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活细胞内亚细胞结构蛋白质组学研究新技术——几种邻近标记策略的应用及比较
被引量：
3
1
作者
杜阳春
唐菁兰
+1 位作者
王友军
张晓嫣
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期641-653,共13页
真核细胞内多种无膜及有膜细胞器为各种生物学过程的发生提供场所.被膜细胞器通过它们之间的膜接触位点所进行的信息交流和物质交换是维持生命活动所必需的.绘制活细胞中细胞器或膜接触位点等处的蛋白质组图谱,将有助于解析这些部位的...
真核细胞内多种无膜及有膜细胞器为各种生物学过程的发生提供场所.被膜细胞器通过它们之间的膜接触位点所进行的信息交流和物质交换是维持生命活动所必需的.绘制活细胞中细胞器或膜接触位点等处的蛋白质组图谱,将有助于解析这些部位的生物学功能及作用机制,并为研究细胞器相互作用提供基础.但由于无膜细胞器或膜接触位点很难分离纯化,传统的生化方法难以系统解析其中的蛋白质组.最近报道的几种基于酶类的蛋白质邻近标记技术,则为系统分析上述空间受限的蛋白质组这一难题提供了有效的解决方案.通过将能催化产生活性自由基(最常见的是生物素及其衍生物的自由基)的酶连接到目标蛋白上,可对其邻近的蛋白质组进行共价标记,从而使后者的分离和鉴定成为可能,并可以运用于活细胞中的动态标记.我们在此综述了几种最新的邻近标记策略的原理及应用,并对它们的优势与局限性进行了比较,以期为细胞器互作的蛋白质组学研究提供参考.
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关键词
细胞器
蛋白质
组
膜接触位点
亚
细胞
区室
蛋白质
相互作用
邻近标记
BirA
APEX
BioID
TurboID
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职称材料
胃癌细胞高尔基体的蛋白质组学技术平台的建立
被引量：
3
2
作者
何婷婷
易永芬
+1 位作者
李艳青
肖钟
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期27-31,共5页
采用蔗糖密度梯度超速离心法分离纯化高尔基体,双向凝胶电泳(2-DE)分离高尔基体蛋白质,用ImageMaster 2D软件分析所得图谱,基质辅助激光解吸离子化飞行时间质谱(MALDI—TOF MS)鉴定蛋白质点等一系列亚细胞器蛋白质组学方法建立胃癌细胞...
采用蔗糖密度梯度超速离心法分离纯化高尔基体,双向凝胶电泳(2-DE)分离高尔基体蛋白质,用ImageMaster 2D软件分析所得图谱,基质辅助激光解吸离子化飞行时间质谱(MALDI—TOF MS)鉴定蛋白质点等一系列亚细胞器蛋白质组学方法建立胃癌细胞内高尔基体的蛋白图谱。结果显示分离出的纯度较高的高尔基体建立了分辨率和重复性均较好的双向电泳图谱,运用质谱技术鉴定出12个蛋白质,包括蛋白合成相关蛋白、膜融合蛋白、调节蛋白、凋亡相关蛋白、运输蛋白、细胞增殖分化相关蛋白。通过亚细胞器分离纯化,双向电泳的蛋白分离及MALDI-TOF MS蛋白鉴定分析,首次成功建立了胃癌细胞SGC7901中高尔基体的蛋白质组学技术路线,为胃癌细胞内高尔基体功能的深入研究奠定了基础。
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关键词
胃癌
细胞
高尔基体
亚
细胞器
蛋白质
组
学
亚
细胞器
分离
原文传递
题名
活细胞内亚细胞结构蛋白质组学研究新技术——几种邻近标记策略的应用及比较
被引量：
3
1
作者
杜阳春
唐菁兰
王友军
张晓嫣
机构
北京师范大学生命科学学院细胞所
北京师范大学生命科学学院遗传与发育生物所
清华大学附属中学国际部
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期641-653,共13页
基金
国家自然科学基金面上项目(31671492)
北京师范大学细胞增殖及调控生物学教育部重点实验室开放基金资助项目~~
文摘
真核细胞内多种无膜及有膜细胞器为各种生物学过程的发生提供场所.被膜细胞器通过它们之间的膜接触位点所进行的信息交流和物质交换是维持生命活动所必需的.绘制活细胞中细胞器或膜接触位点等处的蛋白质组图谱,将有助于解析这些部位的生物学功能及作用机制,并为研究细胞器相互作用提供基础.但由于无膜细胞器或膜接触位点很难分离纯化,传统的生化方法难以系统解析其中的蛋白质组.最近报道的几种基于酶类的蛋白质邻近标记技术,则为系统分析上述空间受限的蛋白质组这一难题提供了有效的解决方案.通过将能催化产生活性自由基(最常见的是生物素及其衍生物的自由基)的酶连接到目标蛋白上,可对其邻近的蛋白质组进行共价标记,从而使后者的分离和鉴定成为可能,并可以运用于活细胞中的动态标记.我们在此综述了几种最新的邻近标记策略的原理及应用,并对它们的优势与局限性进行了比较,以期为细胞器互作的蛋白质组学研究提供参考.
关键词
细胞器
蛋白质
组
膜接触位点
亚
细胞
区室
蛋白质
相互作用
邻近标记
BirA
APEX
BioID
TurboID
Keywords
membrane contact site(MCS)
subcellular proteomics
protein protein interactions(PPIs)
BirA
APEX
BioID
TurboID
分类号
Q26 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
胃癌细胞高尔基体的蛋白质组学技术平台的建立
被引量：
3
2
作者
何婷婷
易永芬
李艳青
肖钟
机构
重庆医科大学基础医学院病理学教研室分子医学与肿瘤研究中心
出处
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期27-31,共5页
基金
国家自然科学基金(30672431)
教育部博士点基金(20060631006)资助项目
文摘
采用蔗糖密度梯度超速离心法分离纯化高尔基体,双向凝胶电泳(2-DE)分离高尔基体蛋白质,用ImageMaster 2D软件分析所得图谱,基质辅助激光解吸离子化飞行时间质谱(MALDI—TOF MS)鉴定蛋白质点等一系列亚细胞器蛋白质组学方法建立胃癌细胞内高尔基体的蛋白图谱。结果显示分离出的纯度较高的高尔基体建立了分辨率和重复性均较好的双向电泳图谱,运用质谱技术鉴定出12个蛋白质,包括蛋白合成相关蛋白、膜融合蛋白、调节蛋白、凋亡相关蛋白、运输蛋白、细胞增殖分化相关蛋白。通过亚细胞器分离纯化,双向电泳的蛋白分离及MALDI-TOF MS蛋白鉴定分析,首次成功建立了胃癌细胞SGC7901中高尔基体的蛋白质组学技术路线,为胃癌细胞内高尔基体功能的深入研究奠定了基础。
关键词
胃癌
细胞
高尔基体
亚
细胞器
蛋白质
组
学
亚
细胞器
分离
Keywords
Gastric cancer cell Golgi apparatus Subcellular proteome Subcellular separation
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
R318.04 [医药卫生—临床医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
活细胞内亚细胞结构蛋白质组学研究新技术——几种邻近标记策略的应用及比较
杜阳春
唐菁兰
王友军
张晓嫣
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
下载PDF
职称材料
2
胃癌细胞高尔基体的蛋白质组学技术平台的建立
何婷婷
易永芬
李艳青
肖钟
《中国生物工程杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
原文传递
已选择
0
条
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