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粗山羊草CCT基因家族进化及节律表达分析
被引量:
4
1
作者
李晓华
丁明亮
+6 位作者
乔玲
李刘军
杨堤贻
赵佳佳
曹勇
郑军
杨三维
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期1151-1158,共8页
CCT家族基因广泛参与植物花期的调控过程,粗山羊草(Aegilops tauschii Coss.)作为小麦D基因组供体,给小麦带来新的花期及适应性相关基因。研究粗山羊草CCT家族基因不仅可为小麦进化、驯化和演变规律提供参考,还有助于认识粗山羊草作为...
CCT家族基因广泛参与植物花期的调控过程,粗山羊草(Aegilops tauschii Coss.)作为小麦D基因组供体,给小麦带来新的花期及适应性相关基因。研究粗山羊草CCT家族基因不仅可为小麦进化、驯化和演变规律提供参考,还有助于认识粗山羊草作为杂草的生态适应性。粗山羊草基因组中26个CCT基因进化分析后发现Group A、Group C、GroupH和Group G中的13个Aet CCT成员出现了快速进化;Group A中有42.1%的位点存在正选择效应,表明快速进化提高了粗山羊草的适应性。基因结构分析表明CCT结构域在Aet CCT家族中保守性很高,但不同基因内含子和外显子的排布差异较大,特异Motif可能是不同亚家族基因间功能差异的重要原因。Aet CCT4、Aet CCT7、Aet CCT8、Aet CCT11、Aet CCT12、Aet CCT16、Aet CCT17、Aet CCT19、Aet CCT21和Aet CCT22的表达具有明显的"生物钟效应",呈现出24 h的节律性表达,且基本都处于快速进化的Group A、Group C、GroupH和Group I。研究结果表明,这些成员可能参与花期调控等生长发育过程,在粗山羊草的适应性形成过程中发挥了作用。
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关键词
粗山羊草
CCT基因家族
正选择
效应
生物钟
效应
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职称材料
题名
粗山羊草CCT基因家族进化及节律表达分析
被引量:
4
1
作者
李晓华
丁明亮
乔玲
李刘军
杨堤贻
赵佳佳
曹勇
郑军
杨三维
机构
山西大学生物工程学院
云南省农业科学院粮食作物研究所/国家小麦改良中心云南分中心
山西省农业科学院小麦研究所
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期1151-1158,共8页
基金
国家自然科学青年基金(31601307)
山西省自然科学基金(2016011001)
山西省农科院育种工程项目(17yzgc010)
文摘
CCT家族基因广泛参与植物花期的调控过程,粗山羊草(Aegilops tauschii Coss.)作为小麦D基因组供体,给小麦带来新的花期及适应性相关基因。研究粗山羊草CCT家族基因不仅可为小麦进化、驯化和演变规律提供参考,还有助于认识粗山羊草作为杂草的生态适应性。粗山羊草基因组中26个CCT基因进化分析后发现Group A、Group C、GroupH和Group G中的13个Aet CCT成员出现了快速进化;Group A中有42.1%的位点存在正选择效应,表明快速进化提高了粗山羊草的适应性。基因结构分析表明CCT结构域在Aet CCT家族中保守性很高,但不同基因内含子和外显子的排布差异较大,特异Motif可能是不同亚家族基因间功能差异的重要原因。Aet CCT4、Aet CCT7、Aet CCT8、Aet CCT11、Aet CCT12、Aet CCT16、Aet CCT17、Aet CCT19、Aet CCT21和Aet CCT22的表达具有明显的"生物钟效应",呈现出24 h的节律性表达,且基本都处于快速进化的Group A、Group C、GroupH和Group I。研究结果表明,这些成员可能参与花期调控等生长发育过程,在粗山羊草的适应性形成过程中发挥了作用。
关键词
粗山羊草
CCT基因家族
正选择
效应
生物钟
效应
Keywords
Aegilops tauschii Coss.
CCT gene family
positive selection
biological clock effect
分类号
S451 [农业科学—植物保护]
S512.1
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
粗山羊草CCT基因家族进化及节律表达分析
李晓华
丁明亮
乔玲
李刘军
杨堤贻
赵佳佳
曹勇
郑军
杨三维
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
4
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参考文献
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