附相关基因(aggA、aafA、agg3A、hdaA)。结果不同菌株在HEp-2细胞粘附试验中表现为不同的粘附表型,所含有的毒力基因及粘附相关基因不同。aggR基因阳性的13株菌中,7株表现为集聚性粘附(AA)表型,其中5株具有集聚性粘附相关基因。此外存在aggR基因阴性但对HEp-2细胞表现为集聚性粘附的非典型EAEC以及具有集聚性粘附相关基因hdaA却表现为对HEp-2细胞不粘附的菌株。结论 EAEC是一类高度异质性大肠埃希菌,HEp-2细胞粘附试验仍然是检测EAEC的"金标准";aggR基因是一种较好的PCR诊断靶基因,在aggR基因的基础上组合其他基因,建立EAEC检测的多重PCR方法具有重要的实际意义。 展开更多
关键词 集聚大肠埃希 粘附表型 粘附基因 HEP-2细胞
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基于6种肠集聚性大肠埃希菌毒力基因检测诊断效果评价
5
作者 崔琪奇 赵冰 +3 位作者 许统圣 郝莉鹏 郑英杰 潘丽峰 《中国公共卫生》 CSCD 北大核心 2023年第10期1342-1347,共6页
目的对肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)分子诊断方法进行性能评价。方法对2015年1月-2019年12月上海市浦东新区腹泻门诊病例粪便样本分别进行大肠埃希菌分离鉴定,并对分离株进行“金标准”HEp-2细胞粘附试验和6种毒力基因检测(aggR、astA、pic... 目的对肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)分子诊断方法进行性能评价。方法对2015年1月-2019年12月上海市浦东新区腹泻门诊病例粪便样本分别进行大肠埃希菌分离鉴定,并对分离株进行“金标准”HEp-2细胞粘附试验和6种毒力基因检测(aggR、astA、pic、aaiA、aatA、aaiG)。根据不同基因组合,构建诊断方法一(uidA-aggR基因阳性)、诊断方法二(uidA-aggR/astA/pic任一基因阳性)、诊断方法三(uidA-aggR/aatA/aaiG/aaiA任一基因阳性)、诊断方法四(uidA-aggR/astA/aaiA任一基因阳性)、诊断方法五(uidA-aggR/astA/pic/aaiA/aatA/aaiG任一基因阳性)5种分子诊断方法。采用灵敏度、特异性、Kappa值、曲线下面积(AUC)等指标评价其诊断效能。结果在2366例病例样本中分离到1390株大肠埃希菌,19.14%(266/1390)分离株呈AA粘附表型,毒力基因检出率以astA(21.87%,304/1390)最高。以“金标准”、诊断方法一至五进行判定,EAEC检出率分别为11.24%(266/2366)、2.37%(56/2366)、14.84%(351/2366)、9.68%(229/2366)、5.26%(361/2366)和16.48%(390/2366)。诊断方法一特异性最高(99.86%,2097/2100)、灵敏度最低(19.92%,53/266),诊断方法三~五与金标准呈中度一致性(Kappa值为0.58~0.65),诊断方法二~五具有较高诊断价值(AUC为0.806~0.882)。结论基于EAEC毒力基因的分子诊断方法暂不可代替金标准。 展开更多
关键词 集聚大肠埃希 毒力基因 集聚粘附 诊断评价
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辽宁省婴幼儿食品中肠集聚性大肠埃希菌的病原学特征及耐药谱研究
6
作者 李雪 孙婷婷 +4 位作者 魏彤竹 王伟杰 刘海霞 张铭琰 刁文丽 《中国食品卫生杂志》 CSCD 北大核心 2023年第2期174-178,共5页
目的对2018—2020年辽宁省婴幼儿食品中致泻大肠埃希菌开展持续监测,了解和掌握本省内致泻大肠埃希菌的病原学特征、药物敏感性特征,为本省致泻大肠埃希菌流行病学研究奠定坚实基础,为可能导致的食源性疾病合理用药提供依据。方法采集... 目的对2018—2020年辽宁省婴幼儿食品中致泻大肠埃希菌开展持续监测,了解和掌握本省内致泻大肠埃希菌的病原学特征、药物敏感性特征,为本省致泻大肠埃希菌流行病学研究奠定坚实基础,为可能导致的食源性疾病合理用药提供依据。方法采集辽宁省共208份婴幼儿食品,分离肠杆菌科细菌,并进行16S rRNA基因测序分析与生化鉴定。对鉴定得到的大肠埃希菌进行毒力基因检测,收集分离的肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)进一步进行血清学分型和耐药谱研究。结果16S rRNA基因测序通过对肠杆菌科进行种鉴定,发现与生化结果一致。其中EAEC的检出率较高,且EAEC的毒力基因pic携带率高。毒力基因分型和血清分型具有一致性。共检测出25株EAEC,其中40%菌株(血清型O134:H9)携带毒力基因pic,28%菌株(血清型O3:H2)同时携带毒力基因aggR和astA,16%菌株(血清型O9:H6)携带毒力基因aggR,16%菌株(血清型O62:H7)携带毒力基因astA。78株大肠埃希菌中EAEC毒力基因的携带率为32.1%。25株EAEC为多重耐药株,主要对β内酰胺类、大环内酯类、喹诺酮类、四环素类抗菌药物耐药严重。结论EAEC是辽宁省婴幼儿食品中大肠埃希菌主要污染菌型,且具有较高的耐药性,应给予更多关注。 展开更多
关键词 集聚大肠埃希 16S rRNA 生化鉴定 毒力基因 耐药谱 血清型
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2017年福建省肠集聚性大肠埃希菌抗生素耐药性分析 被引量:3
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作者 林杰 郑恩惠 +3 位作者 李曲文 徐海滨 杨劲松 翁顺太 《预防医学论坛》 2019年第6期401-403,406,共4页
目的了解福建省肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)的耐药情况,比较分析Kirby-Bauer纸片法和VITEK2全自动药敏结果的一致性。方法2011~2016年福建省监测保存的EAEC菌株33株,运用K-B法和VITEK2法进行耐药性分析,ESBLs检测。使用SPSS软件,统计耐药... 目的了解福建省肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)的耐药情况,比较分析Kirby-Bauer纸片法和VITEK2全自动药敏结果的一致性。方法2011~2016年福建省监测保存的EAEC菌株33株,运用K-B法和VITEK2法进行耐药性分析,ESBLs检测。使用SPSS软件,统计耐药率、分析K-B法与VITEK2法的结果一致性。结果检测EAEC菌株33株,K-B法结果EAEC对氨苄西林(耐药率81.82%)、复方新诺明(耐药率60.61%)耐药严重;VITEK2法对氨苄西林(耐药率81.82%)、复方新诺明(耐药率48.48%)、哌拉西林(耐药率30.30%)、氨苄西林/舒巴坦(耐药率30.30%)耐药较严重。两种方法结果均对美罗培南、哌拉西林/他唑巴坦、阿米卡星、头孢他啶、头孢吡肟等敏感。K-B法和VITEK2法重复试验大部分结果一致。发现3株产ESBLs菌株。结论本研究结果可为下一步耐药基因检测、耐药分子机制等研究提供基础数据。耐药实验结果数据可供临床经验性治疗参考。 展开更多
关键词 致泻大肠埃希 集聚大肠埃希 耐药 Kirby-Bauer纸片法
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肠集聚性大肠埃希菌分离株脉冲场凝胶电泳分析 被引量:3
8
作者 孙晖 刘学通 +3 位作者 赵爱兰 金东 熊衍文 卢珊 《疾病监测》 CAS 2013年第10期807-810,共4页
目的对我国散发腹泻患者肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)分离株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,以了解其分子流行病学特征并初步建立我国EAEC菌株的基础数据库。方法参照PulseNet大肠埃希菌O157∶H7的PFGE实验方法对52株EAEC分离株进行分析,并... 目的对我国散发腹泻患者肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)分离株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析,以了解其分子流行病学特征并初步建立我国EAEC菌株的基础数据库。方法参照PulseNet大肠埃希菌O157∶H7的PFGE实验方法对52株EAEC分离株进行分析,并使用BioNumerics软件进行聚类。结果在限制性内切酶XbaⅠ和PulseNet推荐的电泳参数下,菌株基因组酶切片段分布均匀,条带易于识别。52株EAEC分离株产生了48种PFGE带型,初步聚类为A^N 14个群,不同地区来源及不同HEp-2细胞黏附表型的菌株广泛分布在不同PFGE聚类群中。结论我国散发腹泻患者EAEC分离株呈现高度多态性,PFGE电泳参数和限制性内切酶XbaⅠ适用于我国EAEC菌株的分析。 展开更多
关键词 集聚大肠埃希 集聚黏附 脉冲场凝胶电泳 分子分型
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肠集聚性大肠埃希菌在健康老年人肠道中的分布及其耐药机制研究 被引量:3
9
作者 王原 骆丰 +2 位作者 曹俊敏 张嵘 许江燕 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2016年第6期667-670,673,共5页
目的分析健康老年人肠道中肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)的检出率,并探讨其毒力基因及超广谱β-内酰胺酶(ESBL)的携带情况。方法取健康老年人的粪便标本分别接种于血平板、SS平板、麦康凯平板进行细菌培养,用全自动微生物鉴定仪和质谱仪鉴... 目的分析健康老年人肠道中肠集聚性大肠埃希菌(EAEC)的检出率,并探讨其毒力基因及超广谱β-内酰胺酶(ESBL)的携带情况。方法取健康老年人的粪便标本分别接种于血平板、SS平板、麦康凯平板进行细菌培养,用全自动微生物鉴定仪和质谱仪鉴定细菌到种;对分离的大肠埃希菌采用双纸片协同法检测其ESBL的表型,用PCR法扩增其EAEC毒力基因astA和aggR;ESBL表型阳性的EAEC菌株用PCR法检测其ESBL基因型。结果在175例研究对象中,共检出160株大肠埃希菌,ESBL携带率为36.30%(58/160);EAEC检出16株(10.00%),其中astA阳性14株(8.75%),aggR阳性2株(1.25%);EAEC菌株的ESBL携带率为56.25%(9/16),其基因型均为CTX-M型,其中以CTX-M-14最多,占66.70%(6/9)。结论本研究获得了健康老年人肠道中EAEC的检出率及其毒力基因和ESBL的携带情况,提示我们EAEC不仅是腹泻患者的病原菌,还可以在健康老年人群中携带,且具有较高的携带率和耐药性,提醒我们加强防范。 展开更多
关键词 健康老年人 超广谱Β-内酰胺酶 集聚大肠埃希
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福建省肠集聚性大肠埃希菌耐药表型及基因型初探 被引量:2
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作者 林杰 郑恩惠 +2 位作者 李曲文 翁顺太 邱玉锋 《中国预防医学杂志》 CAS CSCD 2020年第12期1246-1250,共5页
目的了解肠集聚性大肠埃希菌(enteroaggregative Escherichia coli,EAEC)的耐药情况,比较Kirby-Bauer纸片法和VITEK 2法药敏结果的一致性,初步探索EAEC耐药基因的存在情况。方法33株EAEC运用K-B法和VITEK 2法进行耐药试验,检测耐药基因... 目的了解肠集聚性大肠埃希菌(enteroaggregative Escherichia coli,EAEC)的耐药情况,比较Kirby-Bauer纸片法和VITEK 2法药敏结果的一致性,初步探索EAEC耐药基因的存在情况。方法33株EAEC运用K-B法和VITEK 2法进行耐药试验,检测耐药基因sulⅠ、sulⅡ、blaTEM、blaCTX-M、blaOXA。统计耐药率、不同方法结果一致性、耐药基因与表型相关性。结果EAEC对氨苄西林、复方新诺明等耐药严重,对头孢他啶、阿米卡星等敏感;发现4株产ESBLs菌株;K-B法结果与VITEK 2法结果大多是一致的。kappa相关性分析显示,sulⅠ或sulⅡ基因与复方新诺明耐药一致性强度中等。检出3菌株blaTEM阳性,检出1菌株blaCTX-M阳性。结论较全面掌握了福建省EAEC对抗生素的耐药表型,初步发现部分耐药基因,发现sulⅠ或sulⅡ基因与复方新诺明耐药表型相关。 展开更多
关键词 集聚大肠埃希 耐药表型 耐药基因型 Β-内酰胺酶 磺胺类抗生素耐药基因
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湖南省腹泻病人集聚性大肠埃希菌的调查 被引量:1
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作者 刘巧突 谭徽 +2 位作者 陈小勇 李美兰 张小兰 《中国预防医学杂志》 CAS 2002年第1期55-57,共3页
国际上将致泻大肠埃希菌分为五类:产毒大肠埃希菌(ETEC)、致病性大肠埃希菌(EPEC)、侵袭性大肠埃希菌(EHEC)、出血性大肠埃希菌(EHEC)和集聚性大肠埃希菌(EAggEC)[1,2].
关键词 腹泻 集聚大肠埃希 湖南 流行病学
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肠集聚性大肠埃希菌生化特征及耐药性研究
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作者 刘巧突 李美兰 +3 位作者 谭徽 廖威 李金莲 阳利群 《医学研究通讯》 2001年第3期49-51,共3页
肠聚集性大肠埃希菌(Enteroaggreg ative Escheri chria Coli EAggEC)被发现与命名以来,巴西、印度等国家对EAggEC作了菌株分离和流行病学研究,不同作者所作结论常不相同.国内外对其系统生化反应特征及其抗菌药物敏感性研究,罕见文献报... 肠聚集性大肠埃希菌(Enteroaggreg ative Escheri chria Coli EAggEC)被发现与命名以来,巴西、印度等国家对EAggEC作了菌株分离和流行病学研究,不同作者所作结论常不相同.国内外对其系统生化反应特征及其抗菌药物敏感性研究,罕见文献报道,而这些对于新菌的认识和鉴别,以及制定适宜的防治措施,均具有现实指导意义. 展开更多
关键词 集聚大肠埃希 生化特征 耐药
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北京市昌平区2012—2016年肠集聚性黏附大肠埃希氏菌耐药性、毒力基因及分子特征 被引量:8
13
作者 舒高林 李东迅 +3 位作者 闻艳红 彭华 徐代庆 吴杨 《江苏预防医学》 CAS 2017年第2期128-132,共5页
目的了解昌平区肠集聚性黏附大肠埃希氏菌(EAEC)耐药性、毒力基因携带情况及分子特征。方法对2012—2016年北京市昌平区分离的15株EAEC毒株进行复核;以药敏实验检测菌株对16种抗菌药物的耐药性;以PCR法检测8种毒力的携带情况;采用多位... 目的了解昌平区肠集聚性黏附大肠埃希氏菌(EAEC)耐药性、毒力基因携带情况及分子特征。方法对2012—2016年北京市昌平区分离的15株EAEC毒株进行复核;以药敏实验检测菌株对16种抗菌药物的耐药性;以PCR法检测8种毒力的携带情况;采用多位点序列分型(MLST)及脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)进行分子分型分析。结果 15株EAEC耐药率为100.0%,耐多药率为80.0%。每株携带2~5个毒力基因,共有10种毒力基因谱;8个毒力基因阳性率由高到低分别为aap(100.0%)、CVD432(93.3%)、aggA(60.0%)、agg3A(40.0%)、astA(33.3%)、pic(20.0%)、aafA(13.3%),未检出pet阳性。MLST分型分析将15株EAEC菌分为9个ST型,其中有4个新ST型(STcpEC1、STcpEC2、STcpEC3、STcpEC4),以STcpEC1为优势ST型(占33.3%)。PFGE分析得到13种PFGE带型,相同ST型菌株PFGE带型、毒力基因相似系数均较高。结论北京市昌平区近5年EAEC菌耐药率、多重耐药率较高,毒力基因aap、CVD432、aggA检出率高,STcpEC1为优势ST型,PFGE带型具有高度多态性。 展开更多
关键词 集聚黏附大肠埃希 耐药 毒力基因 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳
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一起疑似大肠埃希菌所致食物中毒的实验室检测分析 被引量:4
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作者 杨冰 朱海明 +5 位作者 王海燕 王建 宋曼丹 赖蔚苳 李洪 陈秋霞 《华南预防医学》 2021年第5期616-619,共4页
目的通过对广东省某地某学校发生的一起疑似食物中毒事件的采样样品的实验室检测和分析,为今后做好食源性疾病的病原体检测工作提供参考依据。方法采集广东省某地某学校发生的一起疑似食物中毒事件中病例和从业人员肛拭子、剩余食物留... 目的通过对广东省某地某学校发生的一起疑似食物中毒事件的采样样品的实验室检测和分析,为今后做好食源性疾病的病原体检测工作提供参考依据。方法采集广东省某地某学校发生的一起疑似食物中毒事件中病例和从业人员肛拭子、剩余食物留样和环境样本,进行包括致泻性大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌、沙门菌、副溶血弧菌等常见食源性致病菌,以及产气荚膜梭菌、邻单胞菌和气单胞菌属等检测,对分离到的致泻性大肠埃希菌采用PCR法进行毒力基因检测,采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对肠集聚性粘附大肠埃希氏菌(EAEC)进行分子分型分析。结果 66份样本经分离培养和生化鉴定,其中6份样品检出致泻性大肠埃希氏菌,检出率9.09%(6/66);对检出样本进行致泻性大肠埃希菌PCR检测,分离EAEC毒力基因阳性30株以及产气荚膜梭菌3株,其余病原体均未检出。PFGE分析显示30株EAEC菌种间相似性<70%,不具有同源性。结论在食源性疾病暴发中,需加强流行病学调查、病例临床症状的分析和总结,同时规范采样方法以提高实验室的检出率,真正发挥实验室检测的作用。 展开更多
关键词 集聚粘附大肠埃希 食物中毒 脉冲场凝胶电泳
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肠道集聚性大肠埃希氏菌菌体和gDNA标准物质的研制 被引量:2
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作者 赵琳娜 刘娜 +1 位作者 王学硕 崔生辉 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第18期103-110,共8页
目的:为满足肠道集聚性大肠埃希氏菌准确检测的实验室质量控制和能力验证需求,研制具有我国自主知识产权且具有全基因组测序信息的均匀稳定的肠道集聚性大肠埃希氏菌菌体及gDNA标准物质。方法:利用二代高通量测序技术对肠道集聚性大肠... 目的:为满足肠道集聚性大肠埃希氏菌准确检测的实验室质量控制和能力验证需求,研制具有我国自主知识产权且具有全基因组测序信息的均匀稳定的肠道集聚性大肠埃希氏菌菌体及gDNA标准物质。方法:利用二代高通量测序技术对肠道集聚性大肠埃希氏菌(CMCC 44841)进行全基因组测序,明确CMCC 44841的种属、血清分型、多位点序列分型和毒力基因。对CMCC 44841进行astA、aggR、pic特征性基因聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)确认。采用冷冻干燥技术制备含量为103 CFU/样品的菌球和含量为20 ng/样品的gDNA小球。参照CNAS-GL017对20个菌球样品进行均匀性检验,采用单因素方差分析对结果进行统计分析。将样品分别于-20、4、25℃和37℃条件下保藏,对其贮藏稳定性和运输稳定性进行评价。组织3家实验室进行协同标定和验证。使用5种不同基质的即食食品样本,按照国标法检验标准物质的适用性。结果:利用生物信息学分析,CMCC44841基因组大小为5.057285 Mb,GC含量为50.6%,编码区基因5173个。种属鉴定结果为大肠埃希氏菌(Escherichia coli),血清预测结果为O127:H21,MLST为ST40型,携带除aggR、astA、pic之外其他相关的毒力基因。PCR扩增出astA、aggR、pic片段大小分别为102、400 bp和1111 bp。菌体标准物质均匀性检验结果F=1.59,符合标准物质的要求。菌体和gDNA标准物质样品于-20℃和4℃保藏60 d,25℃保藏7 d,37℃保藏5 d后仍然稳定。经3家实验室协同标定,菌体标准物质样品含量均为103 CFU/样品。20件不同基质的食品样品加入肠道集聚性大肠埃希氏菌标准物质进行检验,均可以检出。结论:本研究所制备的肠道集聚性大肠埃希氏菌菌体及gDNA标准物质所用菌株来源于我国国内分离菌株,且具有明确的全基因组序列信息,均匀性和稳定性均符合要求,适用性良好,能够满足食品检测实验室的质量控制和能� 展开更多
关键词 致泻大肠埃希 集聚大肠埃希 基因组DNA 标准物质 全基因组测序 毒力基因
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一株黄瓜源肠集聚性大肠埃希氏菌耐药及生长预测模型分析
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作者 罗小菊 寇力丹 +3 位作者 杨穗珊 朱梦 常秀亭 谢作蓉 《食品安全质量检测学报》 CAS 北大核心 2022年第18期5917-5923,共7页
目的考查一株黄瓜源肠集聚性大肠埃希氏菌(enteroaggregative Escherichia coli,EAEC)的耐药情况,并建立其生长预测模型。方法将采集的黄瓜样品进行大肠埃希氏菌的分离和鉴定,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)对EAEC... 目的考查一株黄瓜源肠集聚性大肠埃希氏菌(enteroaggregative Escherichia coli,EAEC)的耐药情况,并建立其生长预测模型。方法将采集的黄瓜样品进行大肠埃希氏菌的分离和鉴定,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)对EAEC特征性毒力基因进行确认,并通过VITEK 2 Compact全自动微生物药敏系统进行18种抗生素的耐药性分析;以分离鉴定的EAEC为研究对象,监测其在4、15、25、35℃贮藏条件下在黄瓜上的生长数据,绘制生长曲线,采用SLogistic模型进行拟合,建立黄瓜中EAEC生长预测模型。结果自黄瓜中分离到一株EAEC,携带aggR和astA毒力基因,对磺胺类药物复方新诺明高度耐药。4、15、25、35℃贮藏条件下EAEC在黄瓜上的生长用SLogistic模型拟合的相关系数都大于0.95,该模型可以有效地反应EAEC在黄瓜上的生长情况。结论黄瓜上存在EAEC污染风险,EAEC的耐药性进一步加剧生食黄瓜的安全风险。通过SLogistic方程可以有效建立不同温度条件下EAEC在黄瓜上的生长预测模型,对生食黄瓜的加工、供餐等过程中食源性致病菌风险控制提供参考依据。 展开更多
关键词 黄瓜 集聚大肠埃希 耐药 生长预测模型
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基于特征基因的不同类型致泻大肠埃希氏菌的分子鉴定
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作者 郭梁 刘国强 +6 位作者 海小 罗建兴 孙春玲 王东玉 朱静 雅梅 郭元晟 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2020年第17期178-184,共7页
致泻大肠埃希氏菌是引起人体以腹泻症状为主的常见病原菌。将传统微生物学方法和分子鉴定方法相结合鉴定致泻大肠埃希氏菌。根据聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增和测序建立5种不同类型致泻大肠埃希氏菌的分子鉴定标... 致泻大肠埃希氏菌是引起人体以腹泻症状为主的常见病原菌。将传统微生物学方法和分子鉴定方法相结合鉴定致泻大肠埃希氏菌。根据聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增和测序建立5种不同类型致泻大肠埃希氏菌的分子鉴定标准,并对试验过程进行安全性评价,最后通过检测鲜肉中肠道集聚性大肠埃希氏菌验证此方法的适用性。结果显示5种致泻大肠埃希氏菌标准菌株的特征基因都有明显的条带,且与该特征基因的产物条带大小一致。同时,胶回收测序的结果与特征基因的序列一致性为100%,可利用PCR和测序鉴定5种致泻大肠埃希氏菌;在安全性评价试验中,利用细菌裂解液进行涂板,培养后均未发现菌落生成,因此没有生物安全隐患;肉样中的检测结果显示,有astA基因的目的条带,且测序结果与此基因序列一致,说明此方法能够准确鉴定出鲜肉中肠道集聚性大肠埃希氏菌。成功建立5种不同类型大肠埃希氏菌的分子鉴定方法,评价试验过程的安全性,并准确鉴定出肉样中的肠道集聚性大肠埃希氏菌,为实验室相关标准的制定和修订提供理论依据和有益借鉴。 展开更多
关键词 致泻大肠埃希 聚合酶链式反应 测序 安全评价 集聚大肠埃希
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