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醇类化合物对欧洲林蛙蝌蚪毒性的QSAR研究
被引量：
1
1
作者
郑景泉
杨浩娜
+1 位作者
彭世文
王立峰
《山东农业科学》
2017年第2期67-71,共5页
采用分子描述符计算软件PCLIENT获得123个醇类有机小分子化合物的1 666个理化性质参数,通过相关性分析与逐步线性回归筛选,最终获得14个分子描述符。基于保留的14个关键理化性质,分别以多元线性回归(MLR)、偏最小二乘回归(PLS)与支持向...
采用分子描述符计算软件PCLIENT获得123个醇类有机小分子化合物的1 666个理化性质参数,通过相关性分析与逐步线性回归筛选,最终获得14个分子描述符。基于保留的14个关键理化性质,分别以多元线性回归(MLR)、偏最小二乘回归(PLS)与支持向量回归(SVR)构建醇类化合物对欧洲林蛙蝌蚪毒性的QSAR模型。结果表明:3种模型的独立预测决定系数Q2从初始的-163.350、-0.019、0.686分别提升到0.860、0.903与0.936,剔除无关描述符能显著提升模型的预测精度;基于SVR的训练拟合精度和独立预测精度均较好,表明其泛化能力强,鲁棒性好;SVR模型独立测试集预测值和真实值比较结果证明最终筛选出的14个描述符具有较好的显著性,模型具有较好的稳健性。本方法在有毒化合物等QSAR研究领域有较广泛应用前景。
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关键词
醇类化合物
欧洲
林蛙
蝌蚪
描述符筛选
支持向量回归
定量构效关系
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职称材料
题名
醇类化合物对欧洲林蛙蝌蚪毒性的QSAR研究
被引量：
1
1
作者
郑景泉
杨浩娜
彭世文
王立峰
机构
长沙市长郡中学
湖南省农业生物技术研究中心
出处
《山东农业科学》
2017年第2期67-71,共5页
基金
湖南省自然科学基金项目(2016JJ6060)
文摘
采用分子描述符计算软件PCLIENT获得123个醇类有机小分子化合物的1 666个理化性质参数,通过相关性分析与逐步线性回归筛选,最终获得14个分子描述符。基于保留的14个关键理化性质,分别以多元线性回归(MLR)、偏最小二乘回归(PLS)与支持向量回归(SVR)构建醇类化合物对欧洲林蛙蝌蚪毒性的QSAR模型。结果表明:3种模型的独立预测决定系数Q2从初始的-163.350、-0.019、0.686分别提升到0.860、0.903与0.936,剔除无关描述符能显著提升模型的预测精度;基于SVR的训练拟合精度和独立预测精度均较好,表明其泛化能力强,鲁棒性好;SVR模型独立测试集预测值和真实值比较结果证明最终筛选出的14个描述符具有较好的显著性,模型具有较好的稳健性。本方法在有毒化合物等QSAR研究领域有较广泛应用前景。
关键词
醇类化合物
欧洲
林蛙
蝌蚪
描述符筛选
支持向量回归
定量构效关系
Keywords
Alcohol compound
Tadpole of European Rana
Descriptor screening
Support vector regression
Quantitative structure-activity relationship
分类号
Q592.9 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
醇类化合物对欧洲林蛙蝌蚪毒性的QSAR研究
郑景泉
杨浩娜
彭世文
王立峰
《山东农业科学》
2017
1
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职称材料
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参考文献
引证文献
统计分析
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