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基于TEMβ-内酰胺酶突变与变构关系分析的抗生素耐药机制
被引量：
2
1
作者
白雯静
史彦斌
刘焕香
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期983-988,共6页
目的基于一系列计算生物信息学方法,探索TEMβ-内酰胺酶突变导致的构象变构与抗生素耐药性的关系。方法首先,采用直接耦合分析方法,预测TEM结构中决定其构象的直接和间接的强耦合残基对;其次,采用分子动力学模拟和蛋白质构象阻挫分析方...
目的基于一系列计算生物信息学方法,探索TEMβ-内酰胺酶突变导致的构象变构与抗生素耐药性的关系。方法首先,采用直接耦合分析方法,预测TEM结构中决定其构象的直接和间接的强耦合残基对;其次,采用分子动力学模拟和蛋白质构象阻挫分析方法分析耐药性突变残基参与的耦合残基对在蛋白质构象变化中的作用;最后,采用蛋白质成药性结合位点预测方法Fd-DCA,预测TEM表面潜在的成药性变构位点。结果通过共耦合分析方法发现238-环结构域与Ω-环结构域内部或结构域之间,以及TEM-52的突变残基E104K、G238S和M182T之间存在最强的耦合关系,分子动力学证实这些耦合关系在蛋白质结构与功能维持中具有极为重要的作用。最后,在TEM表面发现了一个成药性变构位点,该位点与Ω-环结构域也强烈的耦合,说明可以通过针对该位点设计药物,间接控制TEM的构象结构,从而减小其对抗生素的识别能力,为抵御TEM引起的耐药研究带来新的研究思路。结论耐药性残基突变会通过打破原有的耦合关系,从而大幅度的影响蛋白质构象稳定性,增加TEM结构的柔性,帮助TEM更加容易识别和水解抗生素药物,产生耐药性。
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关键词
TEM
Β-内酰胺酶
耐药性机制
直接
耦合
分析
分子动力学
构象阻挫评估
药物设计
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职称材料
小截面薄壁方管并行焊接温度场及变形的数值模拟
2
作者
周雪平
王俊恒
+1 位作者
张广军
吴林
《焊接》
北大核心
2007年第7期39-42,共4页
小截面薄壁方管在焊接过程中变形严重,且与胎具之间的传热情况复杂,所以采用传统的单向顺序耦合方法计算的温度场误差较大。对此,文中建立了考虑接触热传导的小截面薄壁方管并行焊接的直接耦合分析模型。通过与实测结果比较,模拟得到的...
小截面薄壁方管在焊接过程中变形严重,且与胎具之间的传热情况复杂,所以采用传统的单向顺序耦合方法计算的温度场误差较大。对此,文中建立了考虑接触热传导的小截面薄壁方管并行焊接的直接耦合分析模型。通过与实测结果比较,模拟得到的温度场与实测结果有较好的吻合,表明该模型能准确的反映方管与胎具间的传热过程,证明了模型的可靠性和正确性,为自动化焊接各项参数的合理选择和优化提供了有效的参考依据。
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关键词
小截面薄壁方管
接触热传导
直接
耦合
分析
数值模拟
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职称材料
拱坝加高培厚中温度与接触耦合分析
3
作者
张社荣
迟守旭
+1 位作者
陈敏岩
黄昌清
《水力发电学报》
EI
CSCD
北大核心
2005年第6期30-34,共5页
大坝加高时最关心的是新老坝体结合面的模拟及其对坝体整体性和应力的影响,本文对新老坝体结合面进行温度与接触的直接耦合分析,真实模拟接触面力与热的传递机理,结果显示,随着温降值减小,新老坝体结合面之间接触压力增大,接触状态趋于...
大坝加高时最关心的是新老坝体结合面的模拟及其对坝体整体性和应力的影响,本文对新老坝体结合面进行温度与接触的直接耦合分析,真实模拟接触面力与热的传递机理,结果显示,随着温降值减小,新老坝体结合面之间接触压力增大,接触状态趋于闭合,并通过与整体计算方法对比,说明加高后坝体整体性良好。
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关键词
水工结构
加高培厚
直接
耦合
分析
拱坝
接触
温度
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职称材料
考虑近岛礁复杂海底地形的浮式平台水动力性能分析
被引量：
3
4
作者
周叶
丁军
+3 位作者
田超
张正伟
凌宏杰
王登婷
《船舶工程》
CSCD
北大核心
2018年第S1期280-286,共7页
基于可以考虑复杂海底地形对波浪传播变形影响的水波模型和可以考虑波浪与浮式结构物相互作用的RANKINE源法,建立近岛礁浮体水动力性能直接分析耦合模型,给出详细的理论推导及数值求解方法,并编制了相关的计算程序THAFTS-BR。首先以均...
基于可以考虑复杂海底地形对波浪传播变形影响的水波模型和可以考虑波浪与浮式结构物相互作用的RANKINE源法,建立近岛礁浮体水动力性能直接分析耦合模型,给出详细的理论推导及数值求解方法,并编制了相关的计算程序THAFTS-BR。首先以均匀水深下百米级浮式平台为研究对象,通过与THAFTS和AQWA等商业软件的计算结果进行对比分析,初步验证了THAFTS-BR程序的正确性和可靠性。随后基于模型试验和前面建立直接分析耦合模型,对比分析了考虑近岛礁海底地形后该浮式平台的运动及载荷响应特性,给出了一些重要结论,为后续布置于岛礁附近的浮式结构物动响应分析、设计与建造等提供了参考依据。
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关键词
复杂海底地形
水动力性能
直接
耦合
分析
方法
模型试验
原文传递
题名
基于TEMβ-内酰胺酶突变与变构关系分析的抗生素耐药机制
被引量：
2
1
作者
白雯静
史彦斌
刘焕香
机构
兰州大学药学院
兰州市食品药品检验所
出处
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期983-988,共6页
基金
国家自然基金(No.21675070)
文摘
目的基于一系列计算生物信息学方法,探索TEMβ-内酰胺酶突变导致的构象变构与抗生素耐药性的关系。方法首先,采用直接耦合分析方法,预测TEM结构中决定其构象的直接和间接的强耦合残基对;其次,采用分子动力学模拟和蛋白质构象阻挫分析方法分析耐药性突变残基参与的耦合残基对在蛋白质构象变化中的作用;最后,采用蛋白质成药性结合位点预测方法Fd-DCA,预测TEM表面潜在的成药性变构位点。结果通过共耦合分析方法发现238-环结构域与Ω-环结构域内部或结构域之间,以及TEM-52的突变残基E104K、G238S和M182T之间存在最强的耦合关系,分子动力学证实这些耦合关系在蛋白质结构与功能维持中具有极为重要的作用。最后,在TEM表面发现了一个成药性变构位点,该位点与Ω-环结构域也强烈的耦合,说明可以通过针对该位点设计药物,间接控制TEM的构象结构,从而减小其对抗生素的识别能力,为抵御TEM引起的耐药研究带来新的研究思路。结论耐药性残基突变会通过打破原有的耦合关系,从而大幅度的影响蛋白质构象稳定性,增加TEM结构的柔性,帮助TEM更加容易识别和水解抗生素药物,产生耐药性。
关键词
TEM
Β-内酰胺酶
耐药性机制
直接
耦合
分析
分子动力学
构象阻挫评估
药物设计
Keywords
TEM β-lactamase
Drug resistance mechanism
Direct coupling analysis
Molecular dynamics
Conformational frustration
Drug design
分类号
R914.2 [医药卫生—药物化学]
Q615 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
小截面薄壁方管并行焊接温度场及变形的数值模拟
2
作者
周雪平
王俊恒
张广军
吴林
机构
哈尔滨工业大学现代焊接生产技术国家重点实验室
出处
《焊接》
北大核心
2007年第7期39-42,共4页
文摘
小截面薄壁方管在焊接过程中变形严重,且与胎具之间的传热情况复杂,所以采用传统的单向顺序耦合方法计算的温度场误差较大。对此,文中建立了考虑接触热传导的小截面薄壁方管并行焊接的直接耦合分析模型。通过与实测结果比较,模拟得到的温度场与实测结果有较好的吻合,表明该模型能准确的反映方管与胎具间的传热过程,证明了模型的可靠性和正确性,为自动化焊接各项参数的合理选择和优化提供了有效的参考依据。
关键词
小截面薄壁方管
接触热传导
直接
耦合
分析
数值模拟
Keywords
small-section tube, contact heat conductien, coupled-analysis, numerical simulation
分类号
TG409 [金属学及工艺—焊接]
下载PDF
职称材料
题名
拱坝加高培厚中温度与接触耦合分析
3
作者
张社荣
迟守旭
陈敏岩
黄昌清
机构
天津大学建筑工程学院
水利部福建水利水电勘测设计研究院
出处
《水力发电学报》
EI
CSCD
北大核心
2005年第6期30-34,共5页
文摘
大坝加高时最关心的是新老坝体结合面的模拟及其对坝体整体性和应力的影响,本文对新老坝体结合面进行温度与接触的直接耦合分析,真实模拟接触面力与热的传递机理,结果显示,随着温降值减小,新老坝体结合面之间接触压力增大,接触状态趋于闭合,并通过与整体计算方法对比,说明加高后坝体整体性良好。
关键词
水工结构
加高培厚
直接
耦合
分析
拱坝
接触
温度
Keywords
hydraulic structure
heighten and thicken
direct coupling analysis
arch dam
contact
temperature
分类号
TV31 [水利工程—水工结构工程]
下载PDF
职称材料
题名
考虑近岛礁复杂海底地形的浮式平台水动力性能分析
被引量：
3
4
作者
周叶
丁军
田超
张正伟
凌宏杰
王登婷
机构
中国船舶科学研究中心
江苏科技大学
南京水利科学研究院
出处
《船舶工程》
CSCD
北大核心
2018年第S1期280-286,共7页
文摘
基于可以考虑复杂海底地形对波浪传播变形影响的水波模型和可以考虑波浪与浮式结构物相互作用的RANKINE源法,建立近岛礁浮体水动力性能直接分析耦合模型,给出详细的理论推导及数值求解方法,并编制了相关的计算程序THAFTS-BR。首先以均匀水深下百米级浮式平台为研究对象,通过与THAFTS和AQWA等商业软件的计算结果进行对比分析,初步验证了THAFTS-BR程序的正确性和可靠性。随后基于模型试验和前面建立直接分析耦合模型,对比分析了考虑近岛礁海底地形后该浮式平台的运动及载荷响应特性,给出了一些重要结论,为后续布置于岛礁附近的浮式结构物动响应分析、设计与建造等提供了参考依据。
关键词
复杂海底地形
水动力性能
直接
耦合
分析
方法
模型试验
Keywords
complicated seabed
hydrodynamic performance
direct coupling analysis method
model test
分类号
P75 [天文地球—海洋科学]
U674.38 [交通运输工程—船舶及航道工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于TEMβ-内酰胺酶突变与变构关系分析的抗生素耐药机制
白雯静
史彦斌
刘焕香
《中国抗生素杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017
2
下载PDF
职称材料
2
小截面薄壁方管并行焊接温度场及变形的数值模拟
周雪平
王俊恒
张广军
吴林
《焊接》
北大核心
2007
0
下载PDF
职称材料
3
拱坝加高培厚中温度与接触耦合分析
张社荣
迟守旭
陈敏岩
黄昌清
《水力发电学报》
EI
CSCD
北大核心
2005
0
下载PDF
职称材料
4
考虑近岛礁复杂海底地形的浮式平台水动力性能分析
周叶
丁军
田超
张正伟
凌宏杰
王登婷
《船舶工程》
CSCD
北大核心
2018
3
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