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应用rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术对山羊瘤胃细菌多样性的研究
被引量:
22
1
作者
石鹏君
柏映国
+6 位作者
袁铁铮
姚斌
范云六
周志刚
孟昆
伍宁丰
刁其玉
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期285-289,共5页
采用免培养的rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)对3种山羊(波尔山羊,内蒙古绒山羊,四川南江黄羊)瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示rpoBDGGE图谱中条带数目少于16S rDNA图谱,并且条带分离效果明显,更有...
采用免培养的rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)对3种山羊(波尔山羊,内蒙古绒山羊,四川南江黄羊)瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示rpoBDGGE图谱中条带数目少于16S rDNA图谱,并且条带分离效果明显,更有利于分析瘤胃细菌群落组成。从两种DGGE图谱中均可以发现3种山羊瘤胃细菌具有一定的相似性,种内个体间相似性明显高于种间相似性,这说明寄主品种是影响瘤胃细菌种群构成的一个重要因素。同时进行了部分优势细菌16S rDNA基因V6-V8区序列的系统发育分析。基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有4条克隆的序列与基因库最相似菌的相似性大于97%,余下的克隆序列相似性在89%~96%之间,其中13条序列的与之相似性最高的序列均来自于未被鉴定的瘤胃细菌。
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关键词
DGGE
16S
RDNA
基因
编码
rna聚合酶
β
亚基
(
rpob
)
基因
瘤胃细菌
遗传多样性
下载PDF
职称材料
题名
应用rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术对山羊瘤胃细菌多样性的研究
被引量:
22
1
作者
石鹏君
柏映国
袁铁铮
姚斌
范云六
周志刚
孟昆
伍宁丰
刁其玉
机构
中国农业科学院饲料研究所
中国农业科学院生物技术研究所
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第2期285-289,共5页
基金
国际科技合作重点项目计划(2004DFA06800)
中央级科研院所社会公益研究专项资助(2005DIB4J038)~~
文摘
采用免培养的rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)对3种山羊(波尔山羊,内蒙古绒山羊,四川南江黄羊)瘤胃细菌优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示rpoBDGGE图谱中条带数目少于16S rDNA图谱,并且条带分离效果明显,更有利于分析瘤胃细菌群落组成。从两种DGGE图谱中均可以发现3种山羊瘤胃细菌具有一定的相似性,种内个体间相似性明显高于种间相似性,这说明寄主品种是影响瘤胃细菌种群构成的一个重要因素。同时进行了部分优势细菌16S rDNA基因V6-V8区序列的系统发育分析。基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有4条克隆的序列与基因库最相似菌的相似性大于97%,余下的克隆序列相似性在89%~96%之间,其中13条序列的与之相似性最高的序列均来自于未被鉴定的瘤胃细菌。
关键词
DGGE
16S
RDNA
基因
编码
rna聚合酶
β
亚基
(
rpob
)
基因
瘤胃细菌
遗传多样性
Keywords
DGGE
16S rDNA gene
rpob
gene
rumen bacteria
bacterial diversity
分类号
S852.6 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用rpoB和16S rDNA基因的变性梯度凝胶电泳技术对山羊瘤胃细菌多样性的研究
石鹏君
柏映国
袁铁铮
姚斌
范云六
周志刚
孟昆
伍宁丰
刁其玉
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
22
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