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题名系统发生网络构建算法综述
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作者
王娟
郭茂祖
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机构
哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院
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出处
《智能计算机与应用》
2014年第1期32-34,37,共4页
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基金
国家自然科学基金(60932008
61172098)
+1 种基金
高等学校博士学科点专项科研基金(20112302110040)
中央高校基本科研业务费专项资金(HIT.ICRST.2010 022)
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文摘
物种的进化史通常被描述成一棵有根系统树,但是当物种进化过程中发生网状进化事件(如,杂交、重组和水平基因转移)时,物种的进化史不再适合被描述成系统树。系统发生网络是系统树的一般化,也是被用来描述物种的进化史,并可以描述物种的网状进化事件。而且系统发生网络也可以可视化冲突数据集,如由不同的基因得到的物种树。因此,系统发生网络的研究是生物信息的一个重要领域。介绍了系统发生网络的概念、发展、研究现状,总结了现有的系统发生网络构建算法。
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关键词
系统发生网络
网状进化事件
隐式网络
显式网络
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Keywords
Phylogenetic Network
Reticulate Event
Abstract Network
Explicit Network
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分类号
TP301
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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