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漆树种质资源SSR遗传多样性分析
被引量:
1
1
作者
王佳
周天华
+3 位作者
柏国清
王齐
刘长超
戴全华
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第22期7429-7437,共9页
漆树是中国重要的经济树种。为了能够保护且合理开发利用漆树资源,本试验采用SSR分子标记技术,对来自陕西、甘肃、河南和云南4个省份的39个地区117个漆树样本进行遗传多样性分析和聚类分析。研究结果显示,10对漆树SSR引物均能对漆树样...
漆树是中国重要的经济树种。为了能够保护且合理开发利用漆树资源,本试验采用SSR分子标记技术,对来自陕西、甘肃、河南和云南4个省份的39个地区117个漆树样本进行遗传多样性分析和聚类分析。研究结果显示,10对漆树SSR引物均能对漆树样本进行PCR扩增且多态性丰富(A=9.400 0, PIC=0.714 6);漆树在物种水平上遗传多样性丰富(N_(a)=1.828 2, I=0.553 2, H=0.393 7),种群间有明显的遗传分化(F_(ST)=0.375 4)。UPGMA聚类分析显示相同种群的样本优先聚为一类,117份漆树样本明显聚为5个大类,表明SSR指纹图谱对漆树样本在种群水平上有良好的鉴定效果。本研究结果为漆树种质资源分类、鉴定和保护提供了重要依据。
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关键词
漆树
(
toxicodendron
vernicifluum)
种质资源
遗传多样性
SSR分子标记
原文传递
漆树WRKY转录因子基因家族生物信息学分析
被引量:
3
2
作者
肖纪元
白航宇
+3 位作者
宋金禄
张智雯
赵爱国
刘朝斌
《西北林学院学报》
CSCD
北大核心
2023年第4期111-118,共8页
漆树作为中国古老的经济树种,具有巨大的经济价值。WRKY转录因子是植物抗逆过程中最为常见的蛋白家族。为探索WRKY转录因子在漆树生长发育及抗逆境胁迫中的作用,以漆树转录组测序结果为试验材料,通过对保守结构域分析和多序列比对,共筛...
漆树作为中国古老的经济树种,具有巨大的经济价值。WRKY转录因子是植物抗逆过程中最为常见的蛋白家族。为探索WRKY转录因子在漆树生长发育及抗逆境胁迫中的作用,以漆树转录组测序结果为试验材料,通过对保守结构域分析和多序列比对,共筛选出20个具有WRKY保守域的基因,根据WRKY结构特征,将筛选出的基因分为3组,其中Ⅱ组根据保守基序分析又可分为5个亚组。通过构建漆树和拟南芥WRKY基因家族系统进化树,分析漆树WRKY基因同源性,并根据其与拟南芥同源漆树基因进行功能预测。同时,对漆树WRKY转录因子在漆树不同部位的差异表达做分析,TvWRKY2、TvWRKY11、TvWRKY14、TvWRKY16、TvWRKY17、TvWRKY19、TvWRKY8、TvWRKY15在根中表达水平上调。通过对漆树WRKY转录因子基因家族进行系统的生物信息学分析,为进一步分析特定WRKY基因功能提供了参考,同时为后续深入研究漆树WRKY蛋白的结构与功能奠定了理论基础。
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关键词
漆树
(
toxicodendron
vernicifluum)
WRKY
转录因子
生物信息学
下载PDF
职称材料
基于流式细胞法和基因组K-mer分析法检测漆树基因组大小
3
作者
郭晖
陈鹏
+3 位作者
郭欣怡
任俊澎
商慧颖
柏国清
《中国生漆》
2023年第3期51-54,共4页
漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(S...
漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(Salix matsudana Koidz)作为对照,利用流式细胞技术估算漆树基因组大小为538.90 Mb。利用高通量测序技术对漆树基因组进行K-mer分析,估算漆树基因组大小为605.9Mb,基因组杂合度为0.572%,重复序列约占71.4%,GC含量为37.2%。从基因组基本结构特征上看,漆树基因组属于高重复、高杂合的复杂基因组。利用获得的DNA序列数据,从头组装了一个大小为638.5Mb,contig N50长度为153bp的漆树基因组。本研究为漆树全基因组精细图谱的绘制和分子育种研究提供了重要的理论依据。
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关键词
漆树
(
toxicodendron
vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.)
基因组大小
流式细胞术
K-mer分析
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职称材料
野漆树研究进展
被引量:
4
4
作者
童俊
杨守坤
+3 位作者
陈法志
陈志伟
翟敬华
徐冬云
《湖北农业科学》
2019年第S02期16-20,共5页
野漆树为漆树科漆属落叶乔木,是以采子产蜡为主的特用经济树种。总结了野漆树资源、育种、育苗、栽培及加工应用等方面的研究进展,分析了应用现状与前景,以期为该植物资源的研究与开发利用提供参考。
关键词
野
漆树
(
toxicodendron
succedaneum)
育种
栽培
加工利用
研究进展
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职称材料
日本野漆树种子休眠及萌发特性研究
被引量:
2
5
作者
陈法志
童俊
+3 位作者
杨守坤
翟敬华
高惠江
刘忠
《湖北农业科学》
2023年第7期95-100,共6页
为探究日本野漆树(Toxicodendron succedaneum)种子的休眠原因、解除休眠方法及萌发特性,以成熟的日本野漆树种子为材料,观测其形态结构及吸水率,测定日本野漆树种子不同部位的甲醇提取物对白菜种子发芽与生长的影响,比较不同脱蜡处理...
为探究日本野漆树(Toxicodendron succedaneum)种子的休眠原因、解除休眠方法及萌发特性,以成熟的日本野漆树种子为材料,观测其形态结构及吸水率,测定日本野漆树种子不同部位的甲醇提取物对白菜种子发芽与生长的影响,比较不同脱蜡处理结合赤霉素浸泡对日本野漆树种子萌发率的影响,测定日本野漆树种子萌发过程中生理生化指标的变化。结果表明,日本野漆树种子透水性差,存在物理休眠现象,清水浸泡15 d吸水率仅34.17%,种子酸蚀处理后清水浸泡5 d已吸胀,吸水率达77.12%。日本野漆树内种皮提取物对白菜种子发芽与生长有显著抑制作用,其内种皮含有抑制发芽内源物质,存在生理休眠现象。98%H_(2)SO_(4)脱蜡处理20 min结合300 mg/L赤霉素溶液浸种12 h,可打破日本野漆树种子休眠,相比对照发芽势、发芽率显著提高,且萌发早、发芽整齐,发芽势达(54.33±0.58)%,发芽率达(97.67±2.52)%,第3天开始萌发,第10天发齐。日本野漆树种子萌发过程中可溶性糖和可溶性蛋白质含量显著降低,POD、α-淀粉酶活性显著增强,休眠期日本野漆树种子ABA含量较高、GA3含量较低,种子吸胀阶段GA3含量急剧增加,胚根长出后ABA和GA3含量显著下降。
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关键词
日本野
漆树
(
toxicodendron
succedaneum)
种子休眠
休眠解除
发芽率
萌发生理
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职称材料
题名
漆树种质资源SSR遗传多样性分析
被引量:
1
1
作者
王佳
周天华
柏国清
王齐
刘长超
戴全华
机构
陕西理工大学生物科学与工程学院
陕西省西安植物园(陕西省植物研究所)
陕西省留坝县闸口石林场
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第22期7429-7437,共9页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31800554)
陕西省重点研发项目(2020NY-083)
陕西理工大学研究生创新基金项目(SLGYCX2017)共同资助。
文摘
漆树是中国重要的经济树种。为了能够保护且合理开发利用漆树资源,本试验采用SSR分子标记技术,对来自陕西、甘肃、河南和云南4个省份的39个地区117个漆树样本进行遗传多样性分析和聚类分析。研究结果显示,10对漆树SSR引物均能对漆树样本进行PCR扩增且多态性丰富(A=9.400 0, PIC=0.714 6);漆树在物种水平上遗传多样性丰富(N_(a)=1.828 2, I=0.553 2, H=0.393 7),种群间有明显的遗传分化(F_(ST)=0.375 4)。UPGMA聚类分析显示相同种群的样本优先聚为一类,117份漆树样本明显聚为5个大类,表明SSR指纹图谱对漆树样本在种群水平上有良好的鉴定效果。本研究结果为漆树种质资源分类、鉴定和保护提供了重要依据。
关键词
漆树
(
toxicodendron
vernicifluum)
种质资源
遗传多样性
SSR分子标记
Keywords
toxicodendron
vernicifluum
Germplasm resources
Genetic diversity
SSR molecular markers
分类号
S792.99 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
漆树WRKY转录因子基因家族生物信息学分析
被引量:
3
2
作者
肖纪元
白航宇
宋金禄
张智雯
赵爱国
刘朝斌
机构
西北农林科技大学林学院
出处
《西北林学院学报》
CSCD
北大核心
2023年第4期111-118,共8页
基金
“十三五”国家重点研发计划(2017YFD0600705)。
文摘
漆树作为中国古老的经济树种,具有巨大的经济价值。WRKY转录因子是植物抗逆过程中最为常见的蛋白家族。为探索WRKY转录因子在漆树生长发育及抗逆境胁迫中的作用,以漆树转录组测序结果为试验材料,通过对保守结构域分析和多序列比对,共筛选出20个具有WRKY保守域的基因,根据WRKY结构特征,将筛选出的基因分为3组,其中Ⅱ组根据保守基序分析又可分为5个亚组。通过构建漆树和拟南芥WRKY基因家族系统进化树,分析漆树WRKY基因同源性,并根据其与拟南芥同源漆树基因进行功能预测。同时,对漆树WRKY转录因子在漆树不同部位的差异表达做分析,TvWRKY2、TvWRKY11、TvWRKY14、TvWRKY16、TvWRKY17、TvWRKY19、TvWRKY8、TvWRKY15在根中表达水平上调。通过对漆树WRKY转录因子基因家族进行系统的生物信息学分析,为进一步分析特定WRKY基因功能提供了参考,同时为后续深入研究漆树WRKY蛋白的结构与功能奠定了理论基础。
关键词
漆树
(
toxicodendron
vernicifluum)
WRKY
转录因子
生物信息学
Keywords
toxicodendron
vernicifluum
WRKY
transcription factor
bioinformatics
分类号
S718.46 [农业科学—林学]
下载PDF
职称材料
题名
基于流式细胞法和基因组K-mer分析法检测漆树基因组大小
3
作者
郭晖
陈鹏
郭欣怡
任俊澎
商慧颖
柏国清
机构
陕西省林业科学院
陕西省植物资源保护与利用工程技术研究中心
出处
《中国生漆》
2023年第3期51-54,共4页
文摘
漆树Toxicodendron vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.是我国重要的经济林木资源,在工业、药用、生态、文化等领域产生了积极的影响。本研究利用流式细胞技术和高通量测序技术对漆树基因组特征进行了初步研究。利用已知基因组大小的柳树(Salix matsudana Koidz)作为对照,利用流式细胞技术估算漆树基因组大小为538.90 Mb。利用高通量测序技术对漆树基因组进行K-mer分析,估算漆树基因组大小为605.9Mb,基因组杂合度为0.572%,重复序列约占71.4%,GC含量为37.2%。从基因组基本结构特征上看,漆树基因组属于高重复、高杂合的复杂基因组。利用获得的DNA序列数据,从头组装了一个大小为638.5Mb,contig N50长度为153bp的漆树基因组。本研究为漆树全基因组精细图谱的绘制和分子育种研究提供了重要的理论依据。
关键词
漆树
(
toxicodendron
vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.)
基因组大小
流式细胞术
K-mer分析
Keywords
toxicodendron
vernicifluum(Stokes)F.A.Barkl.
genome size
flow cytometry
K-mer analysis
分类号
S794.2 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
野漆树研究进展
被引量:
4
4
作者
童俊
杨守坤
陈法志
陈志伟
翟敬华
徐冬云
机构
武汉市农业科学院林业果树研究所
出处
《湖北农业科学》
2019年第S02期16-20,共5页
基金
武汉市农业科学院成果转化项目(CXCG201905)
武汉市农业科学院开放课题(KFKT201915).
文摘
野漆树为漆树科漆属落叶乔木,是以采子产蜡为主的特用经济树种。总结了野漆树资源、育种、育苗、栽培及加工应用等方面的研究进展,分析了应用现状与前景,以期为该植物资源的研究与开发利用提供参考。
关键词
野
漆树
(
toxicodendron
succedaneum)
育种
栽培
加工利用
研究进展
Keywords
toxicodendron
succedaneum
breeding
cultivation
process
research progress
分类号
S794.2 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
日本野漆树种子休眠及萌发特性研究
被引量:
2
5
作者
陈法志
童俊
杨守坤
翟敬华
高惠江
刘忠
机构
武汉市农业科学院林业果树研究所
湖北汇弘生物科技开发有限公司
出处
《湖北农业科学》
2023年第7期95-100,共6页
基金
武汉市创新项目(KFKT201915)。
文摘
为探究日本野漆树(Toxicodendron succedaneum)种子的休眠原因、解除休眠方法及萌发特性,以成熟的日本野漆树种子为材料,观测其形态结构及吸水率,测定日本野漆树种子不同部位的甲醇提取物对白菜种子发芽与生长的影响,比较不同脱蜡处理结合赤霉素浸泡对日本野漆树种子萌发率的影响,测定日本野漆树种子萌发过程中生理生化指标的变化。结果表明,日本野漆树种子透水性差,存在物理休眠现象,清水浸泡15 d吸水率仅34.17%,种子酸蚀处理后清水浸泡5 d已吸胀,吸水率达77.12%。日本野漆树内种皮提取物对白菜种子发芽与生长有显著抑制作用,其内种皮含有抑制发芽内源物质,存在生理休眠现象。98%H_(2)SO_(4)脱蜡处理20 min结合300 mg/L赤霉素溶液浸种12 h,可打破日本野漆树种子休眠,相比对照发芽势、发芽率显著提高,且萌发早、发芽整齐,发芽势达(54.33±0.58)%,发芽率达(97.67±2.52)%,第3天开始萌发,第10天发齐。日本野漆树种子萌发过程中可溶性糖和可溶性蛋白质含量显著降低,POD、α-淀粉酶活性显著增强,休眠期日本野漆树种子ABA含量较高、GA3含量较低,种子吸胀阶段GA3含量急剧增加,胚根长出后ABA和GA3含量显著下降。
关键词
日本野
漆树
(
toxicodendron
succedaneum)
种子休眠
休眠解除
发芽率
萌发生理
Keywords
toxicodendron
succedaneum
seed dormancy
dormancy release
germination percentage
germination physiology
分类号
S330.33 [农业科学—作物遗传育种]
S794.2 [农业科学—农艺学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
漆树种质资源SSR遗传多样性分析
王佳
周天华
柏国清
王齐
刘长超
戴全华
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024
1
原文传递
2
漆树WRKY转录因子基因家族生物信息学分析
肖纪元
白航宇
宋金禄
张智雯
赵爱国
刘朝斌
《西北林学院学报》
CSCD
北大核心
2023
3
下载PDF
职称材料
3
基于流式细胞法和基因组K-mer分析法检测漆树基因组大小
郭晖
陈鹏
郭欣怡
任俊澎
商慧颖
柏国清
《中国生漆》
2023
0
下载PDF
职称材料
4
野漆树研究进展
童俊
杨守坤
陈法志
陈志伟
翟敬华
徐冬云
《湖北农业科学》
2019
4
下载PDF
职称材料
5
日本野漆树种子休眠及萌发特性研究
陈法志
童俊
杨守坤
翟敬华
高惠江
刘忠
《湖北农业科学》
2023
2
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职称材料
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