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题名基于定点突变的植物Ⅲ型聚酮合酶结构与功能研究进展
被引量:3
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作者
李星
陈默
柴团耀
王红
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机构
中国科学院大学
中国科学院遗传与发育生物学研究所
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出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期473-488,共16页
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基金
国家自然科学基金(Nos.61672489
61379081)资助~~
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文摘
植物Ⅲ型聚酮合酶(Polyketide synthases,PKSs)催化形成一系列结构迥异、生理活性不同的聚酮类化合物的基本骨架结构,是聚酮类化合物生物合成途径的关键酶。目前已从植物中克隆和鉴定了多种功能不同的Ⅲ型PKSs。定点突变技术是研究蛋白质结构与功能之间复杂关系的重要方法。文中综述了近年来基于定点突变的植物Ⅲ型PKSs结构与功能关系的研究进展,包括利用定点突变技术修饰各种可能影响植物Ⅲ型PKSs结构的氨基酸残基,来研究其对功能的影响(如控制起始底物的特异性、缩合反应次数以及中间产物环化方式),以期为植物Ⅲ型PKSs结构与功能关系的研究提供参考。
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关键词
聚酮类化合物
植物ⅲ型聚酮合酶
结构与功能
定点突变
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Keywords
polyketides, plant type ⅲ polyketide synthases, structure and function, site-directed mutagenesis
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分类号
Q946.5
[生物学—植物学]
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题名植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化分析
被引量:2
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作者
王波
孙君社
翟玉盼
孙立伟
张秀清
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机构
中国农业大学食品科学与营养工程学院
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第1期83-89,94,共8页
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基金
中央高校基本科研业务费专项资金项目(2010JS083)
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文摘
Ⅲ型聚酮合酶(type Ⅲ polyketide synthase,PKSⅢ)广泛存在于细菌、真菌和植物中,目前数据库中已积累了大量的序列资料。为了进一步了解植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化,以及其作为系统进化研究材料的可能性,选取了75条来自不同植物物种包括苔藓类植物、蕨类植物、裸子植物、单子叶植物和双子叶植物的PKSⅢ蛋白序列,用CLUSTAL X软件对其氨基酸序列进行了比对,并用邻位相接法构建了系统进化树。结果表明,尽管不同来源的PKSⅢ序列表现了很大的差异,但保守结构域CHS-like所包含的主要功能位点半胱氨酸(Cys184)、苯丙氨酸残基(Phe236和Phe286)、组氨酸残基(His335)、天冬酰氨残基(Asn369)在各植物物种中具有很好的保守性;同时发现,在植物PKSⅢ序列中多数的Cys位点均具有较好的保守性,而且蕨类植物PKSⅢ和单子叶植物PKSⅢ在Cys保守位点有很好的相似性;进一步构建分子进化树表明,PKSⅢ基因基本上首先根据功能而聚类,明显地划分为CHSs和non-CHSs两类,其次按照不同的植物物种聚类。
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关键词
植物ⅲ型聚酮合酶
序列比对
分子进化
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Keywords
Plant-specific type ⅲ PKS Sequence alignments Molecular evolution
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分类号
Q943
[生物学—植物学]
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