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AFLP技术在细菌学分型和流行病学调查中的应用 被引量:6
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作者 娄静 祁国明 阚飙 《疾病监测》 CAS 2006年第6期321-324,共4页
关键词 片段长度多态性(rflp) 细菌分型 流行病学
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拟悬铃木根结线虫及其相似种的rDNA-ITS-RFLP分析
2
作者 李君实 赵洪海 +2 位作者 陈长法 赖凡 余冬冬 《植物检疫》 2006年第4期204-206,共3页
本文用特异性引物F195和V5367,对拟悬铃木根结线虫和花生根结线虫的核糖体DNA内转录间隔区(rDNAITS)进行了PCR扩增,扩增产物用5种限制性内切酶TaqⅠ、RsaⅠ、MspⅠ、ClaⅠ、HaeⅢ进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析。TaqⅠ、RsaⅠ、Ms... 本文用特异性引物F195和V5367,对拟悬铃木根结线虫和花生根结线虫的核糖体DNA内转录间隔区(rDNAITS)进行了PCR扩增,扩增产物用5种限制性内切酶TaqⅠ、RsaⅠ、MspⅠ、ClaⅠ、HaeⅢ进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析。TaqⅠ、RsaⅠ、MspⅠ、ClaⅠ酶切拟悬铃木根结线虫的rDNAITS扩增产物所获得限制性酶谱与花生根结线虫的限制性酶谱一致,只有HaeⅢ酶切拟悬铃木根结线虫和花生根结线虫的rDNAITS产物所得酶谱不同。rDNAITS扩增产物的HaeⅢ酶切图谱可以区分拟悬铃木根结线虫和花生根结线虫。 展开更多
关键词 拟悬铃木根结线虫 限制内切酶HaeⅢ 核糖体DNA内转录间隔区(rDNA-ITS) 限制 片段长度多态性(rflp)
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快速筛选高纯合度天麻PCR-RFLP鉴定方法 被引量:17
3
作者 谢莹 华中一 +3 位作者 赵玉洋 周骏辉 李晓琳 袁媛 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第17期113-118,共6页
目的:建立一种快速筛选高纯合度天麻种质材料的方法,为其纯系育种和杂交育种奠定基础。方法:以本课题组前期天麻全基因组测序和群体重测序为基础,利用单核苷酸多态性(SNP)位点开发20个限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)标记,并采用聚合... 目的:建立一种快速筛选高纯合度天麻种质材料的方法,为其纯系育种和杂交育种奠定基础。方法:以本课题组前期天麻全基因组测序和群体重测序为基础,利用单核苷酸多态性(SNP)位点开发20个限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)标记,并采用聚合酶链式反应(PCR)-RFLP法对15份天麻种质的20个RFLP标记进行限制性内切酶实验,根据20个RFLP标记位点酶切条带数目,计算15份天麻种质的纯合度,进而对天麻种质纯合度进行评估;在此基础上,利用基因组重测序技术对评估结果进行验证。结果:利用PCR-RFLP法筛选获得10份纯合度>95%的种质材料,其中3份种质材料的纯合度为95%,7份种质材料的纯合度为100%;利用基因组重测序法筛选获得9份纯合度>95%的种质材料,其中8份种质材料与PCR-RFLP法检测结果一致。结论:该文所建立的用于筛选高纯合度天麻种质的PCR-RFLP法精确度为80%,准确率为89%。该方法实验操作简便、检测效率高,且成本显著低于基因组重测序技术,为天麻纯系育种提供了技术支撑,也为其他中药材品种选育研究提供了借鉴。 展开更多
关键词 天麻 单核苷酸多态性(SNP)位点 限制内切酶片段长度多态性(rflp)标记 纯合度
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16S rDNA-RFLP技术鉴定西藏地区乳制品中的乳杆菌 被引量:16
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作者 于洁 孙志宏 +5 位作者 张家超 艾日登才次克 张彦斌 杨梅 孙天松 张和平 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期804-810,共7页
将16S rDNA PCR技术和RFLP技术相结合,对分离自乳制品中的乳杆菌进行分类和鉴定。从我国西藏地区传统发酵乳中分离出51株乳杆菌,采用通用引物扩增16S rDNA,利用限制性内切酶AluI,HaeⅢ和HinfⅠ将16S rDNA扩增产物进行酶切后,经聚丙烯酰... 将16S rDNA PCR技术和RFLP技术相结合,对分离自乳制品中的乳杆菌进行分类和鉴定。从我国西藏地区传统发酵乳中分离出51株乳杆菌,采用通用引物扩增16S rDNA,利用限制性内切酶AluI,HaeⅢ和HinfⅠ将16S rDNA扩增产物进行酶切后,经聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱将菌种鉴定到种的水平。根据16S rDNA-RFLP的结果从中选出8株有代表性的菌株进行生理生化实验和16S rDNA序列的测定,实验结果与RFLP鉴定结果相吻合,表明此方法是一种快速、准确的可用于大量乳杆菌分类和鉴定的方法。 展开更多
关键词 乳杆菌 鉴定 限制片段长度多态性(rflp) 16S RDNA序列
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阿胶原料驴源性成分的DNA分子鉴别方法 被引量:16
5
作者 罗晖明 肖炳燚 +5 位作者 聂平 刘丽 李文莉 丁野 舒毕琼 孙辉 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期202-211,共10页
目的:建立阿胶原料驴源性成分的鉴别方法。方法:通过聚合酶链式反应(PCR),扩增基因组上的线粒体细胞色素b(Cytb)基因,继而用限制性内切酶Bam HⅠ对该聚合酶链式反应产物进行酶切,将酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳及紫外成像。结果:驴源性成... 目的:建立阿胶原料驴源性成分的鉴别方法。方法:通过聚合酶链式反应(PCR),扩增基因组上的线粒体细胞色素b(Cytb)基因,继而用限制性内切酶Bam HⅠ对该聚合酶链式反应产物进行酶切,将酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳及紫外成像。结果:驴源性成分Cytb的PCR产物能够被Bam HⅠ酶切成76 bp和314 bp 2个片段,而马源性成分均不能够被酶切。结论:结合聚合酶链式反应与限制性内切酶片段长度多态性法(PCR-RFLP),可以鉴别阿胶原料驴源性成分。 展开更多
关键词 动物源中药 阿胶 驴源成分 DNA鉴别 细胞色素b(Cytb) 聚合酶链式反应(PCR) 限制内切酶片段长度多态性(rflp) BamH I
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分子标记技术及其在林木遗传改良研究中的应用 被引量:6
6
作者 梁机 《广西林业科学》 2001年第z1期1-6,共6页
分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种新的较为理想的遗传标记形式 ,近年来发展非常迅速。本文对 DNA限制性片段长度多态性 (RFL P)及随机扩增多态性 DNA(RAPD)遗传标记技术的基本原理与特点进行了简要介绍。全... 分子标记是继形态标记、细胞标记和生化标记之后发展起来的一种新的较为理想的遗传标记形式 ,近年来发展非常迅速。本文对 DNA限制性片段长度多态性 (RFL P)及随机扩增多态性 DNA(RAPD)遗传标记技术的基本原理与特点进行了简要介绍。全面阐述了 DNA分子标记技术在林木遗传连锁图谱构建、林木遗传资源研究、数量性状位点定位与分子标记辅助育种、目的基因追踪等研究方面的应用及前景。 展开更多
关键词 DNA分子标记 限制片段长度多态性(rflp) 随机扩增多态性DNA(RAPD) 遗传改良
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鳗鲡病原菌16S rRNA基因序列测定及系统进化分析 被引量:12
7
作者 马英 关瑞章 +2 位作者 郭松林 邓德波 张俊荣 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期758-763,共6页
对从福建省不同鳗鲡养殖场发病鳗鲡肝脏中分离并经感染证实的35株致病菌的16S rRNA基因进行序列测定和系统进化分析。用CTAB法提取各菌株DNA,以细菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增,用限制性片段长度多态性分析1、6S rDNA序列分析和系统进... 对从福建省不同鳗鲡养殖场发病鳗鲡肝脏中分离并经感染证实的35株致病菌的16S rRNA基因进行序列测定和系统进化分析。用CTAB法提取各菌株DNA,以细菌16S rDNA通用引物进行PCR扩增,用限制性片段长度多态性分析1、6S rDNA序列分析和系统进化分析对其进行分子鉴定,构建系统进化树。结果表明:35株致病菌分别属于γ-变形菌纲和厚壁菌门2大类群的6个属和1个科,主要种类是气单胞菌属的嗜水气单胞菌、维氏气单胞菌、简氏气单胞菌和豚鼠气单胞菌等,占63%;其次是芽孢杆菌属细菌;少量为鲁氏耶尔森菌、弗氏柠檬酸杆菌、克雷伯氏菌属、假交替单胞菌属细菌和肠杆菌科细菌。 展开更多
关键词 鳗鲡 病原菌 16S RRNA基因 限制片段长度多态性(rflp) 系统进化树
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军曹鱼的分子遗传特性研究 被引量:11
8
作者 刘楚吾 刘丽 +1 位作者 王中铎 黎雨轩 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期77-85,共9页
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)和线粒体DNA(mtDNA)的限制性片段长度多态性(RFLP)分析方法对广东湛江近海军曹鱼 Rachycentron canadum 的分子遗传学特征进行了研究。RAPD研究结果显示 17 个引物共检测到 119 个位点,其中多态位点比例 P ... 采用随机扩增多态性DNA(RAPD)和线粒体DNA(mtDNA)的限制性片段长度多态性(RFLP)分析方法对广东湛江近海军曹鱼 Rachycentron canadum 的分子遗传学特征进行了研究。RAPD研究结果显示 17 个引物共检测到 119 个位点,其中多态位点比例 P 为80.85%,遗传相似系数S为 0. 740 0,遗传距离 D 为 0. 260 0, Nei 基因多样性指数 H 为0.300 9,Shannon信息指数I为0.449 8。结果表明,军曹鱼的遗传多样性比较丰富。用 19种识别5、6碱基的限制性内切酶对军曹鱼的mtDNA RFLP进行了分析研究,构建其mtDNA物理图谱;用引物 5’ GTG ATC TGA AAA ACC ACC GTT G 3’和 5’ AAT AGG AAGTAT CAT TGC GGT TTG ATG 3’扩增线粒体细胞色素b区段,得到稳定的850bp大小的特异性条带,用18种识别4—6碱基的限制性内切酶对扩增片段的限制性长度多态性进行分析,并测定其序列。 展开更多
关键词 军曹鱼 随机扩增多态性DNA(RAPD) 限制片段长度多态性(rflp) 线粒体DNA(mtDNA) 遗传多样
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柑橘衰退病毒柚类分离株的分子鉴定 被引量:8
9
作者 宋震 周常勇 +2 位作者 周彦 王雪峰 唐科志 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期314-319,共6页
应用限制性片段长度多态性(RFLP)、双向逆转录-聚合酶链式反应(BD-PCR)、序列分析等技术对我国部分地区柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)柚类分离株进行了鉴定分析。结果表明:柚类以受相对单一的CTV株系侵染为主;柚类... 应用限制性片段长度多态性(RFLP)、双向逆转录-聚合酶链式反应(BD-PCR)、序列分析等技术对我国部分地区柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)柚类分离株进行了鉴定分析。结果表明:柚类以受相对单一的CTV株系侵染为主;柚类上的优势流行株系属于p25/Hin f ⅠRFLP6组群(占79.4%)和p23/BD-PCRⅢ组群(占84.1%);在对柚类CTV分离株S051~S058及国外CTV分离株PB61、T30、T36、T385、SY568、VT、NUAGA的p23、p25基因序列分析中,S051与弱毒株PB61的同源性最高;S052与弱毒株T30、T385的同源性最高;S053、S054、S055、S056、S057、S058与其它CTV分离株的同源关系均较远,并在系统发生树上形成了独立的分枝。 展开更多
关键词 柑橘衰退病毒(CTV) 限制片段长度多态性(rflp) 双向逆转录-聚合酶链式反应(BD-PCR) 序列分析
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不同C/N值下亚硝酸盐氧化菌和异养菌混合体系的微生物多样性(英文) 被引量:9
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作者 胡杰 李大平 +4 位作者 陶勇 张金莲 钟琦 何晓红 王晓梅 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期351-355,共5页
采用PCR-RFLP技术研究了不同C/N比下亚硝酸盐氧化菌及异养菌混合体系的微生物多样性,并探讨了微生物菌群结构与其功能(硝化性能)的关系.C/N=0时,混合体系主要由自养菌和寡营养菌(85.1%)组成,包括亚硝酸盐氧化菌(NOB)、拟杆菌门、α-变... 采用PCR-RFLP技术研究了不同C/N比下亚硝酸盐氧化菌及异养菌混合体系的微生物多样性,并探讨了微生物菌群结构与其功能(硝化性能)的关系.C/N=0时,混合体系主要由自养菌和寡营养菌(85.1%)组成,包括亚硝酸盐氧化菌(NOB)、拟杆菌门、α-变形菌纲、浮霉菌门和绿色非硫细菌中的一些菌株.C/N=0.44时,混合体系中的自养菌减少,异养菌(主要是γ-变形菌纲的成员)大量出现.C/N=8.82时,γ-变形菌纲的菌株尤其是反硝化菌Pseudomonassp.占主导(93.8%).与此同时,随着C/N升高,该混合体系的硝化性能也由专一的亚硝酸盐氧化过程转变为同时硝化反硝化过程.微生物菌群结构的转变较好地解释了其硝化性能的改变.本研究揭示了微生物菌群结构与其功能的内在联系,同时表明PCR-RFLP技术与化学分析相结合是研究微生物菌群结构与功能的有力工具. 展开更多
关键词 微生物多样 PCR-限制片段长度多态性(rflp) 亚硝酸盐氧化菌(NOB) C/N比
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脆肉鲩鱼在冷藏条件下的特定腐败菌分析 被引量:10
11
作者 潘子强 张玉山 +3 位作者 贾冠聪 陈铭溢 陈敏婷 李琳 《食品科技》 CAS 北大核心 2011年第9期36-40,共5页
利用16S rDNA克隆文库及限制性内切酶片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术分析脆肉鲩鱼在冷藏条件下的特定腐败菌。分别提取新鲜鱼肉及腐败的脆肉鲩鱼肉样品中的细菌总DNA并利用通用引物27F/1492R进行... 利用16S rDNA克隆文库及限制性内切酶片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术分析脆肉鲩鱼在冷藏条件下的特定腐败菌。分别提取新鲜鱼肉及腐败的脆肉鲩鱼肉样品中的细菌总DNA并利用通用引物27F/1492R进行PCR扩增,所得PCR产物用于构建克隆文库,阳性克隆子用RFLP进行分析。结果表明:新鲜鱼肉的克隆文库中细菌种类比较丰富,达15种类型,而腐败鱼肉的细菌种类只有7种,且有2种分型的细菌占优势,共占克隆子总数的88.4%。序列比对分析表明,这2种优势菌的16S rDNA序列与假单孢菌属(Pseudomonas)细菌的核苷酸序列的相似性高达99%,说明脆肉鲩鱼在冷藏条件下的特定腐败菌是假单孢菌(Pseudomonassp.)。 展开更多
关键词 脆肉鲩鱼 特定腐败菌 限制内切酶片段长度多态性(rflp) 假单孢菌
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16S rDNA-RFLP法快速鉴定蒙古国传统乳制品中的乳酸菌 被引量:6
12
作者 艾日登才次克 于洁 +4 位作者 杜晓华 李莉 王炜宏 孙天松 张和平 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 2009年第2期63-68,共6页
以17株标准菌株为参照,采用限制性片段长度多态性(RFLP)分析和16S rDNA序列分析相结合的技术,对分离自蒙古国5个地区传统乳制品中的55株乳酸菌进行了快速鉴定。结果表明,通过限制性内切酶AluⅠ、HaeⅢ、BsmaⅠ、TspRⅠ和HinfⅠ的指纹图... 以17株标准菌株为参照,采用限制性片段长度多态性(RFLP)分析和16S rDNA序列分析相结合的技术,对分离自蒙古国5个地区传统乳制品中的55株乳酸菌进行了快速鉴定。结果表明,通过限制性内切酶AluⅠ、HaeⅢ、BsmaⅠ、TspRⅠ和HinfⅠ的指纹图谱分析,将49株乳杆菌和2株片球菌准确鉴定到种,其他4株肠球菌鉴定到属。采用16S rDNA-RFLP方法鉴定乳酸菌具有准确性,可靠性和高效性。 展开更多
关键词 乳酸菌 快速鉴定 限制片段长度多态性(rflp) 16S RDNA序列分析
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临床常见镰刀菌的鉴别 被引量:7
13
作者 窦红涛 李若瑜 +4 位作者 万哲 李然 孙旭光 卜定方 王端礼 《中国真菌学杂志》 2008年第5期276-279,284,共5页
目的从分子生物学角度寻找一种快速准确鉴定临床常见镰刀菌的方法。方法将受试镰刀菌接种于PDA培养基,观察其菌落及镜下形态,在此基础上PCR扩增受试镰刀菌的rDNA ITS并测其序列,在GenBank核酸序列数据库进行同源序列搜索及分析。选择限... 目的从分子生物学角度寻找一种快速准确鉴定临床常见镰刀菌的方法。方法将受试镰刀菌接种于PDA培养基,观察其菌落及镜下形态,在此基础上PCR扩增受试镰刀菌的rDNA ITS并测其序列,在GenBank核酸序列数据库进行同源序列搜索及分析。选择限制性内切酶Dra Ⅱ和Cfr13 Ⅰ进行RFLP。设计了茄病镰刀菌的种特异性引物Sol1、Sol2,初步验证其特异性。结果形态学鉴定结果显示,茄病镰刀菌所占比例最高,除2株串珠镰刀菌外,其余镰刀菌ITS序列分析的结果与形态学鉴定结果一致。茄病、层生和串珠镰刀菌的Dra Ⅱ、Cfr13 I酶切带形互不相同。用Sol1、Sol2扩增受试菌的rDNA ITS,只有茄病镰刀菌为阳性。结论rDNA ITS序列测定及其PCR-RFLP可用于初步鉴别几种临床常见镰刀菌,合适的种特异性引物可以初步快速鉴定茄病镰刀菌。 展开更多
关键词 镰刀菌 内转录间隔区(ITS) 序列测定 限制片段长度多态性(rflp) 种特异引物
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肺癌易感性标记物与肺癌关系的病例对照研究 被引量:3
14
作者 曾勉 陈思东 +4 位作者 谢灿茂 汪保国 冯怿霞 陈漫霞 李碧辉 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期771-774,共4页
目的探讨谷胱甘肽转移酶(GST)和细胞色素CYP1A1、CYP2E1多态性与肺癌易感性的关系。方法用病例对照研究方法,收集广东籍新发原发性肺癌病人91例及同期非肺部疾患住院病人91例作对照,采用聚合酶链式反应(PCR)和限制性片段长度多态性(RFLP... 目的探讨谷胱甘肽转移酶(GST)和细胞色素CYP1A1、CYP2E1多态性与肺癌易感性的关系。方法用病例对照研究方法,收集广东籍新发原发性肺癌病人91例及同期非肺部疾患住院病人91例作对照,采用聚合酶链式反应(PCR)和限制性片段长度多态性(RFLP)技术检测病例和对照的CYP1A1、CYP2E1和GSTM1基因多态性。结果CYP1A1突变型(m2m2)与野生型(mlml)比较,OR值1.51;CYP2E1C1C1型与C1C2型比较,OR值1.80;C2C2型与C1C2型比较,OR值5.48;GSTM1基因缺失型与正常型比较;OR值1.26。两种基因联合分析结果表明:GSTM1基因缺失并携带CYPlAlm2m2与GSTM1基因正常并携带CYP1A1m1m1者比较,OR值2.29,GSTM1基因缺失并携带CYP2E1C1C1型者与GSTM1基因正常并携带CYP2E1C1C2型者比较,OR值2.13,携带CYP1A1m2m2型以及CYP2E1C1C1型者与携带CYP1A1m1m1型和CYPE1c1c2型者比较,OR值3.00。3种基因联合作用分析结果表明:携带CYP1A1m2m2型以及CYP2E1C1C1型并且GSTM1基因缺失者比携带CYP1A1m1m1型和CYP2E1c1c2型且GSTM1基因正常者提高了患肺癌的危险性,OR值3.97。结论CYP1A1、CYP2E1和GSTM1在单因素分析中末显示出与肺癌风险的联系,2个基因和3种基因的联合作用似乎可以提高患肺癌的危险性,但无统计学意义。提示这3种基因均不是肺癌个体易感性的主效基因,可能是次效基因。 展开更多
关键词 细胞色素P450 多态性 肺癌 PCR 限制片段长度多态性(rflp)
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重庆地区汉族CD14启动子区多态性分析 被引量:5
15
作者 冯凯 刘兴 蒋建新 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第18期1667-1669,共3页
目的 调查CD14 ( 2 60 )多态性在重庆地区汉族中的分布特征 ,及检验该随机样本遗传学研究的可靠性。方法 对 110名重庆汉族个体 ,采用降落式PCR和限制性片段长度多态性法 (RFLP)进行基因型分析。结果 重庆地区汉族CD14 ( 2 60 )多... 目的 调查CD14 ( 2 60 )多态性在重庆地区汉族中的分布特征 ,及检验该随机样本遗传学研究的可靠性。方法 对 110名重庆汉族个体 ,采用降落式PCR和限制性片段长度多态性法 (RFLP)进行基因型分析。结果 重庆地区汉族CD14 ( 2 60 )多态性TT、TC、CC 3种基因型频率分别为 43 6%、3 9 1%和 17 3 %;样本分布符合Hardy Weinberg平衡。结论 重庆汉族CD14 ( 2 60 )多态性基因型分布特征与白种人存在明显差异。样本为H W平衡群体 。 展开更多
关键词 降落式PCR(TD—PCR) 限制片段长度多态性(rflp) CD14
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湘西黄牛LPL基因exon5的多态性与生长性状的相关性 被引量:6
16
作者 王兴平 罗仍卓么 +2 位作者 李峰 王京仁 李娜 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2012年第4期792-796,共5页
脂蛋白脂酶(LPL)是机体脂质和脂蛋白代谢的关键酶,在脂质代谢、转运和能量代谢方面发挥着重要作用,影响着动物的生长发育。为探讨湘西黄牛LPL基因的分子遗传特征和寻找与生长性状相关的分子标记,采用PCR产物测序的方法检测了湘西黄牛LP... 脂蛋白脂酶(LPL)是机体脂质和脂蛋白代谢的关键酶,在脂质代谢、转运和能量代谢方面发挥着重要作用,影响着动物的生长发育。为探讨湘西黄牛LPL基因的分子遗传特征和寻找与生长性状相关的分子标记,采用PCR产物测序的方法检测了湘西黄牛LPL基因的SNP位点,并进行了LPL基因exon 5的g.365458G>A位点进行了群体遗传多态与生长性状的关联分析。SNP检测结果表明,LPL基因在Intron 4上新发现了3个SNP(g.365186A>C、g.365248C>T和g.365249C>T),在exon5的182 bp处检测到了1个SNP(g.365458G>A)。g.365458G>A位点的多态性检测结果表明,g.365458G>A位点存在AA、AG和GG 3种基因型,呈中度多态,且达到了Hardy-Weinberg平衡状态。多态性与生产性状的相关性分析结果表明,湘西黄牛AA基因型个体的体高和胸围显著大于GG基因型个体(P<0.05),AA基因型个体的体长和体重极显著大于GG基因型个体(P<0.01)。A等位基因对湘西黄牛的体高、体长、胸围和体重都为正效应,而G等位基因都为负效应。推测LPL基因exon5的g.365458G>A位点有可能作为湘西黄牛生长性状的分子遗传标记位点。 展开更多
关键词 湘西黄牛 LPL基因 限制片段长度多态性(rflp) 生长
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分子生物学技术在寄生虫病防治研究中的应用 被引量:3
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作者 肖方震 许龙善 张山鹰 《海峡预防医学杂志》 CAS 2005年第6期19-22,共4页
分子生物技术在寄生虫病诊断、分类以及流行病学调查方面得到广泛应用,本文就 PCR、PCR-RFLP、RAPD 等目前常用的分子技术作一综述,旨在为寄生虫病防治提供一定的参考价值。
关键词 寄生虫病 分子生物学 限制片段长度多态性(rflp) 随机扩增多态性DNA(RAPD)
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我国4种白蛉的核糖体内转录间隔2区PCR-RFLP多态性分析 被引量:4
18
作者 顾灯安 张仪 兰勤娴 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期100-101,108,共3页
采用PCR-RFLP方法对我国内脏利什曼病传播媒介中华白蛉(Phlebotomus chinensis)、吴氏白蛉(Ph.wui)、长管白蛉(Ph.longiductus)和亚历山大白蛉(Ph.alexandri)等4种白蛉的核糖体内转录间隔2区(ITS2)进行分型。PCR-RFLP结果显示,以限制性... 采用PCR-RFLP方法对我国内脏利什曼病传播媒介中华白蛉(Phlebotomus chinensis)、吴氏白蛉(Ph.wui)、长管白蛉(Ph.longiductus)和亚历山大白蛉(Ph.alexandri)等4种白蛉的核糖体内转录间隔2区(ITS2)进行分型。PCR-RFLP结果显示,以限制性内切酶DraⅠ酶切ITS2片段,可分出4种RFLP带型,即A为450 bp,B为154 bp/127 bp/93 bp/66 bp/10 bp,C为311 bp/80 bp/60 bp,D为353 bp/300 bp/160 bp/58 bp。结果显示,4种白蛉均只有1种RFLP带型,中华白蛉为AA型,亚历山大白蛉为BB型,吴氏白蛉为CC型,长管白蛉为DD型。利用PCR-RFLP方法可区分我国4种内脏利什曼病传播媒介的种类。 展开更多
关键词 白蛉 内转录间隔2区(ITS2) 限制片段长度多态性(rflp)
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一种优良半矮秆水稻品种的分离与分子鉴定 被引量:4
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作者 林建中 杨远柱 +4 位作者 赵小英 唐冬英 周波 杜长青 刘选明 《湖南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第8期66-73,共8页
株1S是中国南方稻区杂交水稻育种广泛应用的优良籼型温敏雄性核不育系.为了改良其农艺性状,我们采用体细胞无性系诱变方法筛选半矮秆突变体.本文报道了2个体细胞无性系突变体SV1S和SV14S的表型和初步分子鉴定结果.与亲本株1S相比,突变... 株1S是中国南方稻区杂交水稻育种广泛应用的优良籼型温敏雄性核不育系.为了改良其农艺性状,我们采用体细胞无性系诱变方法筛选半矮秆突变体.本文报道了2个体细胞无性系突变体SV1S和SV14S的表型和初步分子鉴定结果.与亲本株1S相比,突变体的高度降低,基部节间长度缩短,节间壁显著增厚,但是上部的节间变化不明显.更重要的是,我们发现赤霉素生物合成途径中的关键酶基因GA20ox-2出现了约200bp的缺失突变,导致该基因在半矮秆突变体中的转录水平降低.研究结果表明,突变体SV1S和SV14S很可能是由于同一缺失突变导致赤霉素合成受阻,从而部分导致了半矮秆性状的出现.然而,2个突变体苗期的高度相同,以及糊粉层细胞!-淀粉酶活性和赤霉素敏感性降低等性状与以前报道的sd-1突变体有所不同.因此,我们推测在SV突变体中可能还存在第二个突变位点.该结果也进一步证实了体细胞无性系诱变在水稻育种中具有良好的应用前景. 展开更多
关键词 诱变 GA20ox-2 赤霉素 限制片段长度多态性(rflp) 水稻(Oryza SATIVA L.) 半矮秆
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云南东川黄铜矿酸性浸矿废水中微生物群落分析 被引量:3
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作者 戴志敏 尹华群 +1 位作者 曾晓希 刘学端 《现代生物医学进展》 CAS 2007年第11期1608-1611,共4页
利用限制性片段长度多态性和16s rRNA PCR扩增及其序列分析来研究中国云南东川黄铜矿酸性浸矿废水(AMD)中微生物群落结构。基于建立16s rRNA克隆文库的分子方法常常被用来研究AMD中微生物生态。一小部分的rRNA被PCR扩增,克隆,然后用限... 利用限制性片段长度多态性和16s rRNA PCR扩增及其序列分析来研究中国云南东川黄铜矿酸性浸矿废水(AMD)中微生物群落结构。基于建立16s rRNA克隆文库的分子方法常常被用来研究AMD中微生物生态。一小部分的rRNA被PCR扩增,克隆,然后用限制性片段长度多态性来筛选出其不同种类。在三个样地中,共挑选了357个克隆子,经限制性酶切分析后聚为100个可操作分类单元(OTU)。一个OTU代表各个样地中出现的同一种酶切图谱。有58个OTU被测序分析,结果在基因数据库中比对分析,其系统发育分析表明它们聚类为六大类:γ-proteobacteria,Acidobacteria,Clostridia,Actinobacteria,Nitrospira,α-pro- teobacteria。其中,γ-proteobacteria为最大的群落,在三个样地DCK-Ⅰ,DCN-Ⅰand DC-Ⅱ中分别占36%,57%,62%的比例。但与浸矿相关的微生物如At.ferrooxidans;L ferrooxidans等却发现的很少,仅在两个样地中各发现四个相关的OTUs。在这个AMD环境中浸矿相关的微生物都不是优势种群。 展开更多
关键词 限制片段长度多态性(rflp) 系统发育树 矿坑水
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