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板栗PAT基因家族成员鉴定及不同胁迫响应分析
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作者 李金梅 聂兴华 +4 位作者 葛婧怡 褚世慧 刘阳 秦岭 邢宇 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期847-860,共14页
【目的】鉴定和分析板栗PAT基因家族及其对不同胁迫的响应,探究板栗PAT基因家族的抗逆功能。【方法】在板栗全基因组水平上进行搜索和鉴定板栗PAT基因家族成员,利用生物信息学方法研究其系统发育进化树、基因结构和motif、蛋白理化性质... 【目的】鉴定和分析板栗PAT基因家族及其对不同胁迫的响应,探究板栗PAT基因家族的抗逆功能。【方法】在板栗全基因组水平上进行搜索和鉴定板栗PAT基因家族成员,利用生物信息学方法研究其系统发育进化树、基因结构和motif、蛋白理化性质、染色体定位、共线性和启动子顺式元件等。以燕山红栗为试验材料,分析盐胁迫、抗病胁迫和干旱胁迫处理对板栗PAT基因家族表达模式的影响。【结果】在板栗基因组中共鉴定出包含DHHC结构域的21个PAT基因家族成员,他们与24个AtPAT基因家族成员共聚集为6个亚组;大多数CmPAT家族成员为具有亲水性的碱性稳定蛋白;21个PAT基因家族成员不均匀地分布在板栗的9条染色体上;在CmPAT基因启动子区域鉴定到多种非生物胁迫及激素响应元件;表达模式分析表明,多个CmPAT基因不同程度地参与抗病、干旱、盐胁迫响应。【结论】共鉴定了21个板栗PAT基因家族成员,同时筛选到CmPAT24、CmPAT7、CmPAT14可能共同参与了盐胁迫和干旱胁迫的调控,CmPAT7可能共同参与盐胁迫、干旱胁迫、抗病胁迫的调控。 展开更多
关键词 板栗 棕榈酰基转移酶(pat) 胁迫处理
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