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大连地区无偿献血者隐匿性乙型肝炎病毒感染pre-S/S区基因分析
被引量:
18
1
作者
王东
邓雪莲
+4 位作者
周璐
方琳琳
宋浏伟
袁权
安万新
《中国输血杂志》
CAS
北大核心
2015年第1期26-31,共6页
目的了解大连地区无偿献血者隐匿性肝炎乙型病毒感染(OBI)的情况和pre-S/S区基因的变异情况。方法对大连市血液中心2010年12月2日-2013年5月31日的无偿献血者血液标本进行常规ELISA(HBs Ag、抗-HCV、抗-HIV和抗-TP)和HIV/HBV/HCV联合NA...
目的了解大连地区无偿献血者隐匿性肝炎乙型病毒感染(OBI)的情况和pre-S/S区基因的变异情况。方法对大连市血液中心2010年12月2日-2013年5月31日的无偿献血者血液标本进行常规ELISA(HBs Ag、抗-HCV、抗-HIV和抗-TP)和HIV/HBV/HCV联合NAT筛查,对于单独核酸检测反应性的献血者加以跟踪或回溯,结合乙型肝炎血清学标志物的试验、鉴别试验、病毒定量试验和半巢式PCR来确定OBI,同时对OBI的pre-S/S区基因序列与对照组(HBs Ag+序列,Genbank)做比对分析。结果共筛查158 232份血液标本,确定了其中的69份OBI,流行率为1∶2 293(69/158 232)。41例OBI获得pre-S/S区基因序列:B型6例、C型34例、D型1例;与对照组相比,OBI在S区的氨基酸序列的变异明显(PB=0.013;PC=0.003),主要变异位点为B型的V14G/A、Y161F/S、V168A、P217L和C型的E2G/A/V、T118R/K/A/M、P127T/L/H/S、E164D/G、L175S、S174N。结论大连地区献血者OBI在HBV基因组S区的氨基酸序列存在多个位点的变异,这些变异与OBI的产生存在某种关系,且这种关系受基因型的影响。
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关键词
隐匿性乙型肝炎病毒感染(OBI)
pre-S/S区基因
氨基酸
序列
变异
乙型肝炎病毒
无偿献血者
大连
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职称材料
沙门氏菌CTX-M型超广谱β-内酰胺酶基因分型及变异研究
被引量:
4
2
作者
余菊
徐红红
+5 位作者
申永秀
王艳
张小荣
曹永忠
吴艳涛
巢国祥
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期594-598,共5页
目的通过对不同血清型中沙门氏菌中CTX-M型超广谱β-内酰胺酶分子基因型别、脉冲场凝胶电泳(PFGE)溯源分析及CTX-M氨基酸位点变异情况,研究CTX-M各型别流行特征及在超级耐药克隆中的作用。方法对来源于江苏及周围地区的61株CTX-M阳性的...
目的通过对不同血清型中沙门氏菌中CTX-M型超广谱β-内酰胺酶分子基因型别、脉冲场凝胶电泳(PFGE)溯源分析及CTX-M氨基酸位点变异情况,研究CTX-M各型别流行特征及在超级耐药克隆中的作用。方法对来源于江苏及周围地区的61株CTX-M阳性的肠炎沙门氏菌(S.enteritidis)、印第安纳沙门氏菌(S.indiana)、汤卜逊沙门氏菌(S.thompson)等进行CTX-M型别鉴定、PFGE分子分型、全基因测序对不同型别CTX-M氨基酸位点变异分析。结果61株菌株分为3个CTX-M群6个型。S.indiana含有6种CTX-M基因型,主要型别是CTX-M-65和CTX-M-55;S.enteritidis和S.thompson主要型分别为CTX-M-55、CTX-M-65。PFGE聚类分型有19个型。A2型是携带CTX-M-55型S.enteritidis;B4、B8、B9型是携带CTX-M-55型或CTX-M-65型的S.indiana;D2为携带CTX-M-65型的S.thompson。CTX基因组序列分析显示,在CTX-M-1群、CTX-M-9群、CTX-M-64群易变化氨基酸位点分别是4、3、12个。结论本地区主要CTX型别为CTX-M-55型或CTX-M-65型,S.indiana是CTX基因主要来源。位于质粒上的CTX-M基因复杂且多变是S.indiana超级耐药克隆形成并广泛流行重要原因之一。
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关键词
沙门氏菌
PFGE分型
CTX-M基因型
CTX-M
氨基酸
序列
变异
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职称材料
题名
大连地区无偿献血者隐匿性乙型肝炎病毒感染pre-S/S区基因分析
被引量:
18
1
作者
王东
邓雪莲
周璐
方琳琳
宋浏伟
袁权
安万新
机构
大连市血液中心
厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心
出处
《中国输血杂志》
CAS
北大核心
2015年第1期26-31,共6页
基金
大连市科技计划指导性项目(大卫科发[2013]50号)
大连市医学重点学科优秀卫生专业技术人才培养资助项目(大卫科发[2013]383号)
文摘
目的了解大连地区无偿献血者隐匿性肝炎乙型病毒感染(OBI)的情况和pre-S/S区基因的变异情况。方法对大连市血液中心2010年12月2日-2013年5月31日的无偿献血者血液标本进行常规ELISA(HBs Ag、抗-HCV、抗-HIV和抗-TP)和HIV/HBV/HCV联合NAT筛查,对于单独核酸检测反应性的献血者加以跟踪或回溯,结合乙型肝炎血清学标志物的试验、鉴别试验、病毒定量试验和半巢式PCR来确定OBI,同时对OBI的pre-S/S区基因序列与对照组(HBs Ag+序列,Genbank)做比对分析。结果共筛查158 232份血液标本,确定了其中的69份OBI,流行率为1∶2 293(69/158 232)。41例OBI获得pre-S/S区基因序列:B型6例、C型34例、D型1例;与对照组相比,OBI在S区的氨基酸序列的变异明显(PB=0.013;PC=0.003),主要变异位点为B型的V14G/A、Y161F/S、V168A、P217L和C型的E2G/A/V、T118R/K/A/M、P127T/L/H/S、E164D/G、L175S、S174N。结论大连地区献血者OBI在HBV基因组S区的氨基酸序列存在多个位点的变异,这些变异与OBI的产生存在某种关系,且这种关系受基因型的影响。
关键词
隐匿性乙型肝炎病毒感染(OBI)
pre-S/S区基因
氨基酸
序列
变异
乙型肝炎病毒
无偿献血者
大连
Keywords
occult hepatitis B virus infection
pre-S/S gene
mutation in amino acid sequence
hepatitis B virus
blooddonors
Dalian
分类号
R446.112 [医药卫生—诊断学]
R512.62 [医药卫生—临床医学]
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职称材料
题名
沙门氏菌CTX-M型超广谱β-内酰胺酶基因分型及变异研究
被引量:
4
2
作者
余菊
徐红红
申永秀
王艳
张小荣
曹永忠
吴艳涛
巢国祥
机构
扬州大学医学院
扬州市疾病预防控制中心
扬州大学兽医学院
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期594-598,共5页
基金
国家重点研发计划项目(No.2016YFD0501609)
扬州市社会发展基金项目(No.YZ2017076)资助~~
文摘
目的通过对不同血清型中沙门氏菌中CTX-M型超广谱β-内酰胺酶分子基因型别、脉冲场凝胶电泳(PFGE)溯源分析及CTX-M氨基酸位点变异情况,研究CTX-M各型别流行特征及在超级耐药克隆中的作用。方法对来源于江苏及周围地区的61株CTX-M阳性的肠炎沙门氏菌(S.enteritidis)、印第安纳沙门氏菌(S.indiana)、汤卜逊沙门氏菌(S.thompson)等进行CTX-M型别鉴定、PFGE分子分型、全基因测序对不同型别CTX-M氨基酸位点变异分析。结果61株菌株分为3个CTX-M群6个型。S.indiana含有6种CTX-M基因型,主要型别是CTX-M-65和CTX-M-55;S.enteritidis和S.thompson主要型分别为CTX-M-55、CTX-M-65。PFGE聚类分型有19个型。A2型是携带CTX-M-55型S.enteritidis;B4、B8、B9型是携带CTX-M-55型或CTX-M-65型的S.indiana;D2为携带CTX-M-65型的S.thompson。CTX基因组序列分析显示,在CTX-M-1群、CTX-M-9群、CTX-M-64群易变化氨基酸位点分别是4、3、12个。结论本地区主要CTX型别为CTX-M-55型或CTX-M-65型,S.indiana是CTX基因主要来源。位于质粒上的CTX-M基因复杂且多变是S.indiana超级耐药克隆形成并广泛流行重要原因之一。
关键词
沙门氏菌
PFGE分型
CTX-M基因型
CTX-M
氨基酸
序列
变异
Keywords
Salmonella
PFGE Dendrogram
CTX-M genotype
CTX-M amino acid serial variation
分类号
R382.5 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大连地区无偿献血者隐匿性乙型肝炎病毒感染pre-S/S区基因分析
王东
邓雪莲
周璐
方琳琳
宋浏伟
袁权
安万新
《中国输血杂志》
CAS
北大核心
2015
18
下载PDF
职称材料
2
沙门氏菌CTX-M型超广谱β-内酰胺酶基因分型及变异研究
余菊
徐红红
申永秀
王艳
张小荣
曹永忠
吴艳涛
巢国祥
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
4
下载PDF
职称材料
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