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基于TCGA研究左右半结肠癌基因表达差异及苦参-大血藤-半枝莲作用机制 被引量：1
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作者 刘菁菁 张恩欣 《广州中医药大学学报》 CAS 2024年第3期742-751,共10页
【目的】探讨左半结肠癌与右半结肠癌的基因表达差异及大肠癌核心药对苦参-大血藤-半枝莲作用于左右半结肠癌的机制差异。【方法】下载134例左半结肠癌及194例右半结肠癌患者癌症基因组图谱(TCGA)的转录组数据,应用R软件实现2组差异基... 【目的】探讨左半结肠癌与右半结肠癌的基因表达差异及大肠癌核心药对苦参-大血藤-半枝莲作用于左右半结肠癌的机制差异。【方法】下载134例左半结肠癌及194例右半结肠癌患者癌症基因组图谱(TCGA)的转录组数据,应用R软件实现2组差异基因分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过BATMAN-TCM数据库获取苦参-大血藤-半枝莲药对的活性成分及靶点,基于左右半结肠癌差异基因,分别进行药对-左/右半结肠癌KEGG富集分析、蛋白质互作(PPI)网络构建,比较药对治疗左、右半结肠癌富集的生物信号通路差异及关键靶点差异。【结果】左半结肠癌与右半结肠癌相对于正常癌旁组织共同的差异表达基因共6051个,左半结肠癌特异性的差异表达基因共1958个,右半结肠癌特异性的差异表达基因共1739个;左半结肠癌特异性KEGG富集通路14条,右半结肠癌特异性KEGG富集通路23条。苦参-大血藤-半枝莲药对活性化合物共85个,对应的靶点合计469个,药对-左半结肠癌靶点富集于10条KEGG信号通路,关键靶点为DRD2、CACNA1C、HTR3A、COMT、TH,药对-右半结肠癌靶点富集于1条KEGG信号通路,核心靶点为HTR3A、DRD2、TH、AGT、GRIN2B。【结论】左半结肠癌与右半结肠癌存在基因表达差异:左半结肠癌与免疫功能异常、AMPK信号通路异常等机制有关,右半结肠癌与中性粒细胞外陷阱形成、酒精中毒、Hippo信号通路异常等机制有关。除调控细胞周期及必需氨基酸代谢等机制外,苦参-大血藤-半枝莲药对对调节左半结肠癌肠道内分泌功能、抑制右半结肠癌炎症反应具有特异性作用,亦可能对结肠癌患者具有情绪调控作用。 展开更多
关键词 苦参 大血藤 半枝莲 左半结肠癌 右半结肠癌 差异基因 情绪调控 癌基因组图谱(tcga)
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