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Thermal Wigner Operator in Coherent Thermal State Representation and Its Application 被引量:3
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作者 FANHong-Yi 《Communications in Theoretical Physics》 SCIE CAS CSCD 2002年第3期289-292,共4页
In the coherent thermal state representation we introduce thermal Wigner operator and find that it is'squeezed' under the thermal transformation. The thermal Wigner operator provides us with a new direct and n... In the coherent thermal state representation we introduce thermal Wigner operator and find that it is'squeezed' under the thermal transformation. The thermal Wigner operator provides us with a new direct and neatapproach for deriving Wigner functions of thermal states. 展开更多
关键词 coherent thermal state thermal Wigner operator
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重要性采样方法与自由能计算 被引量:5
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作者 陈淏川 付浩浩 +1 位作者 邵学广 蔡文生 《化学进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2018年第7期921-931,共11页
分子动力学模拟与自由能计算已经在化学、生物学与材料学等领域得到广泛的应用。然而,由于在传统分子动力学模拟的时间尺度内,体系很难跨越较高的自由能能垒,在相空间内的采样大大受限,采样困难使自由能计算难以收敛。增强采样是解决这... 分子动力学模拟与自由能计算已经在化学、生物学与材料学等领域得到广泛的应用。然而,由于在传统分子动力学模拟的时间尺度内,体系很难跨越较高的自由能能垒,在相空间内的采样大大受限,采样困难使自由能计算难以收敛。增强采样是解决这一问题的有效途径,重要性采样方法就是其中一类。本文综述了四种广泛应用的重要性采样方法——伞状采样方法、metadynamics方法、自适应偏置力方法和温度加速分子动力学方法的原理和进展,其中重点概述了自适应偏置力方法的最新发展——扩展自适应偏置力方法和扩展广义自适应偏置力方法,并对这四种重要性采样方法的优缺点进行了比较。最后,讨论和展望了重要性采样与自由能计算方法面临的挑战和前景,并提出了对自适应偏置力方法可能的改进,如与加速分子动力学(aMD)或弦方法结合以提高在高维度空间中的采样效率。 展开更多
关键词 分子动力学模拟 自由能计算 重要性采样 伞状采样 METADYNAMICS 自适应偏置力 温度加速分子动力学
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温度对Al_2O_3吸附诺氟沙星的影响及其分子动力学模拟
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作者 纪营雪 王风贺 +1 位作者 顾中铸 贡雪东 《化学通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期236-242,共7页
采用批量吸附实验及分子动力学(MD)模拟,分别从实验和理论角度研究了温度对氧化铝(Al2O3)吸附诺氟沙星(NOR)性能的影响。结果表明,NOR分子与Al2O3晶体表面存在相互作用,使得Al2O3可有效吸附NOR;对于不同的Al2O3初始投加浓度... 采用批量吸附实验及分子动力学(MD)模拟,分别从实验和理论角度研究了温度对氧化铝(Al2O3)吸附诺氟沙星(NOR)性能的影响。结果表明,NOR分子与Al2O3晶体表面存在相互作用,使得Al2O3可有效吸附NOR;对于不同的Al2O3初始投加浓度,在所设定的三个实验温度(293K,298K,303K)中,298K下NOR的吸附去除效率r298K最高,不同温度条件下的吸附去除效率依次为:r298K〉r293K〉r303K;MD模拟发现NOR分子与Al2O3的(012)晶面间的结合能(Eb)及NOR分子形变能(△Edeform)均有以下顺序:NOR—Al2O3(298K)〉NOR—Al2O3(293K)〉NORmAl2O3(303K),该规律与吸附实验结果一致。通过对MD模拟的对关联函数分析,理沦上揭示了Al2O3,对NOR的吸附主要为非键相互作用。通过对该体系293~303K间各温度的MD模拟,得出Al2O3吸附NOR的理沦最佳温度为298K。研究结果为明晰土壤中抗生素在Al2O2界面的微观吸附过程提供了理论依据。 展开更多
关键词 诺氟沙星(NOR) 氧化铝(Al2O3) 吸附温度分子动力学(MD)模拟
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