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玉米泛素结合酶基因家族的生物信息学及表达分析 被引量：5
1
作者 陈曙 赵秋芳 +1 位作者 陈宏良 贾利强 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期1476-1483,共8页
【目的】利用生物信息学分析玉米泛素结合酶(E2)基因家族的理化性质和功能,并研究低磷处理下泛素E2基因在玉米幼苗不同组织部位的表达情况,为深入研究泛素E2基因响应低磷胁迫的分子机制提供理论参考。【方法】以MEGA 6.0邻接法(NJ)构建... 【目的】利用生物信息学分析玉米泛素结合酶(E2)基因家族的理化性质和功能,并研究低磷处理下泛素E2基因在玉米幼苗不同组织部位的表达情况,为深入研究泛素E2基因响应低磷胁迫的分子机制提供理论参考。【方法】以MEGA 6.0邻接法(NJ)构建拟南芥、水稻和玉米E2基因家族成员的系统发育进化树,利用生物信息学方法对75个玉米E2基因进行序列分析及理化性质预测。对玉米幼苗进行低磷处理,分别在0、1、6和24 h时采集其根部和叶片样品,并分别通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测其E2亚家族XVIII成员基因即ZmUBC17、ZmUBC18、ZmUBC48、ZmUBC57和ZmUBC58在玉米幼苗不同组织中的表达情况。【结果】拟南芥、水稻和玉米的E2基因可划分为18个亚家族,各亚家族间基因功能和进化关系较相近,但含有的E2基因数量差异明显,以亚家族VI的成员最多,亚家族X、XII和XV的成员数最少,均为3个,各亚家族中均分别含拟南芥、水稻和玉米E2基因各1个。玉米E2基因的编码区序列(CDS)长度为402~2616 bp,编码133~871个氨基酸,外显子数目数量存在明显差异,以4~6个居多,最少为1个,最多为12个。86.8%的玉米E2蛋白为不稳定蛋白。玉米E2亚家族XVIII成员中,ZmUBC18、ZmUBC48、ZmUBC57和ZmUBC58蛋白UBC结构域序列具有高度相似性,但与ZmUBC17存在明显差异,且这4个基因在玉米根和叶中均有表达,基因表达模式相似,整体上在低磷处理6 h时的表达量最高;低磷处理下ZmUBC17基因在根中不同时间点的表达量变幅较小,但在叶0~24 h时的表达量呈逐渐升高的变化趋势,尤其是24 h时表达量达最高,表明ZmUBC17基因的响应部位是叶片。【结论】玉米泛素E2蛋白可能参与调控对磷元素的吸收,尤其是ZmUBC17基因具有组织表达特异性,在叶片中大量表达,推测ZmUBC17基因通过调控玉米对磷元素吸收和转运间接影响光合作用效率。 展开更多
关键词 玉米 泛素结合酶(e2) 生物信息学 系统发育进化树 基因表达
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可可泛素结合酶基因家族的生物信息学初步分析 被引量：5
2
作者 赵秋芳 董晨 +2 位作者 决登伟 陈宏良 贾利强 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第9期1732-1740,共9页
泛素结合酶（E2s）促进底物泛素化或者与E3s链接,是靶蛋白泛素化的关键酶,在泛素-蛋白酶体途径中起重要作用。利用可可（Theobroma cacao L.）全基因组测序数据,共鉴定出45个E2s基因家族成员,包括39个UBC和6个UEV基因。通过生物信息学方... 泛素结合酶（E2s）促进底物泛素化或者与E3s链接,是靶蛋白泛素化的关键酶,在泛素-蛋白酶体途径中起重要作用。利用可可（Theobroma cacao L.）全基因组测序数据,共鉴定出45个E2s基因家族成员,包括39个UBC和6个UEV基因。通过生物信息学方法,对可可E2s家族的基本理化性质、基因结构、二级结构预测、亚细胞定位、进化关系等方面进行初步分析。结果表明：可可E2s基因CDS长度在441（Tc UEV3）～3 651 bp（Tc UBC7）之间,对应的编码蛋白氨基酸数目在146（Tc UEV3）～1 216 aa（Tc UBC7）之间,编码蛋白分子量在16.39～134.71 ku之间。E2s基因外显子在1～11之间,多数基因外显子数目在5～7之间。E2s基因在10条染色体上均有分布,1号染色体为7个,数量最多;6号染色体2个基因,数量最少。可可E2s蛋白大多为不稳定蛋白,且均为亲水性蛋白,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主要构成元件。大多数可可E2s蛋白定位在细胞核,少数定位在内质网或者细胞质。进化树分析表明：可可E2s蛋白被分为20个亚家族,包括16个UBC亚家族和4个UEV亚家族,第Ⅵ亚家族E2s数目最多为9个;E2s家族蛋白在物种进化过程中具有高度保守性。 展开更多
关键词 可可 泛素结合酶(e2s) 基因家族 生物信息学
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角毛壳菌泛素结合酶基因的克隆和特性分析 被引量：1
3
作者 张海燕 贺洁 尚富德 《河南大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2014年第1期74-78,共5页
利用BlastX将角毛壳菌(Chaetomium cupreum)几丁质诱导的菌丝体cDNA文库中的ESTs序列与NCBI的Nr(Non-redundant)数据库进行相似性搜索,获得泛素结合酶(ubiquitin conjugating enzyme,E2)基因的ESTs.以此结果设计引物进行RT-PCR,克隆该... 利用BlastX将角毛壳菌(Chaetomium cupreum)几丁质诱导的菌丝体cDNA文库中的ESTs序列与NCBI的Nr(Non-redundant)数据库进行相似性搜索,获得泛素结合酶(ubiquitin conjugating enzyme,E2)基因的ESTs.以此结果设计引物进行RT-PCR,克隆该基因的cDNA序列(CcE2).该序列长600bp,开放阅读框444bp,编码147个氨基酸组成的多肽,蛋白分子量为16.6ku,是亲水性蛋白.BlastP分析表明该基因进化相当保守,与其他真菌的E2具有高度的相似性;三维结构分析显示CcE2仅包含一个功能结构域,在结构域的中央是决定CcE2活性的半胱氨酸残基活性位点. 展开更多
关键词 泛素结合酶(e2) 角毛壳菌 克隆 生物信息学分析
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小麦胁迫相关基因TaUCE2的克隆及表达模式分析
4
作者 毛凤鑫 葛超 +7 位作者 李豪圣 王灿国 韩冉 程敦公 李法计 孙福来 赵振东 刘爱峰 《山东农业科学》 2020年第2期1-6,共6页
前期通过对耐旱小麦的RNA-Seq分析发现,转录本TRIAECS423DLTGACV1252817AA0892160在干旱胁迫下表达量下降;通过克隆、生物信息学分析发现,该转录本包含一个444 bp的完整编码区,编码147个氨基酸,蛋白结构分析其含有一个UBC结构域,与山羊... 前期通过对耐旱小麦的RNA-Seq分析发现,转录本TRIAECS423DLTGACV1252817AA0892160在干旱胁迫下表达量下降;通过克隆、生物信息学分析发现,该转录本包含一个444 bp的完整编码区,编码147个氨基酸,蛋白结构分析其含有一个UBC结构域,与山羊草泛素结合酶(E2)的氨基酸序列完全一致,证明该基因为泛素结合酶(E2)基因(Ta UCE2)。蛋白序列比对发现其第7、91、144位置处的氨基酸在单双子叶植物之间是特异的。进化分析发现该基因是在单双子叶植物进化后期分化的。荧光定量PCR分析表明,该基因响应ABA、干旱、高盐、低温的胁迫,在四种胁迫下,该基因在根中的表达量均降低。本研究为进一步分析泛素蛋白酶体途径在小麦逆境响应中的功能和机制奠定基础。 展开更多
关键词 小麦 泛素结合酶(e2) Ta UCe2 逆境胁迫
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敲低Ube2w增加葡聚糖硫酸钠诱导的小鼠溃疡性结肠炎的易感性 被引量：1
5
作者 王少鑫 崔立红 +3 位作者 李晓伟 刘新尧 罗哲 闫志辉 《基础医学与临床》 2021年第7期946-950,共5页
目的探讨泛素结合酶(E2)W(UBE2W)对葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的小鼠溃疡性结肠炎性反应的影响。方法在小鼠成纤维细胞系L929中转染Ube2w siRNA(1#,2#,3#)不同干扰序列,Western blot检测UBE2W蛋白表达,选择干扰效果最佳的siRNA进行小鼠体内... 目的探讨泛素结合酶(E2)W(UBE2W)对葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的小鼠溃疡性结肠炎性反应的影响。方法在小鼠成纤维细胞系L929中转染Ube2w siRNA(1#,2#,3#)不同干扰序列,Western blot检测UBE2W蛋白表达,选择干扰效果最佳的siRNA进行小鼠体内转染实验。给10只C57BL/6雄性小鼠随机尾静脉注射siRNA(siUbe2w/si-control),并用2.5%DSS喂养,构建两组DSS小鼠溃疡性结肠炎模型,即Ube2w敲低组和对照组各5只。通过Western blot和RT-qPCR检测小鼠结肠组织UBE2W的表达水平,观察两组小鼠的体质量,并通过组织学评分比较结肠炎性反应的严重程度。结果L929细胞转染后Ube2w siRNA2#抑制UBE2W蛋白表达最为明显,敲低Ube2w组小鼠结肠组织中UBE2W mRNA和蛋白表达水平均低于对照组,且Ube2w敲低组小鼠体质量丢失明显多于对照组,敲低组小鼠溃疡性结肠炎组织学评分为(8.60±0.24)分高于对照组(5.20±0.49)分(P<0.05)。结论UBE2W参与了炎性反应的调控过程,Ube2w敲低能够增加DSS诱导小鼠溃疡性结肠炎的易感性。 展开更多
关键词 泛素结合酶(e2)W 葡聚糖硫酸钠盐 结肠炎
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基于TCGA数据乳腺癌组织UBE2T表达临床意义分析 被引量：13
6
作者 罗何三 吴盛喜 +2 位作者 许鸿鹞 黄河澄 林连兴 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2017年第13期901-905,911,共6页
目的既往研究发现,泛素结合酶E2T(ubiquitin-conjugating enzyme E2T,UBE2T)在多种肿瘤中表达升高,然而UBE2T在乳腺癌中是否存在高表达及意义尚不清楚。本研究探讨UBE2T表达水平在乳腺癌中的临床意义和可能的机制。方法从癌症基因组图谱... 目的既往研究发现,泛素结合酶E2T(ubiquitin-conjugating enzyme E2T,UBE2T)在多种肿瘤中表达升高,然而UBE2T在乳腺癌中是否存在高表达及意义尚不清楚。本研究探讨UBE2T表达水平在乳腺癌中的临床意义和可能的机制。方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载正常乳腺组织和乳腺癌组织中UBE2T基因mRNA二代测序数据及临床信息资料,分析UBE2T mRNA表达水平与乳腺癌临床病理学参数的相关性及对预后的影响。采用Cox回归多因素分析探讨影响乳腺癌患者预后的因素,采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法预测UBE2T可能的调控通路。结果 UBE2T mRNA在乳腺癌组织中表达量为9.28~3 963.54,中位374.18,显著高于正常乳腺组织中UBE2T表达量8.54~216.13,中位40.44,差异有统计学意义(P<0.001),而且UBE2T表达水平与乳腺癌患者年龄、分子分型、T分期、TNM分期、雌激素受体(estrogen receptor,ER)、孕激素受体(progesterone receptor,PR)和人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)状态以及病理类型存在显著相关,均P<0.05。进一步分析发现,UBE2T低表达的患者生存预后优于UBE2T高表达的患者,χ~2=7.490,P=0.006。Cox多因素分析结果表明,年龄、分子分型、N分期、M分期和UBE2T表达水平等均是影响乳腺癌患者预后的独立预后因素,P<0.05。GSEA分析表明,UBE2T低表达的组织中存在RIGGINS_TAMOXIFEN_RESISTANCE_DN信号通路(FDR=0.199,P<0.001)和ERB2_UP.V1_DN路通(FDR=0.235,P<0.001)相关基因富集。结论乳腺癌组织中存在UBE2T mRNA水平表达上调,而且UBE2T的表达水平与患者临床病理因素显著相关,其高表达是乳腺癌预后不良因素,其可作为预后判断的分子标记,是潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 癌症基因组图谱 乳腺癌 泛素结合酶e2T 临床意义
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泛素结合酶E2C通过特异性结合β-微管蛋白参与调控肝细胞癌进展 被引量：7
7
作者 刘梦 朱怡卿 +3 位作者 黄金凤 肖邦 陈美婷 王芳 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期14-20,共7页
目的筛选泛素结合酶E2C(UBE2C)的底物蛋白,并探讨其在肝细胞癌进展中的作用。方法构建带有Halotag标签的UBE2C过表达质粒,将UBE2C与Halotag在人高转移肝癌细胞系HCCLM3中融合表达,通过Halolink树脂沉淀UBE2C结合的底物蛋白,并联合SDS-P... 目的筛选泛素结合酶E2C(UBE2C)的底物蛋白,并探讨其在肝细胞癌进展中的作用。方法构建带有Halotag标签的UBE2C过表达质粒,将UBE2C与Halotag在人高转移肝癌细胞系HCCLM3中融合表达,通过Halolink树脂沉淀UBE2C结合的底物蛋白,并联合SDS-PAGE和质谱对底物蛋白进行鉴定。在人肝癌细胞系Huh-7中过表达UBE2C,通过qRT-PCR、蛋白质印迹分析和细胞免疫荧光实验检测UBE2C过表达对其底物蛋白表达的影响,利用细胞核质分离结合蛋白质印迹分析及TOP flash/FOP flash荧光素酶报告基因实验检测UBE2C过表达对Wnt信号通路的影响,并进一步通过qRT-PCR和蛋白质印迹分析验证UBE2C过表达对Wnt信号通路下游基因表达的影响。结果Halotag共沉淀产物经SDS-PAGE和银染后所获得差异条带的质谱鉴定结果显示,β-微管蛋白是UBE2C结合的底物蛋白。与对照组相比,过表达UBE2C降低了Huh-7细胞中β-微管蛋白在蛋白水平的表达(P<0.01),但对其在mRNA水平的表达没有影响(P>0.05)。同时,过表达UBE2C促进了β-联蛋白入核(P<0.05),提高了TOP flash/FOP flash荧光素酶活性(P<0.01),增强了Wnt信号通路下游基因JNK、细胞周期蛋白D1和基质金属蛋白酶7的表达(P均<0.05)。结论UBE2C通过特异性结合β-微管蛋白降低肝癌细胞中β-微管蛋白水平,从而提高Wnt信号通路活性,促进其下游基因表达,进而参与调控肝细胞癌的进展。 展开更多
关键词 肝细胞癌 泛素结合酶e2C Β-微管蛋白 WNT信号通路
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泛素/26S蛋白酶体途径在水稻中的生物学功能研究进展 被引量：4
8
作者 徐丹丹 孙帆 +3 位作者 王银晓 石英尧 王文生 傅彬英 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期25-33,共9页
生物体内的蛋白质降解方式有两种,一种不需要能量,一种需要能量。而泛素/26S蛋白酶体途径便是目前已知的依赖ATP、高效、有高度选择性的蛋白降解途径。它介导了真核生物中80%~85%的蛋白质降解,几乎参与到植物生长发育的各个环节,是植物... 生物体内的蛋白质降解方式有两种,一种不需要能量,一种需要能量。而泛素/26S蛋白酶体途径便是目前已知的依赖ATP、高效、有高度选择性的蛋白降解途径。它介导了真核生物中80%~85%的蛋白质降解,几乎参与到植物生长发育的各个环节,是植物体内蛋白高效专一降解最重要、最精细的调控机制之一。概述了泛素蛋白酶体途径,重点阐述了泛素结合酶E2和泛素连接酶E3的蛋白结构及其在水稻生长发育、激素信号传导、生物和非生物胁迫响应中的生物学功能及机制,并对进一步研究进行了展望,将有助于揭示泛素/26S蛋白酶体途径在水稻生长发育中的精细调控过程,并为水稻抗逆育种提供了指导和借鉴。 展开更多
关键词 泛素蛋白酶体途径 水稻 泛素结合酶e2 泛素连接酶e3 生物学功能
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UBE2T基因表达对鼻咽癌细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响 被引量：5
9
作者 郑志刚 华清泉 陈锋 《实用癌症杂志》 2019年第10期1579-1582,共4页
目的探讨泛素结合酶E2T(UBE2T)基因表达对鼻咽癌细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响。方法选取鼻咽癌细胞系5-8F细胞,随机分为对照组、空白转染组和si-UBE2T组,其中空白转染组细胞转染空白载体,si-UBE2T组细胞转染UBE2T特异性siRNA载体,采... 目的探讨泛素结合酶E2T(UBE2T)基因表达对鼻咽癌细胞增殖、迁移及侵袭能力的影响。方法选取鼻咽癌细胞系5-8F细胞,随机分为对照组、空白转染组和si-UBE2T组,其中空白转染组细胞转染空白载体,si-UBE2T组细胞转染UBE2T特异性siRNA载体,采用MTT法检测各组细胞增殖情况,采用Transwell迁移侵袭试验检测各组细胞迁移和侵袭,Western blotting法检测各组细胞UBE2T蛋白表达。结果 si-UBE2T组UBE2T蛋白相对表达量为(0. 354±0. 051),明显低于对照组和空白转染组(P <0. 05);si-UBE2T组培养第1 d、3 d和6 d吸光度值均低于对照组和空白转染组(P <0. 05);对照组和空白转染组培养第1d、3d和6d吸光度值比较差异无统计学意义(P> 0. 05);si-UBE2T组细胞迁移率和穿膜细胞数分别为(0. 322±0. 040)%和(85. 12±12. 06)个,明显低于对照组和空白转染组(P <0. 05);对照组和空白转染组UBE2T蛋白相对表达量、细胞迁移率和穿膜细胞数比较差异无统计学意义(P> 0. 05)。结论 UBE2T基因表达可促进鼻咽癌5-8F细胞增殖、侵袭及转移,有望成为鼻咽癌分支靶向治疗的靶标。 展开更多
关键词 泛素结合酶e2T 鼻咽癌 5-8F细胞 增殖 迁移 侵袭
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小白菜BcUBCE2基因的克隆及表达分析 被引量：5
10
作者 赵瑞丽 钟凤林 +4 位作者 林义章 高世超 林俊芳 杨碧云 胡海非 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期60-65,共6页
采用cDNA-AFLP和RACE技术从小白菜中克隆得到泛素结合酶E2基因(ubiquitin conjugating enzyme E2),命名为BcUBCE2。序列分析表明,BcUBCE2基因cDNA全长830bp,包含1个456bp的开放阅读框,编码152个氨基酸。结构分析发现,该序列包含一个泛... 采用cDNA-AFLP和RACE技术从小白菜中克隆得到泛素结合酶E2基因(ubiquitin conjugating enzyme E2),命名为BcUBCE2。序列分析表明,BcUBCE2基因cDNA全长830bp,包含1个456bp的开放阅读框,编码152个氨基酸。结构分析发现,该序列包含一个泛素结合酶E2活性位点和一个高度保守的半胱氨酸。进化分析显示,小白菜BcUBCE2蛋白同拟南芥E2蛋白的亲缘关系最近。qRT-PCR分析表明,BcUBCE2基因在小白菜根、茎、叶中均有表达,铜处理10d时BcUBCE2基因的表达量最高。研究认为,BcUBCE2基因可能在铜胁迫响应中发挥重要作用。 展开更多
关键词 小白菜 泛素结合酶e2 RACe 铜胁迫
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泛素结合酶E2Q1表达与肺腺癌临床病理特征及预后相关性分析 被引量：1
11
作者 蒋微 王羽超 +2 位作者 徐春华 邹珏 张倩 《中国呼吸与危重监护杂志》 CAS CSCD 2024年第4期237-241,共5页
目的探究泛素结合酶E2Q1(Ubiquitin-conjugating enzyme E2Q1,UBE2Q1)的表达与肺腺癌临床病理特征及预后的相关性。方法回顾性了选取了2013年1月-2016年12月南京市胸科医院接受根治性手术治疗的74例I~Ⅲ期肺腺癌患者的癌组织及癌旁组织... 目的探究泛素结合酶E2Q1(Ubiquitin-conjugating enzyme E2Q1,UBE2Q1)的表达与肺腺癌临床病理特征及预后的相关性。方法回顾性了选取了2013年1月-2016年12月南京市胸科医院接受根治性手术治疗的74例I~Ⅲ期肺腺癌患者的癌组织及癌旁组织标本,采用免疫组化染色检测UBE2Q1蛋白表达水平,根据染色评分,将患者分为高表达组和低表达组,用卡方检验分析UBE2Q1蛋白水平与临床病理特征的相关性,KaplanMeier生存曲线分析UBE2Q1与肺腺癌患者预后相关性,单因素和多因素Cox比例风险模型分析影响肺腺癌患者生存期的危险因素。结果UBE2Q1在肺腺癌组织中高表达,且表达水平与肿瘤直径、淋巴结转移和TNM分期相关(P<0.05),与患者性别、年龄、吸烟史、肿瘤分化程度无相关性(P>0.05)。Kaplan-Meier生存分析结果显示,UBE2Q1低表达较UBE2Q1高表达患者有更长的无病生存期(disease-free survival,DFS)和总生存时间(overall survival,OS)(P均<0.05)。Cox比例风险模型显示肿瘤直径、淋巴结转移、TNM分期以及UBE2Q1高表达是DFS、OS的危险因素,其中TNM分期是DFS、OS的独立危险因素。结论UBE2Q1在肺腺癌组织中高表达,且与肺腺癌肿瘤直径大、淋巴结转移、TNM分期晚及较差预后相关,UBE2Q1是肺腺癌的危险因素。 展开更多
关键词 泛素结合酶e2Q1 肺腺癌 临床病理特征 预后
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UBE2C和UBE2T与胰腺癌患者预后及免疫细胞浸润的关系 被引量：3
12
作者 于运亮 李婷 +2 位作者 王莉莉 丛培英 封建凯 《山东医药》 CAS 2021年第28期13-18,共6页
目的探讨泛素结合酶E2C(UBE2C)和E2T(UBE2T)与胰腺癌患者预后及免疫细胞浸润的关系。方法检索Oncomine、GEPIA2.0、EMBL-EBI数据库分析两基因在胰腺癌中的表达情况,利用GEPIA、Kaplan-Meierplotter数据库探索两基因的表达与胰腺癌患者... 目的探讨泛素结合酶E2C(UBE2C)和E2T(UBE2T)与胰腺癌患者预后及免疫细胞浸润的关系。方法检索Oncomine、GEPIA2.0、EMBL-EBI数据库分析两基因在胰腺癌中的表达情况,利用GEPIA、Kaplan-Meierplotter数据库探索两基因的表达与胰腺癌患者预后的相关性。利用Oncomine及cBioPortal数据库筛选共表达基因,使用FunRich软件进行富集分析。利用String数据库和Cytoscape软件综合分析与两基因相互作用的蛋白及调控网络。使用Cytoscape筛选核心(Hub)基因,并利用GEPIA进行预后分析。使用TIMER数据库分析两基因的表达与免疫细胞浸润的相关性。结果UBE2C和UBE2T在胰腺癌中表达上调,高表达两基因的患者总生存期和无病生存期显著缩短(P均<0.05)。两基因的表达与患者的分期、分级、巨噬细胞浸润等有关(P均<0.05)。在胰腺癌中UBE2C与UBE2T的表达显著相关(P<0.05),与两基因共表达的基因主要富集于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶激活功能;主要参与细胞周期、纺锤体组装过程;主要位于染色体结构中;在细胞周期、Aurora-B信号通路中富集。筛选的10个Hub基因为PBK、CEP55、BIRC5、MELK、CDK1、NUSAP1、TPX2、BUB1、TOP2A和BUB1B,与胰腺癌患者预后相关(P<0.05)。两基因的表达与巨噬细胞浸润呈负相关关系(P<0.05)。结论UBE2C和UBE2T与胰腺癌患者的预后及多种免疫细胞如T细胞、巨噬细胞的浸润有关,可能通过调控细胞周期、DNA复制过程进而调控胰腺癌的进程。 展开更多
关键词 胰腺癌 泛素结合酶e2C 泛素结合酶e2T 预后 免疫细胞
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UBE2T通过JAK-STAT通路促进甲状腺乳头状癌细胞增殖
13
作者 张丽君 李琳 +1 位作者 斯岩 沈美萍 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2024年第6期762-768,共7页
目的:探讨泛素结合酶E2T(ubiquitin-binding enzyme E2T,UBE2T)在人甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcino-ma,PTC)中的表达情况及其对患者预后的影响,同时探讨UBE2T在PTC细胞中的功能,旨在识别其可能的调控机制,为未来PTC的靶向治... 目的:探讨泛素结合酶E2T(ubiquitin-binding enzyme E2T,UBE2T)在人甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcino-ma,PTC)中的表达情况及其对患者预后的影响,同时探讨UBE2T在PTC细胞中的功能,旨在识别其可能的调控机制,为未来PTC的靶向治疗策略提供理论依据。方法:采用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库,系统分析UBE2T在PTC中的表达及其与患者预后的关系。通过Western blot技术检测UBE2T在甲状腺肿瘤组织和癌旁正常组织中的表达。在PTC细胞系(TPC-1、KTC-1)中进行UBE2T敲减实验,借助CCK-8、平板克隆、划痕和Transwell实验评估细胞增殖、迁移和侵袭能力,并通过Western blot检测相关蛋白水平的变化。结果:TCGA数据库生物信息学分析表明,PTC组织中UBE2T显著升高,且其表达与患者无疾病间隔、淋巴结转移相关(P<0.01)。UBE2T敲减导致TPC-1和KTC-1细胞增殖活力显著下降,同时抑制细胞迁移和侵袭,诱导STAT磷酸化下调。敲减UBE2T的细胞系加入STAT激活剂后,细胞增殖显著提高。结论:敲减UBE2T能抑制PTC细胞系TPC-1和KTC-1的增殖、迁移和侵袭,UBE2T通过调控JAK-STAT信号通路促进细胞增殖,提示UBE2T有可能成为PTC的治疗靶点。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 泛素结合酶e2T JAK-STAT通路
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胃癌组织中UBE2S、FASN蛋白的表达及其临床病理意义
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作者 陈元杏 张丽 +1 位作者 张玉荣 刘杲 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第10期1932-1935,1939,共5页
目的研究胃癌组织中泛素结合酶E2S(UBE2S)、脂肪酸合成酶(FASN)蛋白的表达及其与临床病理特征、生存预后的相关性。方法对2020年1月至2022年12月期间在恩施土家族苗族自治州中心医院行手术切除治疗的108例胃癌患者进行分析,采用Western ... 目的研究胃癌组织中泛素结合酶E2S(UBE2S)、脂肪酸合成酶(FASN)蛋白的表达及其与临床病理特征、生存预后的相关性。方法对2020年1月至2022年12月期间在恩施土家族苗族自治州中心医院行手术切除治疗的108例胃癌患者进行分析,采用Western blot检测胃癌组织及癌旁组织中UBE2S、FASN的蛋白表达水平。比较不同临床病理特征、生存预后患者胃癌组织中UBE2S、FASN蛋白表达水平的差异,采用ROC曲线分析胃癌组织中UBE2S、FASN蛋白表达水平对患者生存预后的评估价值。结果胃癌组织中UBE2S、FASN的蛋白表达水平高于对应的癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05);TNMⅢ期胃癌组织中UBE2S、FASN蛋白表达水平高于TNMⅠ~Ⅱ期,差异有统计学意义(P<0.05);有脉管癌栓的胃癌组织中UBE2S、FASN的蛋白表达高于无脉管癌栓的胃癌组织,差异有统计学意义(P<0.05);死亡患者的胃癌组织中UBE2S、FASN的蛋白表达高于存活患者,差异有统计学意义(P<0.05);胃癌组织中UBE2S、FASN蛋白表达水平评估患者术后死亡的曲线下面积分别为0.828、0.835(P<0.05)。结论胃癌组织中UBE2S、FASN表达增加且与TNM分期、脉管癌栓、生存预后相关。 展开更多
关键词 胃癌 泛素结合酶e2S 脂肪酸合成酶
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泛素结合酶E2T基因干扰影响人卵巢癌细胞株SKOV3增殖的作用与机制 被引量：4
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作者 李馨 张瑜 +1 位作者 倪婷婷 鲁亮 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2022年第10期1198-1202,1207,共6页
目的观察泛素结合酶E2T(UBE2T)基因感染对人卵巢癌细胞株SKOV3增殖的影响,并探讨其机制。方法构建UBE2T⁃shRNA、携带UBE2T、NC⁃shRNA基因的慢病毒载体,将其转染至人卵巢癌细胞株SKOV3,分别记为沉默组、转染组、阴性对照组;并取未转染的... 目的观察泛素结合酶E2T(UBE2T)基因感染对人卵巢癌细胞株SKOV3增殖的影响,并探讨其机制。方法构建UBE2T⁃shRNA、携带UBE2T、NC⁃shRNA基因的慢病毒载体,将其转染至人卵巢癌细胞株SKOV3,分别记为沉默组、转染组、阴性对照组;并取未转染的人卵巢癌细胞株SKOV3,记为空白对照组,每组设置3个复孔,制成细胞悬液,细胞浓度均调整为1×105个/mL。培养72 h。检测细胞形态、增殖抑制率及AKT等相关蛋白表达。结果沉默组细胞显著减少、连接疏松且有形态改变;沉默组细胞增殖抑制率、G1期细胞占比均高于其余3组(P<0.05),S期和G2期细胞占比、UBE2T、AKT、Cyclin D1 mRNA及蛋白表达、p⁃AKT水平均低于其余3组(P<0.05),转染组细胞增殖抑制率、G1期细胞占比均低于阴性对照组与空白组(P<0.05),S期和G2期细胞占比、UBE2T、蛋白激酶B(AKT)、细胞周期蛋白D1(Cyclin D1)mRNA及蛋白表达、磷酸化⁃AKT(p⁃AKT)水平均高于阴性对照组与空白组(P<0.05)。结论UBE2T表达下调可抑制人卵巢癌细胞株SKOV3增殖,而UBE2T基因过表达则可促进人卵巢癌细胞株SKOV3增殖。 展开更多
关键词 泛素结合酶e2T 卵巢癌 增殖 蛋白激酶B 细胞周期蛋白D1
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肝细胞癌中UBE2S互作蛋白的筛选及预后模型构建
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作者 王小燕 张豪 +2 位作者 郭泽皓 曹骏 莫之婧 《吉林大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期168-177,共10页
目的:筛选泛素结合酶E2S (UBE2S)互作蛋白并构建肝细胞癌(HCC)基于UBE2S互作蛋白的预后模型(UIPM),分析UIPM评估HCC患者预后的价值。方法:采用免疫共沉淀(Co-IP)技术筛选与Flag-UBE2S结合的蛋白复合体,经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶... 目的:筛选泛素结合酶E2S (UBE2S)互作蛋白并构建肝细胞癌(HCC)基于UBE2S互作蛋白的预后模型(UIPM),分析UIPM评估HCC患者预后的价值。方法:采用免疫共沉淀(Co-IP)技术筛选与Flag-UBE2S结合的蛋白复合体,经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDSPAGE)和Western blotting法验证后,采用液相色谱-质谱联用仪(LC-MS)分析鉴定UBE2S互作蛋白,并对互作蛋白进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。采用R软件survival包筛选癌症基因组图谱(TGGA)中HCC预后相关蛋白与UBE2S互作蛋白取交集,通过LASSO回归分析从交集蛋白中获取关键蛋白构建UIPM,并建立预后模型风险评分公式,按照风险评分的中位值将TGGA中HCC患者分为高风险组和低风险组,通过受试者工作特征曲线(ROC)评估UIPM的预测准确性,并采用国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库对UIPM预测准确性进行再次验证。采用单因素和多因素Cox回归分析评估UIPM风险评分是否为HCC的预后独立危险因素,并进一步构建列线图模型。结果:Co-IP联合LC-MS分析得到97个UBE2S互作蛋白。GO功能和KEGG信号通路富集分析,互作蛋白主要与半胱氨酸型内肽酶活性、氧化应激和细胞死亡有密切关联。TCGA筛选出5 163个HCC预后相关蛋白,与UBE2S互作蛋白取交集,获得40个预后相关互作蛋白,LASSO回归分析得到7个关键蛋白,包括UBE2S、热休克蛋白家族A成员8(HSPA8)、异质性胞核核糖核蛋白H1(HNRNPH1)、含TCP1伴侣蛋白亚基3 (CCT3)、真核翻译起始因子2亚基1 (EIF2S1)、活化蛋白C激酶1受体(RACK1)和肌动蛋白相关蛋白2/3复合体亚基4(ARPC4),并构建了UIPM,高和低风险组HCC患者生存率存比较差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线,UIPM预测HCC患者1、2和3年UIPM风险评分的ROC曲线下面积(AUC)值均大于0.7,表明预测模型准确度较高。ICGC数据库数据也证实UIPM预测准确度较高。单因� 展开更多
关键词 泛素结合酶e2S 肝细胞癌 免疫共沉淀 液相色谱-质谱联用仪 预后分析
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草菇UBEV2蛋白同源模建筛选其小分子抑制剂 被引量：4
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作者 万佳宁 尚俊军 +7 位作者 汪滢 李正鹏 王莹 唐利华 茅文俊 汪虹 鲍大鹏 龚明 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2020年第4期35-42,共8页
草菇(Volvariella volvacea)具有典型的低温自溶特征,基于草菇低温自溶与一个泛素结合酶E2(ubiquitin-conjugating enzyme,UBE2)高表达及活性相关,采用虚拟筛选法获得潜在的草菇UBEV2抑制剂小分子化合物。结果表明:在2轮虚拟筛选方法得... 草菇(Volvariella volvacea)具有典型的低温自溶特征,基于草菇低温自溶与一个泛素结合酶E2(ubiquitin-conjugating enzyme,UBE2)高表达及活性相关,采用虚拟筛选法获得潜在的草菇UBEV2抑制剂小分子化合物。结果表明:在2轮虚拟筛选方法得到500个靶中化合物的基础上,综合考虑可与UBEV2上的Thr73、Gly77、Ile78、Phe84、Gly85、Asp86、Tyr87、Asp79形成多个氢键,以及Ile78、Leu83、Phe84、Asp86、His138、Ile141等形成较强的疏水作用,最终人工挑选得到150个小分子化合物,对接打分值区间为6.58~8.06。抗冻实验结果提示筛选的化合物能够减轻低温对草菇的伤害。 展开更多
关键词 草菇 泛素结合酶e2 虚拟筛选 抗冻保鲜
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血清hMAM、HER2、UBE2C联合检测对乳腺癌腋窝淋巴结转移的诊断价值
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作者 张江华 王海峰 +1 位作者 张克俭 贾国洪 《中国现代普通外科进展》 CAS 2024年第11期856-860,共5页
目的:探究血清人乳腺珠蛋白(hMAM)、人类表皮生长因子受体2(HER2)、泛素结合酶2C(UBE2C)联合检测对乳腺癌腋窝淋巴结转移的诊断价值。方法:选取2022年3月—2024年3月收治的乳腺癌患者90例,根据病理检查结果是否发生腋窝淋巴结转移分为... 目的:探究血清人乳腺珠蛋白(hMAM)、人类表皮生长因子受体2(HER2)、泛素结合酶2C(UBE2C)联合检测对乳腺癌腋窝淋巴结转移的诊断价值。方法:选取2022年3月—2024年3月收治的乳腺癌患者90例,根据病理检查结果是否发生腋窝淋巴结转移分为转移组(n=40)和非转移组(n=50),收集患者的一般临床资料,多因素Logistic回归分析乳腺癌发生腋窝淋巴结转移的影响因素,绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析hMAM、HER2、UBE2C对乳腺癌腋窝淋巴结转移的诊断价值,Pearson法分析hMAM、HER2、UBE2C与肿瘤标志物血清白蛋白19(CK19)、癌胚抗原(CEA)及三者间相关性。结果:转移组T_(3)+T_(4)期患者及肿瘤直径>3 cm患者占比显著高于非转移组(P<0.05),转移组水平显著高于非转移组(P<0.05);与非转移组相比,转移组血清hMAM、HER2、UBE2C水平均显著升高(P<0.05);CEA、hMAM、HER2、UBE2C水平升高均为影响乳腺癌发生腋窝淋巴结转移的危险因素(P<0.05);ROC曲线结果显示,hMAM、HER2、UBE2C预测乳腺癌发生腋窝淋巴结转移的AUC分别为0.821、0.815、0.819,三者联合的AUC为0.914,显著高于hMAM(Z=2.070,P=0.038)、HER2(Z=2.072,P=0.038)、UBE2C(Z=1.987,P=0.047)单独诊断。hMAM、HER2、UBE2C与肿瘤检测标志物均呈正相关(P<0.05),且三者之间也均互为正相关(P<0.05)。结论:乳腺癌腋窝淋巴结转移患者的血清hMAM、HER2、UBE2C水平升高,三者联合检测对乳腺癌腋窝淋巴结转移具有一定辅助预测价值,可能作为乳腺癌腋窝淋巴结转移潜在的生物标志物。 展开更多
关键词 人乳腺珠蛋白 人类表皮生长因子受体2 泛素结合酶e2C 乳腺肿瘤 腋窝淋巴结转移
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克氏原螯虾泛素结合酶E2r基因的克隆及表达分析 被引量：4
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作者 钱照君 祝天谅 +2 位作者 姜虎成 石宝通 李家乐 《上海海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期641-651,共11页
为了解泛素结合酶E2r基因在克氏原螯虾性腺发育中的作用,利用RACE技术得到了c DNA全序列,命名为Pc-UBE2r。该基因序列全长为3 671 bp,包含泛素结合酶的特有结构域,以及半胱氨酸残基活化位点。开放阅读框为729 bp,编码242个氨基酸,预测... 为了解泛素结合酶E2r基因在克氏原螯虾性腺发育中的作用,利用RACE技术得到了c DNA全序列,命名为Pc-UBE2r。该基因序列全长为3 671 bp,包含泛素结合酶的特有结构域,以及半胱氨酸残基活化位点。开放阅读框为729 bp,编码242个氨基酸,预测蛋白分子量约为27.6 ku。BLAST比对发现,克氏原螯虾UBE2r基因与节肢动物UBE2r基因具有较高的同源性。系统进化分析表明,Pc-UBE2r基因与日本囊对虾聚为一枝。qRT-PCR研究表明,Pc-UBE2r基因在性腺中的表达量显著高于其他组织(P<0.05)。在卵巢中,PcUBE2r基因的表达量在未发育期最低,在卵黄发生前期表达量快速增长,随后表达量逐渐降低。在精巢中,Pc-UBE2r基因的表达量在精母细胞发生期达到最高水平。组织原位杂交结果显示,Pc-UBE2r基因在卵巢中均匀分布在未发育期的卵母细胞细胞质中,随后逐渐迁移到卵母细胞细胞核以及滤泡细胞周围。在精巢中,Pc-UBE2r基因主要分布在精母细胞的周围。组织总蛋白Western blot检测发现,UBE2r蛋白在精巢和卵巢中的表达量也显著高于其他组织(P<0.05)。综上所述,我们推测Pc-UBE2r基因在克氏原螯虾配子发生和性腺发育方面发挥了重要作用,本研究将为虾蟹类性腺发育调控的分子机制奠定基础和提供依据。 展开更多
关键词 泛素结合酶e2r 性腺 原位杂交 WeSTeRN BLOT 克氏原螯虾
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UBE2C在乳腺癌MCF-7细胞增殖中的作用及机制研究
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作者 吴琼 贾永峰 《医学研究杂志》 2024年第7期73-78,共6页
目的研究沉默泛素结合酶E2C(ubiquitin-conjugating enzyme2C,UBE2C)对人乳腺癌MCF-7细胞增殖能力的影响,并初步研究其作用机制。方法利用小干扰RNA(si-RNA)沉默MCF-7细胞中UBE2C基因。利用CCK-8实验及克隆形成实验检测细胞增殖能力。... 目的研究沉默泛素结合酶E2C(ubiquitin-conjugating enzyme2C,UBE2C)对人乳腺癌MCF-7细胞增殖能力的影响,并初步研究其作用机制。方法利用小干扰RNA(si-RNA)沉默MCF-7细胞中UBE2C基因。利用CCK-8实验及克隆形成实验检测细胞增殖能力。实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)、Western blot法分别在mRNA、蛋白水平检测细胞周期相关蛋白激酶抑制蛋白p21以及细胞周期促进蛋白细胞周期蛋白D1(cellcycle protein D1,CyclinD1)、细胞周期蛋白依赖性激酶4(cyclin-dependent kinase4,CDK4)、细胞周期蛋白依赖性激酶6(cyclin-depend-ent kinase 6,CDK6)的表达。结果与空白对照组及阴性对照(si-NC)组细胞比较,si-UBE2C组细胞UBE2C表达下调。CCK-8实验以及克隆形成实验结果显示,si-UBE2C组细胞增殖能力明显降低;与空白对照组及si-NC组细胞比较,si-UBE2C组细胞周期相关蛋白激酶抑制蛋白p21在mRNA及蛋白水平的表达均上调,而细胞周期促进蛋白CyclinD1、CDK4、CDK6在mRNA及蛋白水平的表达均下调。结论UBE2C可以通过介导CyclinD1/CDK4/CDK6复合物及p21的表达来调控MCF-7细胞的增殖能力,促进乳腺癌的进展。 展开更多
关键词 泛素结合酶e2C 乳腺癌 CYCLIND1 增殖
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