连作对马铃薯根际土壤细菌群落结构的影响 被引量：10

1

作者 李国庆 郭华春 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期914-928,共15页

本研究利用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)分析技术,对长期施肥与不施肥的连作马铃薯根际土壤细菌群落结构与功能进行研究。结果表明连作马铃薯在长期施肥与不施肥下,根际土壤细菌群落种类和数量发生显著变化,与对照土壤(CK)相比,有... 本研究利用末端限制性片段长度多态性(T-RFLP)分析技术,对长期施肥与不施肥的连作马铃薯根际土壤细菌群落结构与功能进行研究。结果表明连作马铃薯在长期施肥与不施肥下,根际土壤细菌群落种类和数量发生显著变化,与对照土壤(CK)相比,有益细菌种类和数量均增加,但长期不施肥土壤中有害细菌数量高于长期施肥土壤。与长期不施肥相比,长期施肥对土壤养分利用率较高,与土壤细菌群落种类和数量PS>PNS>CK的变化趋势相一致。因此,连作马铃薯在长期施肥条件下,在一定程度上可以改善土壤养分状况,促进土壤有益微生物的活动,减少根际产生致病菌,但不能从根本上消除马铃薯连作障碍,可能还与其根系分泌物密切相关。今后可对根际土壤微生物、土壤养分和根系分泌物等土壤生态因子之间进行综合研究,从根本上解决马铃薯连作障碍。 展开更多

关键词 马铃薯 连作 根际土壤细菌 末端限制性片段长度多态性技术(T-RFLP) 群落结构 施肥

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香葱伴生番茄对青枯病及根际微生态特征的影响 被引量：1

2

作者 佘小漫 姚挺 +1 位作者 黄真珍 何自福 《广东农业科学》 CAS 2024年第1期10-20,共11页

【目的】为明确香葱伴生对番茄青枯病及根际微生态特征的影响,揭示香葱伴生番茄降低青枯病发病率的机理。【方法】通过田间试验设置番茄单作和香葱伴生番茄2个处理,分别采集单作发病番茄(QK)、单作健康番茄(NBS)和香葱伴生番茄(BS)的根... 【目的】为明确香葱伴生对番茄青枯病及根际微生态特征的影响,揭示香葱伴生番茄降低青枯病发病率的机理。【方法】通过田间试验设置番茄单作和香葱伴生番茄2个处理,分别采集单作发病番茄(QK)、单作健康番茄(NBS)和香葱伴生番茄(BS)的根际土壤,应用16S rDNA高通量测序和液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术,探究香葱伴生对番茄根际微生态特征的影响。【结果】田间试验结果表明,番茄单作处理和香葱伴生番茄处理的青枯病平均病株率分别为50.48、31.43%,香葱伴生番茄处理对番茄青枯病的防治效果为37.74%。16S rDNA高通量测序结果表明,BS、NBS根际土壤细菌群落相对丰度和多样性均显著高于QK;与QK相比,BS和NBS根际土壤细菌茄科雷尔氏菌属相对丰度显著降低,而芽孢杆菌属相对丰度升高;与NBS相比,BS根际土壤细菌茄科雷尔氏菌属相对丰度降低,芽孢杆菌属相对丰度显著提高。利用LC-MS技术共鉴定出番茄根际土壤代谢物586种,其中正离子模式代谢物320种,负离子模式代谢物266种,并将代谢物的功能注释至新陈代谢、遗传信息加工和环境信息加工等代谢通路;与NBS相比,BS根际土壤代谢物中的缬氨酸、L-天冬酰胺和柠檬酸的含量均显著降低,L-赖氨酸、谷氨酸、D-谷氨酰胺和异亮氨酸的含量也低于NBS,但差异未达到显著水平。【结论】香葱伴生番茄显著降低番茄青枯病田间发病率,改变了番茄根际土壤中细菌群落结构和番茄根际土壤代谢物含量。 展开更多

关键词 香葱伴生 番茄青枯病 根际土壤细菌 根际土壤代谢物 防效

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西藏那曲地区垫状点地梅根际土壤细菌多样性研究 被引量：8

3

作者 曹鹏熙 刘怡萱 +3 位作者 许国琪 陈飞飞 郑恒 刘星 《环境生态学》 2019年第5期1-9,共9页

垫状点地梅(Androsace tapete)是青藏高原高寒草甸重要的特有种和广布种之一,是最典型的垫状植物,其独特的垫状结构和发达的根系为研究植物与根际土壤微生物相互关系提供了独特的材料。以西藏那曲地区4个样点的垫状点地梅根际土壤细菌... 垫状点地梅(Androsace tapete)是青藏高原高寒草甸重要的特有种和广布种之一,是最典型的垫状植物,其独特的垫状结构和发达的根系为研究植物与根际土壤微生物相互关系提供了独特的材料。以西藏那曲地区4个样点的垫状点地梅根际土壤细菌为研究对象,采用高通量测序技术及生物信息学等方法,分析根际土壤细菌多样性特征,利用单因素方差分析及post-hoc检验,筛选不同样点根际土壤菌群差异物种,利用CCA典型分析根际土壤菌群与环境因子之间的关联,并基于Spearman等级相关系数,绘制根际土壤菌群与环境因子的相关性Heatmap图。结果显示,4个样点垫状点地梅根际土壤多样性排序为:SP>BG>ZR>KM,厚壁菌门、变形杆菌门和放线菌门是垫状点地梅根际土壤细菌的主要菌门,占总体细菌相对丰度98.73%以上;4个样点根际土壤菌群在Pantoea、Leuconostoc和Lactobacillus上存在显著差异(P<0.05);CCA典型分析表明,大气温度、速效磷和有机物与菌群相对丰度呈显著相关(P<0.05),大气温度对菌群相对丰度影响最大(P=0.001);相关性Heatmap图分析表明,环境因子与18个优势属相对丰度呈显著正相关(P<0.05),与21个优势属丰度呈显著负相关(P<0.05)。本研究将为进一步探究根际土壤细菌在垫状点地梅适应青藏高原极端环境的过程中可能产生的影响提供基础依据。 展开更多

关键词 垫状点地梅 根际土壤细菌 青藏高原 差异物种 环境因子 生物多样性

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普洱地区茶叶内生细菌与根际土壤细菌群落结构分析 被引量：6

4

作者 王桥美 严亮 +5 位作者 杨瑞娟 彭文书 季爱兵 刘丽 张文杰 胡先奇 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期703-714,共12页

【目的】茶叶内生细菌、根际土壤细菌在普洱茶的发酵中起着重要的作用,还可以促进茶树生长,诱导茶树抗病性。研究其群落结构组成及相互关系可为微生物资源开发利用提供理论依据。【方法】本研究以普洱地区茶树叶片和根际土壤为材料,采... 【目的】茶叶内生细菌、根际土壤细菌在普洱茶的发酵中起着重要的作用,还可以促进茶树生长,诱导茶树抗病性。研究其群落结构组成及相互关系可为微生物资源开发利用提供理论依据。【方法】本研究以普洱地区茶树叶片和根际土壤为材料,采用高通量测序技术,对茶叶及根际土壤细菌的16S核糖体RNA基因(16S rRNA)进行测序,比较分析茶叶与根际土壤细菌的群落结构组成。【结果】结果表明,茶叶内生细菌主要由76个属组成,归属于9个门。相对丰度较高的门是厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)。相对丰度较高的属为乳杆菌属(Lactobacillus)、布劳特氏菌属(Blautia)、粪杆菌属(Faecalibacterium)、假单胞菌属(Pseudomonas)、红球菌属(Rhodococcus)、拟杆菌属(Bacteroide)和普雷沃氏菌属(Prevotella)。根际土壤细菌主要由198个属组成,归属于10个门,相对丰度较高的门是变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)和放线菌门(Actinobacteria)。相对丰度较高的属与茶叶中的高丰度属相似,但在两者中的相对丰度有所差异。茶叶内生细菌物种丰度和多样性显著低于根际土壤细菌,但超过50%的茶叶内生细菌同时存在根际土壤中。【结论】通过对普洱地区茶叶内生细菌及根际土壤细菌的群落结构组成分析,明确了茶叶内生细菌与根际土壤细菌的共性与差异,为普洱茶品质改良和生物菌肥开发研究奠定了基础。 展开更多

关键词 茶树 茶叶内生细菌 根际土壤细菌 16S rRNA测序

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环境因子对西藏野生手掌参根际土壤细菌群落结构的影响

5

作者 尹秀 张二豪 +4 位作者 李谊 普姆 刘亚可 禄亚洲 兰小中 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期835-843,共9页

[目的]探究环境因子对西藏野生手掌参根际土壤细菌群落结构的影响。[方法]选取废弃木材厂(FM)、林芝观景台(LZ)、林海观景台(LH)和雷达站(LD)4个采样点采集土壤样品,采用高通量测序技术分析不同海拔手掌参根际土壤细菌群落多样性和群落... [目的]探究环境因子对西藏野生手掌参根际土壤细菌群落结构的影响。[方法]选取废弃木材厂(FM)、林芝观景台(LZ)、林海观景台(LH)和雷达站(LD)4个采样点采集土壤样品,采用高通量测序技术分析不同海拔手掌参根际土壤细菌群落多样性和群落结构特征及不同环境因子对其多样性和结构的影响。[结果]所有样品共检测32门、90纲、224目、378科和693属细菌,变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和酸杆菌门(Acidobacteria)为优势门,慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)和金黄杆菌属(Chryseobacterium)为优势属。随着海拔的升高,手掌参根际土壤细菌群落多样性和丰富度增加,且不同采样点土壤细菌群落多样性的组间差异大于组内差异。[结论]海拔、总钾(TK)、pH和电导率(EC)显著影响根际土壤细菌群落在门水平的组成,总钾(TK)、总磷(TP)和海拔3种环境因子对土壤细菌群落组成在属水平上的影响更明显。 展开更多

关键词 手掌参 环境因子 根际土壤细菌 群落多样性 群落结构

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短时间尺度雄安新区旱柳根际土壤细菌群落特征分析 被引量：1

6

作者 王参 Masoudi Abolfazl +4 位作者 杨佳 王敏 吴昌昊 刘敬泽 于志军 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期858-867,共10页

土壤细菌在土壤生态过程中发挥重要作用,明确雄安新区“千年秀林”植物根际土壤细菌群落组成和多样性,有助于揭示土壤微生物与环境因子的互作关系,为新区森林生态系统可持续发展提供理论支持。以雄安新区重要乡土树种——旱柳(Salix mat... 土壤细菌在土壤生态过程中发挥重要作用,明确雄安新区“千年秀林”植物根际土壤细菌群落组成和多样性,有助于揭示土壤微生物与环境因子的互作关系,为新区森林生态系统可持续发展提供理论支持。以雄安新区重要乡土树种——旱柳(Salix matsudana)为对象,利用高通量测序和生物信息学技术,系统研究基于短时间尺度“千年秀林”旱柳根际土壤细菌群落组成和多样性,并分析菌群和环境因子的互作关系。结果表明,放线菌门、变形菌门和鞘氨醇杆菌属、黄杆菌、固氮菌属等富营养细菌占优势。8月和10月土壤样品中不同菌门相对丰度变化较小,9月波动较大。采样时间与Chao1和PD指数显著相关(P=0.0315,P=0.0137),与Shannon指数相关性不显著(P=0.631),日最高/低气温可显著影响PD指数,且日最低气温升高可显著降低细菌群落的丰富度。Beta多样性在每周时间尺度差异不显著(P=0.363),每两周差异显著(P=0.027),每三周差异极显著(P=0.006)。土壤偏碱性,养分含量差异不显著,全氮平均含量为中上等级,全磷和全钾平均含量处于中下等级。共现性网络互作关系中,协同作用多于拮抗作用。研究结果为明确不同时间尺度森林土壤微生物群落特征研究提供重要补充,可为雄安新区“千年秀林”制定高效的可持续经营管理措施提供科学依据。 展开更多

关键词 雄安新区 旱柳 根际土壤细菌 时间尺度

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茶树根和叶内生细菌的多样性及来源分析

7

作者 林海燕 刘昌伟 +4 位作者 杨勇 张志旭 曾超珍 伍岗 刘仲华 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2023年第6期675-683,共9页

以碧香早和茗丰作为研究对象,采用高效液相色谱等方法测定茶叶中的化学成分,并运用高通量测序技术对比分析不同茶树品种的鲜叶和根部的微生物群落。结果显示:碧香早和茗丰茶鲜叶的优势细菌门为Proteobacteria、Bacteroidetes等,优势细... 以碧香早和茗丰作为研究对象,采用高效液相色谱等方法测定茶叶中的化学成分,并运用高通量测序技术对比分析不同茶树品种的鲜叶和根部的微生物群落。结果显示:碧香早和茗丰茶鲜叶的优势细菌门为Proteobacteria、Bacteroidetes等,优势细菌属为Chryseobacterium、Sphingomonas、Rhizobium、Methylobacterium和Aureimonas等;茶树根系中的优势细菌门主要是Proteobacteria、Actinobacteria和Firmicutes等,优势细菌属为Planococcaceae、Rhizobium和Sphingomona;碧香早叶片中内生菌群的丰富度高于茗丰的,茗丰根系中的内生菌丰富度高于碧香早的;茶树根系内生细菌的多样性高于茶鲜叶的;茶树根和叶的内生菌OTU数少于土壤微生物的;同源性分析表明,茶树叶片内生菌主要来源于叶表,而根部内生细菌主要来自土壤;茗丰鲜叶中的茶氨酸、氨基酸、可可碱、咖啡碱、儿茶素、没食子儿茶素没食子酸酯、表没食子儿茶素没食子酸酯、麦芽糖含量均显著高于碧香早的,碧香早鲜叶中的表没食子儿茶素、蔗糖含量和酚氨比显著高于茗丰的;相关性分析结果显示,部分关键细菌属的相对丰度与茶叶中的部分化学成分的含量呈显著正相关或负相关,推测不同的内生菌群可能参与了茶树品质成分的合成,从而影响茶叶的品质。 展开更多

关键词 茶树 内生细菌 根际土壤细菌 化学成分 茶叶品质

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西藏林芝市油菜根际细菌群落特征分析 被引量：3

8

作者 杜娟 聂丽妍 +2 位作者 魏丽萍 王瑞琪 巩文峰 《高原农业》 2022年第1期16-28,共13页

为了探究西藏林芝市油菜根际细菌群落组成、多样性及与土壤因子的相关性,揭示林芝市油菜根际细菌群落特征,本研究对林芝市18个采样点油菜根际土壤样品进行收集,并采用16S rRNA基因的V3-V4区高通量测序技术对其细菌群落的组成和多样性进... 为了探究西藏林芝市油菜根际细菌群落组成、多样性及与土壤因子的相关性,揭示林芝市油菜根际细菌群落特征,本研究对林芝市18个采样点油菜根际土壤样品进行收集,并采用16S rRNA基因的V3-V4区高通量测序技术对其细菌群落的组成和多样性进行测定分析。结果表明,林芝油菜根际土壤细菌群落中优势菌门为放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、酸杆菌门(Acidobacteria),其中放线菌门在各样点间显著差异;通过线性判别分析(LEfSe),巴宜区和工布江达县具有最多的生物标志物和最高的分类群水平,同为17个,米林县最少;PCoA分析和CPCoA分析显示林芝3个地点油菜根际细菌多样性存在差异。冗余分析(RDA)结果表明铵态氮(NH_(4)^(+))、可溶性P(AP)、总氮(TN)、C_N、蔗糖酶(Sucrase)和有机质(O_M)是影响根际土壤群落最重要的因素,而海拔(Altitude)和NO_(3)^(-)对根际土壤群落影响次之,pH对根际土壤群落影响最小。本研究为掌握林芝市油菜根际土壤微生物群落结构提供了数据支持,为进一步利用高原油菜根际微生物提供了参考。 展开更多

关键词 油菜 根际土壤细菌 群落特征 多样性 冗余分析

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青海高寒草地针茅根际土壤细菌拮抗功能评价及鉴定 被引量：3

9

作者 刘雪儿 马金凤 +1 位作者 杨成德 李统华 《草业学报》 CSCD 北大核心 2019年第8期161-169,共9页

通过分离青海高寒草地针茅根际土壤细菌,以番茄早疫病菌、马铃薯枯萎病菌、马铃薯坏疽病菌和马铃薯炭疽病菌为指示菌,采用平板对峙法对其拮抗功能进行评价,并利用16SrDNA序列分析法进行鉴定。结果表明,从针茅根际土壤中共分离获得23株... 通过分离青海高寒草地针茅根际土壤细菌,以番茄早疫病菌、马铃薯枯萎病菌、马铃薯坏疽病菌和马铃薯炭疽病菌为指示菌,采用平板对峙法对其拮抗功能进行评价,并利用16SrDNA序列分析法进行鉴定。结果表明,从针茅根际土壤中共分离获得23株土壤细菌,17株可转代培养,根际土壤细菌数量介于6.4×10^6~36×10^6cfu·g^-1,其中4T1、5T1、10T1和10T3至少对1种病原真菌有抑菌作用,占细菌总数的17.39%,抑菌率介于46.68%~75.71%;菌株10T1的抑菌效果最好,对番茄早疫病菌、马铃薯枯萎病菌、马铃薯坏疽病菌和马铃薯炭疽病菌的抑菌率分别为67.14%、68.57%、61.43%和75.71%;23株土壤细菌均呈革兰氏阳性,杆状,大小介于3.79μm×0.85μm^10.50μm×2.37μm。结合培养形状、形态特征和16SrDNA序列分析将17株土壤细菌鉴定为7属12种,其中芽孢杆菌属8株,占鉴定总数的47.05%,为优势属。通过对青海高寒极端生境针茅根际土壤细菌的拮抗功能评价,为生防菌剂的开发提供了菌株资源。 展开更多

关键词 高寒草地 根际土壤细菌 筛选 拮抗功能 鉴定

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镉胁迫对桑树根际细菌群落及其多样性的影响 被引量：3

10

作者 胡桂萍 曹红妹 +5 位作者 石旭平 叶川 王丰 王亚威 胡丽春 王军文 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期510-517,共8页

为探究镉(Cd)胁迫对桑树根际细菌群落及其多样性的影响,以桑树品种粤桑11号为供试植物,设置3种Cd胁迫浓度(5、3、2 mg/kg)模拟现实镉污染重度、中度和轻度水平,并以无Cd胁迫为对照进行盆栽试验,分析根际土壤细菌多样性和群落特征变化。... 为探究镉(Cd)胁迫对桑树根际细菌群落及其多样性的影响,以桑树品种粤桑11号为供试植物,设置3种Cd胁迫浓度(5、3、2 mg/kg)模拟现实镉污染重度、中度和轻度水平,并以无Cd胁迫为对照进行盆栽试验,分析根际土壤细菌多样性和群落特征变化。结果显示,轻度镉污染胁迫下桑树根际土壤细菌ACE值、Chao1指数和Shannon指数最高,而Simpson指数最低;重度镉污染胁迫下桑树根际土壤细菌ACE和Chao1指数、Shannon指数最低,而Simpson指数最高。桑树根际土壤细菌分布在21个门,以放线菌门和变形菌门为主要优势菌门,占比分别为31.34%~62.60%和19.64%~34.82%,其中Cd胁迫处理特有细菌属于杂食菌门和迷踪菌门。冗余相关分析(RDA)显示,桑树根际细菌群落结构与环境因子存在显著相关,其中优势菌门变形菌门与土壤有机质(SOM)、全氮(TN)、全钾(TK)含量呈显著正相关,但与铁锰还原态Cd(FMO-Cd)、残渣态Cd(RES-Cd)和可交换态Cd(EXC-Cd)含量呈显著负相关,放线菌门与TK含量呈显著正相关,但与碳酸盐结合态Cd(CAB-Cd)和RES-Cd含量呈显著负相关。结果表明,低浓度Cd胁迫可提高桑树根际细菌群落多样性,而高浓度Cd胁迫会抑制桑树根际细菌群落多样性,且土壤中优势菌门放线菌门和变形菌门与Cd赋存形态和含量及土壤理化性质之间有应激响应。 展开更多

关键词 CD胁迫 桑树 根际土壤细菌 群落多样性 优势菌

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元阳梯田水稻品种‘月亮谷’根系内生及根际细菌的群落结构 被引量：2

11

作者 赵丹 赵娟 +5 位作者 刘涛 黄惠川 廖静静 靳百慧 朱有勇 何霞红 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2017年第1期17-26,共10页

为了解元阳梯田传统水稻品种‘月亮谷’的根系内生及根际土壤的细菌群落结构,本研究以现代品种‘楚粳27’为对照,分别在云南省元阳县和建水县开展种植试验。结果显示:通过菌落分离,共得到202个菌株,结合形态特征、生理生化特性及16s rDN... 为了解元阳梯田传统水稻品种‘月亮谷’的根系内生及根际土壤的细菌群落结构,本研究以现代品种‘楚粳27’为对照,分别在云南省元阳县和建水县开展种植试验。结果显示:通过菌落分离,共得到202个菌株,结合形态特征、生理生化特性及16s rDNA对其进行初步鉴定研究,可分离到11个种和8个属;聚类分析结果表明:元阳县种植的水稻根系内生细菌的相似水平比建水县的低0.202,但其丰富度更高,差异更大;从0.890的相似水平划分,建水县种植的水稻根际土壤细菌聚为一类,较单一,表明元阳县水稻生长的微生物多样性较丰富。比较两个水稻品种在两个地点的根系内生细菌和根际土壤细菌的相对分离频率发现:假单胞菌属(Pseudomonas sp.)为优势属和共有属,恶臭假单胞菌(P.putida)是两个品种在两个地点种植的共有种,两个地点种植的‘月亮谷’,其根系和根际土壤中均能分离到荧光假单胞菌(Pseudomonas fluorescens)。研究初步表明‘月亮谷’在两个不同生态环境种植其根系内生细菌和根际土壤细菌的差异,从土壤微生态的角度阐述了‘月亮谷’能够在哈尼梯田持续种植的原因。 展开更多

关键词 内生细菌 根际土壤细菌 水稻传统品种 '月亮谷’

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转Bt基因玉米对根际土壤细菌遗传多样性的影响 被引量：1

12

作者 孙红炜 李凡 +2 位作者 杨淑珂 王敏 路兴波 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期10-16,共7页

连续两年在田间自然状态下,采用PCR-DGGE方法研究6个不同生育期种植转Bt基因玉米MON810对根际土壤细菌群落遗传多样性的影响。结果表明,2008年,同一生育期内转Bt基因玉米与非Bt基因玉米根际土壤细菌16S rDNA DGGE指纹图谱相似,细菌群落... 连续两年在田间自然状态下,采用PCR-DGGE方法研究6个不同生育期种植转Bt基因玉米MON810对根际土壤细菌群落遗传多样性的影响。结果表明,2008年,同一生育期内转Bt基因玉米与非Bt基因玉米根际土壤细菌16S rDNA DGGE指纹图谱相似,细菌群落的遗传物质组成差异不显著,仅在抽丝期和乳熟期Bt玉米出现两条差异条带。2009年,苗期、拔节期、喇叭口期、抽雄期4个生育期两种玉米出现差异条带,抽丝期和乳熟期无差异条带。对DGGE图谱条带进行克隆测序,部分图谱中的条带所代表的DNA序列相同,最终得到51条DNA序列,共涉及主要细菌门类8个,典型差异条带分别属于芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)。总体来看,与不同品种相比,不同生育期、不同年份间细菌群落差异更为显著,Bt蛋白的积累对根际细菌群落变化有一定影响。 展开更多

关键词 转BT基因玉米 根际土壤细菌 PCR—DGGE 遗传多样性

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接种大豆根瘤菌对大豆根际土壤细菌区系的影响

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作者 牛彦波 吴皓琼 +1 位作者 安琦 王笑庸 《黑龙江科学》 2019年第6期20-21,25,共3页

本研究采用illumina Miseq高通量测序技术,对接种大豆根瘤菌与不接种大豆根瘤菌的大豆根际土壤进行总细菌DNA的提取,对细菌16srRNA高可变区V4～V5进行序列分析,对土壤中的细菌群落进行比较性分析。以不施肥的大豆根际土壤为参照,在施入... 本研究采用illumina Miseq高通量测序技术,对接种大豆根瘤菌与不接种大豆根瘤菌的大豆根际土壤进行总细菌DNA的提取,对细菌16srRNA高可变区V4～V5进行序列分析,对土壤中的细菌群落进行比较性分析。以不施肥的大豆根际土壤为参照,在施入不同根瘤菌处理后,分析大豆根际土壤的细菌区系在门、纲、目、科、属、种的分类群方面是否有差异改变,从分子生物学的角度来揭示黑龙江黑土土壤环境中外源根瘤菌对土壤微生物环境的影响。结果显示:与不接种根瘤菌的秋季土壤为参照,接种适宜的根瘤菌制剂能够丰富大豆根际土壤细菌群落,而不适宜的根瘤菌制剂不能对根际土壤环境有大的影响。由此说明,外源接种大豆根瘤菌引起根际土壤细菌的改变可能需要外源根瘤菌与大豆根系形成共生固氮关系,否则其对土壤群落的影响有限。 展开更多

关键词 接种 大豆根瘤菌 根际土壤细菌 区系影响

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棘托竹荪连作对根际土壤细菌的影响 被引量：5

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作者 梁俊峰 禹飞 史静龙 《湖南生态科学学报》 CAS 2019年第2期1-10,共10页

棘托竹荪连作导致棘托竹荪产量降低、质量下降.土壤细菌群落结构组成及变化能够反映生态系统的结构和功能,在生态系统物质养分循环中发挥着重要的作用.目前,棘托竹荪连作对土壤细菌群落结构组成及分布的影响尚不清楚.以连续三年棘托竹... 棘托竹荪连作导致棘托竹荪产量降低、质量下降.土壤细菌群落结构组成及变化能够反映生态系统的结构和功能,在生态系统物质养分循环中发挥着重要的作用.目前,棘托竹荪连作对土壤细菌群落结构组成及分布的影响尚不清楚.以连续三年棘托竹荪根际土壤为材料,探讨连续种植棘托竹荪对根际土壤细菌的影响,为调控棘托竹荪连作障碍提供理论依据.试验选择连续三年棘托竹荪出菇高峰期的土壤及对应的未种植棘托竹荪的样地,采用"S"形取样法采集土壤样品,对土壤进行理化性质及分子水平上对16SrRNA基因进行HiSeq2500测序研究,利用R语言和SPSS22.0等软件分析棘托竹荪连作对土壤细菌多样性及群落结构的影响.种植棘托竹荪后,与对照相比,土壤有机碳、全磷、碱解氮等的含量均增加,细菌种群数量和多样性均增加.连作三年后,种植棘托竹荪区域的土壤细菌种群与多样性降低,慢生根瘤菌属,Candidatus_Solibacter和Chthoniobacter的相对丰度随连作年限的增加而逐渐增加,Kaistobacter、假单胞菌属、黄杆菌属、金黄杆菌属等菌群相对丰度则逐年减小.在种植棘托竹荪区域,属水平上的菌落受土壤理化性质影响比较大,特别是pH、有机碳、全磷、碱解氮、速效磷和速效钾.随连作年限的延长,棘托竹荪根际土壤理化性质、细菌的群落多样性及结构发生显著变化. 展开更多

关键词 棘托竹荪 连作 根际土壤细菌多样性 群落结构

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花垣铅锌尾矿废弃地地枇杷根际土壤细菌群落演替及功能预测

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作者 吕定红 田向荣 +1 位作者 张丽 李朝阳 《可持续发展》 2023年第6期1987-1997,共11页

看护植物介导的微斑块变化是尾矿废弃地等退化生态系统恢复过程中的活跃成分。以铅锌尾矿废弃地裸地为对照(CK),不同演替阶段的地枇杷斑块(初期Y、中期M和后期O)为研究对象,采用16S rRNA高通量测序技术对不同演替过程中地枇杷根际土壤... 看护植物介导的微斑块变化是尾矿废弃地等退化生态系统恢复过程中的活跃成分。以铅锌尾矿废弃地裸地为对照(CK),不同演替阶段的地枇杷斑块(初期Y、中期M和后期O)为研究对象,采用16S rRNA高通量测序技术对不同演替过程中地枇杷根际土壤细菌数据进行数据挖掘和分析,运用PISCRUSt2功能预测分析探讨了铅锌尾矿废弃地上不同演替过程中地枇杷根际细菌群落变化及碳、氮和磷代谢特征。结果表明:1) 根际细菌优势门主要为变形菌门、蓝细菌门、绿弯菌门和放线菌门等,随着演替正向进行,蓝细菌门和绿弯菌门相对丰度逐渐降低,变形菌门和放线菌门相对丰度增加。优势属类群中鞘脂单胞菌属、Gaiella属、硫杆菌属和短波单胞菌属等的相对丰度逐渐降低,与之相反,红杆菌属、假单胞菌属、木洞菌属、慢生根瘤菌属和玫瑰单胞菌属的相对丰度则逐渐增加,典型对应分析(CCA)结果显示,有效磷(AP)和总磷(TP)与根际细菌物种分布的决定系数R2分别为0.8507 (P = 0.001)和0.9373 (P = 0.001);2) 参与碳固定的6条途径中,以3-羟基丙酸双循环的总关键基因丰度最高,其次为卡尔文循环,随演替正向进行,根际细菌固碳潜力逐渐增加;3) 参与固氮反应的功能酶基因丰度以Y阶段最高,硝化反应的功能酶基因丰度随演替正向进行而逐渐增加,参与N代谢的所有功能基因中异化性硝酸盐还原反应(DNRA)的基因丰度最高,并在O阶段达到最大;4) 有机磷矿化与无机磷溶解的基因丰度均随演替正向进行而逐渐增加,有机磷运输基因丰度随演替正向进行而增加,但无机磷酸盐运输的基因总丰度却显著高于前者。综上所述,随着地枇杷斑块演替的正向进行,地枇杷根际土壤细菌的群落结构与组成发生了显著变化,TP和AP是这种变化的关键环境因子,根际土壤细菌群落以3-羟基丙酸双循环途径为主要的固碳方式,硝态� 展开更多

关键词 花垣县 铅锌尾矿废弃地 地枇杷 根际土壤细菌群落 PICRUSt2 功能预测 元素循环

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不同施肥处理对福建莆田地区枇杷根际微生物多样性的影响 被引量：3

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作者 付龙威 汤晓娟 +3 位作者 林授锴 王春花 张艳珍 刘云国 《江苏农业科学》 2020年第22期261-267,共7页

福建莆田地区是我国枇杷的主产地之一。为探讨复合肥对莆田地区枇杷根际土壤微生物的影响,利用高通量测序技术(Illumina Hiseq)研究4个采样点的根际土壤细菌多样性与土壤理化性质的相关性。结果显示,在12份枇杷根际土壤样品中共得到3537... 福建莆田地区是我国枇杷的主产地之一。为探讨复合肥对莆田地区枇杷根际土壤微生物的影响,利用高通量测序技术(Illumina Hiseq)研究4个采样点的根际土壤细菌多样性与土壤理化性质的相关性。结果显示,在12份枇杷根际土壤样品中共得到35371个细菌操作分类单元(OTU),属于31个门,617个属;共有12个优势门(丰度>1%),其中丰度>6%的是变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria),25个优势属(丰度>1%)。在不同处理的根际土壤中各优势菌门、属所占比例存在明显差异。土壤细菌群落结构和主要理化性质存在显著相关性,其中pH值和全氮、有效磷、总磷含量是影响土壤细菌丰度的主要因素。 展开更多

关键词 枇杷 复合肥 高通量测序 根际土壤细菌多样性 土壤理化性质

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甘薯基部腐烂病对植株根际土壤细菌群落结构的影响

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作者 陈海生 唐超文 +2 位作者 刘守平 陈伟强 侯金祥 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1194-1202,共9页

【目的】探明甘薯茎基部腐烂病发生机制,为构建该病害的绿色防控体系提供依据。【方法】以处于南北薯区交接带、南北甘薯病害发生区的浙江省台州市黄岩区西部山区为研究对象,采用Illumina高通量测序技术,对比研究甘薯茎基部腐烂病发病... 【目的】探明甘薯茎基部腐烂病发生机制,为构建该病害的绿色防控体系提供依据。【方法】以处于南北薯区交接带、南北甘薯病害发生区的浙江省台州市黄岩区西部山区为研究对象,采用Illumina高通量测序技术,对比研究甘薯茎基部腐烂病发病甘薯植株与健康甘薯植株的根际土壤细菌群落结构和多样性,及其根际土壤酶包括土壤脲酶、蔗糖酶和碱性磷酸酶活性。【结果】甘薯茎基部腐烂病显著降低了植株根际土壤脲酶、蔗糖酶和碱性磷酸酶活性,提高了根际土壤细菌多样性指数。在门分类水平上,该病害显著降低了其植株根际土壤放线菌门、疣微菌门和拟杆菌门相对丰度,显著提高了绿湾菌门和Candidate-division-wps-2菌群的相对丰度。在属分类水平上,该病害显著提高了植株根际土壤细菌GP_(1)、未分类的厚壁菌属和芽单胞菌属的相对丰度,显著降低了未分类的链霉菌属、链嗜酸菌属、伯克霍尔德菌属等菌群的相对丰度。【结论】甘薯茎基部腐烂病降低了其植株根际脲酶、蔗糖酶和碱性磷酸酶活性,改变了甘薯根际土壤细菌群落的结构和多样性。 展开更多

关键词 甘薯茎基部腐烂病 高通量测序 根际土壤细菌群落结构 土壤酶活性

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