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汉坦病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:8
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作者 胡丹 郝丽娜 +12 位作者 李丙军 张锦海 吕恒 张凤玉 龚秀芳 耿美玲 谭维国 操敏 郑峰 朱进 姚苹苹 张云 王长军 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2014年第4期347-350,355,共5页
目的通过建立汉坦病毒实时荧光定量PCR检测方法,快速准确地检测汉坦病毒。方法根据汉滩型和汉城型汉坦病S片段基因的序列分别设计特异性探针引物,使用含有目的基因片段的重组质粒标准品绘制标准曲线,建立检测两型汉坦病毒的实时荧光定量... 目的通过建立汉坦病毒实时荧光定量PCR检测方法,快速准确地检测汉坦病毒。方法根据汉滩型和汉城型汉坦病S片段基因的序列分别设计特异性探针引物,使用含有目的基因片段的重组质粒标准品绘制标准曲线,建立检测两型汉坦病毒的实时荧光定量PCR方法。结果建立的检测方法特异性良好,与其他常见病原不发生交叉反应;最低检测限为101copies/μl,灵敏度高;不同梯度定量模板的拷贝数的对数值与Ct值之间线性关系表达式分别为y=-3.4607x+40.988(HTN),y=-3.5307x+39.356(SEO),扩增效率分别为92.2%(HTN)和92.6%(SEO),相关系数R2分别为0.9968(HTN)和0.9997(SEO),呈良好的线性关系,且重复性好。结论建立的实时荧光定量PCR灵敏度高,重复性好,可用于汉坦病毒的快速检测,并可初步辨别汉滩型和汉城型汉坦病毒,对肾综合征出血热的病原早期诊断和流行病学调查有较好的应用价值。 展开更多
关键词 汉坦病毒 荧光定量PCR S片段基因
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汉坦病毒84Fli株S和M片段基因克隆、序列分析及在真核细胞中表达的研究 被引量:3
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作者 刘尊 李德新 +3 位作者 李川 王晓芳 孟祥芝 梁米芳 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期48-51,共4页
目的 克隆汉坦病毒 84Fli株S ,M片段 ,测定这些基因的核苷酸序列 ,用瞬时表达了解S和M片段在真核细胞中的表达。方法 以我国分离的汉坦病毒 84Fli株感染的Vero E6细胞提取总RNA ,用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)技术扩增其S及M片段的... 目的 克隆汉坦病毒 84Fli株S ,M片段 ,测定这些基因的核苷酸序列 ,用瞬时表达了解S和M片段在真核细胞中的表达。方法 以我国分离的汉坦病毒 84Fli株感染的Vero E6细胞提取总RNA ,用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)技术扩增其S及M片段的全长cDNA。然后将 84Fli株的S ,M片段cDNA基因分别克隆入pCR2 1 TOPO载体中 ,随机挑选其中的 3个克隆测定核酸序列 ,确定汉坦病毒 84Fli株S和M片段核苷酸序列。根据S和M片段核苷酸序列设计引物 ,PCR扩增S及M片段的编码区 ,构建了真核表达质粒pcDNA3 84SC及pcDNA3 84MC。用质脂体法把质粒转入COS7细胞 ,瞬时表达NP及G1和G2糖蛋白。用免疫荧光 (IFA)、Westernblot和免疫沉淀方法检测核蛋白及糖蛋白的表达。结果 汉坦病毒 84Fli株的基因组S片段长度为 16 88个核苷酸 ,编码 430个氨基酸。汉坦病毒 84Fli株的基因组M片段长度为 36 16个核苷酸 ,编码 1136个氨基酸。用免疫荧光 (IFA)检测S和M片段在COS细胞中的瞬时表达为阳性。Westernblot结果显示 ,存在有相对分子质量为 5 0 0 0 0左右的核蛋白表达 ,免疫沉淀法显示有核蛋白、G1和G2糖蛋白的表达。结论  84Fli株病毒和其他汉滩病毒在核苷酸序列上虽有差异 ,但在氨基酸水平上的同源性仍很高 。 展开更多
关键词 汉坦病毒 片段基因 核苷酸序列分析 瞬时表达 克隆
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汉坦病毒M和S片段基因的克隆及在成纤维细胞中的瞬时表达
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作者 张梦寒 诸葛洪祥 《江苏医药》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期675-677,F0005,共4页
目的构建汉城病毒M片段和汉滩病毒部分S片段的重组基因pEGFP-M-S,并在成纤维细胞L929中进行瞬时表达。方法用PCR方法克隆分别装在两个模板载体中的部分M片段,连接入pcDNA3·1载体,利用简并密码子得到完整的M片段。将汉城病毒M片段... 目的构建汉城病毒M片段和汉滩病毒部分S片段的重组基因pEGFP-M-S,并在成纤维细胞L929中进行瞬时表达。方法用PCR方法克隆分别装在两个模板载体中的部分M片段,连接入pcDNA3·1载体,利用简并密码子得到完整的M片段。将汉城病毒M片段开放阅读框全长3·4kb的基因与装有汉滩病毒S片段5’末端0·7kb基因的载体pEGFP-HTNV-S0·7用酶切位点连接,构成4·1kb的重组基因,并转染成纤维细胞,进行48h、72h表达。结果成功得到预期大小的4·1kb的重组基因,并在成纤维细胞中进行了瞬时表达。结论汉城病毒M片段和汉滩病毒部分S片段基因的重组基因在成纤维细胞中瞬时表达,产生了M片段的约70kD和55kD的两个糖蛋白,并在与S片段拼接处经蛋白酶切割产生了约26kD的核蛋白,免疫印迹分析产生的约26kD的蛋白具有抗汉坦病毒的抗原活性。 展开更多
关键词 汉坦病毒 成纤维细胞 瞬时表达 成纤维细胞L929 抗汉坦病毒 片段基因 克隆 pcDNA3.1 重组基因 汉滩病毒
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利用同序异尾限制性内切酶快速克隆多基因片段的新方法 被引量:10
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作者 杜广营 朱乃硕 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第6期584-588,共5页
介绍一种可以快速进行多基因片段克隆的新方法——同序异尾限制性内切酶(isoschizomer-heterotailrestrictionendonuclease,IHRE)一步克隆法,该方法可以一步完成多达6个DNA片段的连接,具有简单快速、节省试剂、成功率高、不引入非目的... 介绍一种可以快速进行多基因片段克隆的新方法——同序异尾限制性内切酶(isoschizomer-heterotailrestrictionendonuclease,IHRE)一步克隆法,该方法可以一步完成多达6个DNA片段的连接,具有简单快速、节省试剂、成功率高、不引入非目的基因序列等很多优点.应用该方法已经成功完成对人肠激酶轻链多基因克隆、HSV多表位DNA疫苗的构建等. 展开更多
关键词 分子生物学 同序异尾限制性内切酶(IHRE) 克隆 片段基因
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重叠延伸PCR技术及其在生物学中的应用 被引量:9
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作者 李守宇 《生物学教学》 2013年第4期65-66,共2页
重叠延伸PCR技术是一种通过寡聚核苷酸链之间重叠的部分互相搭桥、互为模板,通过多次PCR扩增,从而获得目的DNA基因片段的方法。该技术高效、快捷、经济,在基因功能研究方面显示良好的应用前景。
关键词 重叠延伸PCR技术 片段基因合成 融合基因构建 基因定点诱变
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近江牡蛎核糖体DNA片段基因序列及其分子分类研究 被引量:8
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作者 罗巍 邹丽珍 +1 位作者 郑天凌 林荣澄 《台湾海峡》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期322-329,i0001,共9页
本文应用分子系统发育学的方法,以“白蚝”和“赤蚝”的18SrDNA、ITS1和ITS2片段序列信息为分子标记,对它们的分类地位进行了探讨.综合上述3种分子标记的分析结果,初步认为“白蚝”应属于近江牡蛎,而“赤蚝”可能不属于近江牡蛎.
关键词 分子生物学 片段基因系列 分子系统发育 近江牡蛎
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变形链球菌表面蛋白多肽片段在转基因番茄中的表达 被引量:5
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作者 郑雨燕 凌均棨 麦穗 《华西口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期180-183,共4页
目的在获得含编码变形链球菌表面蛋白唾液粘附区片段基因的转基因番茄原代种子的基础上,应用分子生物学的方法检测外源基因在转基因植株中的表达。方法用CTAB法提取子代番茄总DNA,PCR筛选含变形链球菌PAc基因唾液粘附区片段的转基因番... 目的在获得含编码变形链球菌表面蛋白唾液粘附区片段基因的转基因番茄原代种子的基础上,应用分子生物学的方法检测外源基因在转基因植株中的表达。方法用CTAB法提取子代番茄总DNA,PCR筛选含变形链球菌PAc基因唾液粘附区片段的转基因番茄子代植株;用Trizol提取番茄总RNA,RT-PCR检测外源基因的转录情况;提取番茄果实总蛋白,用Bradford法测定番茄果实总蛋白含量;通过Western blot检测外源蛋白的表达情况,并用ELISA法对外源蛋白含量进行定量测定。结果获得植物细胞染色体上整合有外源基因并发生表达的转基因番茄子代植株;Western blot和ELISA分析表明含编码变形链球菌表面蛋白唾液粘附区片段基因的转基因番茄子代植株能有效表达外源蛋白,该蛋白含量占番茄可溶性总蛋白的1.2%。结论含编码变形链球菌表面蛋白唾液粘附区片段基因的转基因番茄子代植株能有效表达外源蛋白。 展开更多
关键词 变形链球菌表面蛋白唾液粘附区片段基因 基因番茄 基因表达
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采用PCR技术从高GC含量绿脓杆菌模板中扩增长片段外毒素A全基因 被引量:5
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作者 胡晓梅 饶贤才 +3 位作者 黄建军 金晓琳 朱军民 胡福泉 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第9期833-834,共2页
关键词 PCR技术 高GC含量 绿脓杆菌模板 DNA 外毒素A PCR扩增 片段基因
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江苏省新型布尼亚病毒分离株全长S片段基因特征分析 被引量:5
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作者 董梅 姚学君 马永法 《预防医学》 2019年第1期65-67,共3页
目的分析江苏省新型布尼亚病毒(SFTSV)分离株全长S片段基因的特征,为SFTSV监测和防控提供依据。方法通过GenBank获取江苏省上传的SFTSV毒株全长S片段基因序列信息,通过构建系统进化树鉴定基因型,分析各毒株间核苷酸和氨基酸序列的同源... 目的分析江苏省新型布尼亚病毒(SFTSV)分离株全长S片段基因的特征,为SFTSV监测和防控提供依据。方法通过GenBank获取江苏省上传的SFTSV毒株全长S片段基因序列信息,通过构建系统进化树鉴定基因型,分析各毒株间核苷酸和氨基酸序列的同源性。结果获取江苏省上传的35株SFTSV毒株基因信息,毒株分离年份为2010—2014年,主要为人源毒株,有28株,占80.00%。基因亚型主要为C4和C2,分别有16和14株,分别占45.71%和40.00%。35株SFTSV毒株全长S片段基因核苷酸序列同源性百分比为94.38%~100.00%,氨基酸序列同源性百分比为89.42%~100.00%;35株毒株与各亚型参考毒株间核苷酸序列同源性百分比为94.11%~100.00%,氨基酸序列同源性百分比为89.18%~100.00%;人源毒株与宿主动物分离株间核苷酸和氨基酸同源性为94.74%~99.91%和91.42%~99.80%。结论江苏省SFTSV分离株序列间亲缘性较近,其核苷酸和氨基酸高度同源。 展开更多
关键词 新型布尼亚病毒 全长S片段基因 分子流行病学 同源性
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基因倍增研究进展 被引量:4
10
作者 李鸿健 谭军 《生命科学》 CSCD 2006年第2期150-154,共5页
基因倍增是指DNA片段在基因组中复制出一个或更多的拷贝,这种DNA片段可以是一小段基因组序列、整条染色体,甚至是整个基因组。基因倍增是基因组进化最主要的驱动力之一,是产生具有新功能的基因和进化出新物种的主要原因之一。本文综述... 基因倍增是指DNA片段在基因组中复制出一个或更多的拷贝,这种DNA片段可以是一小段基因组序列、整条染色体,甚至是整个基因组。基因倍增是基因组进化最主要的驱动力之一,是产生具有新功能的基因和进化出新物种的主要原因之一。本文综述了脊椎动物、模式植物和酵母在进化过程中基因倍增研究领域的最新进展,并讨论了基因倍增研究的发展方向。 展开更多
关键词 基因倍增 片段基因组倍增 串联倍增 功能趋异
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辽宁省2011—2017年发热伴血小板减少综合征流行病学特征与M片段基因序列分析 被引量:5
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作者 宗莉 刘学升 +6 位作者 毛玲玲 孙英伟 王子江 孙思浓 刘芸 张洁 赵卓 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期644-647,共4页
目的了解辽宁省2011—2017年发热伴血小板减少综合征(SFTS)的流行病学特征及病毒分离株的基因型分布和进化规律,为SFTS的诊断和制定预防控制策略和措施提供参考依据。方法以辽宁省2011年1月—2017年12月SFTS确诊病例为研究对象,描述疾... 目的了解辽宁省2011—2017年发热伴血小板减少综合征(SFTS)的流行病学特征及病毒分离株的基因型分布和进化规律,为SFTS的诊断和制定预防控制策略和措施提供参考依据。方法以辽宁省2011年1月—2017年12月SFTS确诊病例为研究对象,描述疾病的流行病学特征;将病原体按年份进行分层随机抽样,每年随机选取5株,采用RT-PCR方法扩增分离株M片段基因序列,应用软件Mega6.0软件进行同源性分析,构建亲缘进化树。结果辽宁省2011年1月—2017年12月共报告SFTS确诊病例438例,死亡病例19例,病死率为4.34%;发病时间集中于春夏季,每年7—9月为发病高峰;省内高发地区为丹东市(242例)和大连市(144例);主要发病人群集中于≥45岁中老年人群,占总报告病例数的89.95%;农民及家务待业者发病较多,占总报告病例数的91.32%。基因序列分析结果显示,辽宁省35株发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(SFTSV)分离株的核苷酸序列同源性分别为92.20%~100%,且在C和J2个基因型上均有分布,25株分布在C2基因型分支。结论辽宁省SFTS发病具有一定的季节性和地域性,≥45岁的中老年农民为高危人群;2011—2017年辽宁省SFTSV流行优势株为C2基因亚型。 展开更多
关键词 发热伴血小板减少综合征(SFTS) 流行病学特征 M片段基因序列分析
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PCR技术及影响扩增大片段基因产量的因素 被引量:3
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作者 段子渊 《草食家畜》 1997年第4期18-20,共3页
从PCR技术的原理和操作程序出发,分析与综述了影响扩增大片段目的基因的因素,提出了提高扩增大片段基因产量及特异性的可能途径。
关键词 PCR 片段基因 产量 特异性
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一种用于构建红色红曲霉基因组cosmid文库的大片段DNA制备方法 被引量:4
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作者 安洋 杨晶 +1 位作者 徐欣欣 刘钢 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1385-1388,共4页
【目的】制备用于构建红色红曲霉cosmid文库的大片段基因组DNA。【方法】采用优化的酚氯仿抽提法制备DNA,并利用Sau3AI切割至平均大小为40 kb,然后使用Stratagene包装蛋白构建cosmid文库。基于PCR法使用同源探针从该文库中进行了目的基... 【目的】制备用于构建红色红曲霉cosmid文库的大片段基因组DNA。【方法】采用优化的酚氯仿抽提法制备DNA,并利用Sau3AI切割至平均大小为40 kb,然后使用Stratagene包装蛋白构建cosmid文库。基于PCR法使用同源探针从该文库中进行了目的基因的筛选。【结果】制备了浓度为5μg/μL,平均片段大小大于48 kb的红色红曲霉大片段基因组DNA。利用该DNA构建的cosmid文库基因组覆盖倍数为10,并筛选到了含有目的片段的cosmid。【结论】通过该方法制备红色红曲霉大片段基因组DNA简便易行并且完全可以用于构建cosmid文库。 展开更多
关键词 红色红曲霉 片段基因组DNA cosmid文库
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长片段基因FMNL2 PCR实验的体会 被引量:3
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作者 曾元凤 肖移生 +1 位作者 梁莉 丁彦青 《南昌大学学报(医学版)》 CAS 2013年第4期19-21,共3页
目的尝试扩增长片段FMNL2基因。方法采用巢式PCR或和降落PCR相结合的方法进行了FMNL2基因编码区全长及FMNL2-NT、-CT的扩增。结果高效、特异地扩增出FMNL2基因编码区全长及FMNL2-NT、-CT片段。结论巢式PCR或和降落PCR相结合,提高了目的... 目的尝试扩增长片段FMNL2基因。方法采用巢式PCR或和降落PCR相结合的方法进行了FMNL2基因编码区全长及FMNL2-NT、-CT的扩增。结果高效、特异地扩增出FMNL2基因编码区全长及FMNL2-NT、-CT片段。结论巢式PCR或和降落PCR相结合,提高了目的基因的扩增效率和扩增产物的特异性。 展开更多
关键词 巢式PCR 降落PCR 片段基因 FMNL2
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汉滩病毒西安分离84FLi的M片段全基因序列测定及分析 被引量:3
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作者 李新红 杨为松 +4 位作者 杭长寿 白雪帆 马本江 黄长形 李光玉 《第四军医大学学报》 北大核心 2002年第8期728-731,共4页
目的 测定我国肾综合征出血热患者流产胎儿肝脏分离病毒 84 FL i株的全 M片段基因序列 ,了解其分子基础 .方法 采用反转录 -聚合酶链反应 (RT- PCR) ,分节段扩增 M基因片段的 c DNA,直接用 PCR产物或克隆入 p MD18- T载体后进行测序 ... 目的 测定我国肾综合征出血热患者流产胎儿肝脏分离病毒 84 FL i株的全 M片段基因序列 ,了解其分子基础 .方法 采用反转录 -聚合酶链反应 (RT- PCR) ,分节段扩增 M基因片段的 c DNA,直接用 PCR产物或克隆入 p MD18- T载体后进行测序 .结果  84 FL i株的全 M基因序列组成为 :M片段基因共由 36 16个核苷酸组成 ,四种核苷酸的比例分别为A 30 .92 % ,C 18.0 3% ,G 2 1.18% ,T 2 9.87% . GC含量为39.2 1% ,AT含量为 6 0 .79% .最大开放读码框为 4 1~ 344 8,共编码 1135个氨基酸 .核苷酸序列同源性分析表明 84 FL i株与 HTN型同源性高于与其他型汉坦病毒的同源性 ,其中与中国株的同源性较高 ,与 HV114株的同源性为 85 .5 % .与HTNV的国际标准毒株 76 - 118的核苷酸同源性分别为84 .0 % ,氨基酸的同源性为 96 .0 % .结论  84 FL i株属于汉滩型病毒 。 展开更多
关键词 汉滩病毒 84FLi株 序列分析 系统发生树 M片段基因序列 测定
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细菌人工染色体文库的构建方法分析 被引量:1
16
作者 吴宏梅 刘长青 +4 位作者 刘帅 包阿东 陆涛峰 关伟军 马月辉 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第2期83-87,共5页
细菌人工染色体是一种承载大片段DNA的新型载体系统,它具有插入片断大、嵌合率低、遗传稳定性好、易于操作等优点。在高等生物基因组文库的构建和基因功能的分析等方面有广泛应用。BAC文库的构建是基因组较大的真核生物基因组学研究的... 细菌人工染色体是一种承载大片段DNA的新型载体系统,它具有插入片断大、嵌合率低、遗传稳定性好、易于操作等优点。在高等生物基因组文库的构建和基因功能的分析等方面有广泛应用。BAC文库的构建是基因组较大的真核生物基因组学研究的重要基础。介绍了近年来细菌人工染色体文库构建方法上的研究进展,对其中载体的制备和高分子量DNA的制备这两个关键环节作了较深入的探讨。 展开更多
关键词 细菌人工染色体 基因组文库 构建方法 载体制备 片段基因DNA制备
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白念珠菌酵母相细胞长片段基因表达系列分析文库的构建和初步分析 被引量:1
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作者 周村建 郝飞 +3 位作者 邓永键 李永平 王鲁 钟白玉 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期966-968,共3页
目的构建白念珠菌酵母相细胞长片段基因表达系列分析文库并探讨其基因表达特点。方法采用长片段基因表达系列分析技术(LongSAGE)构建白念珠菌酵母相细胞LongSAGE文库,并从中挑取1000个阳性克隆进行测序。结果成功构建了白念珠菌酵母相细... 目的构建白念珠菌酵母相细胞长片段基因表达系列分析文库并探讨其基因表达特点。方法采用长片段基因表达系列分析技术(LongSAGE)构建白念珠菌酵母相细胞LongSAGE文库,并从中挑取1000个阳性克隆进行测序。结果成功构建了白念珠菌酵母相细胞LongSAGE文库。1000个测序文件中,共获得标签17773个,代表单一转录本7333种,其中单一匹配标签占16·65%,多重匹配标签占6·59%,推测蛋白标签占16·27%,基因组及粘粒等标签占1·64%,新标签为58·86%。标签拷贝数超过35的33个高表达标签中有11个可能属于新的表达序列。结论LongSAGE是一种能够快速、高通量地研究细胞基因表达谱及其丰度的方法,可发现新的表达序列。 展开更多
关键词 念珠菌 白色 二态性 基因表达谱 片段基因表达系列分析
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肝癌组织及细胞系总RNA抽提逆转及基因克隆方法的改进与比较 被引量:1
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作者 易濒 常宏 曹毅 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期520-526,共7页
该文建立了高效肝组织及细胞总RNA抽提、反转录以进行基因克隆和实时定量PCR(q-RT-PCR)的方法。比较了2种反转录酶(M-MLV和SuperScriptII)、2种cDNA合成引物(OligodT和random 6 primer)对总RNA反转录效率的影响,与4种DNA聚合酶(Taq聚合... 该文建立了高效肝组织及细胞总RNA抽提、反转录以进行基因克隆和实时定量PCR(q-RT-PCR)的方法。比较了2种反转录酶(M-MLV和SuperScriptII)、2种cDNA合成引物(OligodT和random 6 primer)对总RNA反转录效率的影响,与4种DNA聚合酶(Taq聚合酶、Pfu聚合酶、LAtaq聚合酶、Prime Star聚合酶)进行长片段基因克隆的能力及效率;同时,该研究比较了不同质量总RNA对有效进行q-RT-PCR与长片段分子克隆的影响。新建立的RNA提取方法使得RNA完整性和均一性提高。RNA的完整性及均一性对长片段cDNA的克隆至关重要。部分降解的组织RNA及细胞RNA仅适合于q-RT-PCR检测mRNA的表达水平,而不适合于cDNA的克隆。 展开更多
关键词 肝癌组织及细胞系 总RNA抽提 反转录 Q-RT-PCR 片段基因克隆
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基因表达序列分析技术(SAGE)在家蚕研究中的应用现状与前景 被引量:1
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作者 甘丽萍 徐世清 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2009年第3期32-35,共4页
家蚕是鳞翅目模式昆虫,家蚕组数据库和基因表达差异分析数据库的建设为鳞翅目害虫功能基因的研究提供了一个便利的技术平台。基因表达序列分析技术(SAGE)以及在此基础上发展起来的结合标签的基因序列延伸(GLGI)、长片段基因表达序列分析... 家蚕是鳞翅目模式昆虫,家蚕组数据库和基因表达差异分析数据库的建设为鳞翅目害虫功能基因的研究提供了一个便利的技术平台。基因表达序列分析技术(SAGE)以及在此基础上发展起来的结合标签的基因序列延伸(GLGI)、长片段基因表达序列分析(LongSAGE)等在家蚕获取基因表达谱、发现组织特异表达以及发现新基因中应用获得了很多重要的结果;众多通用SAGE数据库以及家蚕数据库为SAGE数据的生物信息学分析提供条件;以SAGR为核心的一系列技术通过定性与定量研究将把家蚕基因研究引入基因网络研究中,进行靶向定位以及辐射研究,加快家蚕后基因组时代步伐,为快速有效地发掘和研究鳞翅目害虫的功能基因提供模式价值。 展开更多
关键词 家蚕 基因表达序列分析 结合标签的基因序列延伸 片段基因表达序列分析
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发热伴血小板减少综合征病毒分离株M片段的分子特征分析 被引量:1
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作者 汤复根 李开春 +3 位作者 刘林 曲靖 刘洋 常宏伟 《江苏医药》 CAS 2019年第12期1249-1253,共5页
目的分析安徽省六安市发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)分离株的M片段分子特征。方法从2014-2015年六安市发热伴血小板减少综合征(SFTS)病例血液标本中分离的SFTSV株,进行M片段全基因序列测定,得到10株SFTSV的M片段基因序列。将其与从... 目的分析安徽省六安市发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)分离株的M片段分子特征。方法从2014-2015年六安市发热伴血小板减少综合征(SFTS)病例血液标本中分离的SFTSV株,进行M片段全基因序列测定,得到10株SFTSV的M片段基因序列。将其与从GenBank下载的54株SFTSV国内外公布的序列进行比对分析。结果六安市SFTSV分离株基因型主要为B、D和F基因型,分别为2、1和7株。10株SFTSV分离株与A、B、C、D、E、F各亚型代表分离株间核苷酸序列同源性分别为93.7%~96.1%、93.3%~99.2%、94.4%~97.3%、93.7%~99.5%、94.0%~96.6%、93.6%~99.0%。人源株与动物源株、蜱源株核苷酸同源性分别为93.4%~99.3%、93.5%~99.6%,动物源株与蜱源株核苷酸同源性为93.6%~99.8%。结论安徽省六安市SFTSV分离株为B、D和F基因型,与国内外代表株核苷酸高度同源。 展开更多
关键词 发热伴血小板减少综合征 M片段基因序列 同源性
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