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猪产业链中鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-基因组学分析
被引量:
2
1
作者
蒋增海
滕霖
+3 位作者
贺安文
刘言言
乐敏
何启盖
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期1199-1209,共11页
旨在探究鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-基因组学特征。采用Illumina NovaSeq 6000平台对91株河南省猪产业链中鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-分离菌进行全基因组测序,通过生物信息学分析,进行其血清型的预测、多位...
旨在探究鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-基因组学特征。采用Illumina NovaSeq 6000平台对91株河南省猪产业链中鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-分离菌进行全基因组测序,通过生物信息学分析,进行其血清型的预测、多位点序列的分型以及质粒类型、耐药基因和毒力基因分析。结果表明,在河南省猪产业链中沙门菌4,[5],12:i:-的流行率(1.58%,50/3173)已经超过鼠伤寒沙门菌的流行率(1.29%,41/3173);91株沙门菌的序列型分为ST34(71.42%,65/91)和ST19(28.57%,26/91);鼠伤寒沙门菌/ST34菌株和4,[5],12:i:-/ST34菌株都是IncHI2A_1、IncHI2_1和Col440I_1质粒的偏好宿主;沙门菌血清型4,[5],12:i:-携带率较高的耐药基因是blaTEM-1B_1(72%)、tet(B)_2(90%)、sul2_3(66%)、blaOXA-1_1(34%)等;相比鼠伤寒沙门菌菌株,沙门菌血清型4,[5],12:i:-菌株中质粒的携带率更高,且携带更多种类的耐药基因和毒力基因。本研究首次证实,河南省猪产业链中沙门菌血清型4,[5],12:i:-的流行已经超过鼠伤寒沙门菌,在一定程度上解释了该血清型在河南省病人中主要流行的原因。
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关键词
沙门
菌
血清型
4
[5]
12:i:-
鼠伤寒
沙门
菌
单相变种
猪产业链
基因组学
耐药基因
毒力基因
下载PDF
职称材料
河南地区猪源沙门菌血清型4,[5],12:i:-的分离鉴定及耐药性分析
被引量:
3
2
作者
蒋增海
王成龙
+4 位作者
冯兰珠
胡敏杰
邓同炜
徐耀辉
何启盖
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期22-27,共6页
沙门菌血清型4,[5],12:i:-作为鼠伤寒沙门菌单相变种的一个代表,自从20世纪90年代中期开始,在人类和动物中的流行不断增加。为调查沙门菌血清型4,[5],12:i:-在河南地区猪中的流行情况,本研究于2015年9月~2018年12月,从河南不同地区送检...
沙门菌血清型4,[5],12:i:-作为鼠伤寒沙门菌单相变种的一个代表,自从20世纪90年代中期开始,在人类和动物中的流行不断增加。为调查沙门菌血清型4,[5],12:i:-在河南地区猪中的流行情况,本研究于2015年9月~2018年12月,从河南不同地区送检的63个病例中,分别采集发病仔猪的肺脏、心血、肝脏等样品,进行沙门菌的分离培养。通过染色镜检、PCR法对分离菌株进行鉴定,采用凝集法和鞭毛相抗原诱导转化方法鉴定分离菌株的血清型,采用双重PCR对沙门菌血清型4,[5],12:i:-分离菌株的鉴定结果进一步验证。采用肉汤稀释法测定分离菌株的耐药性。沙门菌的分离鉴定结果显示,从送检的63个病例中,共分离到6株沙门菌,阳性率为9.52%(6/63),其中3株为沙门菌血清型4,[5],12:i:-,另外3株为猪霍乱沙门菌和猪霍乱沙门菌孔成道夫变种。药敏试验结果显示,所有沙门菌分离菌株对氨苄青霉素、磺胺甲基异恶唑、萘啶酸和氯霉素均耐药,且呈多重耐药表型,其中沙门菌血清型4,[5],12:i:-分离菌株对卡那霉素、庆大霉素、阿奇霉素、四环素均耐药,而猪霍乱沙门菌和猪霍乱沙门菌孔成道夫变种分离菌株的耐药性较低。本研究首次报道沙门菌血清型4,[5],12:i:-在我国猪群中的流行情况,且其耐药性较强,可能给临床用药带来困难,对公共卫生安全构成潜在威胁。
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关键词
沙门
菌
猪
沙门
菌
血清型
4
[5]
12:i:-
分离鉴定
药敏试验
下载PDF
职称材料
题名
猪产业链中鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-基因组学分析
被引量:
2
1
作者
蒋增海
滕霖
贺安文
刘言言
乐敏
何启盖
机构
河南牧业经济学院动物医药学院
浙江大学动物科学学院动物医学系&动物预防医学研究所
华中农业大学动物医学院
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期1199-1209,共11页
基金
河南省科技攻关(212102110096)
浙江省重点研发计划(2020C02032
+2 种基金
2021C02008)
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS-35)
河南牧业经济学院博士启动基金(2022HNUAHEDF027)。
文摘
旨在探究鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-基因组学特征。采用Illumina NovaSeq 6000平台对91株河南省猪产业链中鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-分离菌进行全基因组测序,通过生物信息学分析,进行其血清型的预测、多位点序列的分型以及质粒类型、耐药基因和毒力基因分析。结果表明,在河南省猪产业链中沙门菌4,[5],12:i:-的流行率(1.58%,50/3173)已经超过鼠伤寒沙门菌的流行率(1.29%,41/3173);91株沙门菌的序列型分为ST34(71.42%,65/91)和ST19(28.57%,26/91);鼠伤寒沙门菌/ST34菌株和4,[5],12:i:-/ST34菌株都是IncHI2A_1、IncHI2_1和Col440I_1质粒的偏好宿主;沙门菌血清型4,[5],12:i:-携带率较高的耐药基因是blaTEM-1B_1(72%)、tet(B)_2(90%)、sul2_3(66%)、blaOXA-1_1(34%)等;相比鼠伤寒沙门菌菌株,沙门菌血清型4,[5],12:i:-菌株中质粒的携带率更高,且携带更多种类的耐药基因和毒力基因。本研究首次证实,河南省猪产业链中沙门菌血清型4,[5],12:i:-的流行已经超过鼠伤寒沙门菌,在一定程度上解释了该血清型在河南省病人中主要流行的原因。
关键词
沙门
菌
血清型
4
[5]
12:i:-
鼠伤寒
沙门
菌
单相变种
猪产业链
基因组学
耐药基因
毒力基因
Keywords
Salmonella serotype
4
[5]
12:i-
Salmonella typhimurium monophasic variant
pig-borne food chain
genomics
drug-resistant genes
virulence genes
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
河南地区猪源沙门菌血清型4,[5],12:i:-的分离鉴定及耐药性分析
被引量:
3
2
作者
蒋增海
王成龙
冯兰珠
胡敏杰
邓同炜
徐耀辉
何启盖
机构
河南牧业经济学院动物医药学院
河南省猪病防控工程技术研究中心
华中农业大学农业微生物国家重点实验室
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期22-27,共6页
基金
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-35)
河南省科技攻关(212102110096)。
文摘
沙门菌血清型4,[5],12:i:-作为鼠伤寒沙门菌单相变种的一个代表,自从20世纪90年代中期开始,在人类和动物中的流行不断增加。为调查沙门菌血清型4,[5],12:i:-在河南地区猪中的流行情况,本研究于2015年9月~2018年12月,从河南不同地区送检的63个病例中,分别采集发病仔猪的肺脏、心血、肝脏等样品,进行沙门菌的分离培养。通过染色镜检、PCR法对分离菌株进行鉴定,采用凝集法和鞭毛相抗原诱导转化方法鉴定分离菌株的血清型,采用双重PCR对沙门菌血清型4,[5],12:i:-分离菌株的鉴定结果进一步验证。采用肉汤稀释法测定分离菌株的耐药性。沙门菌的分离鉴定结果显示,从送检的63个病例中,共分离到6株沙门菌,阳性率为9.52%(6/63),其中3株为沙门菌血清型4,[5],12:i:-,另外3株为猪霍乱沙门菌和猪霍乱沙门菌孔成道夫变种。药敏试验结果显示,所有沙门菌分离菌株对氨苄青霉素、磺胺甲基异恶唑、萘啶酸和氯霉素均耐药,且呈多重耐药表型,其中沙门菌血清型4,[5],12:i:-分离菌株对卡那霉素、庆大霉素、阿奇霉素、四环素均耐药,而猪霍乱沙门菌和猪霍乱沙门菌孔成道夫变种分离菌株的耐药性较低。本研究首次报道沙门菌血清型4,[5],12:i:-在我国猪群中的流行情况,且其耐药性较强,可能给临床用药带来困难,对公共卫生安全构成潜在威胁。
关键词
沙门
菌
猪
沙门
菌
血清型
4
[5]
12:i:-
分离鉴定
药敏试验
Keywords
Salmonella
pig
Salmonella serotype
4
[5],12:i:-
isolation and identification
drug sensitive test
分类号
S852.61 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
猪产业链中鼠伤寒沙门菌及沙门菌血清型4,[5],12:i:-基因组学分析
蒋增海
滕霖
贺安文
刘言言
乐敏
何启盖
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
下载PDF
职称材料
2
河南地区猪源沙门菌血清型4,[5],12:i:-的分离鉴定及耐药性分析
蒋增海
王成龙
冯兰珠
胡敏杰
邓同炜
徐耀辉
何启盖
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
3
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