目的:探讨ITS2和psbA-trnH序列对海滩牵牛的鉴定能力,为海滩牵牛的分子鉴定提供理论依据。方法:提取不同产地的11份海滩牵牛的DNA,PCR扩增ITS2和psbA-trnH序列并测序。通过BLAST对测序结果进行比对,采用CodonCode Aligner V 6.0.2软件...目的:探讨ITS2和psbA-trnH序列对海滩牵牛的鉴定能力,为海滩牵牛的分子鉴定提供理论依据。方法:提取不同产地的11份海滩牵牛的DNA,PCR扩增ITS2和psbA-trnH序列并测序。通过BLAST对测序结果进行比对,采用CodonCode Aligner V 6.0.2软件对测序峰图进行校对分析,用MEGA 6.0软件计算海滩牵牛的种内、种间遗传距离,构建邻接树聚类分析不同品种海滩牵牛的鉴定结果。结果:ITS2序列长度为349 bp,海滩牵牛1~7号样品为1个种属,种内遗传距离为0.00,8~11号样品为1个种属,种内遗传距离为0.00,11份样品的种间遗传距离为0.13,种内遗传距离远小于种间遗传距离。基于ITS2序列构建的NJ树表明,不同来源的海滩牵牛样品聚为一支,并且能跟同为牵牛属的植物(厚藤)区分开来。psbA-trnH序列仅在海滩牵牛3、4号样品中成功扩增并测序,基于psbA-trnH序列构建的NJ树表明,海滩牵牛3~4号样品能够聚为一支,但厚藤的两个样品无法聚为一支。结论:ITS2序列可以作为海滩牵牛分子鉴定的依据,psbA-trnH序列不适合作为海滩牵牛的DNA条形码技术鉴定序列。展开更多
