期刊文献+
共找到6篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
生物信息学技术与新基因的研究 被引量:45
1
作者 成军 刘妍 +2 位作者 陆荫英 李克 王琳 《世界华人消化杂志》 CAS 2003年第4期474-477,共4页
0引言 新基因的克隆化无异是生物医学领域创新知识源泉的重要组成部分.这一任务,不仅是人类基因组计划(HGP)的核心内容,同时也是后基因组计划(post-HGP)的重要内容.
关键词 生物信息学技术 克隆化 氨基酸基序 蛋白质 基因序 同源性比对 转录因子 细胞凋亡 新基因
下载PDF
扩展青霉碱性脂肪酶cDNA的克隆和表达 被引量:3
2
作者 邬敏辰 李江华 +1 位作者 黄伟达 孙崇荣 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期509-515,共7页
采用 TRIzol试剂一步法所抽提的总 RNA的 D(260)/D(280)值为 1.82,甲醛变性电泳呈现真核微生物所特有的 28S rRNA和 18S rRNA 条带.根据扩展青霉所产碱性脂肪酶(Lip PE)N末端 20个... 采用 TRIzol试剂一步法所抽提的总 RNA的 D(260)/D(280)值为 1.82,甲醛变性电泳呈现真核微生物所特有的 28S rRNA和 18S rRNA 条带.根据扩展青霉所产碱性脂肪酶(Lip PE)N末端 20个氨基酸残基序列和真核生物 mRNA3’端具有 poly(A)等所提供的生物信息,采用 RT-PCR技术和 3’-RACE法扩增了 LipPE成熟肽编码区和3’非纪码区的cDNA,直接将该PCR产物克隆至pUCm-T载体中。序列分析表明,该碱性脂肪酶含有258个氨基酸,其中保守的五肽序列为 Gly-His-Ser-Leu-Gly。进一步采用 ClonTech公司的 SMART~(TM)PCR cDNA文库构建试剂盒,扩增、克隆和测定了自转录起始点至纪码区的 cDNA片段,从而完成了 Lip EP完整 cDNA的分析测定.最后将编码完整脂肪酶蛋白的cDNA克隆至 pGEX-5X-3表达载体中.在大肠杆菌 BL21中进行 IPTG诱导表达,SDS-PAGE检测结果表明,所表达的 GST-Lip EP融合蛋白分子质量约为 53ku; 展开更多
关键词 扩展青霉WMC20718 碱性脂肪酶 基因克隆 表达 氨基酸基序 真核生物 CDNA
原文传递
鸡传染性法氏囊病TL株VP2基因克隆及部分特性分析 被引量:3
3
作者 刘锴 孟学平 +2 位作者 东彦新 姚春雨 孙立杰 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2006年第9期67-68,共2页
关键词 鸡传染性法氏囊病 VP2 基因克隆 传染性法氏囊病病毒 免疫抑制性疾病 氨基酸基序 RNA病毒 特性
下载PDF
Molecular Cloning and Characteristics Analysis of ghrelin Gene in Asian Swamp Eel(Monopterus albus)
4
作者 Guoliang RUAN Kai LIAO +1 位作者 Daiqin YANG Xuwen BING 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2016年第4期769-774,共6页
Ghrelin is an important signaling molecule linking reproductive and energy metabolism. In this study, ghrelin gene of Monopterus albus was cloned. Its structure and function were analysized preliminarily. By Rapid Amp... Ghrelin is an important signaling molecule linking reproductive and energy metabolism. In this study, ghrelin gene of Monopterus albus was cloned. Its structure and function were analysized preliminarily. By Rapid Amplification of cDNA Ends(RACE) technique, full-length cDNA and DNA sequences of ghrelin gene were obtained. The full-length ghrelin cDNA(GenBank accession no. JX122807) was 552 bp long, containing a 115 bp 5'-untranslated region, a 324 bp open reading frame and a 113 bp 3'-untranslated region. The full-length ghrelin DNA was 1 323 bp, consisting of three introns and four exons. The exon/intron junction sequences conformed to the GT/AG rule. Three introns were 594, 84 and 93 bp in length, respectively; four exons were229, 78, 112 and 133 bp in length, respectively. The results of amino acid sequence analysis showed that the deduced propreghrelin sequence of M. albus contained a signal peptide(SP) consisting of 22 amino acid residues, a mature peptide(MP)consisting of 19 amino acid residues and a C-terminal amino acid residue. Among them, the third amino acid of MP was serine(Ser^3) as the site for N-acylation and N-deacetylation reactions; the C-terminal amino acid residue sequence might contain a peptide hormone obestatin, which is a physiological antagonist of mature Ghrelin peptide. The homology and phylogenic relationships analyses of amino acid sequences suggested that propreghrelin of M. albus had high similarity to those of several Perciformes fishes; the propreghrelins of M. albus, Perciformes and Heterosomata fishes were clustered into a subgroup. The high conservatism of the gene structure and the amino acid sequences indicated that Ghrelin exerts important physiological functions and plays similar physiological mechanisms in vertebrates. 展开更多
关键词 Monopterus albus ghrelin gene CLONE Molecular structure
下载PDF
蛋白质二级结构预测的结构表达方法研究
5
作者 吕庆章 牛静 +1 位作者 李小娟 王珂芳 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期87-90,共4页
蛋白质二级结构预测时,描述窗口内氨基酸残基序列的各种物理化学和分子结构参数的数量非常大,而且不能很好地直接体现氨基酸的连接顺序,这样就造成二级结构预测工作既费时效果又低下,因此,对这些数据预处理是非常必要的.研究发现,这些... 蛋白质二级结构预测时,描述窗口内氨基酸残基序列的各种物理化学和分子结构参数的数量非常大,而且不能很好地直接体现氨基酸的连接顺序,这样就造成二级结构预测工作既费时效果又低下,因此,对这些数据预处理是非常必要的.研究发现,这些初始数据对应的变换矩阵的本征值谱与氨基酸残基序列情况无关,只与氨基酸的类别、数量性质有关,而其本征函数数据能够直接反映氨基酸残基的序列情况,利用有显著大小的本征值对应的本征函数作为描述参数,在进行蛋白质二级结构预测时,不但能够显著减少描述参数的个数,而且它体现了氨基酸顺序的变化,这将有效提高蛋白质二级结构预测研究效果. 展开更多
关键词 描述参数 氨基酸基序 蛋白质二级结构预测 平移窗口
下载PDF
不同血清型腺相关病毒衣壳蛋白氨基酸残基序列分析 被引量:1
6
作者 侯宗文 秦玺 +2 位作者 陶磊 史新昌 张怡轩 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期2017-2024,共8页
目的:分析不同血清型腺相关病毒衣壳蛋白(VP1)氨基酸残基序列,建立相似性比较方法和数据库,预测VP1氨基酸残基序列突变后可能隶属的血清型。方法:对不同血清型腺相关病毒VP1氨基酸残基序列分析,找出共同序列,并对序列进行对齐。分别对... 目的:分析不同血清型腺相关病毒衣壳蛋白(VP1)氨基酸残基序列,建立相似性比较方法和数据库,预测VP1氨基酸残基序列突变后可能隶属的血清型。方法:对不同血清型腺相关病毒VP1氨基酸残基序列分析,找出共同序列,并对序列进行对齐。分别对疏水氨基酸残基、亲水氨基酸残基和酸/碱氨基酸残基进行单独赋值,赋值参数包括侧链长度、基团数量和解离/结合强度等,再用相关系数法和差值法计算相似度。规定全局电荷决定界值,判断电荷的变化是否会引起蛋白质周围电场的显著变化。最后综合考虑四者的关系,给出与已知血清型VP1氨基酸残基序相似度。通过其他已知血清型的VP1氨基酸残基序进行验证。结果:基本上可以区分不同的血清型,并且对相同血清型中的不同亚型具有一定的容忍度。结论:对腺相关病毒衣壳蛋白VP1氨基酸残基序列与其血清型间的联系进行了探讨,希望对重组腺相关病毒为载体的基因治疗研发提供支持。 展开更多
关键词 腺相关病毒 血清型 衣壳蛋白氨基酸基序 相似性比较 蛋白序突变 预测
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部