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题名罗氏沼虾组织和性别特异性表达基因的挖掘研究
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作者
任晋东
陈红林
牛宝龙
詹炜
楼宝
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机构
浙江省农业科学院水生生物研究所
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出处
《水产养殖》
CAS
2022年第8期1-7,71,共8页
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基金
浙江省自然科学基金(LY21C190001)
浙江省科技计划项目(2020C02014)。
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文摘
为挖掘罗氏沼虾消化和性别决定主要器官发育规律及个体器官成熟标记(Marker),利用组织特性参数(τ)等分析技术,对性成熟罗氏沼虾的消化和性别决定关键组织器官(眼柄、肝胰腺、精巢、促雄性腺和卵巢)进行转录组表达分析研究。结果表明,5个器官组织的组织特异性高表达基因数依次分别为1 874,2 700,1 698,270和4 216个;以τ≥0.85为条件,鉴定获得组织特异性高表达基因数依次分别为864,1 421, 1 550,254和4 457个;以τ≥1为条件,鉴定获得组织唯一高表达基因数依次分别为33,29,39,5和729个。5个器官组织唯一表达量最高基因的KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)功能研究表明,视紫红质、抗原样蛋白E异构体、rho鸟嘌呤核苷酸交换因子7、四域蛋白酶类抑制剂和血细胞素异构体X2分别在5个组织中显著高表达,且与组织功能显著相关,分别具有成为5个器官组织发育成熟标记(Marker)的特征。发现雄性特异高表达基因162个和雌性特异高表达基因293个,在雄性和雌性中均发现性别特异性,且各组织均匀稳定表达基因KEGG功能分别注释为假设蛋白和核糖体蛋白L28,且二者相对表达量在同性不同组织间变异系数均<0.5,具有作为罗氏沼虾性别发育成熟标记(Marker)的特征。
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关键词
罗氏沼虾
组织特异性
性别特异基因
组织特异性参数
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Keywords
Macrobrachium rosenbergii
Tissue-specific
Sex-specific genes
Tissue-specific parameters
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分类号
Q786
[生物学—分子生物学]
S966.12
[农业科学—水产养殖]
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