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基于网络药理学、分子对接和实验验证探讨肉苁蓉苯乙醇总苷治疗不育症的作用机制
1
作者 王志 孟新源 +1 位作者 郑董璇 胡君萍 《现代药物与临床》 CAS 2024年第11期2781-2789,共9页
目的运用网络药理学方法推测肉苁蓉苯乙醇总苷在治疗不育症方面的潜在作用靶点和信号通路,并通过分子对接和动物体内实验来验证并进一步探讨其作用机制。方法应用TCMSP等数据库及文献收集肉苁蓉苯乙醇总苷的活性成分及潜在作用靶点,通... 目的运用网络药理学方法推测肉苁蓉苯乙醇总苷在治疗不育症方面的潜在作用靶点和信号通路,并通过分子对接和动物体内实验来验证并进一步探讨其作用机制。方法应用TCMSP等数据库及文献收集肉苁蓉苯乙醇总苷的活性成分及潜在作用靶点,通过基因数据库(Gene Cards)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取不育症疾病靶点;通过Venny 2.1软件获得交集靶点基因,结合STRING数据库绘制蛋白相互作用(PPI)网络,并通过Cytoscape 3.8.2软件筛选肉苁蓉苯乙醇总苷治疗不育症的核心作用靶点;运用DAVID数据库,分析交集基因的基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集情况。选取关键作用靶点与药物活性成分通过AutoDockTools 1.5.6软件进行分子对接验证;最后通过肉苁蓉苯乙醇总苷干预腺嘌呤诱导的不育症大鼠模型,通过反转录PCR(RT-PCR)法、蛋白质印迹(Western blotting)法验证大鼠睾丸组织中核心靶点和核心通路的表达。结果肉苁蓉苯乙醇总苷共筛选出21个潜在活性成分,62个药物靶点,7961个不育症靶点,药物与不育症交集靶点51个;核心活性成分主要为毛蕊花糖苷、松果菊苷、管花苷A等,核心靶点主要为肿瘤坏死因子(TNF)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、哈维大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(HRAS)、纤溶酶原基因(PLG)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA)等;GO功能富集主要包括蛋白水解、一碳代谢过程、细胞外基质分解等;KEGG富集通路主要包括雌激素信号通路、GnRH信号通路、氮代谢、代谢途径信号通路等;分子对接结果显示核心活性组分与不育症关键核心靶基因TNF、MMP9、HRAS、PLG、HSP90AA1的结合度高;体内实验结果表明,给予肉苁蓉苯乙醇总苷后,不育症大鼠睾丸组织ERα、HSP90 mRNA和蛋白表达升高,ERβmRNA和蛋白表达降低(P<0.05)。结论肉苁蓉苯乙醇总苷治疗不育症是多靶点、多通路共同调控的结� 展开更多
关键词 肉苁蓉苯乙醇总苷 不育症 网络药理学 分子对接 作用机制 毛蕊花糖苷 松果菊苷 管花苷A 雌激素受体 热休克蛋白90α家族A类成员1
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金丝桃苷通过抑制HSP90AA1抑制乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭 被引量：1
2
作者 郭晋祥 魏攀 +3 位作者 吕会茹 李姣锋 王开武 张红 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第21期5271-5276,共6页
目的基于网络药理学方法探讨金丝桃苷治疗乳腺癌的靶点及作用机制,并通过体外和体内实验进行验证。方法通过SwissTarget和TargetNet数据库获取金丝桃苷作用靶点,通过GeneCards数据库获取乳腺癌疾病相关靶点;利用STRING平台构建蛋白质相... 目的基于网络药理学方法探讨金丝桃苷治疗乳腺癌的靶点及作用机制,并通过体外和体内实验进行验证。方法通过SwissTarget和TargetNet数据库获取金丝桃苷作用靶点,通过GeneCards数据库获取乳腺癌疾病相关靶点;利用STRING平台构建蛋白质相互作用(PPI)网络;基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库分析交集靶点基因与乳腺癌临床表型的关系。采用CCK-8实验及异种移植实验观察金丝桃苷对乳腺癌细胞体外和体内增殖的影响;采用Transwell实验和划痕实验观察金丝桃苷对乳腺癌细胞侵袭和迁移的影响;构建热休克蛋白(HSP)90α家族A类成员(HSP90AA)1过表达质粒并转染人乳腺癌细胞系MCF-7和MDA-MB-231,观察上调HSP90AA1表达对乳腺癌增殖、侵袭及迁移的影响。结果基于网络药理学的分析显示,金丝桃苷作用于乳腺癌的靶点共有包括HSP90AA1在内的25个靶点;TCGA数据库的临床数据表明,HSP90AA1在乳腺癌癌组织中的表达较正常乳腺组织表达明显上调(P<0.05),且其高表达与临床分期晚及预后差密切相关(P<0.05)。功能实验中,金丝桃苷显著抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭(P<0.05),并能明显抑制裸鼠乳腺癌癌移植瘤的生长(P<0.05)。金丝桃苷呈剂量依赖性抑制HSP90AA1蛋白表达(P<0.05),使用HSP90AA1过表达质粒上调HSP90AA1表达则明显逆转金丝桃苷的以上抑癌作用(P<0.05)。结论HSP90AA1在乳腺癌表达上调,并与乳腺癌的不良预后密切相关;金丝桃苷可通过抑制HSP90AA1抑制乳腺癌增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 乳腺癌 金丝桃苷 热休克蛋白90α家族A类成员1 网络药理学 增殖 迁移 侵袭
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基于网络药理学与分子对接技术探讨京尼平苷治疗脑缺血的作用机制 被引量：1
3
作者 郝月 郎晋荣 +3 位作者 王俊怡 赵婷婷 王诗 刘昊 《现代药物与临床》 CAS 2022年第12期2724-2728,共5页
目的 运用网络药理学方法和分子对接方法研究京尼平苷治疗脑缺血潜在作用机制。方法 通过PubChem、PharmMapper、GeneCards、OMIM数据库分别对京尼平苷和疾病的靶点进行预测,借助Venny 2.1.0工具将二者取交集获取共有靶点,通过STRING数... 目的 运用网络药理学方法和分子对接方法研究京尼平苷治疗脑缺血潜在作用机制。方法 通过PubChem、PharmMapper、GeneCards、OMIM数据库分别对京尼平苷和疾病的靶点进行预测,借助Venny 2.1.0工具将二者取交集获取共有靶点,通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用(PPI)网络,随后通过Cytoscape 3.7.2软件对核心靶点进行网络拓扑分析;基于核心靶点基因开展基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)基因富集分析。利用AutodockTool软件对所筛选的核心靶点分别与京尼平苷进行分子对接。结果 通过STRING数据库构建交集靶点的PPI网络,获得173个交集靶点,包括酪氨酸蛋白激酶(SRC)、蛋白激酶B1(AKT1)、热休克蛋白90α家族A级成员1(HSP90AA1)、PIK3R1、表皮生长因子受体(EGFR)等。京尼平苷治疗脑缺血可能通过调控磷脂酰肌醇-3-羟激酶(PI3K)–蛋白激酶B(Akt)信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末化产物(AGE)–晚期糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、Ras信号通路等多种信号通路发挥治疗脑缺血的作用。结论 预测了京尼平苷治疗脑缺血的潜在作用机制,为后续实验研究提供理论依据和研究方向。 展开更多
关键词 京尼平苷 脑缺血 网络药理学 分子对接 酪氨酸蛋白激酶 蛋白激酶B1 热休克蛋白90α家族A级成员1
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