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褪黑激素对PDGFA基因在绒山羊皮肤毛囊中表达模式的影响
被引量：
6
1
作者
丽春
张文广
+14 位作者
杨文柱
王志新
张永斌
高爱琴
张燕军
赵艳红
苏蕊
常子丽
金鑫
王鹏宇
冯林
刘慧
武瑞兵
王瑞军
李金泉
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期2031-2039,共9页
【目的】探讨血小板衍生生长因子A(platelet-derived growth factor A,PDGFA)在内蒙古阿尔巴斯绒山羊皮肤毛囊上的表达规律和褪黑激素对其的影响。【方法】选择体重和产绒量相当的阿尔巴斯绒山羊成年母羊,分为4组,即从不埋植的对照组和...
【目的】探讨血小板衍生生长因子A(platelet-derived growth factor A,PDGFA)在内蒙古阿尔巴斯绒山羊皮肤毛囊上的表达规律和褪黑激素对其的影响。【方法】选择体重和产绒量相当的阿尔巴斯绒山羊成年母羊,分为4组,即从不埋植的对照组和3组不同时间埋植褪黑激素的试验组。试验组在埋植期间每隔一个月按照2 mg kg-1BW的剂量在绒山羊耳后皮下埋植褪黑激素。采集12个月(从2009年8月至2010年7月)的受试羊体侧部皮肤样品,用定量逆转录PCR(qRT-PCR)检测皮肤中PDGFA基因的表达量。【结果】各组间PDGFA基因的表达模式不同。对照组在11月时其表达量为全年最低,在12月,随着毛囊周期性生长缓慢进入退行期,其PDGFA基因的表达量也缓慢上升,并在休止期(1—4月)高度表达。而开始埋植褪黑激素后,仅第二年埋植组在翌年1月时表达量显著提高(P<0.05);在2月与连续两年埋植组一样,随着绒毛开始脱落,PDGFA基因的表达量也有下降趋势;到5月,其表达量显著低于1月(P<0.05),此时新一轮的绒毛已长出体表。停止埋植褪黑激素后,仅第一年埋植组翌年PDGFA基因的表达模式和毛囊生长周期与对照组基本一致。【结论】绒山羊皮肤组织当中PDGFA基因在毛囊生长期低表达,退行期和休止期高表达。埋植褪黑激素可缩短毛囊生长周期。PDGFA基因是一个控制毛囊从兴盛期向退行期和休止期转化的因子。
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关键词
褪黑激素
血小板
生长
因子A基因
皮肤毛囊
绒毛
生长
周期
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职称材料
基于高通量转录组测序阿尔巴斯型绒山羊绒毛生长周期差异表达基因分析
被引量：
2
2
作者
赵濛
刘志红
+5 位作者
奈日乐
谢遇春
马丽娜
米璐
李金泉
李婕
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期69-81,共13页
为研究绒山羊绒毛生长周期内皮肤基因表达规律以及皮肤差异表达基因的挖掘,采用Illumina HiSeqTM2000高通量转录组测序平台RNA-Seq技术,对3只成年雌性阿尔巴斯型内蒙古绒山羊全年12个月的皮肤样本进行转录组测序,将无参考基因组de novo...
为研究绒山羊绒毛生长周期内皮肤基因表达规律以及皮肤差异表达基因的挖掘,采用Illumina HiSeqTM2000高通量转录组测序平台RNA-Seq技术,对3只成年雌性阿尔巴斯型内蒙古绒山羊全年12个月的皮肤样本进行转录组测序,将无参考基因组de novo拼接组装的unigene运用Nr,GO,COG以及KEGG数据库进行比对注释,并进行差异基因在全年各月份间的变化规律分析。结果显示,测序获得的unigene数为105 854条,比对注释基因55 541个,其中共有51 078条转录本进行了GO注释,21 189条转录本在COG数据库分析得到注释,26 201条预测基因KEGG数据库比对成功。其中皮肤基因GO注释在生物学功能分类中,细胞过程、代谢过程、生物学调控、生物功能调控以及刺激应答方面注释到的转录本比例最大;在分子功能分类中,结合以及催化活性作用方面注释到的转录本比例最大;通过COG数据库的比对注释,看到皮肤表达基因的同源蛋白功能主要集中在基因转录、翻译后修饰、和信号传导机制方面,反而在同工酶转运和代谢、细胞动力、二级代谢生物合成、转运和催化以及核结构方面注释到的基因极少;皮肤转录组数据与KEGG数据库比对,得到皮肤相关转录本较为富集的几条通路分别为MAPK signaling pathway,Wnt signaling pathway,Notch signaling pathway,Hedgehog signaling pathway,TGF-βsignaling pathway,JAK-STAT signaling pathway以及Focal signaling pathway;通过绒山羊不同月份皮肤转录组测序数据进行差异基因分析,得出绒山羊全年皮肤生长周期中基因差异变化规律为绒山羊全年皮肤共有4次较为剧烈的基因差异变化,第1次发生在2月与3月之间,第2次发生在3月与4月之间,第3次发生在6月与7月之间,第4次发生在10月与11月之间,前2次出现的基因差异变化较后2次剧烈得多,说明绒山羊绒毛生长启动时基因变化剧烈,而绒毛生长到休止时的皮肤基因变化较为缓和,
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关键词
绒山羊
转录组
差异表达基因
皮肤
绒毛
生长
周期
原文传递
题名
褪黑激素对PDGFA基因在绒山羊皮肤毛囊中表达模式的影响
被引量：
6
1
作者
丽春
张文广
杨文柱
王志新
张永斌
高爱琴
张燕军
赵艳红
苏蕊
常子丽
金鑫
王鹏宇
冯林
刘慧
武瑞兵
王瑞军
李金泉
机构
内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室
内蒙古白绒山羊种羊场
加拿大农业食品部
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期2031-2039,共9页
基金
现代农业产业技术体系建设专项资金(ZARS-40-05)
文摘
【目的】探讨血小板衍生生长因子A(platelet-derived growth factor A,PDGFA)在内蒙古阿尔巴斯绒山羊皮肤毛囊上的表达规律和褪黑激素对其的影响。【方法】选择体重和产绒量相当的阿尔巴斯绒山羊成年母羊,分为4组,即从不埋植的对照组和3组不同时间埋植褪黑激素的试验组。试验组在埋植期间每隔一个月按照2 mg kg-1BW的剂量在绒山羊耳后皮下埋植褪黑激素。采集12个月(从2009年8月至2010年7月)的受试羊体侧部皮肤样品,用定量逆转录PCR(qRT-PCR)检测皮肤中PDGFA基因的表达量。【结果】各组间PDGFA基因的表达模式不同。对照组在11月时其表达量为全年最低,在12月,随着毛囊周期性生长缓慢进入退行期,其PDGFA基因的表达量也缓慢上升,并在休止期(1—4月)高度表达。而开始埋植褪黑激素后,仅第二年埋植组在翌年1月时表达量显著提高(P<0.05);在2月与连续两年埋植组一样,随着绒毛开始脱落,PDGFA基因的表达量也有下降趋势;到5月,其表达量显著低于1月(P<0.05),此时新一轮的绒毛已长出体表。停止埋植褪黑激素后,仅第一年埋植组翌年PDGFA基因的表达模式和毛囊生长周期与对照组基本一致。【结论】绒山羊皮肤组织当中PDGFA基因在毛囊生长期低表达,退行期和休止期高表达。埋植褪黑激素可缩短毛囊生长周期。PDGFA基因是一个控制毛囊从兴盛期向退行期和休止期转化的因子。
关键词
褪黑激素
血小板
生长
因子A基因
皮肤毛囊
绒毛
生长
周期
Keywords
melatonin
platelet-derived growth factor A gene
skin hair follicle
hair growth circle
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
基于高通量转录组测序阿尔巴斯型绒山羊绒毛生长周期差异表达基因分析
被引量：
2
2
作者
赵濛
刘志红
奈日乐
谢遇春
马丽娜
米璐
李金泉
李婕
机构
内蒙古农业大学动物科学学院
内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室
东北农业大学动物科学技术学院
出处
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第2期69-81,共13页
基金
国家自然科学基金项目(31660640)
国家重点研发计划(2018YFD0502003)
+1 种基金
内蒙古自然科学基金项目(2017MS0356
2016ZD02)
文摘
为研究绒山羊绒毛生长周期内皮肤基因表达规律以及皮肤差异表达基因的挖掘,采用Illumina HiSeqTM2000高通量转录组测序平台RNA-Seq技术,对3只成年雌性阿尔巴斯型内蒙古绒山羊全年12个月的皮肤样本进行转录组测序,将无参考基因组de novo拼接组装的unigene运用Nr,GO,COG以及KEGG数据库进行比对注释,并进行差异基因在全年各月份间的变化规律分析。结果显示,测序获得的unigene数为105 854条,比对注释基因55 541个,其中共有51 078条转录本进行了GO注释,21 189条转录本在COG数据库分析得到注释,26 201条预测基因KEGG数据库比对成功。其中皮肤基因GO注释在生物学功能分类中,细胞过程、代谢过程、生物学调控、生物功能调控以及刺激应答方面注释到的转录本比例最大;在分子功能分类中,结合以及催化活性作用方面注释到的转录本比例最大;通过COG数据库的比对注释,看到皮肤表达基因的同源蛋白功能主要集中在基因转录、翻译后修饰、和信号传导机制方面,反而在同工酶转运和代谢、细胞动力、二级代谢生物合成、转运和催化以及核结构方面注释到的基因极少;皮肤转录组数据与KEGG数据库比对,得到皮肤相关转录本较为富集的几条通路分别为MAPK signaling pathway,Wnt signaling pathway,Notch signaling pathway,Hedgehog signaling pathway,TGF-βsignaling pathway,JAK-STAT signaling pathway以及Focal signaling pathway;通过绒山羊不同月份皮肤转录组测序数据进行差异基因分析,得出绒山羊全年皮肤生长周期中基因差异变化规律为绒山羊全年皮肤共有4次较为剧烈的基因差异变化,第1次发生在2月与3月之间,第2次发生在3月与4月之间,第3次发生在6月与7月之间,第4次发生在10月与11月之间,前2次出现的基因差异变化较后2次剧烈得多,说明绒山羊绒毛生长启动时基因变化剧烈,而绒毛生长到休止时的皮肤基因变化较为缓和,
关键词
绒山羊
转录组
差异表达基因
皮肤
绒毛
生长
周期
Keywords
caprine
transcriptomes
differentially expressed genes
skin
cycle of follicle growth
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
褪黑激素对PDGFA基因在绒山羊皮肤毛囊中表达模式的影响
丽春
张文广
杨文柱
王志新
张永斌
高爱琴
张燕军
赵艳红
苏蕊
常子丽
金鑫
王鹏宇
冯林
刘慧
武瑞兵
王瑞军
李金泉
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012
6
下载PDF
职称材料
2
基于高通量转录组测序阿尔巴斯型绒山羊绒毛生长周期差异表达基因分析
赵濛
刘志红
奈日乐
谢遇春
马丽娜
米璐
李金泉
李婕
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
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