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基于网络药理学探讨三七对骨愈合的作用机制
被引量:
4
1
作者
吴文正
郑晓辉
+3 位作者
高怡加
欧阳崇志
黄敏玲
杨锐敏
《广州中医药大学学报》
CAS
2020年第8期1561-1567,共7页
【目的】基于网络药理学方法探讨三七对骨愈合的作用机制。【方法】通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取三七的主要化学成分及其对应的作用靶点;借助人类基因数据库(GeneCards)获取骨愈合相关靶标基因,与三七作用靶点取交集后获得三...
【目的】基于网络药理学方法探讨三七对骨愈合的作用机制。【方法】通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取三七的主要化学成分及其对应的作用靶点;借助人类基因数据库(GeneCards)获取骨愈合相关靶标基因,与三七作用靶点取交集后获得三七—骨愈合的交集靶点。通过Cytoscape 3.7.1软件构建中药调控网络并进行可视化展示;通过STRING在线数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络。利用DAVID数据库进行交集基因的基因本体论(GO)功能富集分析及基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。【结果】三七作用于骨愈合的化学成分有7个,相关靶点70个,关键有效成分4个,关键靶点68个。GO分析结果显示,三七—骨愈合的交集基因的生物功能主要涉及对雌二醇的反应、RNA聚合酶II启动子转录的正调控、DNA模板转录的正调控等生物过程,细胞质基质、细胞外间隙、核质等细胞组成;酶结合、相同的蛋白结合、转录因子结合等分子功能。KEGG通路富集结果显示,三七—骨愈合的交集基因的通路主要包括人类疾病通路(如肿瘤疾病通路、乙型肝炎等)、环境信息处理通路[如磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等]、有机系统通路(如甲状腺激素信号通路、催乳激素信号通路等)、细胞过程通路(如细胞局部粘附、p53信号通路等)。【结论】三七调节骨愈合的作用机制呈多成分、多靶点、多通路特点,主要通过肿瘤疾病通路、PI3K-Akt信号通路、甲状腺激素信号通路、细胞局部粘附等多方面的途径发挥调节骨愈合的作用。
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关键词
三七
骨愈合
网络药理学
肿瘤疾病
通路
PI3K-AKT
信号
通路
甲状腺激素
信号
通路
细胞粘附
原文传递
As_(2)O_(3)饮水慢性中毒对大鼠肝脏TRβ1介导的甲状腺激素信号通路的影响
2
作者
王炼
王雪飞
+3 位作者
高魁
郭迎春
张天阳
杨英
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1526-1533,1578,共9页
As_(2)O_(3)能干扰大鼠血清甲状腺激素(TH)水平,引发慢性肝损伤,然而其机制仍不清楚。为了探明TH信号通路在As2O3引发慢性肝损伤中的作用,采用qRT-PCR、Western blot技术检测大鼠肝脏TH信号通路的关键调控因子TRβ1、核内途径TRβ1的下...
As_(2)O_(3)能干扰大鼠血清甲状腺激素(TH)水平,引发慢性肝损伤,然而其机制仍不清楚。为了探明TH信号通路在As2O3引发慢性肝损伤中的作用,采用qRT-PCR、Western blot技术检测大鼠肝脏TH信号通路的关键调控因子TRβ1、核内途径TRβ1的下游因子(Cyclin D1)基因和蛋白表达变化,核外途经关键因子(Bax、Bcl-2)蛋白的变化。结果显示:与对照组相比,As_(2)O_(3)作用110d,雌鼠肝脏TRβ1蛋白表达均显著降低(P<0.01),0.1、0.2mg/L组Cyclin D1表达显著升高(P<0.01);雄鼠0.4mg/L组TRβ1蛋白表达显著降低(P<0.01),各组Cyclin D1的表达均显著升高(P<0.01),mRNA表达结果与蛋白基本一致。与对照组相比,As_(2)O_(3)作用194d,各组TRβ1蛋白表达显著降低(P<0.01),Cyclin D1的表达均显著升高(P<0.01),mRNA表达结果与蛋白基本一致。与对照组相比,As_(2)O_(3)干扰了大鼠Bcl-2和Bax蛋白表达,并随着作用时间的增长,诱导Bcl-2/Bax蛋白比值升高。其中,各组雌鼠和0.4mg/L组雄鼠Bcl-2/Bax比值显著升高(P<0.01),0.1mg/L组雄鼠明显升高(P<0.05)。表明大鼠长期慢性饮水摄入As_(2)O_(3)会引起其肝脏TRβ1的基因和蛋白水平异常下降,Cyclin D1的水平异常升高,诱导Bcl-2/Bax蛋白比值升高。
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关键词
As_(2)O_(3)
肝毒性
甲状腺激素
信号
通路
甲状腺激素
受体β1
大鼠
原文传递
冷驯化下中缅树鼩BAT中主要内分泌信号通路转录组分析
被引量:
1
3
作者
王慧娟
贾婷
+1 位作者
朱万龙
王政昆
《生物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期45-51,共7页
为探究冷驯化条件下,胰岛素和甲状腺激素信号通路在中缅树鼩褐色脂肪组织(brown adipose tissue,BAT)中的调节机制,利用Illumina novaseq 6000平台对对照组和冷驯化组中缅树鼩BAT进行转录组测序,通过生物信息学分析筛选出与胰岛素和甲...
为探究冷驯化条件下,胰岛素和甲状腺激素信号通路在中缅树鼩褐色脂肪组织(brown adipose tissue,BAT)中的调节机制,利用Illumina novaseq 6000平台对对照组和冷驯化组中缅树鼩BAT进行转录组测序,通过生物信息学分析筛选出与胰岛素和甲状腺激素相关的信号通路及候选基因。结果显示:冷驯化组较对照组,共2879个基因表达存在显著差异,其中1181个上调,1698个下调;GO分析结果显示细胞组分、分子功能、生物学过程分别显著富集到24、28和55条term,差异表达基因主要富集在生物学过程;KEGG分析差异表达基因显著富集到20条pathways,其中筛选到与胰岛素和甲状腺激素信号通路相关的候选基因有PDPK1、AKT2、ACACA、SLC2A4和THRB等。结果表明,中缅树鼩可通过调节BAT中胰岛素和甲状腺激素信号通路中基因表达来应对寒冷环境。
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关键词
转录组
中缅树鼩
褐色脂肪组织
胰岛素
信号
通路
甲状腺激素
信号
通路
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职称材料
题名
基于网络药理学探讨三七对骨愈合的作用机制
被引量:
4
1
作者
吴文正
郑晓辉
高怡加
欧阳崇志
黄敏玲
杨锐敏
机构
广州中医药大学第一临床医学院
广州中医药大学第一附属医院
出处
《广州中医药大学学报》
CAS
2020年第8期1561-1567,共7页
基金
广东省自然科学基金资助项目(编号:2018A030313369)
广东省中医药局科研项目(编号:20181084)。
文摘
【目的】基于网络药理学方法探讨三七对骨愈合的作用机制。【方法】通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取三七的主要化学成分及其对应的作用靶点;借助人类基因数据库(GeneCards)获取骨愈合相关靶标基因,与三七作用靶点取交集后获得三七—骨愈合的交集靶点。通过Cytoscape 3.7.1软件构建中药调控网络并进行可视化展示;通过STRING在线数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络。利用DAVID数据库进行交集基因的基因本体论(GO)功能富集分析及基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。【结果】三七作用于骨愈合的化学成分有7个,相关靶点70个,关键有效成分4个,关键靶点68个。GO分析结果显示,三七—骨愈合的交集基因的生物功能主要涉及对雌二醇的反应、RNA聚合酶II启动子转录的正调控、DNA模板转录的正调控等生物过程,细胞质基质、细胞外间隙、核质等细胞组成;酶结合、相同的蛋白结合、转录因子结合等分子功能。KEGG通路富集结果显示,三七—骨愈合的交集基因的通路主要包括人类疾病通路(如肿瘤疾病通路、乙型肝炎等)、环境信息处理通路[如磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等]、有机系统通路(如甲状腺激素信号通路、催乳激素信号通路等)、细胞过程通路(如细胞局部粘附、p53信号通路等)。【结论】三七调节骨愈合的作用机制呈多成分、多靶点、多通路特点,主要通过肿瘤疾病通路、PI3K-Akt信号通路、甲状腺激素信号通路、细胞局部粘附等多方面的途径发挥调节骨愈合的作用。
关键词
三七
骨愈合
网络药理学
肿瘤疾病
通路
PI3K-AKT
信号
通路
甲状腺激素
信号
通路
细胞粘附
Keywords
Radix Notoginseng
bone healing
network pharmacology
pathways in cancer
PI3K-Akt signaling pathway
thyroid hormone signaling pathway
cell adhesion
分类号
R285.5 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
As_(2)O_(3)饮水慢性中毒对大鼠肝脏TRβ1介导的甲状腺激素信号通路的影响
2
作者
王炼
王雪飞
高魁
郭迎春
张天阳
杨英
机构
河南牧业经济学院动物医药学院
内蒙古农业大学兽医学院
鄂尔多斯市东胜区动物疫病预防控制中心
巴彦淖尔杭锦后旗农牧和科技局
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第7期1526-1533,1578,共9页
基金
河南省科技发展计划资助项目(222102110211)
河南省教育厅重点研发资助项目(21B230007)
河南省自然科学基金资助项目(232300420029)。
文摘
As_(2)O_(3)能干扰大鼠血清甲状腺激素(TH)水平,引发慢性肝损伤,然而其机制仍不清楚。为了探明TH信号通路在As2O3引发慢性肝损伤中的作用,采用qRT-PCR、Western blot技术检测大鼠肝脏TH信号通路的关键调控因子TRβ1、核内途径TRβ1的下游因子(Cyclin D1)基因和蛋白表达变化,核外途经关键因子(Bax、Bcl-2)蛋白的变化。结果显示:与对照组相比,As_(2)O_(3)作用110d,雌鼠肝脏TRβ1蛋白表达均显著降低(P<0.01),0.1、0.2mg/L组Cyclin D1表达显著升高(P<0.01);雄鼠0.4mg/L组TRβ1蛋白表达显著降低(P<0.01),各组Cyclin D1的表达均显著升高(P<0.01),mRNA表达结果与蛋白基本一致。与对照组相比,As_(2)O_(3)作用194d,各组TRβ1蛋白表达显著降低(P<0.01),Cyclin D1的表达均显著升高(P<0.01),mRNA表达结果与蛋白基本一致。与对照组相比,As_(2)O_(3)干扰了大鼠Bcl-2和Bax蛋白表达,并随着作用时间的增长,诱导Bcl-2/Bax蛋白比值升高。其中,各组雌鼠和0.4mg/L组雄鼠Bcl-2/Bax比值显著升高(P<0.01),0.1mg/L组雄鼠明显升高(P<0.05)。表明大鼠长期慢性饮水摄入As_(2)O_(3)会引起其肝脏TRβ1的基因和蛋白水平异常下降,Cyclin D1的水平异常升高,诱导Bcl-2/Bax蛋白比值升高。
关键词
As_(2)O_(3)
肝毒性
甲状腺激素
信号
通路
甲状腺激素
受体β1
大鼠
Keywords
As_(2)O_(3)
hepatotoxicity
TH signal pathway
TRβ1
rat
分类号
S859.8 [农业科学—临床兽医学]
原文传递
题名
冷驯化下中缅树鼩BAT中主要内分泌信号通路转录组分析
被引量:
1
3
作者
王慧娟
贾婷
朱万龙
王政昆
机构
云南师范大学
云南经济管理学院医学院
出处
《生物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期45-51,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31660121)
云南省中青学术和技术带头人后备人才项目(2019HB013)
云南省万人计划青年拔尖人才项目(YNWR-QNRC-2019-047)。
文摘
为探究冷驯化条件下,胰岛素和甲状腺激素信号通路在中缅树鼩褐色脂肪组织(brown adipose tissue,BAT)中的调节机制,利用Illumina novaseq 6000平台对对照组和冷驯化组中缅树鼩BAT进行转录组测序,通过生物信息学分析筛选出与胰岛素和甲状腺激素相关的信号通路及候选基因。结果显示:冷驯化组较对照组,共2879个基因表达存在显著差异,其中1181个上调,1698个下调;GO分析结果显示细胞组分、分子功能、生物学过程分别显著富集到24、28和55条term,差异表达基因主要富集在生物学过程;KEGG分析差异表达基因显著富集到20条pathways,其中筛选到与胰岛素和甲状腺激素信号通路相关的候选基因有PDPK1、AKT2、ACACA、SLC2A4和THRB等。结果表明,中缅树鼩可通过调节BAT中胰岛素和甲状腺激素信号通路中基因表达来应对寒冷环境。
关键词
转录组
中缅树鼩
褐色脂肪组织
胰岛素
信号
通路
甲状腺激素
信号
通路
Keywords
Tupaia belangeri
transcriptome
brown adipose tissue
insulin signaling pathway
thyroid hormone signaling pathway
分类号
Q494 [生物学—生理学]
Q953
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学探讨三七对骨愈合的作用机制
吴文正
郑晓辉
高怡加
欧阳崇志
黄敏玲
杨锐敏
《广州中医药大学学报》
CAS
2020
4
原文传递
2
As_(2)O_(3)饮水慢性中毒对大鼠肝脏TRβ1介导的甲状腺激素信号通路的影响
王炼
王雪飞
高魁
郭迎春
张天阳
杨英
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
3
冷驯化下中缅树鼩BAT中主要内分泌信号通路转录组分析
王慧娟
贾婷
朱万龙
王政昆
《生物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
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