利用16S rDNA克隆文库及限制性内切酶片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术分析脆肉鲩鱼在冷藏条件下的特定腐败菌。分别提取新鲜鱼肉及腐败的脆肉鲩鱼肉样品中的细菌总DNA并利用通用引物27F/1492R进行...利用16S rDNA克隆文库及限制性内切酶片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术分析脆肉鲩鱼在冷藏条件下的特定腐败菌。分别提取新鲜鱼肉及腐败的脆肉鲩鱼肉样品中的细菌总DNA并利用通用引物27F/1492R进行PCR扩增,所得PCR产物用于构建克隆文库,阳性克隆子用RFLP进行分析。结果表明:新鲜鱼肉的克隆文库中细菌种类比较丰富,达15种类型,而腐败鱼肉的细菌种类只有7种,且有2种分型的细菌占优势,共占克隆子总数的88.4%。序列比对分析表明,这2种优势菌的16S rDNA序列与假单孢菌属(Pseudomonas)细菌的核苷酸序列的相似性高达99%,说明脆肉鲩鱼在冷藏条件下的特定腐败菌是假单孢菌(Pseudomonassp.)。展开更多
文摘应用限制性片段长度多态性(RFLP)、双向逆转录-聚合酶链式反应(BD-PCR)、序列分析等技术对我国部分地区柑橘衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)柚类分离株进行了鉴定分析。结果表明:柚类以受相对单一的CTV株系侵染为主;柚类上的优势流行株系属于p25/Hin f ⅠRFLP6组群(占79.4%)和p23/BD-PCRⅢ组群(占84.1%);在对柚类CTV分离株S051~S058及国外CTV分离株PB61、T30、T36、T385、SY568、VT、NUAGA的p23、p25基因序列分析中,S051与弱毒株PB61的同源性最高;S052与弱毒株T30、T385的同源性最高;S053、S054、S055、S056、S057、S058与其它CTV分离株的同源关系均较远,并在系统发生树上形成了独立的分枝。