-
题名极小种群馨香玉兰特异性单核苷酸多态性位点开发
- 1
-
-
作者
张涛
李学
张竞
印轩鹏
贺水莲
-
机构
云南农业大学园林园艺学院
-
出处
《西部林业科学》
CAS
北大核心
2022年第4期68-74,共7页
-
基金
中国科学院昆明植物研究所云南省极小种群野生植物综合保护开放基金(PSESP2021F02)
云南省教育厅研究生科学研究基金(2020Y179)。
-
文摘
在馨香玉兰全基因组范围内进行特异性单核苷酸多态性(SNP)位点开发,为馨香玉兰濒危保护以及资源利用提供理论依据。利用以云南省5个野生居群和2个栽培居群共70个个体为材料,进行简化基因组测序技术(SLAF-seq),成功开发了843082个用于馨香玉兰SLAF建库的标签,其中多态性SLAF标记有287843个,通过数据质控,共获得了180650个高度一致性的群体SNP位点,利用SNP位点对馨香玉兰居群进行遗传多样性分析,结果显示:馨香玉兰的观测杂合度H_(o)为0.2697,期望杂合度H_(e)为0.3355,Shannon指数为0.5069,Nei多样性指数为0.3553。结果表明,利用SLAF-seq技术能够实现全基因组范围内的大量SNP标记位点开发,利用大量的SNP位点解析物种的遗传多样性更具准确性和先进性。
-
关键词
馨香玉兰
特异性单核苷酸多态性
遗传多样性
简化基因组测序技术
-
Keywords
Magnolia odoratissima
SNP
genetic diversity
SLAF-seq
-
分类号
S718.46
[农业科学—林学]
Q949.747.1
[生物学—植物学]
-
