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基于关联规则映射的生物信息网络多维数据挖掘算法 被引量：33
1
作者 唐晓东 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2015年第6期1614-1616,1620,共4页
针对在生物信息网络中对复杂和大规模的数据集进行挖掘时所出现的算法挖掘精度低、运行速度慢、内存占用大等问题,提出一种基于关联规则映射的生物信息网络多维数据挖掘算法。该算法结合网络数据集之间的关联映射关系,从而确定网络数据... 针对在生物信息网络中对复杂和大规模的数据集进行挖掘时所出现的算法挖掘精度低、运行速度慢、内存占用大等问题,提出一种基于关联规则映射的生物信息网络多维数据挖掘算法。该算法结合网络数据集之间的关联映射关系,从而确定网络数据集的关联规则,并引入挖掘因子和相对误差来提高算法的挖掘精度;根据多维子空间中数据集之间的关联程度进行子空间区分以及子空间内数据集区分,从而实现对不同数据集的有效挖掘。在实验中,对不同数据集数量下的算法内存占用情况、算法挖掘精度、算法运行时间进行仿真,从实验结果可以看出基于关联规则映射的挖掘算法可以有效地提高挖掘精度,在减少内存占用和提升计算速度上也具有一定的优势。 展开更多
关键词 数据挖掘 关联规则映射 生物信息网络 多维数据挖掘
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LncRNA-疾病关联预测方法研究
2
作者 富坤 李佳宁 《医学信息》 2023年第4期166-169,174,共5页
越来越多的生物实验证实,长链非编码RNA(lncRNA)的功能异常与多种人类复杂疾病的发生具有明显关联。传统实验方法验证lncRNA-疾病关联费时费力,利用现有生物实验数据,通过计算方法预测lncRNA-疾病关联,可为生物实验设计提供重要参考,具... 越来越多的生物实验证实,长链非编码RNA(lncRNA)的功能异常与多种人类复杂疾病的发生具有明显关联。传统实验方法验证lncRNA-疾病关联费时费力,利用现有生物实验数据,通过计算方法预测lncRNA-疾病关联,可为生物实验设计提供重要参考,具有重要现实意义。本文对当前主流lncRNA-疾病关联预测的计算方法进行综述,总结各类方法的优点和不足,并展望后续模型的开发。 展开更多
关键词 长链非编码RNA lncRNA-疾病关联预测 生物信息网络 机器学习 深度学习
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基于关联规则映射的生物信息网络多维数据挖掘算法分析 被引量：2
3
作者 吐尔逊江.托合提 《无线互联科技》 2015年第19期35-36,共2页
要想对生物信息网络数据进行大范围的挖掘,所应用到的算法有很多不足之处,比如,精确度低,运行速度迟缓以及占内存等,基于这一背景,文章提出了一种能够对生物信息进行映射并关联的数据挖掘算法,这种算法不仅能够映射关联,确定网络数据集... 要想对生物信息网络数据进行大范围的挖掘,所应用到的算法有很多不足之处,比如,精确度低,运行速度迟缓以及占内存等,基于这一背景,文章提出了一种能够对生物信息进行映射并关联的数据挖掘算法,这种算法不仅能够映射关联,确定网络数据集,还能够基于算法引入相对误差,使算法的精确性提高。通过构建数据集间的关联,能够对空间内的数据进行区分,达到更好的数据挖掘效果。 展开更多
关键词 关联规则 映射 生物信息网络 数据挖掘算法
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GSDS:基因结构显示系统 被引量：198
4
作者 郭安源 朱其慧 +1 位作者 陈新 罗静初 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期1023-1026,共4页
构建了一个用于绘制基因结构示意图的网站系统(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)。用户可提交核酸序列、NCBI核酸序列号或基因外显子位置信息,得到基因结构示意图;并可指定在基因结构图上标注某些特定区域。系统允许用户同时输入多个基因,... 构建了一个用于绘制基因结构示意图的网站系统(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)。用户可提交核酸序列、NCBI核酸序列号或基因外显子位置信息,得到基因结构示意图;并可指定在基因结构图上标注某些特定区域。系统允许用户同时输入多个基因,并指定输出次序和标注区域。结果可用位图和矢量图两种图形格式显示。点击位图格式结果,可以查看相应序列。系统提供中英文两种用户界面。 展开更多
关键词 基因结构示意图 生物信息网络工具 计算机图形
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基于SVG的肠道微生物信息网络图的设计与实现 被引量：1
5
作者 牛志嘉 黄燕 +1 位作者 吴平 张日俊 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2008年第3期829-832,共4页
提出了采用SVG方法设计和实现Web方式肠道微生物信息网络图。用SVG图形描述动物肠道微生物信息的网络关系,提供交互式的表现形式;服务器端调用SPSS统计分析软件提供的数据分析接口,完成对试验数据的分析;并在知识库的指导下利用分析结果... 提出了采用SVG方法设计和实现Web方式肠道微生物信息网络图。用SVG图形描述动物肠道微生物信息的网络关系,提供交互式的表现形式;服务器端调用SPSS统计分析软件提供的数据分析接口,完成对试验数据的分析;并在知识库的指导下利用分析结果,根据SVG模板动态生成相应的SVG文档给用户提供显示。给出了采用这一方案的肠道微生物信息网络图的生成和显示模块的设计与实现,最后给出实际应用的效果。该系统的实施能给肠道微生物科研试验人员的研究工作提供帮助。 展开更多
关键词 肠道微生物信息网络图 基于WEB 可缩放矢量图形 可扩展标记语言
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国家基因库概述 被引量：9
6
作者 张勇 李启沅 +10 位作者 王县 周晓琳 魏冬琼 严志祥 王世鹏 钱璞毅 孙啸 万仟 程乐 周欣 汪建 《转化医学研究（电子版）》 2014年第4期111-117,共7页
国家基因库是服务于国家战略需求的国家级公益性创新科研及产业基础设施建设项目。2011年1月,国家发展改革委员会正式批复同意依托深圳华大基因研究院组建深圳国家基因库。同年10月国家发展改革委员会、财政部、工业和信息化部、国家卫... 国家基因库是服务于国家战略需求的国家级公益性创新科研及产业基础设施建设项目。2011年1月,国家发展改革委员会正式批复同意依托深圳华大基因研究院组建深圳国家基因库。同年10月国家发展改革委员会、财政部、工业和信息化部、国家卫生计划生育委员会(原卫生部)联合批复同意深圳国家基因库建设方案,相关项目列人国家战略性新兴产业发展专项资金计划。国家基因库建立集资源样本库、生物信息库、生物资源信息网络为一体的发展及运营模式,并由深圳华大基因研究院组建及运营,拟通过建立高水平的生物资源样本库、高效的生物信息数据处理、存储与管理系统以及覆盖广泛的联盟网络,有效保护、合理开发和利用我国生物资源及基因数据资源,该项目的建设实施有利于保护我国珍贵且特有的遗传资源,实现样本资源、基因及数据资源共享开发利用,提高我国遗传资源样本和基因信息数据的储存、分析、管理和应用能力,进而推动生命科学和生物产业发展。这对于我们国家抢占未来生物经济的战略制高点、掌控生物遗传资源、基因战略资源,具有极其重要的战略意义。 展开更多
关键词 国家基因库 资源样本库 生物信息库 生物资源信息网络
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生命科学的进展与生物信息网络 被引量：3
7
作者 朱定尔 《医学图书馆通讯》 1996年第4期2-2,共1页
近代生命科学迅猛发展,特别是作为生命科学的前沿——分子生物学的发展,已从根本上改变了它在自然科学中的地位和作用.有识之士都公认生命科学将在21世纪发挥推动科学进步的关键作用,21世纪也将成为公认的“生命科学世纪”.因此,加强发... 近代生命科学迅猛发展,特别是作为生命科学的前沿——分子生物学的发展,已从根本上改变了它在自然科学中的地位和作用.有识之士都公认生命科学将在21世纪发挥推动科学进步的关键作用,21世纪也将成为公认的“生命科学世纪”.因此,加强发展以生命科学为核心的科技情报信息研究和服务,已成为推动科学技术发展,实施“科教兴国”的先导.最近,在剑桥成立的“欧洲生物信息研究所”(EU- ropean Bioinformatics Institute,EBT),是第一个跨国信息研究所,是欧洲分子生物学实验室数据中心的延伸.该研究所与环球网(World Wide Web,WWW) 展开更多
关键词 生命科学 生物信息网络 情报工作自动化 中国
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中国微生物信息网络的建设
8
作者 马俊才 刘澎涛 等 《首都信息化》 2001年第5期54-54,共1页
关键词 微生物信息网络 INTERNET 数据库系统 中国
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