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玉米泛素结合酶基因ZmUBC-76的功能分析 被引量：6
1
作者 决登伟 桑雪莲 +3 位作者 舒波 刘丽琴 王一承 石胜友 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2017年第8期1507-1511,共5页
通过生物信息学方法,从玉米基因组中得到1个泛素结合酶家族基因序列,将其命名为ZmUBC-76。该基因序列开放阅读框为2 589 bp,编码的蛋白具有862个氨基酸,其分子量为98.91 ku,理论等电点为8.07。预测定位于细胞核。荧光定量PCR分析表明,... 通过生物信息学方法,从玉米基因组中得到1个泛素结合酶家族基因序列,将其命名为ZmUBC-76。该基因序列开放阅读框为2 589 bp,编码的蛋白具有862个氨基酸,其分子量为98.91 ku,理论等电点为8.07。预测定位于细胞核。荧光定量PCR分析表明,该基因具有组织表达特异性,在根和幼果中的表达量最高,在穗丝中表达最低。非生物胁迫表达分析结果表明:在盐胁迫和干旱胁迫下,ZmUBC-76的表达呈逐渐下降趋势,在处理24 h时达到最低;在低温胁迫时,ZmUBC-76的表达量未出现显著变化。上述结果表明,ZmUBC-76可能参与了植物对盐和干旱胁迫的响应。 展开更多
关键词 玉米 泛素结合酶基因 干旱 低温 盐胁迫
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家蚕泛素结合酶新基因的克隆与基因组结构及5′调控区分析 被引量：2
2
作者 徐豫松 王华兵 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期439-443,共5页
在家蚕丝腺cDNA文库测序过程中,发现一个编码家蚕泛素结合酶的EST序列,利用3′RACE方法克隆了一个新的家蚕泛素结合酶基因cDNA全长序列,命名为BmUCE2 I(GenBank登录号为DQ219874)。家蚕BmUCE2 I基因全长cDNA由465 bp的开放阅读框序列(O... 在家蚕丝腺cDNA文库测序过程中,发现一个编码家蚕泛素结合酶的EST序列,利用3′RACE方法克隆了一个新的家蚕泛素结合酶基因cDNA全长序列,命名为BmUCE2 I(GenBank登录号为DQ219874)。家蚕BmUCE2 I基因全长cDNA由465 bp的开放阅读框序列(ORF)、97 bp的5′端非翻译区序列(5-′UTR)和237 bp的3′端非编码区序列(3-′UTR)组成,其编码的154个氨基酸与其他真核生物间具有较高的同源性。利用BmUCE2 I的EST片断作探针,通过筛选家蚕噬菌体基因组文库,获得了家蚕BmUCE2 I基因组序列和5′调控序列。BmUCE2 I基因由4个外显子和3个内含子组成,在5′端上游调控区域没有类似TATA盒元件,但在-219^-268 bp的区域存在一个50bp的启动子序列,此外还存在CF2-Ⅱ、FTZ、DFD、BRCZ2、DL、STAT、PRD-HD等多个转录因子结合位点。家蚕泛素结合酶新基因的克隆、基因结构及5′调控区的分析为进一步研究泛素蛋白水解酶复合通路相关基因的调控规律提供了重要依据。 展开更多
关键词 家蚕 泛素结合酶基因 基因克隆 启动子
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香蕉泛素结合酶基因的克隆及其功能初步分析 被引量：2
3
作者 李羽佳 金志强 +5 位作者 刘菊华 贾彩红 张建斌 王甲水 许奕 徐碧玉 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2013年第6期1098-1102,共5页
根据香蕉根系均一化全长cDNA文库筛选出一个香蕉泛素结合酶基因的片段通过RACE技术克隆该基因,命名为mauce2。生物信息学分析表明,该基因全长为929 bp,有一个完整的ORF编码148个氨基酸,蛋白分子量为16 505.1 ku,理论等电点为8.41,是一... 根据香蕉根系均一化全长cDNA文库筛选出一个香蕉泛素结合酶基因的片段通过RACE技术克隆该基因,命名为mauce2。生物信息学分析表明,该基因全长为929 bp,有一个完整的ORF编码148个氨基酸,蛋白分子量为16 505.1 ku,理论等电点为8.41,是一个碱性氨基酸。与江南卷柏、大豆、苹果、拟南芥的同源性为97.97%、97.30%、96.62%、95.95%。器官特异性表达分析表明,该基因在各器官中均有表达,在花中表达量最高,根次之,叶中表达量最低。 展开更多
关键词 香蕉 泛素结合酶基因 克隆 实时定量PCR 组织特异性表达分析
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细粒棘球绦虫泛素结合酶基因家族的生物信息学及表达分析 被引量：1
4
作者 杜小迪 侯巍 +5 位作者 苏中华 马青梅 何雪 华瑞其 阳爱国 杨光友 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期2605-2618,共14页
本研究对细粒棘球绦虫泛素结合酶(EgE2s)基因家族进行鉴定、生物信息学分析以及检测其在不同发育阶段的转录水平,为其功能研究和构建优势抗原表位疫苗奠定基础。本研究基于数据库中细粒棘球绦虫基因组学信息,对EgE2s基因家族进行T-A克... 本研究对细粒棘球绦虫泛素结合酶(EgE2s)基因家族进行鉴定、生物信息学分析以及检测其在不同发育阶段的转录水平,为其功能研究和构建优势抗原表位疫苗奠定基础。本研究基于数据库中细粒棘球绦虫基因组学信息,对EgE2s基因家族进行T-A克隆、生物信息学分析以及采用qRT-PCR法检测了这些基因在原头蚴(Protoscolex, PSCs)和28日龄童虫中的转录水平。结果成功克隆并测序19个EgE2s基因,更正了两个原序列有误的EgE2s,分别为EgE2L3(登录号:MZ277618);EgE2J1(登录号:MZ277619)。三级结构和保守基序预测结果表明EgE2s高度保守。qRT-PCR结果显示,EgE2s的转录水平在PSCs和28日龄童虫中存在差异,其中EgE2A(P<0.001)、EgE2J1(P<0.01)在PSCs阶段高表达。B细胞抗原表位预测表明EgE2N的139-157区域位于EgE2s保守基序外。同时,T细胞抗原表位预测表明EgE2N与人和犬MHCⅠ类分子各有两个强结合位点,且有一个共同的抗原表位位点104-113。综上,EgE2A和EgE2J1可能在PSCs的生长发育中起重要作用。EgE2N的139-157和104-113区域可能是药物研究和疫苗开发的靶序列。 展开更多
关键词 细粒棘球绦虫 泛素结合酶基因家族 生物信息学 转录水平分析
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胶孢炭疽菌泛素结合酶基因CgUBC2的RNAi突变体获得与功能分析 被引量：1
5
作者 苏初连 康浩 +3 位作者 杨石有 蒲金基 夏杨 张贺 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期125-131,共7页
为了研究胶孢炭疽菌泛素结合酶基因CgUBC2的功能以及与致病相关基因间的关联性。利用RNAi技术构建沉默载体pSilent-1:CgUBC2,通过PEG介导法获得突变体菌株,实时荧光定量PCR法分析其侵染寄主过程中的差异表达,以及与PG、ECH、LIP、PKS、... 为了研究胶孢炭疽菌泛素结合酶基因CgUBC2的功能以及与致病相关基因间的关联性。利用RNAi技术构建沉默载体pSilent-1:CgUBC2,通过PEG介导法获得突变体菌株,实时荧光定量PCR法分析其侵染寄主过程中的差异表达,以及与PG、ECH、LIP、PKS、HMT、Sin3P、NRPS 7个致病相关基因的关联性。通过特异性引物检测鉴定、表达量分析,获得CgUBC2的RNAi突变体为pSilent-1:CgUBC2-1和pSilent-1:CgUBC2-2,侵染过程中突变体菌株CgUBC2基因表达量、7个致病相关基因的表达量显著低于野生型菌株。成功获得胶孢炭疽菌泛素结合酶基因CgUBC2的RNAi沉默突变体,CgUBC2参与侵染寄主的过程、正向调控7个致病相关基因和致病力。 展开更多
关键词 胶孢炭疽菌 泛素结合酶基因CgUBC2 RNAi突变体
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泛素结合酶基因UbcH10在脑星形胶质细胞瘤组织中的表达及意义 被引量：1
6
作者 蒋磊 骆纯 +4 位作者 胡国汉 黄承光 陈菊祥 孙克华 卢亦成 《中华神经医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期459-463,共5页
目的探讨泛素结合酶基因UbcH10在脑星形胶质细胞瘤组织中mRNA和蛋白表达水平及其与星形胶质细胞瘤病理级别的相关性。方法应用实时荧光定量PCR、免疫组织化学染色和蛋白印迹实验检测UbeH10 mRNA和蛋自在32例不同级别脑星形胶质细胞瘤和... 目的探讨泛素结合酶基因UbcH10在脑星形胶质细胞瘤组织中mRNA和蛋白表达水平及其与星形胶质细胞瘤病理级别的相关性。方法应用实时荧光定量PCR、免疫组织化学染色和蛋白印迹实验检测UbeH10 mRNA和蛋自在32例不同级别脑星形胶质细胞瘤和6例正常脑组织中的表达．并检测UbcH10蛋白表达与增殖抗原Ki-67蛋白表达的相关性。结果实时荧光定量PCR结果、免疫组织化学染色结果和蛋白印迹实验结果提示：与正常脑组织（1．00±1．57；0％；0．43±0．42）比较．UbcHlomRNA和蛋白表达水平在高级别星形胶质细胞瘤（64．33±60．98；9．65％±5．75％；0．69±0．38）和低级别星形胶质细胞瘤（8．36±8．15；4．82％±3．30％；0．10±0．08）中明显上调，差异均有统计学意义（P〈0．05）；且高、低级别星形胶质细胞瘤之间比较差异也有统计学意义（P〈0．05）。UbcH10阳性细胞表达率与增殖抗原Ki-67阳性细胞表达率呈显著的正相关关系（r=0．67，P=0．000）。结论泛素结合酶基因UbcH10可能在星形胶质细胞瘤的发生发展恶变过程中具有重要作用。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 星形胶质细胞瘤 泛素结合酶基因UbcH10 增殖抗原Ki-67蛋白
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