目的:利用实时定量PCR结合变性梯度凝胶电泳技术(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)检测慢性牙周炎患者不同生境中牙龈卟啉单胞菌、齿垢密螺旋体。方法:选取30名慢性牙周炎志愿者,分别采集龈上菌斑、龈下菌斑及唾液样本,运...目的:利用实时定量PCR结合变性梯度凝胶电泳技术(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)检测慢性牙周炎患者不同生境中牙龈卟啉单胞菌、齿垢密螺旋体。方法:选取30名慢性牙周炎志愿者,分别采集龈上菌斑、龈下菌斑及唾液样本,运用DGGE技术比较分析各组样本微生物群落结构。通过偏最小二乘法(partial least squares,PLS)分析,得出不同生境相关优势条带,并对其进行克隆、测序分析,确定相应最近邻居。采用实时定量PCR技术对龈下菌斑与龈上菌斑、龈下菌斑与唾液中牙龈卟啉单胞菌及齿垢密螺旋体进行定量检测分析。结果:实时定量PCR定量检测结果显示,龈下菌斑中牙龈卟啉单胞菌及齿垢密螺旋体含量高于龈上菌斑和唾液。结论:实时定量PCR技术结合DGGE技术能更好的诠释微生物群落信息。展开更多
为了改进发酵蔬菜的工艺,研究"泡菜老汤"对发酵甘蓝原核微生物群落结构的影响。通过聚合酶链式反应结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,分离发酵甘蓝体系混合微生物16S r DNA V3区基因片段,采用Quantity One软件分析原核微...为了改进发酵蔬菜的工艺,研究"泡菜老汤"对发酵甘蓝原核微生物群落结构的影响。通过聚合酶链式反应结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,分离发酵甘蓝体系混合微生物16S r DNA V3区基因片段,采用Quantity One软件分析原核微生物香农指数(Shannon-Wiener index)多样性指数、主成分分析及相似性聚类分析。结果表明,新汤中微生物数量多于老汤;新汤中Shannon-Wiener指数随发酵时间的变化规律为低-高-较低,老汤中香农指数随发酵时间的变化规律为高-低-较高;主成分分析说明甘蓝老汤1~8 d聚合在一起;新汤中除了第1 d,其他的也都聚合在一起;聚类图谱显示新汤第8 d与老汤1~8 d的所有样品微生物群落高度相似,表明老汤的原核微生物群落结构较新汤更稳定,建议发酵蔬菜的工艺采用"泡菜老汤"发酵。展开更多
文摘目的:利用实时定量PCR结合变性梯度凝胶电泳技术(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)检测慢性牙周炎患者不同生境中牙龈卟啉单胞菌、齿垢密螺旋体。方法:选取30名慢性牙周炎志愿者,分别采集龈上菌斑、龈下菌斑及唾液样本,运用DGGE技术比较分析各组样本微生物群落结构。通过偏最小二乘法(partial least squares,PLS)分析,得出不同生境相关优势条带,并对其进行克隆、测序分析,确定相应最近邻居。采用实时定量PCR技术对龈下菌斑与龈上菌斑、龈下菌斑与唾液中牙龈卟啉单胞菌及齿垢密螺旋体进行定量检测分析。结果:实时定量PCR定量检测结果显示,龈下菌斑中牙龈卟啉单胞菌及齿垢密螺旋体含量高于龈上菌斑和唾液。结论:实时定量PCR技术结合DGGE技术能更好的诠释微生物群落信息。
文摘为了改进发酵蔬菜的工艺,研究"泡菜老汤"对发酵甘蓝原核微生物群落结构的影响。通过聚合酶链式反应结合变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,分离发酵甘蓝体系混合微生物16S r DNA V3区基因片段,采用Quantity One软件分析原核微生物香农指数(Shannon-Wiener index)多样性指数、主成分分析及相似性聚类分析。结果表明,新汤中微生物数量多于老汤;新汤中Shannon-Wiener指数随发酵时间的变化规律为低-高-较低,老汤中香农指数随发酵时间的变化规律为高-低-较高;主成分分析说明甘蓝老汤1~8 d聚合在一起;新汤中除了第1 d,其他的也都聚合在一起;聚类图谱显示新汤第8 d与老汤1~8 d的所有样品微生物群落高度相似,表明老汤的原核微生物群落结构较新汤更稳定,建议发酵蔬菜的工艺采用"泡菜老汤"发酵。
