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池蝶蚌组织蛋白酶L1-like基因的克隆及表达特征分析
被引量:
1
1
作者
彭扣
胡蓓娟
+5 位作者
赵大显
王军花
盛军庆
吴娣
史建伍
洪一江
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期1556-1566,共11页
为了解淡水贝类是否存在组织蛋白酶L的亚型及其亚型的免疫相关作用,本实验利用已构建的池蝶蚌血细胞全长c DNA文库,筛选获得与之同源的EST序列,结合RACE技术进一步克隆了池蝶蚌一个新的组织蛋白酶L基因的c DNA全长,命名为Hs Cts L1-lik...
为了解淡水贝类是否存在组织蛋白酶L的亚型及其亚型的免疫相关作用,本实验利用已构建的池蝶蚌血细胞全长c DNA文库,筛选获得与之同源的EST序列,结合RACE技术进一步克隆了池蝶蚌一个新的组织蛋白酶L基因的c DNA全长,命名为Hs Cts L1-like基因(Gen Bank登录号为KF015273)。该序列全长为1280 bp,5′-非翻译区(5′UTR)为31 bp,3′-非翻译区(3′UTR)为256 bp,开放阅读框区(ORF)为993 bp,编码330个氨基酸,预测蛋白相对分子量为36.86 ku,理论等电点为6.23。序列分析结果显示,Hs Cts L1-like与其他软体动物相对应序列具有共同结构特征,包含信号肽、前肽抑制域和成熟肽三部分,在其他物种中已鉴定的Cts L签名序列标签(ERF/WNIN、GNFD、GCXGG和QCHN等)在Hs Cts L1-like中均可找到。其氨基酸序列同缢蛏Cts L1(AGL33704.1)同源性最高,达67%;与报道的三角帆蚌Cts L(ADV03094)和池蝶蚌中另一个Cts L(AEX88474)仅均为52.91%;系统进化分析表明,Hs Cts L1-like与缢蛏、长牡蛎和合浦珠母贝的Cts L1聚为一分支,推测Hs Cts L1-like属于Cts L家族中的亚型1。实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测显示,Hs Cts L1-like m RNA在肝脏中表达量最高,其次是卵巢和精巢。注射鳗弧菌后,血细胞和肝脏Hs Cts L1-like m RNA转录水平显著升高,暗示其是一个免疫有关的基因,参与了池蝶蚌的先天免疫应答反应。
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关键词
池蝶蚌
组织
蛋白酶
l
1-
like
组织
表达
克隆
序列分析
Q
RT-PCR
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职称材料
题名
池蝶蚌组织蛋白酶L1-like基因的克隆及表达特征分析
被引量:
1
1
作者
彭扣
胡蓓娟
赵大显
王军花
盛军庆
吴娣
史建伍
洪一江
机构
南昌大学生命科学学院
出处
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期1556-1566,共11页
基金
江西省科技支撑项目(20121BBF60036)
江西省自然科学基金(20151BAB204035)
+4 种基金
江西省教育厅自然科学青年基金项目(GJJ14219)
江西省科技落地项目(KJLD12001)
国家自然科学基金(31260282
31260642
31160534)~~
文摘
为了解淡水贝类是否存在组织蛋白酶L的亚型及其亚型的免疫相关作用,本实验利用已构建的池蝶蚌血细胞全长c DNA文库,筛选获得与之同源的EST序列,结合RACE技术进一步克隆了池蝶蚌一个新的组织蛋白酶L基因的c DNA全长,命名为Hs Cts L1-like基因(Gen Bank登录号为KF015273)。该序列全长为1280 bp,5′-非翻译区(5′UTR)为31 bp,3′-非翻译区(3′UTR)为256 bp,开放阅读框区(ORF)为993 bp,编码330个氨基酸,预测蛋白相对分子量为36.86 ku,理论等电点为6.23。序列分析结果显示,Hs Cts L1-like与其他软体动物相对应序列具有共同结构特征,包含信号肽、前肽抑制域和成熟肽三部分,在其他物种中已鉴定的Cts L签名序列标签(ERF/WNIN、GNFD、GCXGG和QCHN等)在Hs Cts L1-like中均可找到。其氨基酸序列同缢蛏Cts L1(AGL33704.1)同源性最高,达67%;与报道的三角帆蚌Cts L(ADV03094)和池蝶蚌中另一个Cts L(AEX88474)仅均为52.91%;系统进化分析表明,Hs Cts L1-like与缢蛏、长牡蛎和合浦珠母贝的Cts L1聚为一分支,推测Hs Cts L1-like属于Cts L家族中的亚型1。实时荧光定量PCR(q RT-PCR)检测显示,Hs Cts L1-like m RNA在肝脏中表达量最高,其次是卵巢和精巢。注射鳗弧菌后,血细胞和肝脏Hs Cts L1-like m RNA转录水平显著升高,暗示其是一个免疫有关的基因,参与了池蝶蚌的先天免疫应答反应。
关键词
池蝶蚌
组织
蛋白酶
l
1-
like
组织
表达
克隆
序列分析
Q
RT-PCR
Keywords
Hyriopsis sch
l
ege
l
ii
cathepsin
l
1-
like
(Cts
l
1-
like
)
tissues expression
c
l
oning
sequence ana
l
ysis
qRT-PCR
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
池蝶蚌组织蛋白酶L1-like基因的克隆及表达特征分析
彭扣
胡蓓娟
赵大显
王军花
盛军庆
吴娣
史建伍
洪一江
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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