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野生小豆和栽培小豆microRNA全基因组鉴定与比较分析
1
作者
马燕明
陈春海
+5 位作者
杨凯
李奕松
赵波
李江
李永强
万平
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第9期1273-1281,共9页
MicroRNA(miRNA)是一种非编码的小RNA分子,对真核生物基因表达起着非常重要的调控作用,miRNA系统鉴定对于研究其功能及作用机制具有重要意义。本研究分别以栽培小豆京农6号(JN6)和野生小豆CWA108为试验材料,进行了深度miRNA测序。系统...
MicroRNA(miRNA)是一种非编码的小RNA分子,对真核生物基因表达起着非常重要的调控作用,miRNA系统鉴定对于研究其功能及作用机制具有重要意义。本研究分别以栽培小豆京农6号(JN6)和野生小豆CWA108为试验材料,进行了深度miRNA测序。系统鉴定和注释这2个物种的miRNA,并分析了其miRNA种类的异同、表达量的差异和靶基因在功能富集上的差别。鉴定出了JN6和CWA108共有和特有的miRNA,明确了它们之间差异表达的miRNA,以及这些特有和差异miRNA的靶基因在功能富集上的差异,发现可能和抗病与抗逆途径相关。
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关键词
MIRNA
栽培
小豆
(
vigna
angularis)
野生
小豆
(
vigna
angularis
var.nipponensis)
下载PDF
职称材料
题名
野生小豆和栽培小豆microRNA全基因组鉴定与比较分析
1
作者
马燕明
陈春海
杨凯
李奕松
赵波
李江
李永强
万平
机构
北京农学院/北京农业应用新技术北京市重点实验室
深圳华大基因科技有限公司
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第9期1273-1281,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31371694)资助~~
文摘
MicroRNA(miRNA)是一种非编码的小RNA分子,对真核生物基因表达起着非常重要的调控作用,miRNA系统鉴定对于研究其功能及作用机制具有重要意义。本研究分别以栽培小豆京农6号(JN6)和野生小豆CWA108为试验材料,进行了深度miRNA测序。系统鉴定和注释这2个物种的miRNA,并分析了其miRNA种类的异同、表达量的差异和靶基因在功能富集上的差别。鉴定出了JN6和CWA108共有和特有的miRNA,明确了它们之间差异表达的miRNA,以及这些特有和差异miRNA的靶基因在功能富集上的差异,发现可能和抗病与抗逆途径相关。
关键词
MIRNA
栽培
小豆
(
vigna
angularis)
野生
小豆
(
vigna
angularis
var.nipponensis)
Keywords
miRNA
Wild adzuki bean（
vigna
angularis）
Cultivated adzuki bean（
vigna
angularis var. nipponensis）
分类号
S521 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
野生小豆和栽培小豆microRNA全基因组鉴定与比较分析
马燕明
陈春海
杨凯
李奕松
赵波
李江
李永强
万平
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
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