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人卵泡液游离DNA提取及定量检测方法的比较
1
作者
池梅
刘宇
+5 位作者
申秋子
邹敏
李自立
张衷源
杜欣
张玲
《实用妇产科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期375-380,共6页
目的:比较不同的DNA提取方法、实时荧光定量PCR(qPCR)的引物及荧光染料对人卵泡液游离核DNA(cf-nDNA)和游离线粒体DNA(cf-mtDNA)定量检测的影响。方法:收集2018年3月~10月在华中科技大学同济医学院生殖医学中心进行体外受精/卵胞浆内单...
目的:比较不同的DNA提取方法、实时荧光定量PCR(qPCR)的引物及荧光染料对人卵泡液游离核DNA(cf-nDNA)和游离线粒体DNA(cf-mtDNA)定量检测的影响。方法:收集2018年3月~10月在华中科技大学同济医学院生殖医学中心进行体外受精/卵胞浆内单精子显微注射技术(IVF/ICSI)的40例患者卵泡液样本,分别用4种不同的方法(方法一:BeaverBeads^(TM) Circulating DNA试剂盒、方法二:蛋白酶K(PK)法、方法三:Hieff^(■) qPCR SYBR^(■) Green Master Mix和方法四:KOD SYBR^(■) qPCR Mix)提取和纯化卵泡液中的游离DNA(cf-DNA)样本;用4种cf-nDNA引物(ALU115、B2MF1、GAPDH和β-globin)和4种cf-mtDNA引物(ND1-primer1、ND1-primer2、hmito3和hmito5)分别定量检测卵泡液cf-nDNA和cf-mtDNA水平;比较qPCR实验中SYBR Green化学染料和TaqMan探针两种方法在定量检测上的差异。结果:提取cf-nDNA的浓度按以下顺序排列:方法一>方法四>方法二>方法三(P<0.05),提取cf-mtDNA的浓度按以下顺序排列:方法一>方法四>方法三>方法二(P<0.05);样本中cf-nDNA的扩增浓度按照以下顺序排列:ALU115>GAPDH>β-globin>B2MF1(P<0.05),4种cf-nDNA引物无相关性(P>0.05)。cf-mtDNA的扩增浓度按以下顺序排列:ND1-primer1>ND1-primer2>hmito5>hmito3(P<0.05)。ND1-primer1和ND1-primer2有很强的相关性(r=0.517,P<0.05),hmito3和hmito5也有很强的相关性(r=0.989,P<0.05);在以β-globin和ND1-primer1为引物的qPCR实验中,TaqMan探针法检测的Ct值高于SYBR Green化学染料法(P<0.05)。结论:人卵泡液样本的提取方法、引物和荧光染料的选择均影响cf-nDNA和cf-mtDNA的定量,建议根据不同的研究目的选择合适的方法。
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关键词
游离
核
dna
游离
线粒体
dna
人卵泡液
检测方法
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职称材料
题名
人卵泡液游离DNA提取及定量检测方法的比较
1
作者
池梅
刘宇
申秋子
邹敏
李自立
张衷源
杜欣
张玲
机构
武汉科技大学医学院妇产科
华中科技大学同济医学院生殖健康研究所
华中科技大学同济医学院生殖医学中心
湖北省妇幼保健院妇科
出处
《实用妇产科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期375-380,共6页
基金
湖北省卫生健康委员会面上项目(编号:WJ2019M112)。
文摘
目的:比较不同的DNA提取方法、实时荧光定量PCR(qPCR)的引物及荧光染料对人卵泡液游离核DNA(cf-nDNA)和游离线粒体DNA(cf-mtDNA)定量检测的影响。方法:收集2018年3月~10月在华中科技大学同济医学院生殖医学中心进行体外受精/卵胞浆内单精子显微注射技术(IVF/ICSI)的40例患者卵泡液样本,分别用4种不同的方法(方法一:BeaverBeads^(TM) Circulating DNA试剂盒、方法二:蛋白酶K(PK)法、方法三:Hieff^(■) qPCR SYBR^(■) Green Master Mix和方法四:KOD SYBR^(■) qPCR Mix)提取和纯化卵泡液中的游离DNA(cf-DNA)样本;用4种cf-nDNA引物(ALU115、B2MF1、GAPDH和β-globin)和4种cf-mtDNA引物(ND1-primer1、ND1-primer2、hmito3和hmito5)分别定量检测卵泡液cf-nDNA和cf-mtDNA水平;比较qPCR实验中SYBR Green化学染料和TaqMan探针两种方法在定量检测上的差异。结果:提取cf-nDNA的浓度按以下顺序排列:方法一>方法四>方法二>方法三(P<0.05),提取cf-mtDNA的浓度按以下顺序排列:方法一>方法四>方法三>方法二(P<0.05);样本中cf-nDNA的扩增浓度按照以下顺序排列:ALU115>GAPDH>β-globin>B2MF1(P<0.05),4种cf-nDNA引物无相关性(P>0.05)。cf-mtDNA的扩增浓度按以下顺序排列:ND1-primer1>ND1-primer2>hmito5>hmito3(P<0.05)。ND1-primer1和ND1-primer2有很强的相关性(r=0.517,P<0.05),hmito3和hmito5也有很强的相关性(r=0.989,P<0.05);在以β-globin和ND1-primer1为引物的qPCR实验中,TaqMan探针法检测的Ct值高于SYBR Green化学染料法(P<0.05)。结论:人卵泡液样本的提取方法、引物和荧光染料的选择均影响cf-nDNA和cf-mtDNA的定量,建议根据不同的研究目的选择合适的方法。
关键词
游离
核
dna
游离
线粒体
dna
人卵泡液
检测方法
Keywords
Cell free nuclear
dna
Cell free mitochondrial
dna
Human follicular fluid
Detection methods
分类号
R711 [医药卫生—妇产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人卵泡液游离DNA提取及定量检测方法的比较
池梅
刘宇
申秋子
邹敏
李自立
张衷源
杜欣
张玲
《实用妇产科杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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