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华南虎蛔虫ITS及5.8S rDNA序列扩增及分析 被引量：8
1
作者 王培园 陈武 +3 位作者 贺现辉 袁子国 朱兴全 林瑞庆 《畜牧与兽医》 北大核心 2010年第9期74-76,共3页
以从我国广州动物园华南虎肠道中采集的2条蛔虫作为研究对象,利用核糖体DNA(rDNA)中转录间隔区序列(ITS)的遗传标记特点,用保守引物NC5和NC2对提取的DNA进行PCR扩增,经胶回收纯化后,连接到pGEM-TEasy载体上,然后转化并鉴定出阳性菌落。... 以从我国广州动物园华南虎肠道中采集的2条蛔虫作为研究对象,利用核糖体DNA(rDNA)中转录间隔区序列(ITS)的遗传标记特点,用保守引物NC5和NC2对提取的DNA进行PCR扩增,经胶回收纯化后,连接到pGEM-TEasy载体上,然后转化并鉴定出阳性菌落。对菌落进行PCR扩增并测序,将测序结果与GenBank公布的相关蛔虫ITS序列进行比对分析。结果显示,来自广州动物园的2条蛔虫ITS及5.8S rDNA序列总长均为858 bp,序列相似性为100%,与狮弓蛔虫(Toxascaris leonina)、猫弓首蛔虫(Toxocara cati)、犬弓蛔虫(T.canis)的ITS-1序列相似性分别为97%、81%、82%;5.8S序列的相似性分别为100%、98%、99%;ITS-2序列与GenBank上公布的狮弓蛔虫序列相似性94.6%,与猫弓首蛔虫、犬弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔虫(T.malaysiensis)序列相似性均小于60%。研究结果证明此次分离的华南虎蛔虫属于狮弓蛔虫。 展开更多
关键词 华南虎 蛔虫 核糖体dna(rdna) ITS 鉴定
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寄生于猫的马来西亚弓首蛔虫在我国的发现 被引量：2
2
作者 李明伟 朱兴全 +2 位作者 曹湛 林瑞庆 宋慧群 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期530-532,共3页
目的对采集于广州1只猫小肠内、形态与犬弓首蛔虫相似的寄生虫进行分子生物学鉴定。方法以核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区(ITS)作为遗传标记对虫体进行种特异PCR鉴定,并测定了ITS-2序列,将序列与犬弓首蛔虫、猫弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔... 目的对采集于广州1只猫小肠内、形态与犬弓首蛔虫相似的寄生虫进行分子生物学鉴定。方法以核糖体DNA(rDNA)内转录间隔区(ITS)作为遗传标记对虫体进行种特异PCR鉴定,并测定了ITS-2序列,将序列与犬弓首蛔虫、猫弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔虫序列进行比较,得到其序列的相似性和差异性。结果用马来西亚弓首蛔虫种特异性引物对试验虫体DNA进行扩增时,能扩增出明显的DNA片段,而犬弓首蛔虫、猫弓首蛔虫种特异性引物对试验虫体DNA扩增时不能扩增出任何DNA片段。试验虫体的ITS-2序列与马来西亚弓首蛔虫的ITS2序列相似性为100%,与猫弓首蛔虫的相似性为88.7%～89.0%,与犬弓首蛔虫相似性为75.8%。结论经分子生物学和形态学鉴定,从广州猫体采集的蛔虫为马来西亚弓首蛔虫,在我国为首次发现。 展开更多
关键词 马来西亚弓首蛔虫 核糖体dna(rdna) 内转录间隔区(ITS) PCR鉴定
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一株分离自胶州湾的裸甲藻形态相似种的分子系统学研究 被引量：4
3
作者 朱霞 甄毓 于志刚 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期153-162,共10页
对一株分离自胶州湾的裸甲藻形态相似种(Gymnodinium sp.ZX)进行了分子水平的分类鉴定。提取基因组DNA后扩增核糖体小亚基和转录间隔区序列,经纯化、克隆并测序。将获得的序列分别进行Blastn同源性分析,并下载相关序列构建系统进化树,... 对一株分离自胶州湾的裸甲藻形态相似种(Gymnodinium sp.ZX)进行了分子水平的分类鉴定。提取基因组DNA后扩增核糖体小亚基和转录间隔区序列,经纯化、克隆并测序。将获得的序列分别进行Blastn同源性分析,并下载相关序列构建系统进化树,结果表明,该藻与共生藻(Symbiodinium)亲缘关系较近,而与裸甲藻(Gymnodinium)等其他甲藻亲缘关系较远,因此初步鉴定该藻为一种共生藻。用核糖体小亚基和转录间隔区序列分别对共生藻属构建系统进化树,分析各类群之间的关系,初步鉴定本藻属于共生藻属E类群。该藻分离自胶州湾,在f/2培养液中生长良好,表明胶州湾可能存在营自由生活的共生藻。 展开更多
关键词 核糖体dna(rdna) 转录间隔区 裸甲藻 共生藻
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