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赤子爱胜蚓蛋白磷酸酶2A类似激活剂样蛋白cDNA和氨基酸序列分析
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作者 马培元 于保锋 +5 位作者 王萱 张丽娜 田九博 穆秀丽 孟涛涛 弓韬 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2020年第3期266-270,共5页
目的分析赤子爱胜蚓蛋白磷酸酶2A(protein phosphatase 2A,PP2A)类似激活剂样蛋白的cDNA和氨基酸序列。方法从赤子爱胜蚓cDNA文库中随机测序得到目标cDNA序列,应用DNAMAN、NCBI ORF finder、BLAST、Conserved Domains、GOR、SWISS-MODEL... 目的分析赤子爱胜蚓蛋白磷酸酶2A(protein phosphatase 2A,PP2A)类似激活剂样蛋白的cDNA和氨基酸序列。方法从赤子爱胜蚓cDNA文库中随机测序得到目标cDNA序列,应用DNAMAN、NCBI ORF finder、BLAST、Conserved Domains、GOR、SWISS-MODEL、PDB等基因和蛋白质分析软件进行该目标基因测序及氨基酸序列分析。结果赤子爱胜蚓PP2A类似激活剂样蛋白cDNA序列长547 bp,编码87个氨基酸残基;与该蛋白基因序列相似度较高的多是不同物种中PP2A类似激活剂蛋白基因序列,其中与Crassostrea virginica serine/threonine-protein phosphatase 2A activator-like mRNA核苷酸相似度为67%;与该蛋白氨基酸序列相似度较高的多是不同物种中的PP2A类似激活剂蛋白氨基酸序列,其中与serine/threonine-protein phosphatase 2A activator(Crassostrea gigas)氨基酸相似度为70%;目标序列中存在一段PTPA超家族保守结构域,蛋白质二级结构以α螺旋以及无规则卷曲为主,三级预测结果与二级结构一致。结论本实验分析的赤子爱胜蚓PP2A类似激活剂样蛋白与牡蛎PP2A类似激活剂蛋白及存在于所有真核生物中且高度保守的PTPA同源度较高,可能具有特异性激活肿瘤抑制因子PP2A的间接抑制肿瘤作用。 展开更多
关键词 赤子爱胜蚓 蛋白磷酸酶2A 类似激活物样蛋白 cDNA 氨基酸 序列分析
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