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应用抑制消减杂交和cDNA芯片技术筛选流行性感冒病毒感染相关基因 被引量：5
1
作者 陈忠斌 杨静 +2 位作者 王华 孙偶军 王升启 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期21-26,共6页
病毒基因组有限的编码能力和以病毒蛋白为靶的抗病毒药物易出现耐药性 ,使从病毒感染宿主筛选病毒感染相关生物大分子作为抗病毒药靶和诊断标志物成为新的研究方向。为了筛选流行性感冒 (流感 )病毒感染相关基因 ,采用抑制消减杂交 (sup... 病毒基因组有限的编码能力和以病毒蛋白为靶的抗病毒药物易出现耐药性 ,使从病毒感染宿主筛选病毒感染相关生物大分子作为抗病毒药靶和诊断标志物成为新的研究方向。为了筛选流行性感冒 (流感 )病毒感染相关基因 ,采用抑制消减杂交 (suppressionsubtractivehybridization ,SSH)技术 ,以流感病毒A/鲁防 / 93 - 9(H3N2 )感染的MDCK细胞及正常MDCK细胞为材料 ,构建病毒感染特异性差减cDNA文库。从文库中随机挑取约 80 0个克隆 ,PCR扩增其中插入片段 ,经纯化、紫外定量后 ,用基因芯片自动点样仪点在氨基片上 ,制备cDNA芯片。将流感病毒感染的MDCK细胞和正常MDCK细胞的总RNA分别用Cy3、Cy5反转录荧光标记后 ,与cDNA芯片杂交 ,用芯片扫描仪扫描获得芯片杂交信号 ,经阳性对照校正和归一化处理后 ,以如下条件作为判定基因差异表达的标准 ;(a)Cy3与Cy5的信号比值大于 1 5 (正常细胞用Cy5标记 )或小于 0 6 7(正常细胞用Cy3标记 ) ;(b)Cy3和Cy5信号值之一必须大于 10 0 0。经cDNA芯片筛选获得了 18个流感病毒感染特异性克隆 ,经测序和生物信息学分析发现均为流感病毒感染相关新基因EST。流感病毒感染相关基因cDNA片段的获得 ,为新型病毒药靶诊断标志物发现和功能研究提供了基础。 展开更多
关键词 流行性感冒病毒 抑制消减杂交 CDNA芯片 病毒感染基因组学 药靶
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抗病毒药物研究新领域:病毒感染基因组学 被引量：1
2
作者 陈忠斌 高玮 王升启 《国外医学（药学分册）》 2001年第6期351-355,共5页
由于病毒基因组编码基因数量少 ,从病毒中发现药物靶标受到一定限制。最近的研究表明 ,抑制宿主细胞中某些蛋白的功能可以阻断病毒感染。与病毒基因组相比 ,人类基因组序列中可能包括更多的与病毒繁殖有关的基因。用DNA微阵列技术系统... 由于病毒基因组编码基因数量少 ,从病毒中发现药物靶标受到一定限制。最近的研究表明 ,抑制宿主细胞中某些蛋白的功能可以阻断病毒感染。与病毒基因组相比 ,人类基因组序列中可能包括更多的与病毒繁殖有关的基因。用DNA微阵列技术系统分析宿主基因表达 ,是一种从宿主细胞角度发现潜在抗病毒靶标的有效方法。最近报道了有关病毒影响宿主细胞基因表达谱的研究战略 ,以及通过表达谱分析来发现与病毒复制有关的宿主细胞通路。因此 。 展开更多
关键词 病毒感染基因组学 DNA微阵列技术 基因表达谱 抗病毒药物 靶标
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