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老年人接种甲型流感疫苗前后在不同衰弱状态下基因表达变化
被引量:
1
1
作者
范皎
曾静
+2 位作者
史镜琪
徐国纲
李天志
《中华保健医学杂志》
2023年第5期526-530,共5页
目的通过对转录组测序数据分析,探索老年人接种甲型流感疫苗前后在不同衰弱状态下基因表达变化。方法从GEO数据库中下载转录组测序数据,分别计算衰弱与非衰弱老年人在接种疫苗前和接种后3、7 d的差异表达基因,并使用GO功能富集分析和KEG...
目的通过对转录组测序数据分析,探索老年人接种甲型流感疫苗前后在不同衰弱状态下基因表达变化。方法从GEO数据库中下载转录组测序数据,分别计算衰弱与非衰弱老年人在接种疫苗前和接种后3、7 d的差异表达基因,并使用GO功能富集分析和KEGG通路分析对差异基因进行功能注释;进一步根据差异基因的相关性,当设定关联系数阈值为0.85时,参数β=5,基于此创建基因共表达网络;分选出与临床表型呈显著性相关的基因模块,最终根据模块内部的相连性筛选出核心枢纽基因。结果衰弱和非衰弱老年人在接种疫苗前和接种后3、7 d,分别有2756、1558、1783个差异表达基因。依据差异基因表达的相关程度,共分选出12个基因共表达模块,其中绿色模块与年龄及衰弱状态表型呈显著相关;发现B3GAT1、PTGDR等17个基因位于共表达网络的核心区;生物注释功能结果进一步表明,模块内基因主要富集于适应性免疫应答、T细胞激活、NK细胞激活等生物学过程中。结论不同衰弱状态的老年人在接种甲型流感疫苗前后基因表达,免疫反应、T细胞激活等信号通路存在差异。
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关键词
衰弱
甲型
流感疫苗
接种
免疫反应
老年人
下载PDF
职称材料
题名
老年人接种甲型流感疫苗前后在不同衰弱状态下基因表达变化
被引量:
1
1
作者
范皎
曾静
史镜琪
徐国纲
李天志
机构
解放军总医院第二医学中心老年医学研究所、国家老年疾病临床医学研究中心
出处
《中华保健医学杂志》
2023年第5期526-530,共5页
基金
国家重点研发计划(2020YFC2002700)
国家自然科学基金面上项目(82070447)。
文摘
目的通过对转录组测序数据分析,探索老年人接种甲型流感疫苗前后在不同衰弱状态下基因表达变化。方法从GEO数据库中下载转录组测序数据,分别计算衰弱与非衰弱老年人在接种疫苗前和接种后3、7 d的差异表达基因,并使用GO功能富集分析和KEGG通路分析对差异基因进行功能注释;进一步根据差异基因的相关性,当设定关联系数阈值为0.85时,参数β=5,基于此创建基因共表达网络;分选出与临床表型呈显著性相关的基因模块,最终根据模块内部的相连性筛选出核心枢纽基因。结果衰弱和非衰弱老年人在接种疫苗前和接种后3、7 d,分别有2756、1558、1783个差异表达基因。依据差异基因表达的相关程度,共分选出12个基因共表达模块,其中绿色模块与年龄及衰弱状态表型呈显著相关;发现B3GAT1、PTGDR等17个基因位于共表达网络的核心区;生物注释功能结果进一步表明,模块内基因主要富集于适应性免疫应答、T细胞激活、NK细胞激活等生物学过程中。结论不同衰弱状态的老年人在接种甲型流感疫苗前后基因表达,免疫反应、T细胞激活等信号通路存在差异。
关键词
衰弱
甲型
流感疫苗
接种
免疫反应
老年人
Keywords
Frailty
Influenza A vaccine vaccination
Immune response
Older adults
分类号
R592 [医药卫生—老年医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
老年人接种甲型流感疫苗前后在不同衰弱状态下基因表达变化
范皎
曾静
史镜琪
徐国纲
李天志
《中华保健医学杂志》
2023
1
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