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几种江蓠属海藻的ISSR标记分析
被引量:
22
1
作者
孙雪
张学成
+4 位作者
茅云翔
刘金姐
隋正红
秦松
费修绠
《高技术通讯》
EI
CAS
CSCD
2003年第9期89-93,共5页
用ISSR标记对几种江蓠属海藻进行了遗传多样性的研究。所用的7种实验材料包括4株龙须菜(其中3株分别来自中国青岛、委内瑞拉和南非,及1株青岛产龙须菜的高温选育种)和细基江蓠繁枝变型、真江蓠、芋根江蓠。用9条ISSR引物进行筛选,有6条...
用ISSR标记对几种江蓠属海藻进行了遗传多样性的研究。所用的7种实验材料包括4株龙须菜(其中3株分别来自中国青岛、委内瑞拉和南非,及1株青岛产龙须菜的高温选育种)和细基江蓠繁枝变型、真江蓠、芋根江蓠。用9条ISSR引物进行筛选,有6条可扩增出清晰可辨条带。这6条引物在7种材料中共扩增出151条带,其中117条(77.48%)表现出多态性。根据Nei等的遗传相似性系数(S)对7种材料进行分析,结果显示青岛产龙须菜与其选育种的相似性最高(S为0.939)。在3株不同产地龙须菜中,青岛龙须菜与南非龙须菜的遗传距离最近(S为0.643),委内瑞拉龙须菜与前两者的S分别为0.167和0.192,因此初步推断委内瑞拉龙须菜不属于龙须菜种。包括龙须菜(产自青岛或南非)在内的4种江蓠间的相似性系数在0~0.143之间。
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关键词
江蓠属海藻
龙须菜
ISSR标记
遗传多样性
遗传相似性
简单
串联
重复
序列
DNA
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职称材料
轮枝镰孢SSR标记开发及在玉米分离群体遗传多样性分析中的应用
被引量:
18
2
作者
任旭
朱振东
+2 位作者
李洪杰
段灿星
王晓鸣
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期52-66,共15页
【目的】开发轮枝镰孢(Fusarium verticillioides)的SSR标记,为轮枝镰孢遗传多样性研究提供技术支持。【方法】利用Fastpcr在轮枝镰孢基因组中查找符合条件的SSR位点,采用Primer5.0软件设计引物,利用NTSYS及Popgene分析来自玉米的轮枝...
【目的】开发轮枝镰孢(Fusarium verticillioides)的SSR标记,为轮枝镰孢遗传多样性研究提供技术支持。【方法】利用Fastpcr在轮枝镰孢基因组中查找符合条件的SSR位点,采用Primer5.0软件设计引物,利用NTSYS及Popgene分析来自玉米的轮枝镰孢单孢分离物群体的PCR扩增结果。【结果】共设计有效扩增SSR引物158对,经筛选,109对(69.0%)可扩增出2条及以上的条带,其中55对引物(34.8%)多态性较好,可扩增出3条及以上的条带。从11条已组装的轮枝镰孢染色体上各选出2对多态性引物,计22对引物,对66株轮枝镰孢玉米分离物进行扩增,共获得125个等位变异,变异范围为2—11个,平均为5.68个。轮枝镰孢玉米分离物之间Nei’s基因多样性指数为0.1139—0.8687,平均为0.6199,表现出较高的遗传多样性。【结论】基于轮枝镰孢基因组序列开发的SSR标记具有很好的多态性,可用于轮枝镰孢的遗传多样性分析。用22对SSR引物扩增,以遗传相似系数0.3进行划分,可将66株轮枝镰孢玉米分离物分为3群;中国轮枝镰孢玉米分离物的遗传多样性与地理分布无相关性。
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关键词
轮枝镰孢
简单
串联
重复
序列
玉米分离物
遗传多样性
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职称材料
微卫星标记技术的研究进展及其在家兔研究中的应用
被引量:
1
3
作者
朱玉峰
王元占
杨培梁
《中国养兔》
2004年第6期25-28,共4页
关键词
微卫星标记技术
家兔
简单
串联
重复
序列
分布
多态性
遗传图谱
种群间亲缘关系
下载PDF
职称材料
题名
几种江蓠属海藻的ISSR标记分析
被引量:
22
1
作者
孙雪
张学成
茅云翔
刘金姐
隋正红
秦松
费修绠
机构
中国海洋大学海洋生命学院
中国科学院海洋研究所
出处
《高技术通讯》
EI
CAS
CSCD
2003年第9期89-93,共5页
基金
国家自然科学基金(30170736)
中国科学院海洋研究所实验海洋生物实验室开放课题共同资助项目。
文摘
用ISSR标记对几种江蓠属海藻进行了遗传多样性的研究。所用的7种实验材料包括4株龙须菜(其中3株分别来自中国青岛、委内瑞拉和南非,及1株青岛产龙须菜的高温选育种)和细基江蓠繁枝变型、真江蓠、芋根江蓠。用9条ISSR引物进行筛选,有6条可扩增出清晰可辨条带。这6条引物在7种材料中共扩增出151条带,其中117条(77.48%)表现出多态性。根据Nei等的遗传相似性系数(S)对7种材料进行分析,结果显示青岛产龙须菜与其选育种的相似性最高(S为0.939)。在3株不同产地龙须菜中,青岛龙须菜与南非龙须菜的遗传距离最近(S为0.643),委内瑞拉龙须菜与前两者的S分别为0.167和0.192,因此初步推断委内瑞拉龙须菜不属于龙须菜种。包括龙须菜(产自青岛或南非)在内的4种江蓠间的相似性系数在0~0.143之间。
关键词
江蓠属海藻
龙须菜
ISSR标记
遗传多样性
遗传相似性
简单
串联
重复
序列
DNA
Keywords
Gracilaria, G. lemaneiformis, ISSR, Genetic diversity
分类号
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
轮枝镰孢SSR标记开发及在玉米分离群体遗传多样性分析中的应用
被引量:
18
2
作者
任旭
朱振东
李洪杰
段灿星
王晓鸣
机构
中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大工程
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期52-66,共15页
基金
国家科技支撑计划项目(2006BAD08A06)
国家现代农业(玉米)产业技术体系(CARS-02)
文摘
【目的】开发轮枝镰孢(Fusarium verticillioides)的SSR标记,为轮枝镰孢遗传多样性研究提供技术支持。【方法】利用Fastpcr在轮枝镰孢基因组中查找符合条件的SSR位点,采用Primer5.0软件设计引物,利用NTSYS及Popgene分析来自玉米的轮枝镰孢单孢分离物群体的PCR扩增结果。【结果】共设计有效扩增SSR引物158对,经筛选,109对(69.0%)可扩增出2条及以上的条带,其中55对引物(34.8%)多态性较好,可扩增出3条及以上的条带。从11条已组装的轮枝镰孢染色体上各选出2对多态性引物,计22对引物,对66株轮枝镰孢玉米分离物进行扩增,共获得125个等位变异,变异范围为2—11个,平均为5.68个。轮枝镰孢玉米分离物之间Nei’s基因多样性指数为0.1139—0.8687,平均为0.6199,表现出较高的遗传多样性。【结论】基于轮枝镰孢基因组序列开发的SSR标记具有很好的多态性,可用于轮枝镰孢的遗传多样性分析。用22对SSR引物扩增,以遗传相似系数0.3进行划分,可将66株轮枝镰孢玉米分离物分为3群;中国轮枝镰孢玉米分离物的遗传多样性与地理分布无相关性。
关键词
轮枝镰孢
简单
串联
重复
序列
玉米分离物
遗传多样性
Keywords
Fusarium verticillioides
simple sequance repeat (SSR)
pathogen isolate from maize
genetic diversity
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
微卫星标记技术的研究进展及其在家兔研究中的应用
被引量:
1
3
作者
朱玉峰
王元占
杨培梁
机构
南方医院实验动物研究中心
出处
《中国养兔》
2004年第6期25-28,共4页
关键词
微卫星标记技术
家兔
简单
串联
重复
序列
分布
多态性
遗传图谱
种群间亲缘关系
分类号
S829.1 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
几种江蓠属海藻的ISSR标记分析
孙雪
张学成
茅云翔
刘金姐
隋正红
秦松
费修绠
《高技术通讯》
EI
CAS
CSCD
2003
22
下载PDF
职称材料
2
轮枝镰孢SSR标记开发及在玉米分离群体遗传多样性分析中的应用
任旭
朱振东
李洪杰
段灿星
王晓鸣
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012
18
下载PDF
职称材料
3
微卫星标记技术的研究进展及其在家兔研究中的应用
朱玉峰
王元占
杨培梁
《中国养兔》
2004
1
下载PDF
职称材料
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