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中国家驴TYRP1基因第二内含子多态性分析
1
作者 马晓君 苏咏梅 +3 位作者 朱文进 王茂晗 陈芝媛 赵涵 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第6期110-114,共5页
为了探究TYRP1基因对中国家驴毛色的影响,试验采集410只不同毛色中国家驴的血液样本,采用聚合酶链式反应及单链构象多态性(polymerase chain reaction and single-strand conformation polymorphism, PCR-SSCP)方法检测中国家驴TYRP1基... 为了探究TYRP1基因对中国家驴毛色的影响,试验采集410只不同毛色中国家驴的血液样本,采用聚合酶链式反应及单链构象多态性(polymerase chain reaction and single-strand conformation polymorphism, PCR-SSCP)方法检测中国家驴TYRP1基因第二内含子中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,对不同毛色中国家驴个体进行基因分型,并计算基因型频率和等位基因频率,分析TYRP1基因第二内含子多态性与中国家驴不同毛色之间的关系。结果表明:在中国家驴TYRP1基因第二内含子中检测到1个SNP位点(g.1 702A→G),该位点存在AA、AG、GG三种基因型;乌头、黑三粉、青三粉、灰三粉、白色和白化家驴的优势等位基因均为A。乌头、黑三粉和青三粉均为AA基因型频率最高,GG基因型频率最低;灰三粉为AA基因型频率最高,AG基因型频率最低(0)。在乌头、黑三粉、青三粉、灰三粉家驴中,AA基因型频率为灰三粉最高,然后依次为青三粉、黑三粉和乌头;以黑毛色为主色调的家驴(乌头、黑三粉、青三粉)GG基因型频率低于以灰毛色为主色调的家驴(灰三粉),有白毛混杂的黑三粉和青三粉的GG基因型频率低于纯黑的乌头。样本中的白色家驴和白化家驴各有2头,其基因型均为AA纯合子。说明随着中国家驴黑色被毛比例的增加,TYRP1基因g.1 702A→G位点的AA基因型频率逐渐降低,推测该位点可能与中国家驴毛色性状有关。 展开更多
关键词 中国家驴 酪氨酸酶相关蛋白1(TYRP1)基因 第二内含子 聚合酶链式反应及单链构象多态性(pcr-sscp) 毛色
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德保矮马生长激素受体基因PCR-SSCP分析 被引量：3
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作者 蒋钦杨 黄艳娜 +3 位作者 韦英明 陆广涛 言旭光 蒋和生 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第3期3-7,共5页
为了研究德保矮马生长激素受体(GHR)基因的多态性,试验根据GenBank公布的马GHR基因样序列设计了9对特异性引物,PCR扩增出德保矮马GHR基因的9个外显子片段(eoxn 2～10),单链构象多态性(SSCP)分析这些片段多态性,并进行群体遗传学分析。... 为了研究德保矮马生长激素受体(GHR)基因的多态性,试验根据GenBank公布的马GHR基因样序列设计了9对特异性引物,PCR扩增出德保矮马GHR基因的9个外显子片段(eoxn 2～10),单链构象多态性(SSCP)分析这些片段多态性,并进行群体遗传学分析。结果表明:德保矮马GHR基因9个片段中有3个片段表现出聚合酶链式反应-单链构象多态性,即E1、E3和E5,其他6个片段无多态性。E1片段表现为3种基因型AA、GG和AG型,GG型为优势基因型,G为优势等位基因;E3片段表现出4种基因型,即AA、AC、GA和GC,GA为优势基因型,A、G为优势等位基因;E5片段表现出3种基因型,即AA、AG和GG型,GG为优势基因型,G为优势等位基因。GHR基因E1、E3、E5片段均为中度多态;E1和E3片段处于Hardy-Weinberg非平衡状态,E5处于平衡状态。 展开更多
关键词 德保矮马 生长激素受体 聚合酶链式反应-单链构象多态性(pcr-sscp) 群体遗传学分析
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苏姜猪Lrh-1基因PCR-SSCP多态性及其与产仔数的关系 被引量：3
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作者 王利红 袁旭红 +4 位作者 魏萍萍 张瑞 王维 李丹 林伟 《江苏农业科学》 北大核心 2015年第5期21-25,共5页
为深入研究苏姜猪肝受体类似物质-1(Lrh-1)基因的多态性及其与产仔数性状间相关性,依据NCBI数据库中猪Lrh-1基因核酸序列设计2对引物,采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法对苏姜猪Lrh-1基因进行多态性检测。检测结果显示,... 为深入研究苏姜猪肝受体类似物质-1(Lrh-1)基因的多态性及其与产仔数性状间相关性,依据NCBI数据库中猪Lrh-1基因核酸序列设计2对引物,采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法对苏姜猪Lrh-1基因进行多态性检测。检测结果显示,引物P1 PCR扩增产物存在7种SSCP条带型,共有4个碱基突变位点,分别为27287662、27287593、27287535和27287511位;引物P2 PCR扩增产物存在2种SSCP条带型,碱基突变位于27423038位;将扩增序列与猪Lrh-1CDS区进行比对分析,其中27287662、27287593和27423038位的碱基突变位于配体结合域(LBD)区内,且突变均属同义突变,表明LBD区对于Lrh-1基因功能稳定具有重要作用;不同碱基突变位点的基因频率经群体遗传学分析,除27287511位点处于群体不平衡状态(P<0.05)外,其他位点均达群体平衡状态(P>0.05);Lrh-1基因P1和P2扩增区SSCP不同类型苏姜猪第1胎和第2胎平均产仔数间无显著差异(P>0.05)。 展开更多
关键词 苏姜猪 肝受体类似物质-1(Lrh-1) 聚合酶链式反应-单链构象多态性(pcr-sscp) 产仔数
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