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竞争性等位基因特异的TaqMan聚合酶链反应法和DNA直接测序法检测KRAS G12D突变的对比分析
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作者 郑晴晴 贾伟平 +3 位作者 张蓉 胡承 罗彦丽 常英 《上海医学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期820-823,I0001,共5页
目的对比分析竞争性等位基因特异的TaqMan聚合酶链反应(castPCR)法和DNA直接测序法检测肠镜活组织检查标本KRAS G12D突变的差异。方法应用活组织检查钳收集肠镜下结直肠腺瘤和结直肠癌组织,抽提组织DNA,分别采用castPCR法和DNA直接测序... 目的对比分析竞争性等位基因特异的TaqMan聚合酶链反应(castPCR)法和DNA直接测序法检测肠镜活组织检查标本KRAS G12D突变的差异。方法应用活组织检查钳收集肠镜下结直肠腺瘤和结直肠癌组织,抽提组织DNA,分别采用castPCR法和DNA直接测序法获得KRAS G12D的突变情况。结果腺瘤组和腺癌组castPCR法检测的KRAS G12D突变率均显著高于同组DNA直接测序法(P值均<0.05),两组间castPCR法和DNA直接测序法检测的KRAS G12D突变率的差异均无统计学意义(P值均>0.05)。腺瘤组两种检测方法的突变型符合率为55.6%,野生型符合率为100.0%,阴性符合率为100.0%,总体符合率为87.5%,一致性检验Kappa值为0.643 5;腺癌组两种检测方法的突变型符合率为50.0%,野生型符合率为100.0%,阴性符合率为100.0%,总体符合率为85.0%,一致性检验Kappa值为0.583 3。提示两种方法检测阴性的一致性程度均较高,但检测阳性的一致性程度一般。Mutation Detector分析结果显示,castPCR法能够检测出突变量<1%的突变,灵敏度高达0.1%。检测突变量分析结果显示,当KRAS G12D突变量≥4%时,castPCR法和DNA直接测序法检测KRAS G12D均为阳性;当突变量<4%时,仅castPCR法能够检测出KRAS G12D为阳性。提示castPCR法能够检测出DNA直接测序法检测不出的KRAS G12D突变,较DNA直接测序法效率高。结论 castPCR法能够高效地检测肠镜活组织检查标本中低突变量的KRAS G12D,其临床实用价值较DNA直接测序法高。 展开更多
关键词 竞争性等位基因特异的TaqMan聚合酶链反应 组织检查标本 KRAS G12D
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骨髓活检标本固定液的选择 被引量:3
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作者 姚洪田 郑舟军 严丽萍 《肿瘤学杂志》 CAS 2001年第5期315-315,共1页
对65例骨髓活检分别用Bouin液、LowyFMA液、10 %福尔马林及Richman盐酸甲醛液处理 ,结果经Bouin液和LowyFMA液固定并加脱钙液的骨髓活检标本 ,其形态结构较10
关键词 骨髓 组织检查标本 固定液 Bouin液
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P16蛋白在胃癌中的表达及意义 被引量:2
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作者 於健 唐剑敏 +2 位作者 朱东胜 祝鋆 王路明 《上海医学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期410-410,共1页
本研究采用免疫组织化学方法检测胃癌、慢性萎缩性胃炎和慢性浅表性胃炎患者胃黏膜标本的P16蛋白表达水平,现报道如下。 1 材料与方法 1.1材料收集上海市第二人民医院2004年6月2005年6月行胃镜检查的慢性浅表性胃炎(30例)、慢性... 本研究采用免疫组织化学方法检测胃癌、慢性萎缩性胃炎和慢性浅表性胃炎患者胃黏膜标本的P16蛋白表达水平,现报道如下。 1 材料与方法 1.1材料收集上海市第二人民医院2004年6月2005年6月行胃镜检查的慢性浅表性胃炎(30例)、慢性萎缩性胃炎(32例)、不典型增生(12例)和胃癌患者(31例)的胃黏膜活组织检查标本, 展开更多
关键词 P16蛋白 胃癌患者 慢性浅表性胃炎 慢性萎缩性胃炎 免疫组织化学方法 组织检查标本 胃黏膜标本 蛋白表达水平
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免疫组织化学技术诊断消化道活组织检查标本564例分析 被引量:1
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作者 张晓琴 董新华 《临床医药实践》 2006年第10期768-768,共1页
关键词 免疫组织化学技术 组织检查标本 消化道 技术诊断 免疫组织化学标记 病理诊断 早治疗
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