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鄂霍次克海冷泉沉积物真核生物多样性的初步研究 被引量：2
1
作者 高远 李富超 +3 位作者 姜鹏 秦松 栾锡武 秦蕴珊 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期29-33,共5页
从鄂霍次克海沉积物样品中提取总基因组DNA,进行核糖体rRNA基因内转录间隔区(ITS)的扩增,构建克隆文库并进行测序,对该环境下真核生物的多样性进行了初步研究。结果发现,该环境下的真核生物具有较高的多样性,主要为3大类,真核藻类、真... 从鄂霍次克海沉积物样品中提取总基因组DNA,进行核糖体rRNA基因内转录间隔区(ITS)的扩增,构建克隆文库并进行测序,对该环境下真核生物的多样性进行了初步研究。结果发现,该环境下的真核生物具有较高的多样性,主要为3大类,真核藻类、真菌和微型浮游动物。藻类和微型浮游动物的组成与前人在该海域浮游生物生态学的研究相吻合,而真菌群落具有较高的多样性,这为该区域真核生物多样性、所参与的生物地球化学过程及生态学意义的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 冷泉沉积物 核糖体rRNA基因内转录间隔区 真核生物多样性
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不同类型冰川雪坑中真核微生物多样性变化与环境因子关系研究 被引量：5
2
作者 马晓军 刘炜 +2 位作者 侯书贵 陈拓 秦大河 《自然科学进展》 北大核心 2008年第3期254-261,共8页
通过变性梯度凝胶电泳(DGGE),对两个不同类型冰川雪坑中真核微生物的多样性进行比较分析.并结合冰雪中δ18O、可溶性离子等多项环境指标,探讨了不同类型、不同深度冰川雪中真核微生物多样性的差异及其与环境因子关系.结果表明,东天山大... 通过变性梯度凝胶电泳(DGGE),对两个不同类型冰川雪坑中真核微生物的多样性进行比较分析.并结合冰雪中δ18O、可溶性离子等多项环境指标,探讨了不同类型、不同深度冰川雪中真核微生物多样性的差异及其与环境因子关系.结果表明,东天山大陆性冰川和玉龙山海洋性冰川雪样中的真核微生物多样性显著不同,玉龙山雪坑中真核微生物主要为Fungi和Cercozoan;东天山雪坑中真核微生物分属于Viridiplantae,Fungi,Cercozoan,Alveolata和Metazoa等5大类,其中,Viridiplantae为主要类群,Fungi次之.大陆性冰川表层雪和深层雪中优势真核微生物多样性差别较大,但在海洋性冰川雪坑中,这种变化较小.不同类型冰川雪中真核微生物的这种差异与环境指标的变化明显相关,实验证明,环境与地域对冰雪中真核微生物的多样性有重要影响,真核微生物同冰雪细菌一样,可作为气候环境变化的指标. 展开更多
关键词 大陆性冰川 海洋性冰川 真核微生物多样性 DGGE
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应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性 被引量：5
3
作者 王娜 蔡玉勇 +2 位作者 李赟 王崇明 崔红 《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期51-56,共6页
为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1~V3区的高变区序列,筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析可将不同藻种分离开。... 为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1~V3区的高变区序列,筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析可将不同藻种分离开。随后对青岛沙子口扇贝养殖海区9个月份真核浮游生物多样性进行了DGGE分析,结果从9个月份2 m深的海水中总共扩增出38条谱带,其中共有谱带3条,占总数的7.69%,不同月份的特征性谱带11个,占总谱带数的28.2%。不同月份水样中的谱带数显著不同,香农多样性指数为0.4632。相似性分析表明,2009年3和4月养殖海区真核微生物种类相似性最高,为89.7%。基于不同月份水样微生物种类多样性进行UPGMA聚类分析,结果表明,2008年5,6,8月和2009年1,2,3,4月分别聚为一支,显示取样时间相近的月份微生物种类相似度最高。 展开更多
关键词 PCR-DGGE 18S RDNA序列 真核浮游生物多样性
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洛阳江流域真核浮游生物多样性研究 被引量：1
4
作者 黄卫红 李双彤 +3 位作者 翁莉莉 柯玉森 曾武峰 张秋芳 《泉州师范学院学报》 2021年第6期36-44,共9页
以18S rRNA基因为分子标记,应用高通量测序和水质监测技术对洛阳江流域后坂水库(HB)、惠女水库(HN)、福滨街桥(FB)、前后埭交界处(QHD)、杏宅水闸(XZ)和洛阳桥(LY)共6个代表性断面水体的真核浮游生物多样性及其与环境因子相关性进行了分... 以18S rRNA基因为分子标记,应用高通量测序和水质监测技术对洛阳江流域后坂水库(HB)、惠女水库(HN)、福滨街桥(FB)、前后埭交界处(QHD)、杏宅水闸(XZ)和洛阳桥(LY)共6个代表性断面水体的真核浮游生物多样性及其与环境因子相关性进行了分析.结果表明:HB和HN水质状况较好,其水质指标类别均为Ⅱ级以上;XZ和LY水质相对较差,除个别水质指标为Ⅱ级以上,其他指标均为Ⅲ级以下;不同断面水体真核浮游生物结构组成不同,HN物种丰富度较高,物种分布较为均匀,LY物种丰富度和均匀度相对较低;6个断面水体共检测到真核浮游生物33个门、46个纲、60个目、71个科和100个属;隐藻类(Cryptomonadales)和纤毛门(Ciliophora)是FB外其他断面水体的主要优势物种,而FB主要优势物种为子囊菌门(Ascomycota);6个断面水体真核浮游生物群落组成均具一定差异,入海口LY的真核浮游生物群落组成与其他区域差异尤为明显;此外,水体真核浮游生物多样性与环境因子具有显著相关性,其中纤毛门(Ciliophora)与TN、NO_(2)^(-)-N和NO_(3)^(-)-N呈显著正相关,而隐藻类的Kathablepharidae属和环节动物门(Annelida)皆与COD_(Mn)呈显著正相关;HN和FB真核浮游生物的营养型和功能群落组成不同于其他断面水体,未定义腐生营养型微生物(Undefined Saprotroph)为二者特有的功能群落. 展开更多
关键词 洛阳江流域 真核浮游生物多样性 环境因子 高通量测序 18S rRNA基因
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