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大连地区无偿献血者隐匿性乙型肝炎病毒感染pre-S/S区基因分析 被引量:18
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作者 王东 邓雪莲 +4 位作者 周璐 方琳琳 宋浏伟 袁权 安万新 《中国输血杂志》 CAS 北大核心 2015年第1期26-31,共6页
目的了解大连地区无偿献血者隐匿性肝炎乙型病毒感染(OBI)的情况和pre-S/S区基因的变异情况。方法对大连市血液中心2010年12月2日-2013年5月31日的无偿献血者血液标本进行常规ELISA(HBs Ag、抗-HCV、抗-HIV和抗-TP)和HIV/HBV/HCV联合NA... 目的了解大连地区无偿献血者隐匿性肝炎乙型病毒感染(OBI)的情况和pre-S/S区基因的变异情况。方法对大连市血液中心2010年12月2日-2013年5月31日的无偿献血者血液标本进行常规ELISA(HBs Ag、抗-HCV、抗-HIV和抗-TP)和HIV/HBV/HCV联合NAT筛查,对于单独核酸检测反应性的献血者加以跟踪或回溯,结合乙型肝炎血清学标志物的试验、鉴别试验、病毒定量试验和半巢式PCR来确定OBI,同时对OBI的pre-S/S区基因序列与对照组(HBs Ag+序列,Genbank)做比对分析。结果共筛查158 232份血液标本,确定了其中的69份OBI,流行率为1∶2 293(69/158 232)。41例OBI获得pre-S/S区基因序列:B型6例、C型34例、D型1例;与对照组相比,OBI在S区的氨基酸序列的变异明显(PB=0.013;PC=0.003),主要变异位点为B型的V14G/A、Y161F/S、V168A、P217L和C型的E2G/A/V、T118R/K/A/M、P127T/L/H/S、E164D/G、L175S、S174N。结论大连地区献血者OBI在HBV基因组S区的氨基酸序列存在多个位点的变异,这些变异与OBI的产生存在某种关系,且这种关系受基因型的影响。 展开更多
关键词 隐匿性乙型肝炎病毒感染(OBI) pre-S/S区基因 氨基酸序列变异 乙型肝炎病毒 无偿献血者 大连
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沙门氏菌CTX-M型超广谱β-内酰胺酶基因分型及变异研究 被引量:4
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作者 余菊 徐红红 +5 位作者 申永秀 王艳 张小荣 曹永忠 吴艳涛 巢国祥 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期594-598,共5页
目的通过对不同血清型中沙门氏菌中CTX-M型超广谱β-内酰胺酶分子基因型别、脉冲场凝胶电泳(PFGE)溯源分析及CTX-M氨基酸位点变异情况,研究CTX-M各型别流行特征及在超级耐药克隆中的作用。方法对来源于江苏及周围地区的61株CTX-M阳性的... 目的通过对不同血清型中沙门氏菌中CTX-M型超广谱β-内酰胺酶分子基因型别、脉冲场凝胶电泳(PFGE)溯源分析及CTX-M氨基酸位点变异情况,研究CTX-M各型别流行特征及在超级耐药克隆中的作用。方法对来源于江苏及周围地区的61株CTX-M阳性的肠炎沙门氏菌(S.enteritidis)、印第安纳沙门氏菌(S.indiana)、汤卜逊沙门氏菌(S.thompson)等进行CTX-M型别鉴定、PFGE分子分型、全基因测序对不同型别CTX-M氨基酸位点变异分析。结果61株菌株分为3个CTX-M群6个型。S.indiana含有6种CTX-M基因型,主要型别是CTX-M-65和CTX-M-55;S.enteritidis和S.thompson主要型分别为CTX-M-55、CTX-M-65。PFGE聚类分型有19个型。A2型是携带CTX-M-55型S.enteritidis;B4、B8、B9型是携带CTX-M-55型或CTX-M-65型的S.indiana;D2为携带CTX-M-65型的S.thompson。CTX基因组序列分析显示,在CTX-M-1群、CTX-M-9群、CTX-M-64群易变化氨基酸位点分别是4、3、12个。结论本地区主要CTX型别为CTX-M-55型或CTX-M-65型,S.indiana是CTX基因主要来源。位于质粒上的CTX-M基因复杂且多变是S.indiana超级耐药克隆形成并广泛流行重要原因之一。 展开更多
关键词 沙门氏菌 PFGE分型 CTX-M基因型 CTX-M氨基酸序列变异
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