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传毒媒介基因组中内源性病毒元件多样性及功能的研究进展
1
作者 何雨娟 张传溪 +1 位作者 陈剑平 李俊敏 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期501-510,共10页
在病毒与宿主的长期相互作用中,部分病毒基因序列可以被整合到宿主基因组中,形成内源性病毒元件(endogenous viral element,EVE)。随着近年来基因组学和宏病毒组学的发展,研究人员发现除逆转录病毒外,非逆转录RNA病毒同样可以被整合到... 在病毒与宿主的长期相互作用中,部分病毒基因序列可以被整合到宿主基因组中,形成内源性病毒元件(endogenous viral element,EVE)。随着近年来基因组学和宏病毒组学的发展,研究人员发现除逆转录病毒外,非逆转录RNA病毒同样可以被整合到传毒媒介等真核生物基因组中,形成内源性非逆转录RNA病毒元件(non-retroviral EVE,nrEVE),但关于其具体功能的研究较少。鉴于传毒媒介传播的动物病毒和植物病毒对人、动物及植物造成严重危害,该文聚焦近年来国内外关于传毒媒介基因组中的EVE,特别是nrEVE的研究,总结了EVE的定义及发现,蚊子、蚜虫、蓟马、飞虱和蜱虫等重要传毒媒介中EVE的多样性及功能,并对该领域的后续研究重点进行展望,以期为揭示RNA病毒与宿主的长期协同进化关系及发展新的抗虫策略提供理论基础。 展开更多
关键词 非逆转录RNA病毒 病毒元件 基因水平转移 传毒媒介
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介导植物病毒病症状发生的病毒元件与寄主因子 被引量：3
2
作者 张超 龚前园 +1 位作者 张永强 李为民 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期44-49,共6页
植物遭受病毒侵染后,常表现出花叶、发育畸形、褪绿、坏死等症状。在农业生产中,这些症状的发生直接导致作物的产量/品质下降,有些造成严重的经济损失。因而,病毒病症状发生的分子机制长期以来一直为人们所关注。结合近年来国内外最新... 植物遭受病毒侵染后,常表现出花叶、发育畸形、褪绿、坏死等症状。在农业生产中,这些症状的发生直接导致作物的产量/品质下降,有些造成严重的经济损失。因而,病毒病症状发生的分子机制长期以来一直为人们所关注。结合近年来国内外最新的研究报道,分别从病毒和寄主两个方面,总结归纳了介导症状发生的病毒元件以及参与症状发生的寄主因子,并在此基础上分析讨论了病毒病症状发生的分子机制。 展开更多
关键词 植物病毒 症状发生 病毒元件 寄主因子
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茄科作物基因组内源病毒元件的分析鉴定
3
作者 陈汝豪 孟繁烨 +5 位作者 杨曼华 陈家茹 邹莹 宋波涛 马恢 聂碧华 《园艺学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期190-202,共13页
利用6个茄科物种的35个公开基因组数据进行了茄科基因组内源性病毒元件(endogenous viralelement,EVE)的挖掘。结果发现,主要来源于花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)等共17种疑似的植物EVE。其中,烟草脉明病毒(tobacco vein clearing v... 利用6个茄科物种的35个公开基因组数据进行了茄科基因组内源性病毒元件(endogenous viralelement,EVE)的挖掘。结果发现,主要来源于花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)等共17种疑似的植物EVE。其中,烟草脉明病毒(tobacco vein clearing virus,TVCV)序列以大片段的形式普遍存于几乎所有收集的茄科植物基因组中,含量大约在0.01%~0.32%,片段平均长度范围为500~2300 bp,序列数量范围为200~5000条。以马铃薯DM1-3基因组为例分析这些TVCV内源序列的分布和组成,发现内源性TVCV序列在马铃薯DM 1-3的12条染色体上分散排布,平均每条染色体上有57条序列;这些内源病毒序列与TVCV基因组比对,虽然它们无法覆盖TVCV完整基因组序列,但是能够覆盖完整的编码区。进一步通过RT-PCR和原位杂交定位,验证了TVCV在马铃薯材料中的存在和分布。 展开更多
关键词 茄科作物 马铃薯 基因组 内源病毒元件 烟草脉明病毒
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