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过表达海藻糖合成酶编码基因TvTPS/TPP的绿色木霉工程菌的构建及其抗逆特性分析
1
作者 张豪 李哲 +1 位作者 郭凯 郝永任 《山东农业科学》 北大核心 2022年第5期1-9,共9页
绿色木霉广泛用于促生抗逆、生物防治、纤维素酶生产和生物质利用等方面。木霉体内代谢途径丰富,代谢产物繁多,很多代谢产物参与调控木霉对不利环境的适应能力。海藻糖是一种典型的应激代谢产物,在逆境条件下,可以保护生物免受伤害。海... 绿色木霉广泛用于促生抗逆、生物防治、纤维素酶生产和生物质利用等方面。木霉体内代谢途径丰富,代谢产物繁多,很多代谢产物参与调控木霉对不利环境的适应能力。海藻糖是一种典型的应激代谢产物,在逆境条件下,可以保护生物免受伤害。海藻糖合成酶主要包括海藻糖磷酸合成酶和海藻糖磷酸磷酸酯酶。本试验从绿色木霉Tv-1511中鉴定出一个海藻糖合成双功能酶编码基因TvTPS/TPP,构建了绿色木霉TvTPS/TPP基因过表达菌株Tv-1511-TPS/TPP-OE,并对其在绿色木霉Tv-1511抗逆性中的功能进行了分析。结果表明,与野生型相比,TvTPS/TPP过表达菌株具有更高的海藻糖含量,过表达TvTPS/TPP基因显著提高了绿色木霉对盐、高温和干旱的耐受性。因此,TvTPS/TPP基因在绿色木霉生长抗逆方面可能起着重要作用。 展开更多
关键词 绿色木霉 海藻糖磷酸合成酶 海藻糖磷酸磷酸酯酶 抗逆特性
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申克孢子丝菌TPS基因生物信息学分析 被引量：1
2
作者 黄家敏 李玉哲 +9 位作者 高文超 吴晓雁 孙瑶 黄丽林 张静 李美荣 胡南 旷翠娥 刘佳庆 黄怀球 《皮肤性病诊疗学杂志》 2018年第6期325-329,共5页
目的:分析和预测申克孢子丝菌海藻糖磷酸合成酶(TPS)基因及其编码蛋白的生物信息学特征及功能。方法:利用生物信息学软件和网站分析预测申克孢子丝菌TPS基因及其编码蛋白的结构和功能特征。结果:申克孢子丝菌TPS基因全长为2 864 bp,编码... 目的:分析和预测申克孢子丝菌海藻糖磷酸合成酶(TPS)基因及其编码蛋白的生物信息学特征及功能。方法:利用生物信息学软件和网站分析预测申克孢子丝菌TPS基因及其编码蛋白的结构和功能特征。结果:申克孢子丝菌TPS基因全长为2 864 bp,编码905个氨基酸。Target P和MotifScan预测该蛋白定位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点,其中磷酸化位点尤为丰富,包含cAMP依赖性磷酸激酶、蛋白激酶C(PKC)和酪氨酸激酶(CK2)磷酸化位点。TPS蛋白是亲水性蛋白,无跨膜结构,未发现信号肽。结论:预测申克孢子丝菌TPS基因编码蛋白位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点的结构功能特点,可行相应小分子抑制剂筛选以开发新型抗真菌药物。 展开更多
关键词 申克孢子丝菌 海藻糖磷酸合成酶 生物信息学
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甘蓝型油菜海藻糖磷酸合成酶(TPS)基因家族的生物信息学分析 被引量：2
3
作者 周尧 孙超 +3 位作者 张玉松 卢晨阳 杨进成 林良斌 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第8期2500-2511,共12页
海藻糖磷酸合成酶(TPS)在植物响应多种非生物胁迫及生物胁迫时起着重要的作用,但目前对甘蓝型油菜中TPS基因的了解甚少。本研究运用生物信息学方法在甘蓝型油菜基因组中筛选甘蓝型油菜TPS家族基因,对鉴定出的31个BnTPSs基因进行分子特... 海藻糖磷酸合成酶(TPS)在植物响应多种非生物胁迫及生物胁迫时起着重要的作用,但目前对甘蓝型油菜中TPS基因的了解甚少。本研究运用生物信息学方法在甘蓝型油菜基因组中筛选甘蓝型油菜TPS家族基因,对鉴定出的31个BnTPSs基因进行分子特征、蛋白特性、蛋白结构域、保守基序、顺式作用元件、KaKs、染色体定位、系统进化树构建等研究。系统发育分析表明,BnTPS家族分为Ⅰ和Ⅱ类,家族成员数明显比甘蓝、白菜和拟南芥中的TPS基因数多,不规则分布于染色体上。多数蛋白呈酸性,分别在N端和C端具有TPS和TPP结构域。顺式作用元件分析表明,TPS家族与植株抗逆境胁迫有关。KaKs分析表明,大多BnTPSs家族成员有多拷贝基因,基因在纯化选择压力下进化。本研究结果为进一步研究甘蓝型油菜TPS家族基因生物学功能尤其在响应逆境中的功能奠定理论基础。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 海藻糖磷酸合成酶基因家族 生物信息学分析
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谷子蔗糖磷酸合成酶及互作蛋白的生物信息和基因表达分析 被引量：1
4
作者 范会 刘红云 +1 位作者 程金金 刘征 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期5223-5231,共9页
蔗糖在植物的生长过程中发挥至关重要的作用,蔗糖磷酸合成酶(SPS)是蔗糖合成的关键限速酶。生物信息分析显示,在谷子中,SPS-Si000130m与海藻糖6-磷酸合成酶基因TPS-Si016303m、尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶基因UGD-Si035452m存在显著的相互... 蔗糖在植物的生长过程中发挥至关重要的作用,蔗糖磷酸合成酶(SPS)是蔗糖合成的关键限速酶。生物信息分析显示,在谷子中,SPS-Si000130m与海藻糖6-磷酸合成酶基因TPS-Si016303m、尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶基因UGD-Si035452m存在显著的相互作用。高通量测序对谷子3种基因的表达谱研究进一步表明,在谷子根、茎、叶、穗中SPS-Si000130m基因与TPS-Si016303m基因的表达模式呈正相关,与UGD-Si0354-52m基因的表达模式呈负相关。但无论是正相关还是负相关,TPS-Si016303m和UGD-Si035452m沿谷子叶片梯度的表达模式均与SPS-Si000130m基因存在差异。SPS-Si000130m的表达集中在叶片光合作用的功能部位,而TPS-Si016303m的转录物在叶片梯度各部位均可检测到,可见即使这两个基因呈现正相关,它们之间仍存在自身独特的表达、调控特点;负相关基因(即UGD-Si035452m和SPS-Si000130m)沿叶片梯度相反的表达模式则反映出植物通过基因表达的区域化,避免这两个酶彼此竞争相同底物,防止无效循环的进行。进一步通过生物信息学软件预测三种蛋白的功能结构域和3D结构则显示,SPS-Si000130m和TPS-Si016303m之间存在相同功能结构域—糖基转移酶功能结构域;而SPS-Si000130m和UGD-Si035452m之间没有相同功能结构域。总之,深入研究3种蛋白功能和结构的特点及它们之间的相互作用,将加深对谷子糖类代谢调控网络的认识,并有助于我们改善谷子品质的研究。 展开更多
关键词 谷子 蔗糖磷酸合成酶 海藻糖6-磷酸合成酶 尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶 蛋白互作 基因表达
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