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一种新的基因克隆方法——消减杂交差异显示分析方法
被引量：
3
1
作者
郭榕
李勇
《国际遗传学杂志》
CAS
2006年第3期183-186,共4页
消减杂交差异显示分析方法(subtractivehybridizationdifferencedisplay,SHDD)是近年来在cD-NA代表性差异分析方法(cDNARepresentationalDifferenceAnalysis,cDNARDA)和mRNA差异显示分析方法(mRNADifferentialDisplay,mRNADD)的基础上...
消减杂交差异显示分析方法(subtractivehybridizationdifferencedisplay,SHDD)是近年来在cD-NA代表性差异分析方法(cDNARepresentationalDifferenceAnalysis,cDNARDA)和mRNA差异显示分析方法(mRNADifferentialDisplay,mRNADD)的基础上发展而来的一种克隆基因的新方法。SHDD方法结合了cDNARDA的特异性特点与mRNADD在双向筛查差异片段和较高的检测灵敏度方面的优势。在具体技术路线设计上,SHDD最大的特点就是在两样本间双向一轮与二轮均衡、温和消减杂交基础上引入了同位素mRNADD差异显示技术,使得该方法在克隆低丰度信息及较弱差异信息、提高差异分析结果的特异性、减少假阳性、减少重复差异结果,提高差异分析的信息量同时又降低工作量等方面明显优于经典的mRNADD和cDNARDA方法。
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关键词
消减杂交
差异
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分析
cDNA代表性
差异
分析
mRNA
差异
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分析
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职称材料
代表性差异分析和消减杂交差异显示分析方法在克隆差异基因方面的灵敏度比较
2
作者
郭榕
李勇
《肿瘤研究与临床》
CAS
2010年第2期84-88,共5页
目的建立目的基因差异信息标量化的配对研究体系，比较经典的代表性差异分析（RDA）方法和消减杂交差异显示分析（SHDD）方法在克隆差异基因方面的灵敏度。方法以人类乳头瘤病毒（HPV）DNA为模板行PCR扩增获得376bp和869bp两个片段，作...
目的建立目的基因差异信息标量化的配对研究体系，比较经典的代表性差异分析（RDA）方法和消减杂交差异显示分析（SHDD）方法在克隆差异基因方面的灵敏度。方法以人类乳头瘤病毒（HPV）DNA为模板行PCR扩增获得376bp和869bp两个片段，作为差异目的基因掺入人血基因组DNA，获得5组目的基因拷贝数呈梯度差异的配对研究体系，比较RDA和SHDD方法的检测灵敏度。结果应用RDA方法可克隆得到上调6倍的376bp片段和上调8倍的869bp的HPV片段，而应用SHDD方法可克隆到上调4倍的两种差异片段。结论SHDD方法由于采用了两样本差异产物问的双向均衡消减杂交，避免了经典RDA方法不均衡消减杂交导致的差异信息的丢失，在克隆较弱的差异信息，尤其是较长差异信息方面，显著优于经典RDA方法。
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关键词
代表性
差异
分析
消减杂交
差异
显示
分析
基因组
DNA
人乳头瘤病毒
原文传递
题名
一种新的基因克隆方法——消减杂交差异显示分析方法
被引量：
3
1
作者
郭榕
李勇
机构
青岛胸科医院
北京癌症研究中心
出处
《国际遗传学杂志》
CAS
2006年第3期183-186,共4页
基金
国家自然科学基金(No.30400542)
文摘
消减杂交差异显示分析方法(subtractivehybridizationdifferencedisplay,SHDD)是近年来在cD-NA代表性差异分析方法(cDNARepresentationalDifferenceAnalysis,cDNARDA)和mRNA差异显示分析方法(mRNADifferentialDisplay,mRNADD)的基础上发展而来的一种克隆基因的新方法。SHDD方法结合了cDNARDA的特异性特点与mRNADD在双向筛查差异片段和较高的检测灵敏度方面的优势。在具体技术路线设计上,SHDD最大的特点就是在两样本间双向一轮与二轮均衡、温和消减杂交基础上引入了同位素mRNADD差异显示技术,使得该方法在克隆低丰度信息及较弱差异信息、提高差异分析结果的特异性、减少假阳性、减少重复差异结果,提高差异分析的信息量同时又降低工作量等方面明显优于经典的mRNADD和cDNARDA方法。
关键词
消减杂交
差异
显示
分析
cDNA代表性
差异
分析
mRNA
差异
显示
分析
Keywords
Subtractive hybridization differential display（SHDD）
cDNA representational difference analysis（eDNA RDA）
mRNA differential display（mRNA DD）
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
代表性差异分析和消减杂交差异显示分析方法在克隆差异基因方面的灵敏度比较
2
作者
郭榕
李勇
机构
青岛市胸科医院结核科
北京大学临床肿瘤学院北京肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室
出处
《肿瘤研究与临床》
CAS
2010年第2期84-88,共5页
基金
基金项目：国家自然科学基金面上项目（30871366）
文摘
目的建立目的基因差异信息标量化的配对研究体系，比较经典的代表性差异分析（RDA）方法和消减杂交差异显示分析（SHDD）方法在克隆差异基因方面的灵敏度。方法以人类乳头瘤病毒（HPV）DNA为模板行PCR扩增获得376bp和869bp两个片段，作为差异目的基因掺入人血基因组DNA，获得5组目的基因拷贝数呈梯度差异的配对研究体系，比较RDA和SHDD方法的检测灵敏度。结果应用RDA方法可克隆得到上调6倍的376bp片段和上调8倍的869bp的HPV片段，而应用SHDD方法可克隆到上调4倍的两种差异片段。结论SHDD方法由于采用了两样本差异产物问的双向均衡消减杂交，避免了经典RDA方法不均衡消减杂交导致的差异信息的丢失，在克隆较弱的差异信息，尤其是较长差异信息方面，显著优于经典RDA方法。
关键词
代表性
差异
分析
消减杂交
差异
显示
分析
基因组
DNA
人乳头瘤病毒
Keywords
Representational difference analysis
Subtractive hybridization difference display
Genome
DNA
Human papilloma virus
分类号
R341 [医药卫生—基础医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种新的基因克隆方法——消减杂交差异显示分析方法
郭榕
李勇
《国际遗传学杂志》
CAS
2006
3
下载PDF
职称材料
2
代表性差异分析和消减杂交差异显示分析方法在克隆差异基因方面的灵敏度比较
郭榕
李勇
《肿瘤研究与临床》
CAS
2010
0
原文传递
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参考文献
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