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基于全基因组关联分析探究汉族青年12周抗阻训练增肌效果遗传机制
1
作者
顾壮壮
梁丽娟
+2 位作者
梁妍
张之豪
李燕春
《北京体育大学学报》
CSSCI
北大核心
2024年第3期108-123,共16页
目的:通过全基因组关联分析筛选与汉族青年12周抗阻训练增肌效果关联的遗传分子标记,并结合生物信息学方法探究新发现的遗传分子标记影响抗阻训练增肌效果的可能机制,进一步构建多基因预测分数模型(Polygenic Scores,PGS)为精准化抗阻...
目的:通过全基因组关联分析筛选与汉族青年12周抗阻训练增肌效果关联的遗传分子标记,并结合生物信息学方法探究新发现的遗传分子标记影响抗阻训练增肌效果的可能机制,进一步构建多基因预测分数模型(Polygenic Scores,PGS)为精准化抗阻训练方案的制定提供参考。方法:187名久坐汉族青年完成12周抗阻训练(男性占比:48.53%),联合股四头肌中段厚度(Quadriceps Muscle Thickness,THK-QUAD)和全身瘦体重(lean-body mass,LBM)变化评测增肌效果。抽取静脉血5 mL,采用TIANGEN DNA提取试剂盒提取受试者的DNA,应用Illumina Infinium CGA-24v1-0芯片进行基因分型。,采用全基因组关联分析和生物信息学分析方法完成数据分析。结果:1)12周抗阻训练后,LBM和THK-QUAD均表现出极显著提升(P<0.01),但△LBM和△THK-QUAD的变异系数分别为0.84和0.60,提示具有较大的个体差异性;2)GWAS分析发现9个SNPs与△LBM存在显著关联(P<1×10^(-5)),8个SNPs与△THK-QUAD存在显著关联(P<1×10^(-5));基于17个SNPs计算的PGS与△LBM和△THK-QUAD存在正相关的线性关系,R2分别为0.1236和0.3156;通过ROC曲线得出PGS低于-0.683分无法从当前运动干预中获得较高增肌效果,PGS高于-0.103分则可以在当前运动干预中取得良好的增肌效果;3)生物信息学分析提示17个SNPs可能与181种基因的表达存在关系,这181个基因富集于3种通路以及17种生物功能中,并且有5个基因(NPC1、ENDOG、MT3、SMAD4、OSBPL2)在多条通路中发挥作用。结论:本研究首次基于GWAS在汉族青年抗阻训练队列发现17个新的SNPs可用于抗阻训练增肌效果预测的遗传分子标记;富集分析发现以NPC1、ENDOG、MT3、SMAD4、OSBPL2为主的一系列基因,可能通过调节金属离子转运与细胞内稳态维持、胆固醇转运以及代谢和骨骼肌重塑过程等途径影响抗阻训练增肌效果;基于17个SNPs计算的PGS评分高于-0.103分则能够取得较好的增肌效果
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关键词
全基因组关联分析
多基因遗传分数
遗传分子标记
抗阻训练
精准
化
运动
健身
指导
方案
生物信息学
原文传递
题名
基于全基因组关联分析探究汉族青年12周抗阻训练增肌效果遗传机制
1
作者
顾壮壮
梁丽娟
梁妍
张之豪
李燕春
机构
河南师范大学体育学院
北京体育大学
出处
《北京体育大学学报》
CSSCI
北大核心
2024年第3期108-123,共16页
基金
国家重点研发计划项目“运动健康促进效果个体差异的生物学机制与健身指导方案”(项目编号:SQ2018YFC2000602)
中央高校基本科研业务费专项资金资助课题(项目编号:2015SYS009)
中央高校基本科研业务费专项资金资助(项目编号:2015SYS06)。
文摘
目的:通过全基因组关联分析筛选与汉族青年12周抗阻训练增肌效果关联的遗传分子标记,并结合生物信息学方法探究新发现的遗传分子标记影响抗阻训练增肌效果的可能机制,进一步构建多基因预测分数模型(Polygenic Scores,PGS)为精准化抗阻训练方案的制定提供参考。方法:187名久坐汉族青年完成12周抗阻训练(男性占比:48.53%),联合股四头肌中段厚度(Quadriceps Muscle Thickness,THK-QUAD)和全身瘦体重(lean-body mass,LBM)变化评测增肌效果。抽取静脉血5 mL,采用TIANGEN DNA提取试剂盒提取受试者的DNA,应用Illumina Infinium CGA-24v1-0芯片进行基因分型。,采用全基因组关联分析和生物信息学分析方法完成数据分析。结果:1)12周抗阻训练后,LBM和THK-QUAD均表现出极显著提升(P<0.01),但△LBM和△THK-QUAD的变异系数分别为0.84和0.60,提示具有较大的个体差异性;2)GWAS分析发现9个SNPs与△LBM存在显著关联(P<1×10^(-5)),8个SNPs与△THK-QUAD存在显著关联(P<1×10^(-5));基于17个SNPs计算的PGS与△LBM和△THK-QUAD存在正相关的线性关系,R2分别为0.1236和0.3156;通过ROC曲线得出PGS低于-0.683分无法从当前运动干预中获得较高增肌效果,PGS高于-0.103分则可以在当前运动干预中取得良好的增肌效果;3)生物信息学分析提示17个SNPs可能与181种基因的表达存在关系,这181个基因富集于3种通路以及17种生物功能中,并且有5个基因(NPC1、ENDOG、MT3、SMAD4、OSBPL2)在多条通路中发挥作用。结论:本研究首次基于GWAS在汉族青年抗阻训练队列发现17个新的SNPs可用于抗阻训练增肌效果预测的遗传分子标记;富集分析发现以NPC1、ENDOG、MT3、SMAD4、OSBPL2为主的一系列基因,可能通过调节金属离子转运与细胞内稳态维持、胆固醇转运以及代谢和骨骼肌重塑过程等途径影响抗阻训练增肌效果;基于17个SNPs计算的PGS评分高于-0.103分则能够取得较好的增肌效果
关键词
全基因组关联分析
多基因遗传分数
遗传分子标记
抗阻训练
精准
化
运动
健身
指导
方案
生物信息学
Keywords
genome-wide association studies
genetic markers
polygenic scores
resistance training
bioinformatics
分类号
G804.2 [文化科学—运动人体科学]
G808.1 [文化科学—体育学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于全基因组关联分析探究汉族青年12周抗阻训练增肌效果遗传机制
顾壮壮
梁丽娟
梁妍
张之豪
李燕春
《北京体育大学学报》
CSSCI
北大核心
2024
0
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