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4种常见储藏物螨类ITS2基因片段序列以及系统发育分析
被引量：
3
1
作者
杨志俊
易忠权
+3 位作者
胡学锋
王静
陈琳
崔玉宝
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2018年第7期729-732,739,共5页
目的以核糖体第二核糖体内部转录间隔区(ITS2)作为分子标记,对粉尘螨、屋尘螨、腐食酪螨和热带无爪螨进行系统发育树分析。方法 PCR扩增种常见储藏物螨种的ITS2基因并测序,进行序列比对分析;从GenBank下载8条螨虫的ITS2序列,用MEGA 2.1...
目的以核糖体第二核糖体内部转录间隔区(ITS2)作为分子标记,对粉尘螨、屋尘螨、腐食酪螨和热带无爪螨进行系统发育树分析。方法 PCR扩增种常见储藏物螨种的ITS2基因并测序,进行序列比对分析;从GenBank下载8条螨虫的ITS2序列,用MEGA 2.1软件构建分子系统树,进行系统进化分析。结果分析4种螨的ITS2序列长度为316~487bp,种内基因遗传距离为0.003 823~0.052 599,种间遗传距离为0.187 440~0.534 699。以长食酪螨(Tyrophagus longior)为外类群构建系统发育树,进行系统发育分析,屋尘螨与粉尘螨亲缘关系较近,腐食酪螨及热带无爪螨分别位于发育树的基部和中部,系统发育树结果与根据形态分类对应。结论依据ITS2基因片段序列及系统发育树可对常见螨种鉴定,ITS2基因片段可作为螨种鉴定的分子标记。
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关键词
储藏物螨类
核糖体
its
2
基因
分子标记
系统发育
原文传递
大熊猫等八种野生珍稀动物蛔虫ITS-2基因的序列分析
被引量：
9
2
作者
何光志
牛李丽
+6 位作者
杨光友
邓家波
王帅
余星明
汪涛
古小彬
陈维刚
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期933-938,共6页
为了探讨寄生在大熊猫、小熊猫、黑猩猩、白眉长臂猿和4种熊科动物(北极熊、棕熊西藏亚种、狗熊四川亚种和棕熊东北亚种)体内蛔虫的分类地位,测定了核糖体第二内转录间隔区(ITS-2)基因序列,并对这些序列进行同源性分析和采用UPGMA法构...
为了探讨寄生在大熊猫、小熊猫、黑猩猩、白眉长臂猿和4种熊科动物(北极熊、棕熊西藏亚种、狗熊四川亚种和棕熊东北亚种)体内蛔虫的分类地位,测定了核糖体第二内转录间隔区(ITS-2)基因序列,并对这些序列进行同源性分析和采用UPGMA法构建分子系统树。结果表明:寄生在大熊猫、小熊猫和4种熊科动物体内的蛔虫均为贝蛔属蛔虫;寄生在黑猩猩和白眉长臂猿体内的蛔虫为蛔属蛔虫。分析结果提示蛔虫与宿主之间存在协同进化关系。
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关键词
大熊猫
野生珍稀动物
蛔虫
核糖体
its
-2
基因
序列分析
协同进化
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职称材料
11株螨虫分离株的ITS－2序列分析与系统关系研究
被引量：
6
3
作者
古小彬
张晓谦
+2 位作者
杨光友
贾小勇
王帅
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期235-242,共8页
为探讨动物体上一些常见寄生螨虫的分类地位，对11株螨虫分离株的核糖体第二内部转录间隔区（ITS-2）基因序列进行测定，并从GenBank下载21条螨虫的ITS-2序列，用UPGMA法构建分子系统树。序列分析结果显示：6株疥螨分离株ITS－2基因全...
为探讨动物体上一些常见寄生螨虫的分类地位，对11株螨虫分离株的核糖体第二内部转录间隔区（ITS-2）基因序列进行测定，并从GenBank下载21条螨虫的ITS-2序列，用UPGMA法构建分子系统树。序列分析结果显示：6株疥螨分离株ITS－2基因全长均为361bp，含有335个保守性位点，15个变异位点和9个简约信息位点；序列间的同源性为96．9％～99．7％。5株足螨分离株ITS－2基因存在长度上的变异（225～232bp），序列中包括184个保守性位点，44个变异位点，9个简约信息位点；分离自黄牛和奶牛的4株足螨分离株的ITS-2序列同源性为92．4％～97．3％，而熊猫足螨分离株同黄牛、奶牛足螨分离株的同源性较低（78．7％～82．6％）。UPGMA显示：32株螨虫分离株分成2个支系，第1个支系包括疥螨科的疥螨属Sarcoptes和背肛螨属Notoedres；第2个支系包括痒螨科的足螨属Chorioptes和痒螨属Psoroptes。从分析结果来看，笔者支持疥螨的单种说法；而足螨属中分离自熊猫的足螨和痒螨属中分离自水牛的痒螨的分类地位还有待进一步探讨。
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关键词
螨虫分离株
核糖体
its
-2
基因
序列分析
分子系统发生
下载PDF
职称材料
题名
4种常见储藏物螨类ITS2基因片段序列以及系统发育分析
被引量：
3
1
作者
杨志俊
易忠权
胡学锋
王静
陈琳
崔玉宝
机构
盐城出入境检验检疫局
盐城市第三人民医院中心实验室
南京出入境检验检疫局
连云港出入境检验检疫局
扬州出入境检验检疫局
南京医科大学附属无锡人民医院
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2018年第7期729-732,739,共5页
基金
江苏出入境检验检疫局科研项目(No.2017KJ24
No.2016KJ31)
文摘
目的以核糖体第二核糖体内部转录间隔区(ITS2)作为分子标记,对粉尘螨、屋尘螨、腐食酪螨和热带无爪螨进行系统发育树分析。方法 PCR扩增种常见储藏物螨种的ITS2基因并测序,进行序列比对分析;从GenBank下载8条螨虫的ITS2序列,用MEGA 2.1软件构建分子系统树,进行系统进化分析。结果分析4种螨的ITS2序列长度为316~487bp,种内基因遗传距离为0.003 823~0.052 599,种间遗传距离为0.187 440~0.534 699。以长食酪螨(Tyrophagus longior)为外类群构建系统发育树,进行系统发育分析,屋尘螨与粉尘螨亲缘关系较近,腐食酪螨及热带无爪螨分别位于发育树的基部和中部,系统发育树结果与根据形态分类对应。结论依据ITS2基因片段序列及系统发育树可对常见螨种鉴定,ITS2基因片段可作为螨种鉴定的分子标记。
关键词
储藏物螨类
核糖体
its
2
基因
分子标记
系统发育
Keywords
Storage mites
the ribosomal second internal transcribed spacer （
its
-
2
）
DNA marker
phylogenesis
分类号
R384.4 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
大熊猫等八种野生珍稀动物蛔虫ITS-2基因的序列分析
被引量：
9
2
作者
何光志
牛李丽
杨光友
邓家波
王帅
余星明
汪涛
古小彬
陈维刚
机构
四川农业大学动物医学院
成都动物园
出处
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第11期933-938,共6页
基金
成都大熊猫繁育研究基金会资助项目(CPF08005)
文摘
为了探讨寄生在大熊猫、小熊猫、黑猩猩、白眉长臂猿和4种熊科动物(北极熊、棕熊西藏亚种、狗熊四川亚种和棕熊东北亚种)体内蛔虫的分类地位,测定了核糖体第二内转录间隔区(ITS-2)基因序列,并对这些序列进行同源性分析和采用UPGMA法构建分子系统树。结果表明:寄生在大熊猫、小熊猫和4种熊科动物体内的蛔虫均为贝蛔属蛔虫;寄生在黑猩猩和白眉长臂猿体内的蛔虫为蛔属蛔虫。分析结果提示蛔虫与宿主之间存在协同进化关系。
关键词
大熊猫
野生珍稀动物
蛔虫
核糖体
its
-2
基因
序列分析
协同进化
Keywords
Ailuropoda melanoleuca
rare wildlife animal
roundworm
ribosome
its
-
2
rDNA
sequence analysis
coevolution
分类号
S852.731 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
11株螨虫分离株的ITS－2序列分析与系统关系研究
被引量：
6
3
作者
古小彬
张晓谦
杨光友
贾小勇
王帅
机构
四川农业大学动物医学院
绵阳市畜牧兽医局
北京实验动物研究中心
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第2期235-242,共8页
基金
四川省学术和技术带头人培养基金(SZ0082)
文摘
为探讨动物体上一些常见寄生螨虫的分类地位，对11株螨虫分离株的核糖体第二内部转录间隔区（ITS-2）基因序列进行测定，并从GenBank下载21条螨虫的ITS-2序列，用UPGMA法构建分子系统树。序列分析结果显示：6株疥螨分离株ITS－2基因全长均为361bp，含有335个保守性位点，15个变异位点和9个简约信息位点；序列间的同源性为96．9％～99．7％。5株足螨分离株ITS－2基因存在长度上的变异（225～232bp），序列中包括184个保守性位点，44个变异位点，9个简约信息位点；分离自黄牛和奶牛的4株足螨分离株的ITS-2序列同源性为92．4％～97．3％，而熊猫足螨分离株同黄牛、奶牛足螨分离株的同源性较低（78．7％～82．6％）。UPGMA显示：32株螨虫分离株分成2个支系，第1个支系包括疥螨科的疥螨属Sarcoptes和背肛螨属Notoedres；第2个支系包括痒螨科的足螨属Chorioptes和痒螨属Psoroptes。从分析结果来看，笔者支持疥螨的单种说法；而足螨属中分离自熊猫的足螨和痒螨属中分离自水牛的痒螨的分类地位还有待进一步探讨。
关键词
螨虫分离株
核糖体
its
-2
基因
序列分析
分子系统发生
Keywords
mite isolate
the second internal transcribed spacer （
its
-
2
）
sequence analysis
molecular phylogenetics
分类号
S852.746 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
4种常见储藏物螨类ITS2基因片段序列以及系统发育分析
杨志俊
易忠权
胡学锋
王静
陈琳
崔玉宝
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2018
3
原文传递
2
大熊猫等八种野生珍稀动物蛔虫ITS-2基因的序列分析
何光志
牛李丽
杨光友
邓家波
王帅
余星明
汪涛
古小彬
陈维刚
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2008
9
下载PDF
职称材料
3
11株螨虫分离株的ITS－2序列分析与系统关系研究
古小彬
张晓谦
杨光友
贾小勇
王帅
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
6
下载PDF
职称材料
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