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同源建模关键步骤的研究动态
被引量:
13
1
作者
曾炳佳
曹以诚
+1 位作者
杜正平
陈晓曦
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2008年第2期7-10,共4页
应用同源建模的蛋白质结构预测已经成为一种快速获得蛋白质结构的技术,这种技术也将成为完成结构基因组计划的有力工具。同源建模是指寻找与目标序列同源而且有实验测定结构的蛋白质作为模板,从而构建目标序列的结构模型的方法。限制这...
应用同源建模的蛋白质结构预测已经成为一种快速获得蛋白质结构的技术,这种技术也将成为完成结构基因组计划的有力工具。同源建模是指寻找与目标序列同源而且有实验测定结构的蛋白质作为模板,从而构建目标序列的结构模型的方法。限制这种方法的应用主要是同源建模的关键步骤,即目标与模板之间序列比对和环区建模的准确性。当模型的准确性达到令人信服的程度时,更为精确的计算机辅助药物设计和改造蛋白质,甚至设计全新功能的蛋白质将成为可能。综述了从算法和策略上提高同源建模关键步骤准确性的研究进展。
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关键词
蛋白质结构预测
同源建模
目标
模板
比对
环区建模
下载PDF
职称材料
题名
同源建模关键步骤的研究动态
被引量:
13
1
作者
曾炳佳
曹以诚
杜正平
陈晓曦
机构
华南理工大学生物科学与工程学院
出处
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2008年第2期7-10,共4页
基金
国家自然科学基金重大研究计划项目(No.90412015)
教育部中国网络计划生物信息网络平台子项目(No.B1-137040130)
文摘
应用同源建模的蛋白质结构预测已经成为一种快速获得蛋白质结构的技术,这种技术也将成为完成结构基因组计划的有力工具。同源建模是指寻找与目标序列同源而且有实验测定结构的蛋白质作为模板,从而构建目标序列的结构模型的方法。限制这种方法的应用主要是同源建模的关键步骤,即目标与模板之间序列比对和环区建模的准确性。当模型的准确性达到令人信服的程度时,更为精确的计算机辅助药物设计和改造蛋白质,甚至设计全新功能的蛋白质将成为可能。综述了从算法和策略上提高同源建模关键步骤准确性的研究进展。
关键词
蛋白质结构预测
同源建模
目标
模板
比对
环区建模
Keywords
protein structure prediction
homology modeling
target-template alignment
loop modeling
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
同源建模关键步骤的研究动态
曾炳佳
曹以诚
杜正平
陈晓曦
《生物学杂志》
CAS
CSCD
2008
13
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