目的研究硫嘌呤甲基转移酶(thiopurine S-methyltransferase,TPMT)基因编码区突变及多态性在急性白血病(acute leukemia,AL)患儿和健康儿童中的分布情况。方法应用逆转录聚合酶链变性梯度凝胶电泳结合DNA直接测序技术,对53例AL...目的研究硫嘌呤甲基转移酶(thiopurine S-methyltransferase,TPMT)基因编码区突变及多态性在急性白血病(acute leukemia,AL)患儿和健康儿童中的分布情况。方法应用逆转录聚合酶链变性梯度凝胶电泳结合DNA直接测序技术,对53例AL患儿和115名健康儿童的cDNAs进行了TPMT突变及多态性的筛查与鉴定,分析各基因型在两组之间的分布差异。结果在健康儿童组TPM丁中发现2个国内外未见报道的基因突变位点:210C〉T(C70C)和622T〉C(F208L)杂合子各1例,提交至GenBankdbsNP,分别获NCBI—SS序列号:107796292、107795933。鉴定了2种已知的编码区单核苷酸多态性(single—nucleotide polymorphisms within the coding region,cSNPs),474T〉C(11581)即TPMT*1S和719A〉G(T240C)即TPMT*3C在中国AL患儿及健康儿童中的等位基因频率,分别为14.2%,2.83%与17.0%,3.04%,等位基因总频率分别为16.2%,2.99%。两种cSNPs在两组人群的等位基因频率差异无统计学意义。结论发现了两个新的基因突变位点,提供了为预测不同个体间对硫嘌呤类药物潜在敏感性差异的遗传学标志。确定了两种已知cSNPs在中国AL患儿及健康儿童中的基因型分布和等位基因频率,发现它们与白血病的易感性无相关性。展开更多
目的探讨基于SNaPshot技术的精液特异性编码区单核苷酸多态性(coding region single nucleo⁃tide polymorphism,cSNP)遗传标记检测在精液(斑)溯源及混合体液(斑)鉴定中的可行性。方法制备16例精液斑和11例精液-静脉血混合斑样本,提取其...目的探讨基于SNaPshot技术的精液特异性编码区单核苷酸多态性(coding region single nucleo⁃tide polymorphism,cSNP)遗传标记检测在精液(斑)溯源及混合体液(斑)鉴定中的可行性。方法制备16例精液斑和11例精液-静脉血混合斑样本,提取其基因组DNA(genomic DNA,gDNA)和总RNA,并将总RNA逆转录为互补DNA(complementary DNA,cDNA)。在已验证的精液特异性mRNA编码基因上筛选cSNP遗传标记。基于SNaPshot技术构建cSNP复合检测体系并通过CE对样本进行基因分型。结果成功构建了包含5个精液特异性cSNP的复合检测体系。在16例精液样本中,除了位于TGM4基因上的cSNP在cDNA的检测结果中出现等位基因丢失外,其余cSNP的gDNA和cDNA分型结果高度一致。检测精液-静脉血混合斑时,检出的cSNP分型结果均与精液提供者的基因型一致,未受到静脉血提供者基因型的干扰。结论应用SNaPshot技术检测精液特异性cSNP的方法可以应用于法医学精液(斑)的基因分型,并为混合体液(斑)中精液来源个体的判定提供信息。展开更多
文摘目的研究硫嘌呤甲基转移酶(thiopurine S-methyltransferase,TPMT)基因编码区突变及多态性在急性白血病(acute leukemia,AL)患儿和健康儿童中的分布情况。方法应用逆转录聚合酶链变性梯度凝胶电泳结合DNA直接测序技术,对53例AL患儿和115名健康儿童的cDNAs进行了TPMT突变及多态性的筛查与鉴定,分析各基因型在两组之间的分布差异。结果在健康儿童组TPM丁中发现2个国内外未见报道的基因突变位点:210C〉T(C70C)和622T〉C(F208L)杂合子各1例,提交至GenBankdbsNP,分别获NCBI—SS序列号:107796292、107795933。鉴定了2种已知的编码区单核苷酸多态性(single—nucleotide polymorphisms within the coding region,cSNPs),474T〉C(11581)即TPMT*1S和719A〉G(T240C)即TPMT*3C在中国AL患儿及健康儿童中的等位基因频率,分别为14.2%,2.83%与17.0%,3.04%,等位基因总频率分别为16.2%,2.99%。两种cSNPs在两组人群的等位基因频率差异无统计学意义。结论发现了两个新的基因突变位点,提供了为预测不同个体间对硫嘌呤类药物潜在敏感性差异的遗传学标志。确定了两种已知cSNPs在中国AL患儿及健康儿童中的基因型分布和等位基因频率,发现它们与白血病的易感性无相关性。
文摘目的探讨基于SNaPshot技术的精液特异性编码区单核苷酸多态性(coding region single nucleo⁃tide polymorphism,cSNP)遗传标记检测在精液(斑)溯源及混合体液(斑)鉴定中的可行性。方法制备16例精液斑和11例精液-静脉血混合斑样本,提取其基因组DNA(genomic DNA,gDNA)和总RNA,并将总RNA逆转录为互补DNA(complementary DNA,cDNA)。在已验证的精液特异性mRNA编码基因上筛选cSNP遗传标记。基于SNaPshot技术构建cSNP复合检测体系并通过CE对样本进行基因分型。结果成功构建了包含5个精液特异性cSNP的复合检测体系。在16例精液样本中,除了位于TGM4基因上的cSNP在cDNA的检测结果中出现等位基因丢失外,其余cSNP的gDNA和cDNA分型结果高度一致。检测精液-静脉血混合斑时,检出的cSNP分型结果均与精液提供者的基因型一致,未受到静脉血提供者基因型的干扰。结论应用SNaPshot技术检测精液特异性cSNP的方法可以应用于法医学精液(斑)的基因分型,并为混合体液(斑)中精液来源个体的判定提供信息。